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The map label for this gene is 126176526

Identifier: 126176526

GI number: 126176526

Start: 5082674

End: 5085436

Strand: Reverse

Name: 126176526

Synonym: Sbal_4345

Alternate gene names: NA

Gene position: 5085436-5082674 (Counterclockwise)

Preceding gene: 126176527

Following gene: 126176523

Centisome position: 99.18

GC content: 42.16

Gene sequence:

>2763_bases
ATGGCGATGACAGAAGATACTCTGGTTCAACAAGTAACAGCCGATTACTTATTAAATGAATTACAGTGGGATGCCTCTGT
CATGGGCATGTATGAGCGTTTAGGCAAAGAAGGGGACTTTGGGCGAGAGTCCGAGAAGGACGTTATTCTTACCCGATACT
TAGGTGAGAAGCTGATAGCGTTGAACCCCGGTTTGCCTGAAGTTGTCTACCAAGAGGCACTTCGTCTTGTCTGCGAAATG
CCGTCTTCAACCAATATTCTTGCTGTTAATAAAGAAAAATATTCGTTGCACAAAAATGGGGTGGAAGTCAGCTACCTCAA
TGATAAAGGTGATCGGGTAAAGAAGCGTCTTCGTCTTTTCGATTTTGATAATTATGAAAACAATCACTTTTTATTAGTGC
GTGAGTTTTGGGTAAAGGGTGACATTTATCGTCGCAGAGCTGATTTGGTTGGATTTGTGAATGGAATTCCGCTGCTGTTT
ATGGAAGTGAAAAACGTTCACAAGGATATTAGGGCTGCCTACGAACAAAACCTCGCCGATTACAAAGACACTATTCCGCA
TCTGTTTTATCACAATGCTTTTATCATTTTGGGAAATGGCATTGACGCCAAGATTGGATCTGTCTCCAGCAAATTTGAGC
ATTTTAATGACTGGAAGCGATTAAAAGAGAATGAGCTTGGTGTTGTGGATATGGAAACCTTGCTGAAAGGAACCTGCTCC
AAAACCAATCTAATGGATATCTTTGAAAATTTTACCTTGTTCGACCAAAGTTCTGGACGGCTAGTGAAAATTGTTGCGCG
TAATCATCAGTATCTTGGTGTCGGTCGAGCAATAGATGCTGTTATCAATCGTGGTGAACGCTTGGGTAAATTGGGTGTGT
TTTGGCATACCCAAGGTTCAGGGAAATCTTATTCAATCGTATTTTTTGCGCAGATGGTGCATCGAAAGTTGGGGGGGAAT
TATACCTTTGTAGTGCTGACTGATCGGGAAGATCTCGATACGCAGATTTATAAAACTTTCGCAGGAAGTGGAGTCGTCGA
CAATGATAAAGACCCATGCCGTGCCGATAGTGGTAAAACCCTTAAAGAACTAATAGGCCAGCAGAAAGCTTTTGTTTTCA
CCTTGATTCAAAAATTTAATGAAAAGGTAGATCCTTTAAAGCCTTATTCTGAACGCGATGACATTATTGTTATTACCGAC
GAGGCTCACCGTACACAGTACGGAACTTTGTCTCTAAATATGCGTAATGCTCTGCCTAATGCCAGCTTTATCGGCTTTAC
AGGCACTCCATTATTCAAAGATGACGAGATAACCAAGAAGGTATTCGGTGATTATGTTTCCACCTATGATTTTCAACGTG
CAGTTGAAGATAAAGCAACGGTACCTTTGTATTACGATGCTCGTGGCGAAGAATTAATATTTACTGATGAGGATGGTAAC
GAGCATACAGTCGCTGACCCCAAAGGAATTAATGAGCGCATAGCAGAAAAACTTGAAGAGCTAGAAATTGATGATGTGGA
TGTACAACAACGGTTAGAGCGTGAGCTTAAACGCGACTACCACATCATTACTTCAACCAGTAGGCTTGATCAGATTGCTC
AAGATTTTGTTGCCCATTATGCCAATGGTTGGGAAACGGGCAAGGCCATGTTTGTTTGCCTTGATAAAATCACCTGTGTA
CGAATGCACAAACTGATAGGTTTTTATTGGCAGCAAGAAGTTAAAGCAAAAGAGAGAGAGCTTTCATCGGCCGCTGATGA
GCAAGATTTAGCTTGGCGAGAACGACAATTGGCGTGGATGAAAGAAACGCTTATGGCCGTTGTGGTTAGTGAGGAACAAG
GCGAGGTTGCGAAGTTTGAAAAGTGGGACTTGGATATTAGGCCGTATCGCCTGCTCATTAAAACTGGTTTTGAGTTACAG
GATGGTTCGCGTTTGGATATGGAAGAGGCGTTTAAGTCTAGCGAACACCCTTTCAGGGTAGCGATTGTTTGTGCCATGTG
GTTAACGGGCTTTGATGTACCAACACTCTCCACTCTGTATTTAGACAAACCCCTTAAGGCGCATACTTTAATGCAGGCCA
TTGCTAGGGCAAATCGTGTGGCGGAAGGCAAAAATAATGGACTGATTGTCGATTACAGCGGCATACTCAAAAATCTACGT
AAAGCGCTGGCAACATTTGCTGGTGCGGGTGACGAAGGCCATGGTGGTGAGGAAGGTGAAAGTGAACCCGCTAAGCCCAA
TGAGGAACTTTTAGAAAGCCTGAATGAGTCGATTAGTTTTGCCGCTGAGTTTTTACGAAAGCACGATTTTGAATTGAGTC
GAATTATCACCGAAACTGGATTTGCCAAGAACTCGGCGATTGCACAGGCCAAAGAAGTCATCAATATAAATGATGAAACC
AGAAAACGATTTGAGGTGATCGCCAGAGAGGTATTTAACAAATTCAAGGCTTGTATTAACGTGCCGGGTATTAATAAATA
TCGTGATCTGCGTGATGCTATTAATGTGCTCTATAAGAGTTTGCAGGCCGATAAAGAGAAAGCTGATATTTCCGATATCA
TGAAAGAGTTGTATGAAATCGTTGACGGTAGTATAGACACTACATATAAAATCAAAGAGCCAAAACCGGATAACGAGCGA
ATTTACGATATCAGTAAGATCGATTTTGAACGTTTGCGTCAGGAGTTTGCAAAATCAGAGCGAAAAAACACAACTGTGCA
GTCTCTGAAGCATGCTGTTGAGAATAAACTTGCTCGCTTATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAATGAGTGGTTGAAACGCGCTGAGGAAGACGGTTTAGTGAATAAGCTTAATCGGCCCGTACGTTATCAATTCGAAAACA
AAAAATAAAAGGATTTAGCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CGCGTCAATTAGCTTGGCCGATCCAGCGACAATTAACTTGGCCGGTTGAGACTCGGTTTAATTTAGTTTGTTTTGGGCTT
CTTTTCGCCTGTAGCTTTCT

Product: HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 920; Mature: 919

Protein sequence:

>920_residues
MAMTEDTLVQQVTADYLLNELQWDASVMGMYERLGKEGDFGRESEKDVILTRYLGEKLIALNPGLPEVVYQEALRLVCEM
PSSTNILAVNKEKYSLHKNGVEVSYLNDKGDRVKKRLRLFDFDNYENNHFLLVREFWVKGDIYRRRADLVGFVNGIPLLF
MEVKNVHKDIRAAYEQNLADYKDTIPHLFYHNAFIILGNGIDAKIGSVSSKFEHFNDWKRLKENELGVVDMETLLKGTCS
KTNLMDIFENFTLFDQSSGRLVKIVARNHQYLGVGRAIDAVINRGERLGKLGVFWHTQGSGKSYSIVFFAQMVHRKLGGN
YTFVVLTDREDLDTQIYKTFAGSGVVDNDKDPCRADSGKTLKELIGQQKAFVFTLIQKFNEKVDPLKPYSERDDIIVITD
EAHRTQYGTLSLNMRNALPNASFIGFTGTPLFKDDEITKKVFGDYVSTYDFQRAVEDKATVPLYYDARGEELIFTDEDGN
EHTVADPKGINERIAEKLEELEIDDVDVQQRLERELKRDYHIITSTSRLDQIAQDFVAHYANGWETGKAMFVCLDKITCV
RMHKLIGFYWQQEVKAKERELSSAADEQDLAWRERQLAWMKETLMAVVVSEEQGEVAKFEKWDLDIRPYRLLIKTGFELQ
DGSRLDMEEAFKSSEHPFRVAIVCAMWLTGFDVPTLSTLYLDKPLKAHTLMQAIARANRVAEGKNNGLIVDYSGILKNLR
KALATFAGAGDEGHGGEEGESEPAKPNEELLESLNESISFAAEFLRKHDFELSRIITETGFAKNSAIAQAKEVININDET
RKRFEVIAREVFNKFKACINVPGINKYRDLRDAINVLYKSLQADKEKADISDIMKELYEIVDGSIDTTYKIKEPKPDNER
IYDISKIDFERLRQEFAKSERKNTTVQSLKHAVENKLARL

Sequences:

>Translated_920_residues
MAMTEDTLVQQVTADYLLNELQWDASVMGMYERLGKEGDFGRESEKDVILTRYLGEKLIALNPGLPEVVYQEALRLVCEM
PSSTNILAVNKEKYSLHKNGVEVSYLNDKGDRVKKRLRLFDFDNYENNHFLLVREFWVKGDIYRRRADLVGFVNGIPLLF
MEVKNVHKDIRAAYEQNLADYKDTIPHLFYHNAFIILGNGIDAKIGSVSSKFEHFNDWKRLKENELGVVDMETLLKGTCS
KTNLMDIFENFTLFDQSSGRLVKIVARNHQYLGVGRAIDAVINRGERLGKLGVFWHTQGSGKSYSIVFFAQMVHRKLGGN
YTFVVLTDREDLDTQIYKTFAGSGVVDNDKDPCRADSGKTLKELIGQQKAFVFTLIQKFNEKVDPLKPYSERDDIIVITD
EAHRTQYGTLSLNMRNALPNASFIGFTGTPLFKDDEITKKVFGDYVSTYDFQRAVEDKATVPLYYDARGEELIFTDEDGN
EHTVADPKGINERIAEKLEELEIDDVDVQQRLERELKRDYHIITSTSRLDQIAQDFVAHYANGWETGKAMFVCLDKITCV
RMHKLIGFYWQQEVKAKERELSSAADEQDLAWRERQLAWMKETLMAVVVSEEQGEVAKFEKWDLDIRPYRLLIKTGFELQ
DGSRLDMEEAFKSSEHPFRVAIVCAMWLTGFDVPTLSTLYLDKPLKAHTLMQAIARANRVAEGKNNGLIVDYSGILKNLR
KALATFAGAGDEGHGGEEGESEPAKPNEELLESLNESISFAAEFLRKHDFELSRIITETGFAKNSAIAQAKEVININDET
RKRFEVIAREVFNKFKACINVPGINKYRDLRDAINVLYKSLQADKEKADISDIMKELYEIVDGSIDTTYKIKEPKPDNER
IYDISKIDFERLRQEFAKSERKNTTVQSLKHAVENKLARL
>Mature_919_residues
AMTEDTLVQQVTADYLLNELQWDASVMGMYERLGKEGDFGRESEKDVILTRYLGEKLIALNPGLPEVVYQEALRLVCEMP
SSTNILAVNKEKYSLHKNGVEVSYLNDKGDRVKKRLRLFDFDNYENNHFLLVREFWVKGDIYRRRADLVGFVNGIPLLFM
EVKNVHKDIRAAYEQNLADYKDTIPHLFYHNAFIILGNGIDAKIGSVSSKFEHFNDWKRLKENELGVVDMETLLKGTCSK
TNLMDIFENFTLFDQSSGRLVKIVARNHQYLGVGRAIDAVINRGERLGKLGVFWHTQGSGKSYSIVFFAQMVHRKLGGNY
TFVVLTDREDLDTQIYKTFAGSGVVDNDKDPCRADSGKTLKELIGQQKAFVFTLIQKFNEKVDPLKPYSERDDIIVITDE
AHRTQYGTLSLNMRNALPNASFIGFTGTPLFKDDEITKKVFGDYVSTYDFQRAVEDKATVPLYYDARGEELIFTDEDGNE
HTVADPKGINERIAEKLEELEIDDVDVQQRLERELKRDYHIITSTSRLDQIAQDFVAHYANGWETGKAMFVCLDKITCVR
MHKLIGFYWQQEVKAKERELSSAADEQDLAWRERQLAWMKETLMAVVVSEEQGEVAKFEKWDLDIRPYRLLIKTGFELQD
GSRLDMEEAFKSSEHPFRVAIVCAMWLTGFDVPTLSTLYLDKPLKAHTLMQAIARANRVAEGKNNGLIVDYSGILKNLRK
ALATFAGAGDEGHGGEEGESEPAKPNEELLESLNESISFAAEFLRKHDFELSRIITETGFAKNSAIAQAKEVININDETR
KRFEVIAREVFNKFKACINVPGINKYRDLRDAINVLYKSLQADKEKADISDIMKELYEIVDGSIDTTYKIKEPKPDNERI
YDISKIDFERLRQEFAKSERKNTTVQSLKHAVENKLARL

Specific function: Subunit R is required for both nuclease and ATPase activities, but not for modification [H]

COG id: COG0610

COG function: function code V; Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 helicase ATP-binding domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR014001
- InterPro:   IPR021810
- InterPro:   IPR014021
- InterPro:   IPR004473
- InterPro:   IPR006935
- InterPro:   IPR007409 [H]

Pfam domain/function: PF11867 DUF3387; PF04313 HSDR_N; PF04851 ResIII [H]

EC number: =3.1.21.3 [H]

Molecular weight: Translated: 105321; Mature: 105190

Theoretical pI: Translated: 5.44; Mature: 5.44

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAMTEDTLVQQVTADYLLNELQWDASVMGMYERLGKEGDFGRESEKDVILTRYLGEKLIA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHCCEEEE
LNPGLPEVVYQEALRLVCEMPSSTNILAVNKEKYSLHKNGVEVSYLNDKGDRVKKRLRLF
ECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHH
DFDNYENNHFLLVREFWVKGDIYRRRADLVGFVNGIPLLFMEVKNVHKDIRAAYEQNLAD
CCCCCCCCEEEEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKDTIPHLFYHNAFIILGNGIDAKIGSVSSKFEHFNDWKRLKENELGVVDMETLLKGTCS
HHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHCCCC
KTNLMDIFENFTLFDQSSGRLVKIVARNHQYLGVGRAIDAVINRGERLGKLGVFWHTQGS
CCHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHCCHHHCCEEEEEEECCC
GKSYSIVFFAQMVHRKLGGNYTFVVLTDREDLDTQIYKTFAGSGVVDNDKDPCRADSGKT
CCEEEHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH
LKELIGQQKAFVFTLIQKFNEKVDPLKPYSERDDIIVITDEAHRTQYGTLSLNMRNALPN
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEEHHHCCCC
ASFIGFTGTPLFKDDEITKKVFGDYVSTYDFQRAVEDKATVPLYYDARGEELIFTDEDGN
CCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCC
EHTVADPKGINERIAEKLEELEIDDVDVQQRLERELKRDYHIITSTSRLDQIAQDFVAHY
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
ANGWETGKAMFVCLDKITCVRMHKLIGFYWQQEVKAKERELSSAADEQDLAWRERQLAWM
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
KETLMAVVVSEEQGEVAKFEKWDLDIRPYRLLIKTGFELQDGSRLDMEEAFKSSEHPFRV
HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHCCCCCCHHEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHH
AIVCAMWLTGFDVPTLSTLYLDKPLKAHTLMQAIARANRVAEGKNNGLIVDYSGILKNLR
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
KALATFAGAGDEGHGGEEGESEPAKPNEELLESLNESISFAAEFLRKHDFELSRIITETG
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
FAKNSAIAQAKEVININDETRKRFEVIAREVFNKFKACINVPGINKYRDLRDAINVLYKS
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LQADKEKADISDIMKELYEIVDGSIDTTYKIKEPKPDNERIYDISKIDFERLRQEFAKSE
HHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKNTTVQSLKHAVENKLARL
HCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
AMTEDTLVQQVTADYLLNELQWDASVMGMYERLGKEGDFGRESEKDVILTRYLGEKLIA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHCCEEEE
LNPGLPEVVYQEALRLVCEMPSSTNILAVNKEKYSLHKNGVEVSYLNDKGDRVKKRLRLF
ECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHH
DFDNYENNHFLLVREFWVKGDIYRRRADLVGFVNGIPLLFMEVKNVHKDIRAAYEQNLAD
CCCCCCCCEEEEEEEEHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKDTIPHLFYHNAFIILGNGIDAKIGSVSSKFEHFNDWKRLKENELGVVDMETLLKGTCS
HHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHCCCC
KTNLMDIFENFTLFDQSSGRLVKIVARNHQYLGVGRAIDAVINRGERLGKLGVFWHTQGS
CCHHHHHHHCCEEEECCCCCEEEEEECCCCEEEHHHHHHHHHHCCHHHCCEEEEEEECCC
GKSYSIVFFAQMVHRKLGGNYTFVVLTDREDLDTQIYKTFAGSGVVDNDKDPCRADSGKT
CCEEEHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH
LKELIGQQKAFVFTLIQKFNEKVDPLKPYSERDDIIVITDEAHRTQYGTLSLNMRNALPN
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEEEHHHCCCC
ASFIGFTGTPLFKDDEITKKVFGDYVSTYDFQRAVEDKATVPLYYDARGEELIFTDEDGN
CCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCC
EHTVADPKGINERIAEKLEELEIDDVDVQQRLERELKRDYHIITSTSRLDQIAQDFVAHY
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHH
ANGWETGKAMFVCLDKITCVRMHKLIGFYWQQEVKAKERELSSAADEQDLAWRERQLAWM
CCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHH
KETLMAVVVSEEQGEVAKFEKWDLDIRPYRLLIKTGFELQDGSRLDMEEAFKSSEHPFRV
HHHHHHHEEECCCCCCHHHHHCCCCCCHHEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCHH
AIVCAMWLTGFDVPTLSTLYLDKPLKAHTLMQAIARANRVAEGKNNGLIVDYSGILKNLR
HHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHH
KALATFAGAGDEGHGGEEGESEPAKPNEELLESLNESISFAAEFLRKHDFELSRIITETG
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCC
FAKNSAIAQAKEVININDETRKRFEVIAREVFNKFKACINVPGINKYRDLRDAINVLYKS
CCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LQADKEKADISDIMKELYEIVDGSIDTTYKIKEPKPDNERIYDISKIDFERLRQEFAKSE
HHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKNTTVQSLKHAVENKLARL
HCCHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]