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The map label for this gene is 157825279

Identifier: 157825279

GI number: 157825279

Start: 148265

End: 150895

Strand: Direct

Name: 157825279

Synonym: A1C_00805

Alternate gene names: NA

Gene position: 148265-150895 (Clockwise)

Preceding gene: 157825278

Following gene: 157825280

Centisome position: 12.04

GC content: 33.14

Gene sequence:

>2631_bases
ATGGCGATTCCAGCTAAAGCTGATGATGCTTTTTCATGGATGTCAACCAGTTTTGGTGGATTAAAAAGCTTATTCGGTTG
TTTAGAAGTGCCTAAATTTACAAGTTTTAAAGATGGTAATATAGGAATTAGTTTATCTACAGCCGGAACTTGGCAATCAA
CAGGTAATACTGTTGAGAAAGGTAAATTGTTAAAAATAAACTGGTCTACTTCAGGTCTTACTCCTGAACCTAGAAAATAT
CTAGTATTATATAGAATTGATCCAAGGTTTAGTACGCCGCAAGTTTTCATTAAAACTTATAATTATTCTAAATTACAATT
TGAAGCTTTAAGATTTCCGCGTTTTGTTATGGACAATAACAGTGCAACACCGGGGGCTATACCGCCTGATAAAGACCTTG
ATGCACTGTCATTTACTAAAATGTCTGATTCTGTTAAATATTTTGACTATTCTGACAGTAATTCGCGCATTAAAGTTAAG
GCCGGTGATGTAGTAAATATTAGTTTAGTTGGTAAAGATAATTTTTTTAGCCCTAATACTCTAGATAATATTTTAACACA
GGAACTGGATAGTTCAATATTTGCTGCTTCTGCACTTTATACTCAAAGTAACCTTGGAAATTTTGACAATAGAATAATTT
ATTCATCTGCAAAGGAAGTATGTGATCTTATAGACGCTTCAAGAAATCCTGATAAACCAAGCGGGTGTAGCGGTACTGGC
TCAGCTACAAAATATAAAAGTATAAATAGTAACGAAGCATTAGTCGGCAAACCTATGATAACGGGAGCGGTACAAAATTT
AATGGGCTTAATTAATTCTTGTCCTGCTAATGCCGGTATAAATACTAGCCCTGCTTGCTATTACGATCAAGGTAGAGGGA
TGATAATTAAAGTAGGCGGGCAGGTTATTAAGGAACGAGATCAGAGTTTTGTAAATTCTGGTAGTACTCAAAGTAGCTTT
ATATATTATCAAGCCACTAGCGGCGGTACTATGGATTTTACTAGCGATTGGCAAGTTAATAACATGTTTAGTAATTCAGT
TTTAATGCGTGATTGGAGCCAAAATTTTTCAAATTATGCTAATTTTGTGGATTATATAAATAAGAATGATTGGTCAGCTA
ATTTTTTATATTTTGGTCGTTATTCGATGATTGTTGAAATAGGTAACGGGACAAATTCAATTAGTCCAGGTGATCAGCAA
AATATAAGTTTAGAATATTTCATAACATCTGATGGTACGTTACCTGATCCATCTGTTCGTGGTACGCCGGTAGATTATAA
CTTTGCTGCTGATGCACCGCAAGATGGATATTTGTGGTTAAGGGTGGTAAATCCTAATAGTAATATACACGGGGTAGTTA
GTGTAAATTATGCTAATTATACTGGTACAACTTGGTTTTCTGATATAATATATAATGGTGCTATTAAACCTATTACCGAT
CAGTTTAGAACTTTTAGTCAGCACTTTTATATTAAGTTAATTAATAATTCTGCAGTGCAGAATATAGCTAAAGCTGCATT
GACTCTTTATGTTACTATATTTGGTCTAATGTTTGTTGCGGGAGCATTAAAATTAACTGCCATAGAAGTGATAACACGTA
TATGCAAAATAGCTATAGTAGCTTTTTTAATTAGAGAAGAAAGTTGGCGCTTTTTTAATACATACTTCTTTAGTGCATTT
ACTAACGGTATTGATTTCTTTGTAACTAACGTAGTAGGTGCTACAAGCTCTAGATCTAATATTTTTGGTTTTATTGATCC
TATATTTGATAAATATACTAACGGTAGGATTTGGGGATTATTATTTATTGAATTATTACAAATACATAATGGTTTAGCAT
TTATTGCTATTATAACCATTTATTCACTTATTACTTATTTTAGAGCTATTTTAGAAGTGATAATAGGCTATGTTATGGCA
TTCATAGGGCTAACTGTTATGATTTCATTAGCACCGTTTTTCATAATATTAATGTTATTTGAAAAAACTAAAAGTTTATT
TGATAATTGGATATCGACATTGCTTAGCTATGTAGTGCAGCCGACAATATTATTGATTTTCTTTTTATTGATAGATCAGG
TTTTATCTGAGCAGCTTTTAAAAGTAGTAGTTAGAGCTTGTTGGGATACTCTGATACCAATCAAAATAGGGCTTGATTTA
ACACATCTTGGTATTCCGATTAATTTCTCTTTTACATTACCGTTCTTACCAGGAATACCTTTCTATGTACCGGATGTACC
GGAAATTAGTCGCTCTAATCTTCTAACGAACAATGCTAATACTTTCTTAGTATTGTTTACTACGGCTTTATTATTTTATT
CATATTGCTTGATGTCATATGGTTTAGTAAGCTTTGTAAATATAGTAGTCGGAATGCTTACAAATGTTACACCGGCACGA
ATATCAGGAAATTATCAAGAACGTTCTGATCCTGTGGGCGCTGTTATGAAGGATATAGGTTCGGTAACAAAACCGATTAA
AAGGGTGGCTATGGCTCCGGGTAGAATTTTCAAAGATAAGATAATTGATCAAAATTATAAGGCTAGAAAACCGGAAGGAG
GTGGTGAATTTACACATAAATTCCTTGCCGAACGTAATGATGTATCGAAGAAAGAGGCAGAGAGAAAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTGCTCGCAATGACAAAAAATAAAAACCACGGTATGATTTGTTGGATAACAATTTAAAATTATGAAAATTCTTAAGAGTT
TAGTTTTATTAGTTTTGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAAAATTGTTTTAGTGTAATCCCGCGATTTAAAAAATCGTCATTGCAAGCAGATCGTCATTGCAAGCAGCAGTAGGATGG
TACGTCAATCTCATGAAATA

Product: TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 876; Mature: 875

Protein sequence:

>876_residues
MAIPAKADDAFSWMSTSFGGLKSLFGCLEVPKFTSFKDGNIGISLSTAGTWQSTGNTVEKGKLLKINWSTSGLTPEPRKY
LVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQFEALRFPRFVMDNNSATPGAIPPDKDLDALSFTKMSDSVKYFDYSDSNSRIKVK
AGDVVNISLVGKDNFFSPNTLDNILTQELDSSIFAASALYTQSNLGNFDNRIIYSSAKEVCDLIDASRNPDKPSGCSGTG
SATKYKSINSNEALVGKPMITGAVQNLMGLINSCPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKERDQSFVNSGSTQSSF
IYYQATSGGTMDFTSDWQVNNMFSNSVLMRDWSQNFSNYANFVDYINKNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGTNSISPGDQQ
NISLEYFITSDGTLPDPSVRGTPVDYNFAADAPQDGYLWLRVVNPNSNIHGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIKPITD
QFRTFSQHFYIKLINNSAVQNIAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAIEVITRICKIAIVAFLIREESWRFFNTYFFSAF
TNGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIAIITIYSLITYFRAILEVIIGYVMA
FIGLTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDL
THLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISRSNLLTNNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYGLVSFVNIVVGMLTNVTPAR
ISGNYQERSDPVGAVMKDIGSVTKPIKRVAMAPGRIFKDKIIDQNYKARKPEGGGEFTHKFLAERNDVSKKEAERK

Sequences:

>Translated_876_residues
MAIPAKADDAFSWMSTSFGGLKSLFGCLEVPKFTSFKDGNIGISLSTAGTWQSTGNTVEKGKLLKINWSTSGLTPEPRKY
LVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQFEALRFPRFVMDNNSATPGAIPPDKDLDALSFTKMSDSVKYFDYSDSNSRIKVK
AGDVVNISLVGKDNFFSPNTLDNILTQELDSSIFAASALYTQSNLGNFDNRIIYSSAKEVCDLIDASRNPDKPSGCSGTG
SATKYKSINSNEALVGKPMITGAVQNLMGLINSCPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKERDQSFVNSGSTQSSF
IYYQATSGGTMDFTSDWQVNNMFSNSVLMRDWSQNFSNYANFVDYINKNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGTNSISPGDQQ
NISLEYFITSDGTLPDPSVRGTPVDYNFAADAPQDGYLWLRVVNPNSNIHGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIKPITD
QFRTFSQHFYIKLINNSAVQNIAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAIEVITRICKIAIVAFLIREESWRFFNTYFFSAF
TNGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIAIITIYSLITYFRAILEVIIGYVMA
FIGLTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDL
THLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISRSNLLTNNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYGLVSFVNIVVGMLTNVTPAR
ISGNYQERSDPVGAVMKDIGSVTKPIKRVAMAPGRIFKDKIIDQNYKARKPEGGGEFTHKFLAERNDVSKKEAERK
>Mature_875_residues
AIPAKADDAFSWMSTSFGGLKSLFGCLEVPKFTSFKDGNIGISLSTAGTWQSTGNTVEKGKLLKINWSTSGLTPEPRKYL
VLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQFEALRFPRFVMDNNSATPGAIPPDKDLDALSFTKMSDSVKYFDYSDSNSRIKVKA
GDVVNISLVGKDNFFSPNTLDNILTQELDSSIFAASALYTQSNLGNFDNRIIYSSAKEVCDLIDASRNPDKPSGCSGTGS
ATKYKSINSNEALVGKPMITGAVQNLMGLINSCPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKERDQSFVNSGSTQSSFI
YYQATSGGTMDFTSDWQVNNMFSNSVLMRDWSQNFSNYANFVDYINKNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGTNSISPGDQQN
ISLEYFITSDGTLPDPSVRGTPVDYNFAADAPQDGYLWLRVVNPNSNIHGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIKPITDQ
FRTFSQHFYIKLINNSAVQNIAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAIEVITRICKIAIVAFLIREESWRFFNTYFFSAFT
NGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIAIITIYSLITYFRAILEVIIGYVMAF
IGLTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLT
HLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISRSNLLTNNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSYGLVSFVNIVVGMLTNVTPARI
SGNYQERSDPVGAVMKDIGSVTKPIKRVAMAPGRIFKDKIIDQNYKARKPEGGGEFTHKFLAERNDVSKKEAERK

