| Definition | Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009441 |
| Length | 6,096,872 |
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The map label for this gene is 146298791
Identifier: 146298791
GI number: 146298791
Start: 1173890
End: 1175086
Strand: Direct
Name: 146298791
Synonym: Fjoh_1030
Alternate gene names: NA
Gene position: 1173890-1175086 (Clockwise)
Preceding gene: 146298790
Following gene: 146298796
Centisome position: 19.25
GC content: 27.65
Gene sequence:
>1197_bases ATGAAAAACATTTTATTACTTAAATTAAATAATGAAAGACTAAGAGAGATTTTATTTTTTTTAGGAGTCTTATTATTGAT AATAATTCCAAAAGGAGGATTTAAGATTGCCGGAATTCCTTTGACATGGGGATATTTATATCTGGGTTTTTTATTAATTC TTTCGACAATTATTATAGTCAGCAAATATAAATTCCCGGTTAACAGCCGGCATTTTATGTGCTATGTGGCAACTTTACCA TTTGTGGTATATTTTTCACTTCATTTATTAATATTTGGATACGAAGGTTCAACGGGTAATTTTATTGCTTTCTACATCAG CTTTGTTTTCCTGCCTTTTTTATTTTATATTATTTTAGGATATTTTCTAACTAAAATAAATCATGATTATATTGAAAAAA TAATAGCTAATGCTGTTTTTCTAATCTCTGTTTATGGTATTTTCTTGTTTTCATACAAACAGATTTATGGTCATTTTTTA GAAATTCCCTATATAACGGTTAATGCTGATGATTTGGGAGAGCTGGCAAGATCTAAATTTAATCAAAGAGGTTCTATTGC TAAATTAATCTCAACGTATAATAATGGAAATATTTTTGGAGTATGTACTTTAATGCTTTTTCCTGTTTTTTATAAAAAAA CAACATCAAAAATTAAAATTTTCATTGTTATCCTGGCTTTACTATTAACCTTATCAAGAACAGTTTGGATTGGTTTACTT TTCTTCTTTTTAATTCTTTATAGGAATAAATTATATCAATTAGCTAAAATTTATCTTGCAGGAGCGATTTTACTTTTTGT TATTGGATCAGTTCTTATGACCAGATATTTTCAATATGGTTCCCTGGAAGGATTTATTCTAGACTCAAATCTTGGCGGAA GGATTTTACAAATTAGAAAAGTAAATGATATCACACTTTTTGGAAATGGCCCTTATACGATAATTGATGAAATTGTGTAC TTATCTATATTTAGACAATTTGGTATTGTTGGTTTATTTTTATTTTGCGTTTCTTTTTTTGCTCCGGTATATATTTTTTT ACAAACTAAAAATAACAACCAGGTTTACTTATTAGGAATATTAACGTATTTATTTGTTTGTTTAAGCGACGGATGTATGC TTTTAATACCTACACTAGTTTTTTTCTATTTCATTTGTACGATGGCCTTCATTCGTCACAACAGAGCCGAGGAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTGCTTTTATTAGTATAGTATTTTTAAAAAGATTTTATAAAAAACAACAGGCATTACAAGCCTAATTATTATCGTAGGC AGTCATTTCTTATTTTTAAG
Downstream 100 bases:
>100_bases AACATCGCAGAGAAGAAAAATGTAAATTCCGTATTGACGAACCAGAATATTTTCGGTCAAAAAAGAAAAAGAAAACAACA GAGAAATCGAAAAATATAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 398; Mature: 398
Protein sequence:
>398_residues MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIVSKYKFPVNSRHFMCYVATLP FVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILGYFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFL EIPYITVNADDLGELARSKFNQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRKVNDITLFGNGPYTIIDEIVY LSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGILTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE
Sequences:
>Translated_398_residues MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIVSKYKFPVNSRHFMCYVATLP FVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILGYFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFL EIPYITVNADDLGELARSKFNQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRKVNDITLFGNGPYTIIDEIVY LSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGILTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE >Mature_398_residues MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIVSKYKFPVNSRHFMCYVATLP FVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILGYFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFL EIPYITVNADDLGELARSKFNQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRKVNDITLFGNGPYTIIDEIVY LSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGILTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 45894; Mature: 45894
Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 3.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIV CCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKYKFPVNSRHFMCYVATLPFVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILG HHCCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFLEIPYITVNADDLGELARSKF HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHH NQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL CCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEE VNDITLFGNGPYTIIDEIVYLSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGI ECEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEHHH LTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIV CCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SKYKFPVNSRHFMCYVATLPFVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILG HHCCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFLEIPYITVNADDLGELARSKF HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHH NQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL CCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEE VNDITLFGNGPYTIIDEIVYLSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGI ECEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEHHH LTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA