Definition Rickettsia akari str. Hartford, complete genome.
Accession NC_009881
Length 1,231,060

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The map label for this gene is 157825280

Identifier: 157825280

GI number: 157825280

Start: 151083

End: 154547

Strand: Direct

Name: 157825280

Synonym: A1C_00810

Alternate gene names: NA

Gene position: 151083-154547 (Clockwise)

Preceding gene: 157825279

Following gene: 157825281

Centisome position: 12.27

GC content: 33.82

Gene sequence:

>3465_bases
ATGAACAAAAATATTTTTATTACATTATTAGTATCGCTATTGCTGCTTTCCGGTTGTACCGGCGATACTTGTATTGACCC
TGATGATTTCGGTTTTATCAAATTCAATGTCTCTTCTCGATATAATCCAGAAGAAATTACTTCAAGAGATGAAGGTGATC
AGGTAGTACCATGGCGTGATAGTGCTTATAAAGTAAATGGTTATCCTTTAACCGTTATGGTAAGACCGTGGAGTTATATA
CTTGGCGATAAAAATACTTCAGGTCAGTTATCTGCATGGTGTCCATGGTACGGTCAGAAAAATAACACAACTACTTTGGC
TGCGTTTTGCGTTAAGCTACAACCGTGCACTTTTTGGGATAATGCTAGACTTGATATGTGTACTCCTAATCCCGCAAATC
AAAGTGACGCAATGATTAGTAATCCTCCATGTATAATGACAGACGGTGTAGGGCTTTATTTTCTTATTGCTGCTAAAAAT
ACCGATCCCAATATTTCACCGGATTCACAGCGTAAACCACAAGGTATAACTCAGCATTTAGGAGAGCTGACTTCGAGTGT
AGGCTATGAATTTTATAGTGTTAGTAGTACAGGACAATTCTTGAAAGCCGGCGGTATAAATTATCAATATAAAGGTCAGG
AGAAGTCAAAATATGCTCAATCTCCTCTTTATTTTAAGATTATAGATAAATTTTATAATGATAATAGCGGGCAATATAGA
TTAGTAATCAAATCTGGAGTTACTGATACTAGACCCGATCCGCTACAATTTTTAACGGATTTAATAAAAAGAGTATTATT
TGGTAAGGATGGGATTATAAAGAAAACTTATCAACAAATAATTGATACGCCGGGTTATAGGATGAGTGTCTCGGCTATTT
TAACGCTATATATAATGTTTACGGGCTTTTCCTTTTTAATAGGTAATATAAACCTTACTCATGTCGAACTTATAGTTAGA
ATATTAAAAGTTAGTATAGTCTCAATATTATTAAGTACGGATAAAGCTTGGACCTTTTTTCATGATTATTTATTCGTATT
TTTTATTGACGGGGTTCAGCAAATACTACAAATAATTAATGAAGCTGCGGCTACCGGTCCTGGTTCTCAAAGTTTGCTGG
GGTTACTTATCGCTCCTCAAACTTTATCTAAATTATTTTCTTTACTATTTGTTGATTGGCTTGGTTTTATATATATCATT
CTATATTTGATAGCCCTATATTTCCTTTTCTTTCTTATATTTAAAGCTACTATTATCTATCTAACCGCTCTTATAACTAT
TGGTATGATTATAATTATGGGACCGATATTTATTTGTTTCATGTTGTTTAATATCACTCGTTCGTTATTTGAGAATTGGT
TAAGACAATTAATATCATATGCATTACAGCCTATAATTTTATTTGCCGGTATCGCTTTTATTTCAATGATCATCAGAACT
GAAATATATTCAACGCTTGGTTTTGGGGTATGTAAACATGATTTTCCTAATTTAGGTCCGATAAATGAAATATTCGGTAG
TTTTCTTGAGGATATAGATCCAAGCCTTGGTAATTCAATATTTTATTGGTGGTTTCCTGTACCAATGAAAGGAGGTATAA