Specific function: Unknown

COG id: COG3704

COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007688 [H]

Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 97512; Mature: 97381

Theoretical pI: Translated: 8.29; Mature: 8.29

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAIPAKADDAFSWMSTSFGGLKSLFGCLEVPKFTSFKDGNIGISLSTAGTWQSTGNTVEK
CCCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCC
GKLLKINWSTSGLTPEPRKYLVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQFEALRFPRFVMDNN
CEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHCCEEEECCC
SATPGAIPPDKDLDALSFTKMSDSVKYFDYSDSNSRIKVKAGDVVNISLVGKDNFFSPNT
CCCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCH
LDNILTQELDSSIFAASALYTQSNLGNFDNRIIYSSAKEVCDLIDASRNPDKPSGCSGTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
SATKYKSINSNEALVGKPMITGAVQNLMGLINSCPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGG
CCCEECCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEECH
QVIKERDQSFVNSGSTQSSFIYYQATSGGTMDFTSDWQVNNMFSNSVLMRDWSQNFSNYA
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEECCHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
NFVDYINKNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGTNSISPGDQQNISLEYFITSDGTLPDPSVR
HHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCC
GTPVDYNFAADAPQDGYLWLRVVNPNSNIHGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIKPITD
CCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHH
QFRTFSQHFYIKLINNSAVQNIAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAIEVITRICKIAIV
HHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLIREESWRFFNTYFFSAFTNGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGL
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCHHH
LFIELLQIHNGLAFIAIITIYSLITYFRAILEVIIGYVMAFIGLTVMISLAPFFIILMLF
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCEE
THLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISRSNLLTNNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSY
EEECCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLVSFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMKDIGSVTKPIKRVAMAPGRIFKDK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
IIDQNYKARKPEGGGEFTHKFLAERNDVSKKEAERK
HHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
AIPAKADDAFSWMSTSFGGLKSLFGCLEVPKFTSFKDGNIGISLSTAGTWQSTGNTVEK
CCCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCC
GKLLKINWSTSGLTPEPRKYLVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQFEALRFPRFVMDNN
CEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCCCEEHHHHHCCEEEECCC
SATPGAIPPDKDLDALSFTKMSDSVKYFDYSDSNSRIKVKAGDVVNISLVGKDNFFSPNT
CCCCCCCCCCCCCCCCEEHHCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCH
LDNILTQELDSSIFAASALYTQSNLGNFDNRIIYSSAKEVCDLIDASRNPDKPSGCSGTG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
SATKYKSINSNEALVGKPMITGAVQNLMGLINSCPANAGINTSPACYYDQGRGMIIKVGG
CCCEECCCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEECCCEEEEEECH
QVIKERDQSFVNSGSTQSSFIYYQATSGGTMDFTSDWQVNNMFSNSVLMRDWSQNFSNYA
HHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCEECCHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
NFVDYINKNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGTNSISPGDQQNISLEYFITSDGTLPDPSVR
HHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCC
GTPVDYNFAADAPQDGYLWLRVVNPNSNIHGVVSVNYANYTGTTWFSDIIYNGAIKPITD
CCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHH
QFRTFSQHFYIKLINNSAVQNIAKAALTLYVTIFGLMFVAGALKLTAIEVITRICKIAIV
HHHHHHHEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFLIREESWRFFNTYFFSAFTNGIDFFVTNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGL
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCCCHHH
LFIELLQIHNGLAFIAIITIYSLITYFRAILEVIIGYVMAFIGLTVMISLAPFFIILMLF
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLIDQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCEE
THLGIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEISRSNLLTNNANTFLVLFTTALLFYSYCLMSY
EEECCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLVSFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQERSDPVGAVMKDIGSVTKPIKRVAMAPGRIFKDK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHH
IIDQNYKARKPEGGGEFTHKFLAERNDVSKKEAERK
HHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11557893 [H]