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The map label for this gene is abgT [H]

Identifier: 153950986

GI number: 153950986

Start: 722485

End: 724014

Strand: Direct

Name: abgT [H]

Synonym: JJD26997_0800

Alternate gene names: 153950986

Gene position: 722485-724014 (Clockwise)

Preceding gene: 153952441

Following gene: 153952270

Centisome position: 39.16

GC content: 31.9

Gene sequence:

>1530_bases
ATGAATATTTTTTTAAAAAATATAGAAAAAATGGGAAATAAAATCCCTGATGTTAGCATACTTTTTCTTTTTGCTTTAAT
TATTATTTTGTTGGCTTCTTTTTTCTTATCTTTGTTTGATTTTAATTATTTTCTCATCAAAGCTGATGGAAGTGGTAGCG
AGCAAGTAGTGATAAAAAATTTCCTATCTTTAGGTAATTTTTTAAATCTCTTAAGTTCTATGACTTCAAATTTTATCAAT
TTTCCACCCTTGGGTGTGGTTTTAGTGGTAGCTTTAGCTATAGGTATAGCCGAAACAAGCGGTTTTTTAAGGGTATCTTT
AATTAAATTGTCTTTATTTATACCTAAAAGATTAATCGTTCCTGTGGTTCTTGTTATTTCGGTGGCAAGTCATATTATAG
GAGATGGAGCTTATGTATTTTTAATGCCCATAGTGGCTATGCTTTTTATTTCTGCTAAAAAACATCCTGTTGCAGGTATA
GCTACTGCTTTTGCGGGGTATGCAGGGGGACTTTCAGCAAGCTTTACCCCTTCGCTTATTGATCCTATTATGCAAGGTTT
TACAGAAAAAGCTGCTCATATTATTGATACAAGCATTGATATTAATGTGCTTTGTAATTATTTTGTGTCTTTAGCTGGGA
CTATAAGCGTCGTTCTTTTTTGCTGGTTTGTGTGTGATAAGATTGTAGAGCCTTATTTGAAAAATAATTTACCTATAGAT
GGAGACTATGAGGAATTTTCTTCAAATAGTATAAGCAAGGATGAAAATAGGGGATTTATCTTCGCTTTACTAAGTATTTT
GGCTATGATTGTGATTTTGGTGGTTTTAGCTTATCCAAGCGATTCTTTGCTTAGAGGTTCGCATGGAAGTTTGAGTGAAA
AAGATGCAATCTTGATGAAGGGACTCGTAGCATTTTTATTCTTATTTTTTGCTATTCCAGGTTTGATTTTTGGTATTTTT
TCTAAAAAATTTACAAGTTTGATTCAAGCTGTGAATGCTATGAGCGATGCTTTAAAACCTTTAATCGGTTTTATGGTGTT
TTGTTTTATATGCGGACAATTTTTATATGTGTTTAATGAATCAAATATTTCAAAACTTCTTGCTGTAAGTGGGGCTGAAC
TTTTAAAATCTTTAGCTTTGCCAAGCGGAATTACAATATTTGGCATAATAGTTTTTACCGGTTTTTTAAATTTATTCGTT
ACTTCAGCTACTTCTAAATGGGCTGTTTTAGCACCTATTTTTGTTCCTATGCTCATGCTTGTAGGCATAGCTCCTGAACT
TACTCAAGCAGCTTTTAGGGTAAGTGATAGTGCGATTAATGTGATGACTCCTTTATGTCCTTTTTATCCACTTATTATTG
CTTATTGTCAAAAATATAGCTCCAAAACAGGAGTGGGAACTCTTTGCTCTATAATGATACCTTATAGTATAGCCTTAATG
ATAGCTTTGACTTTAACCTTATATTTATTTTGGATTTTTAATATACCTTTGGGTTTTGAAAGTTCTTATATTTACACTTT
GAAAGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTTTTTTTAATTTTTTTTAAAAAAAACTTATTTTCTATATAAGAATAAACTTAGTATTTAGTATAATAATAATAAT
TTCTATTTTAAGGTGTTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATGGATTATAAGCAAATACAAATTGATAATTTTTTCAGATATCTAGCTGTGCCTTCACAAAGCAATGCTAAAGCACA
AAGCTTGCCAAGCACGCAAG

Product: putative efflux pump component MtrF

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 509; Mature: 509

Protein sequence:

>509_residues
MNIFLKNIEKMGNKIPDVSILFLFALIIILLASFFLSLFDFNYFLIKADGSGSEQVVIKNFLSLGNFLNLLSSMTSNFIN
FPPLGVVLVVALAIGIAETSGFLRVSLIKLSLFIPKRLIVPVVLVISVASHIIGDGAYVFLMPIVAMLFISAKKHPVAGI
ATAFAGYAGGLSASFTPSLIDPIMQGFTEKAAHIIDTSIDINVLCNYFVSLAGTISVVLFCWFVCDKIVEPYLKNNLPID
GDYEEFSSNSISKDENRGFIFALLSILAMIVILVVLAYPSDSLLRGSHGSLSEKDAILMKGLVAFLFLFFAIPGLIFGIF
SKKFTSLIQAVNAMSDALKPLIGFMVFCFICGQFLYVFNESNISKLLAVSGAELLKSLALPSGITIFGIIVFTGFLNLFV
TSATSKWAVLAPIFVPMLMLVGIAPELTQAAFRVSDSAINVMTPLCPFYPLIIAYCQKYSSKTGVGTLCSIMIPYSIALM
IALTLTLYLFWIFNIPLGFESSYIYTLKG

Sequences:

>Translated_509_residues
MNIFLKNIEKMGNKIPDVSILFLFALIIILLASFFLSLFDFNYFLIKADGSGSEQVVIKNFLSLGNFLNLLSSMTSNFIN
FPPLGVVLVVALAIGIAETSGFLRVSLIKLSLFIPKRLIVPVVLVISVASHIIGDGAYVFLMPIVAMLFISAKKHPVAGI
ATAFAGYAGGLSASFTPSLIDPIMQGFTEKAAHIIDTSIDINVLCNYFVSLAGTISVVLFCWFVCDKIVEPYLKNNLPID
GDYEEFSSNSISKDENRGFIFALLSILAMIVILVVLAYPSDSLLRGSHGSLSEKDAILMKGLVAFLFLFFAIPGLIFGIF
SKKFTSLIQAVNAMSDALKPLIGFMVFCFICGQFLYVFNESNISKLLAVSGAELLKSLALPSGITIFGIIVFTGFLNLFV
TSATSKWAVLAPIFVPMLMLVGIAPELTQAAFRVSDSAINVMTPLCPFYPLIIAYCQKYSSKTGVGTLCSIMIPYSIALM
IALTLTLYLFWIFNIPLGFESSYIYTLKG
>Mature_509_residues
MNIFLKNIEKMGNKIPDVSILFLFALIIILLASFFLSLFDFNYFLIKADGSGSEQVVIKNFLSLGNFLNLLSSMTSNFIN
FPPLGVVLVVALAIGIAETSGFLRVSLIKLSLFIPKRLIVPVVLVISVASHIIGDGAYVFLMPIVAMLFISAKKHPVAGI
ATAFAGYAGGLSASFTPSLIDPIMQGFTEKAAHIIDTSIDINVLCNYFVSLAGTISVVLFCWFVCDKIVEPYLKNNLPID
GDYEEFSSNSISKDENRGFIFALLSILAMIVILVVLAYPSDSLLRGSHGSLSEKDAILMKGLVAFLFLFFAIPGLIFGIF
SKKFTSLIQAVNAMSDALKPLIGFMVFCFICGQFLYVFNESNISKLLAVSGAELLKSLALPSGITIFGIIVFTGFLNLFV
TSATSKWAVLAPIFVPMLMLVGIAPELTQAAFRVSDSAINVMTPLCPFYPLIIAYCQKYSSKTGVGTLCSIMIPYSIALM
IALTLTLYLFWIFNIPLGFESSYIYTLKG

Specific function: Essential for aminobenzoyl-glutamate utilization. May transport aminobenzoyl-glutamate into the cell. Seems also to increase the sensitivity to low levels of aminobenzoyl-glutamate. Sufficient to confer aminobenzoyl-glutamate utilization phenotype [H]

COG id: COG2978

COG function: function code H; Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081879, Length=494, Percent_Identity=29.7570850202429, Blast_Score=244, Evalue=1e-65,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004697
- InterPro:   IPR011540 [H]

Pfam domain/function: PF03806 ABG_transport [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55407; Mature: 55407

Theoretical pI: Translated: 7.69; Mature: 7.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
4.5 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
4.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MNIFLKNIEKMGNKIPDVSILFLFALIIILLASFFLSLFDFNYFLIKADGSGSEQVVIKN
CCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCHHHHHH
FLSLGNFLNLLSSMTSNFINFPPLGVVLVVALAIGIAETSGFLRVSLIKLSLFIPKRLIV
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
PVVLVISVASHIIGDGAYVFLMPIVAMLFISAKKHPVAGIATAFAGYAGGLSASFTPSLI
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH
DPIMQGFTEKAAHIIDTSIDINVLCNYFVSLAGTISVVLFCWFVCDKIVEPYLKNNLPID
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
GDYEEFSSNSISKDENRGFIFALLSILAMIVILVVLAYPSDSLLRGSHGSLSEKDAILMK
CCHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCCCHHHHHHHH
GLVAFLFLFFAIPGLIFGIFSKKFTSLIQAVNAMSDALKPLIGFMVFCFICGQFLYVFNE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
SNISKLLAVSGAELLKSLALPSGITIFGIIVFTGFLNLFVTSATSKWAVLAPIFVPMLML
CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
VGIAPELTQAAFRVSDSAINVMTPLCPFYPLIIAYCQKYSSKTGVGTLCSIMIPYSIALM
HCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
IALTLTLYLFWIFNIPLGFESSYIYTLKG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9829935; 9097039; 9278503; 2825131; 7567469 [H]