ATAATTTCCACAAAGCAAAGATATTAGTTCCCGGAGATCATATAATAGTAGATGATACTTGTAAGAATGATCATGATAAA
TGTAAGCATTGTGCTGCGTATGAGTGTATAGATGAACGCTATATTGAATTACCGTTTTTAGATTTAGTTAAAGATGCAAA
AAGGATTAGTAATTTTATAAACGGGAAATTTGTCCAACTTGATGGGATATTACTAATTTTTGTGTCTATTTATTTGCTAA
GTAAATTTAACGATACTGCTATATCGACGGCACAATTTATTTCCGGTACTTCAGGTAATTTAACAGACATACAAAAAGTT
AATCAGCAATCTTATGAATATGCAGCGAAGCAAATGAATAGACCGCTAAGTTATGTGGCTAAGATGGTAGGTGCACCCGT
AACTAGCCGTGTAAATGCAATGCAAGAGCAAGCTAGCATGTTCTTTGCCGAGAAATTTGAAAATATGATGATGGGAAGGC
TTGAAAAGCAAGCTCTCGGTTCTTCAGCAAACAAAGCCGTACAAAATGAGGTTAAAAGAAAATACGGTATAGATTTTAAA
GATGTAAAAATGAATGCTATTACTGATTATGAAAACGGTATTTCAGGATTGTTAAAGAATTTACCTAAAGGGAATGAATT
AAAAGCAAAAGAACTATCGAAAATGAAATTTACTCAGCTTCGAGATAAAATTGCTGCAAATAAATATGGAGTGAAAGATT
ATACCGCTTTAAGTAAAGAACAAAAAACAGAGCTTGATAAGTCCTTAAAAGATGCTAACTTACGTGAACTTGCTAGTGAT
GCGAACTTTACTAAAGATTATCAAGATGCTTATAAGTATGCTCACCAAGAAATGTCAGGGCGAGGTGTTGGTCTGTTCGG
TAAGAATATAGGAGTGCTTAGAATCTGGCAAGAGATGGAGCATCGTGTTGATACAAAACGTAAATTAAAAGAAGAAAAGC
GTGTAGGTATAGGCGAAAAAATATATGCAGGTTATACAGGAATAAAAAGAGGAGCTTTAACTGCAATAGTTGGTAAAGAT
TTACGTGATGCTTATGAGGGTAATCTAACCAGTGCTGAATGGCATGATTTTGAATATAACGATCCAAGGCTTAGAACTTA
TAGCGAAAAATTAAAAGATAATGACAAAGCACGGGAACGTGAAGAACTCAAAATGCATATTAATAAAGAAACGTTAGCTG
CTCAGGCAGATATATTATCACCAGAATATCTAGCAAGACTAGAAAAAGCAGGTAGACAGAGTGATGTTGAGTATTATCAA
GAATTAGCTTACAGAAAGCTTATGCATGATGTGCATGGTATGTTATTCGAGGAAGGTAAACCGGTAATGATGGGCGACAG
ATTTATGCGTGAGAAAGCTACTGATTCTCAGATGCGAGATATGATAGATAACGCTCACAGAAAACATGCAGAATTTATAG
AGGGAGATCGATATATTCGTCGCCAAGAGCATTATGATATTATGCACGAGAAAGCTGAAGGAAATTTAGAACAAACGTAT
AAAGAGCTTAAAGATCATTTCAAAAGAGATCAGATCAACATTGAGGAAATACCGGAATTAATAGCCCAAAAGATCAAAGA
TACTGAGCAGGGACCTGAAGTAGACGCAAAGATTACGGAAGAGCTTAATAACTTTAATGCTGATGTTAAAAATTATGAAT
ATAGCACTGAAGTATTAAATAAAATAGAGGACAGAAAGCAAGCTATTACCGATGAAGTCAATGCTCAGATCGATCAGATT
AATAAATATAGGGAAAATGCCAAAATGGAAAAATATGTGAGGCCAATAGTAAATGAAGGCAGAAAACTAAGAAAATTAGA
AGATCATTTAAGAAATATGAATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCTCATGAAATAATCACAAATTCCTGAGATTGTTCTGTTAAAACTTACAGTTTTTCCTCGCAATGACGGTAAAATTGAG
ACATATAGAAATAACTTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAAAAGATATATATTTAGAATAGTTGTTTGCTTTAGTAATAAAGTTAATCAATACTTTTGAGGTATAGTTATGAATAAAG
CAAAAATATTTATGAATGGT

Product: TrbL/VirB6 plasmid conjugative transfer protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1154; Mature: 1154

Protein sequence:

>1154_residues
MNKNIFITLLVSLLLLSGCTGDTCIDPDDFGFIKFNVSSRYNPEEITSRDEGDQVVPWRDSAYKVNGYPLTVMVRPWSYI
LGDKNTSGQLSAWCPWYGQKNNTTTLAAFCVKLQPCTFWDNARLDMCTPNPANQSDAMISNPPCIMTDGVGLYFLIAAKN
TDPNISPDSQRKPQGITQHLGELTSSVGYEFYSVSSTGQFLKAGGINYQYKGQEKSKYAQSPLYFKIIDKFYNDNSGQYR
LVIKSGVTDTRPDPLQFLTDLIKRVLFGKDGIIKKTYQQIIDTPGYRMSVSAILTLYIMFTGFSFLIGNINLTHVELIVR
ILKVSIVSILLSTDKAWTFFHDYLFVFFIDGVQQILQIINEAAATGPGSQSLLGLLIAPQTLSKLFSLLFVDWLGFIYII
LYLIALYFLFFLIFKATIIYLTALITIGMIIIMGPIFICFMLFNITRSLFENWLRQLISYALQPIILFAGIAFISMIIRT
EIYSTLGFGVCKHDFPNLGPINEIFGSFLEDIDPSLGNSIFYWWFPVPMKGGINNFHKAKILVPGDHIIVDDTCKNDHDK
CKHCAAYECIDERYIELPFLDLVKDAKRISNFINGKFVQLDGILLIFVSIYLLSKFNDTAISTAQFISGTSGNLTDIQKV
NQQSYEYAAKQMNRPLSYVAKMVGAPVTSRVNAMQEQASMFFAEKFENMMMGRLEKQALGSSANKAVQNEVKRKYGIDFK
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ANFTKDYQDAYKYAHQEMSGRGVGLFGKNIGVLRIWQEMEHRVDTKRKLKEEKRVGIGEKIYAGYTGIKRGALTAIVGKD
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ELAYRKLMHDVHGMLFEEGKPVMMGDRFMREKATDSQMRDMIDNAHRKHAEFIEGDRYIRRQEHYDIMHEKAEGNLEQTY
KELKDHFKRDQINIEEIPELIAQKIKDTEQGPEVDAKITEELNNFNADVKNYEYSTEVLNKIEDRKQAITDEVNAQIDQI
NKYRENAKMEKYVRPIVNEGRKLRKLEDHLRNMN

Sequences:

>Translated_1154_residues
MNKNIFITLLVSLLLLSGCTGDTCIDPDDFGFIKFNVSSRYNPEEITSRDEGDQVVPWRDSAYKVNGYPLTVMVRPWSYI
LGDKNTSGQLSAWCPWYGQKNNTTTLAAFCVKLQPCTFWDNARLDMCTPNPANQSDAMISNPPCIMTDGVGLYFLIAAKN
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KELKDHFKRDQINIEEIPELIAQKIKDTEQGPEVDAKITEELNNFNADVKNYEYSTEVLNKIEDRKQAITDEVNAQIDQI
NKYRENAKMEKYVRPIVNEGRKLRKLEDHLRNMN
>Mature_1154_residues
MNKNIFITLLVSLLLLSGCTGDTCIDPDDFGFIKFNVSSRYNPEEITSRDEGDQVVPWRDSAYKVNGYPLTVMVRPWSYI
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KELKDHFKRDQINIEEIPELIAQKIKDTEQGPEVDAKITEELNNFNADVKNYEYSTEVLNKIEDRKQAITDEVNAQIDQI
NKYRENAKMEKYVRPIVNEGRKLRKLEDHLRNMN

Specific function: Unknown

COG id: COG3704

COG function: function code U; Type IV secretory pathway, VirB6 components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Cell membrane; Lipid-anchor (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trbL/virB6 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR007688 [H]

Pfam domain/function: PF04610 TrbL [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 132091; Mature: 132091

Theoretical pI: Translated: 7.28; Mature: 7.28

Prosite motif: PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.1 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.1 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKNIFITLLVSLLLLSGCTGDTCIDPDDFGFIKFNVSSRYNPEEITSRDEGDQVVPWRD
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCC
SAYKVNGYPLTVMVRPWSYILGDKNTSGQLSAWCPWYGQKNNTTTLAAFCVKLQPCTFWD
CCEEECCEEEEEEECCCHHEECCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
NARLDMCTPNPANQSDAMISNPPCIMTDGVGLYFLIAAKNTDPNISPDSQRKPQGITQHL
CCCEECCCCCCCCCCCCEECCCCEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
GELTSSVGYEFYSVSSTGQFLKAGGINYQYKGQEKSKYAQSPLYFKIIDKFYNDNSGQYR
HHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEE
LVIKSGVTDTRPDPLQFLTDLIKRVLFGKDGIIKKTYQQIIDTPGYRMSVSAILTLYIMF
EEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
TGFSFLIGNINLTHVELIVRILKVSIVSILLSTDKAWTFFHDYLFVFFIDGVQQILQIIN
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAAATGPGSQSLLGLLIAPQTLSKLFSLLFVDWLGFIYIILYLIALYFLFFLIFKATIIY
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LTALITIGMIIIMGPIFICFMLFNITRSLFENWLRQLISYALQPIILFAGIAFISMIIRT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIYSTLGFGVCKHDFPNLGPINEIFGSFLEDIDPSLGNSIFYWWFPVPMKGGINNFHKAK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEE
ILVPGDHIIVDDTCKNDHDKCKHCAAYECIDERYIELPFLDLVKDAKRISNFINGKFVQL
EEECCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
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KMVGAPVTSRVNAMQEQASMFFAEKFENMMMGRLEKQALGSSANKAVQNEVKRKYGIDFK
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
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HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
QKTELDKSLKDANLRELASDANFTKDYQDAYKYAHQEMSGRGVGLFGKNIGVLRIWQEME
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCC
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CCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHH
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RQEHYDIMHEKAEGNLEQTYKELKDHFKRDQINIEEIPELIAQKIKDTEQGPEVDAKITE
HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH
ELNNFNADVKNYEYSTEVLNKIEDRKQAITDEVNAQIDQINKYRENAKMEKYVRPIVNEG
HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RKLRKLEDHLRNMN
HHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MNKNIFITLLVSLLLLSGCTGDTCIDPDDFGFIKFNVSSRYNPEEITSRDEGDQVVPWRD
CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCC
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CCEEECCEEEEEEECCCHHEECCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCC
NARLDMCTPNPANQSDAMISNPPCIMTDGVGLYFLIAAKNTDPNISPDSQRKPQGITQHL
CCCEECCCCCCCCCCCCEECCCCEEEECCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHH
GELTSSVGYEFYSVSSTGQFLKAGGINYQYKGQEKSKYAQSPLYFKIIDKFYNDNSGQYR
HHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHCCCCCEECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEE
LVIKSGVTDTRPDPLQFLTDLIKRVLFGKDGIIKKTYQQIIDTPGYRMSVSAILTLYIMF
EEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHH
TGFSFLIGNINLTHVELIVRILKVSIVSILLSTDKAWTFFHDYLFVFFIDGVQQILQIIN
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EAAATGPGSQSLLGLLIAPQTLSKLFSLLFVDWLGFIYIILYLIALYFLFFLIFKATIIY
HHHCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EIYSTLGFGVCKHDFPNLGPINEIFGSFLEDIDPSLGNSIFYWWFPVPMKGGINNFHKAK
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCEE
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EEECCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
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HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
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HEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH
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ELAYRKLMHDVHGMLFEEGKPVMMGDRFMREKATDSQMRDMIDNAHRKHAEFIEGDRYIR
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHH
ELNNFNADVKNYEYSTEVLNKIEDRKQAITDEVNAQIDQINKYRENAKMEKYVRPIVNEG
HHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
RKLRKLEDHLRNMN
HHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA