| Definition | Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009089 |
| Length | 4,290,252 |
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The map label for this gene is mleN [H]
Identifier: 126700349
GI number: 126700349
Start: 3170622
End: 3172064
Strand: Direct
Name: mleN [H]
Synonym: CD2734
Alternate gene names: 126700349
Gene position: 3170622-3172064 (Clockwise)
Preceding gene: 126700348
Following gene: 126700351
Centisome position: 73.9
GC content: 32.02
Gene sequence:
>1443_bases ATGAAAATGAATACAGAAAGAAAAATACCTTCATTTAGATATTCCTTGTTAGTAATGCTTGCAATAATAGCTCTAACATC AGTTGGTATAGTTGTATTTAATGCTTCTATAACTACAATGTTTTTACTTTCATGGCTTATAGTAGTTCCTGCAGCCATGA AACTTGGTTATACTAATGATGAAATAGAAGCTTTTGGATTTGAAGTTGGCAAAGATGCCTTTCAATCAAACTTAATTATA CTTTCTGTTGGTGTACTAATAGCAGCTTGGATAGCTGCTGGTACAATACCAACAGTAGTATATAGTGGACTAACAATAAT AACCCCTAAATATTTTCTGCTTACAACATTAATCGTATGTTCATTAACTTCTGTTGCTACTGGTACATCTTGGGGGACTC TTGGAACTTCTGGTATAGCAATGATGAGTATTGGTACTAGTATGGGTATTCCTCTTGGTTTAACAGCTGGTGCAGTCATT TCTGGTGCTTTCTTTGGAGATAAGATGTCACCTCTATCAGATTCTACAAACTTAGCTGCAGCAGTTTGTAAGACAGATGT AATTACACATATGAAGCATATGTTTTATACCACAGGACCTGCATACGTAATATGTATAGTTCTGTATACAGTAATTGGAT TTAAGTATTCAAATAATACTATAGACTATGTTCAAATAAATCAAATCAAGGATGTATTAAATTCAAACTTTCATATTGGT TTAGTAGCAATGATTCCAATAATATTTTTATTATTACTTTTATTGCTACAAAAGCCACCCATTATATCTATACTAAGTTC AGCTATCATGGGACTTATTATAGCAGTATTTCAAGAAGGAGAAAAAATAGGTGATGTTTTAAATTACATGCTATCAGGAT TTACTATAGATACTGGATTTGTCTATGCCGACAAACTATTAAATCGTGGTGGAATAATGAGTATGGCTGAAACCGTTTTA CTAGTATTTGTAGTTTTCGTTATTGCTGGTATTCTCCAAAAAACTGGATTCTTAGAAGTACTGCTTCAACCTCTTATAAC TAAAATAGGAAAATCAAGAACTAAATTGGTTGGGTCTACTTTTATAGTAAGCTACTTTGCAAATGCATTTAGTTCATCAA TGATGTTCACTTCTGTATTTGTCGGAACTCTAATGTCTCCAATATACAAAGAATTTAAATTAAAACCACAAAATCTATCT AGAATTATAGAAGATACAGCTACACTTGGTGGTCCATTAATACCATGGAATTCAAATGCTGTTTTCTGTGCTCAGACTCT TGGTGTAAGTCCACTAGAATTTATTCCATATTGTTTCTTAAGTTGGATTACACCTATAATTTCATTTATTTATGGTGTAA CTGGTTTTACTATGCTTACATACACAGATGATGAAATTGAAGAGTTAGAAATATTTGATACTGCTCAGAGAAGAGTTGAT TGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCAAAGAATAAACTTAGCTTGTCCAAGAAGTATGCTTGAAGAAGCTCTTATAAGAATAAAAAATGCAATTAACTAAAAAT ATTTAAGGAGAATTTGCACT
Downstream 100 bases:
>100_bases ATATGAAATTTGAATACTATTACTTAATTCAGGATATTGCAGGTATATTATTGGCATTTATAGGACTTAGAATGTCTATT ATTGGATTTAGGATACTTTC
Product: malate-2H(+)/Na(+)-lactate antiporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 480
Protein sequence:
>480_residues MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTNDEIEAFGFEVGKDAFQSNLII LSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVCSLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVI SGAFFGDKMSPLSDSTNLAAAVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGFVYADKLLNRGGIMSMAETVL LVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGSTFIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLS RIIEDTATLGGPLIPWNSNAVFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD
Sequences:
>Translated_480_residues MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTNDEIEAFGFEVGKDAFQSNLII LSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVCSLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVI SGAFFGDKMSPLSDSTNLAAAVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGFVYADKLLNRGGIMSMAETVL LVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGSTFIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLS RIIEDTATLGGPLIPWNSNAVFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD >Mature_480_residues MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTNDEIEAFGFEVGKDAFQSNLII LSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVCSLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVI SGAFFGDKMSPLSDSTNLAAAVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGFVYADKLLNRGGIMSMAETVL LVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGSTFIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLS RIIEDTATLGGPLIPWNSNAVFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD
Specific function: Couples proton uptake and Na(+) efflux to the substrate- product malate/lactate antiport, in an electroneutral malate- 2H(+)/Na(+)-lactate exchange. Plays a role in supporting growth to high density on malate at reduced protonmotive force [H]
COG id: COG1757
COG function: function code C; Na+/H+ antiporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the nhaC Na(+)/H(+) antiporter family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004770 - InterPro: IPR018461 [H]
Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 52205; Mature: 52205
Theoretical pI: Translated: 5.79; Mature: 5.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 4.2 %Met (Translated Protein) 5.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 4.2 %Met (Mature Protein) 5.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTND CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC EIEAFGFEVGKDAFQSNLIILSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVC HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHH SLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVISGAFFGDKMSPLSDSTNLAA HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH AVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCEEECCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCH LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEECHH VYADKLLNRGGIMSMAETVLLVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGST HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH FIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLSRIIEDTATLGGPLIPWNSNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC VFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD EEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTND CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC EIEAFGFEVGKDAFQSNLIILSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVC HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHH SLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVISGAFFGDKMSPLSDSTNLAA HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH AVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCEEECCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCH LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGF HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEECHH VYADKLLNRGGIMSMAETVLLVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGST HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH FIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLSRIIEDTATLGGPLIPWNSNA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC VFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD EEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9384377; 10903309 [H]