| Definition | Psychrobacter sp. PRwf-1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009524 |
| Length | 2,978,976 |
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The map label for this gene is 148652610
Identifier: 148652610
GI number: 148652610
Start: 953189
End: 954520
Strand: Direct
Name: 148652610
Synonym: PsycPRwf_0801
Alternate gene names: NA
Gene position: 953189-954520 (Clockwise)
Preceding gene: 148652599
Following gene: 148652611
Centisome position: 32.0
GC content: 45.5
Gene sequence:
>1332_bases ATGTTCTCTTCTATTTGGCAAGTCTTAACCGCACATCCTGAATTTTTAGCGATGCTCACTATCCCGTTTGTGACGGCATT TGTGACTTGGGCGCATGTTTGGATGGCATTAAAAATGCTGTTTTATCCCATTAAGTTTTGGGGGATAAAAATTCCTAACC TACCGTTTGGCTGGCAGGGTATTGGCTGGCAGGGTATTGTGCCGCGTAAGGCAGGTAAAATCTCAGGGGTCATTGTTGAT CAGACCTTATCTAAGCTTGGCTCACTTGATGAATTCTTTAAGGCGATGGAGCCTGAAGAGATGGCTGACTTTATTACTAA AACAGTCGATGCCAATCTTGAGCATCTTATTGATGAGATTATGAATGAGCGCTCTGCCTCTTTGTGGAGCAATTTGCCGT ATGCATTAAAGCGCCGCATCTACGCGCATGCCCATGAGCAGCTTCCCATTATCATGCGTGAGCTTGTGGTAGACTTAACC CACAACGTAGAAGACTTGGTAGATATGCGCCAAATGATTGTGCGCACTATGGAAAATGACCGCCGTTTGATGGTCAATAT GTTTTTGAAGGTGGGCCAAAAAGAGATTAACTTTATTTGGCATATTAGTGCGCTTATAGGCTTTGTGTTTGGTATCGTGC AGATGTTTATTTATCTGTTGGTGCCACAGCACTGGACAGTGCCATTTTTTGCTGCCATCTGGGGCTTTTTGACTAACTGG ATTGCCATTTGGATGGTGTTTAATCCAGTAGAGCCGGTACCGGTTAAGTATTTAAGACTGTTTAAAAAGGTCAAAGGCTT TCCTTTTGTGGTGCCAGTTATCCCTCGTATGGACACCTATTATTGGCAAGGTGGTTTTATGAAGCGTCAGCCTGAGGTGT CGGAGGTGTTCGCCGGCATCGTGGTGCAAGAGCTGGTAACCCTTGAGAACATCATGAATGAGATGATGTATGGCTATAAA GCGGCTGAGACCCGCAATCTAATGAAGCGCCATTTATATGGAGTGTTAGAGTCACCTGTGGTCAGCACCACTTTGCGTGT CGGCTTGGGGCGACGAGAGTTTGGTCAGCTCAAAAATACCATTATCGATAAGTCTATTGATGCCACTATGGTGCCTATCC GTGATCCGGGGCTTAATGAAAGCCGTGCTAGCAAGATTTATGGCCTGTTTTGTGAGCGTATTAAAGCGTTAACACCCAGA GAGTTCCAAAACTTGCTGCGTCCCGCCTTTAGAGAGGATGAAACCACATTAATTATCTTGGGTGGGGTGACGGGTTTTTT GGCCGGTTGGCTACACTTAATACTGGTCTTTTTCCCCATCAGTGGCGGTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGGGTGTGTTAGAATTTGGCACACAAAATGACCGATACACGGAAGTGGGTGTTTAACCTAAGTCTATAAAGAACAATAAA GAATAAGTGATATATCCAAC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTATAATTAGACCTATGACCGCTATAAGCTGCATCCTTATGCAGGGCACAAGCTATCTCTGTCTTAAGCGGCGTCTTA GGCAGGTTTTTCGGGTTAAG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 443; Mature: 443
Protein sequence:
>443_residues MFSSIWQVLTAHPEFLAMLTIPFVTAFVTWAHVWMALKMLFYPIKFWGIKIPNLPFGWQGIGWQGIVPRKAGKISGVIVD QTLSKLGSLDEFFKAMEPEEMADFITKTVDANLEHLIDEIMNERSASLWSNLPYALKRRIYAHAHEQLPIIMRELVVDLT HNVEDLVDMRQMIVRTMENDRRLMVNMFLKVGQKEINFIWHISALIGFVFGIVQMFIYLLVPQHWTVPFFAAIWGFLTNW IAIWMVFNPVEPVPVKYLRLFKKVKGFPFVVPVIPRMDTYYWQGGFMKRQPEVSEVFAGIVVQELVTLENIMNEMMYGYK AAETRNLMKRHLYGVLESPVVSTTLRVGLGRREFGQLKNTIIDKSIDATMVPIRDPGLNESRASKIYGLFCERIKALTPR EFQNLLRPAFREDETTLIILGGVTGFLAGWLHLILVFFPISGG
Sequences:
>Translated_443_residues MFSSIWQVLTAHPEFLAMLTIPFVTAFVTWAHVWMALKMLFYPIKFWGIKIPNLPFGWQGIGWQGIVPRKAGKISGVIVD QTLSKLGSLDEFFKAMEPEEMADFITKTVDANLEHLIDEIMNERSASLWSNLPYALKRRIYAHAHEQLPIIMRELVVDLT HNVEDLVDMRQMIVRTMENDRRLMVNMFLKVGQKEINFIWHISALIGFVFGIVQMFIYLLVPQHWTVPFFAAIWGFLTNW IAIWMVFNPVEPVPVKYLRLFKKVKGFPFVVPVIPRMDTYYWQGGFMKRQPEVSEVFAGIVVQELVTLENIMNEMMYGYK AAETRNLMKRHLYGVLESPVVSTTLRVGLGRREFGQLKNTIIDKSIDATMVPIRDPGLNESRASKIYGLFCERIKALTPR EFQNLLRPAFREDETTLIILGGVTGFLAGWLHLILVFFPISGG >Mature_443_residues MFSSIWQVLTAHPEFLAMLTIPFVTAFVTWAHVWMALKMLFYPIKFWGIKIPNLPFGWQGIGWQGIVPRKAGKISGVIVD QTLSKLGSLDEFFKAMEPEEMADFITKTVDANLEHLIDEIMNERSASLWSNLPYALKRRIYAHAHEQLPIIMRELVVDLT HNVEDLVDMRQMIVRTMENDRRLMVNMFLKVGQKEINFIWHISALIGFVFGIVQMFIYLLVPQHWTVPFFAAIWGFLTNW IAIWMVFNPVEPVPVKYLRLFKKVKGFPFVVPVIPRMDTYYWQGGFMKRQPEVSEVFAGIVVQELVTLENIMNEMMYGYK AAETRNLMKRHLYGVLESPVVSTTLRVGLGRREFGQLKNTIIDKSIDATMVPIRDPGLNESRASKIYGLFCERIKALTPR EFQNLLRPAFREDETTLIILGGVTGFLAGWLHLILVFFPISGG
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 51111; Mature: 51111
Theoretical pI: Translated: 9.32; Mature: 9.32
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 5.0 %Met (Translated Protein) 5.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 5.0 %Met (Mature Protein) 5.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFSSIWQVLTAHPEFLAMLTIPFVTAFVTWAHVWMALKMLFYPIKFWGIKIPNLPFGWQG CCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCCC IGWQGIVPRKAGKISGVIVDQTLSKLGSLDEFFKAMEPEEMADFITKTVDANLEHLIDEI CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH MNERSASLWSNLPYALKRRIYAHAHEQLPIIMRELVVDLTHNVEDLVDMRQMIVRTMEND HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC RRLMVNMFLKVGQKEINFIWHISALIGFVFGIVQMFIYLLVPQHWTVPFFAAIWGFLTNW HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH IAIWMVFNPVEPVPVKYLRLFKKVKGFPFVVPVIPRMDTYYWQGGFMKRQPEVSEVFAGI HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHH VVQELVTLENIMNEMMYGYKAAETRNLMKRHLYGVLESPVVSTTLRVGLGRREFGQLKNT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH IIDKSIDATMVPIRDPGLNESRASKIYGLFCERIKALTPREFQNLLRPAFREDETTLIIL HHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE GGVTGFLAGWLHLILVFFPISGG CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MFSSIWQVLTAHPEFLAMLTIPFVTAFVTWAHVWMALKMLFYPIKFWGIKIPNLPFGWQG CCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEECCCCCCCCCC IGWQGIVPRKAGKISGVIVDQTLSKLGSLDEFFKAMEPEEMADFITKTVDANLEHLIDEI CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH MNERSASLWSNLPYALKRRIYAHAHEQLPIIMRELVVDLTHNVEDLVDMRQMIVRTMEND HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC RRLMVNMFLKVGQKEINFIWHISALIGFVFGIVQMFIYLLVPQHWTVPFFAAIWGFLTNW HHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH IAIWMVFNPVEPVPVKYLRLFKKVKGFPFVVPVIPRMDTYYWQGGFMKRQPEVSEVFAGI HHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHH VVQELVTLENIMNEMMYGYKAAETRNLMKRHLYGVLESPVVSTTLRVGLGRREFGQLKNT HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH IIDKSIDATMVPIRDPGLNESRASKIYGLFCERIKALTPREFQNLLRPAFREDETTLIIL HHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEE GGVTGFLAGWLHLILVFFPISGG CCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA