Definition Prochlorococcus marinus str. MIT 9515, complete genome.
Accession NC_008817
Length 1,704,176

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The map label for this gene is 123966806

Identifier: 123966806

GI number: 123966806

Start: 1385528

End: 1387273

Strand: Reverse

Name: 123966806

Synonym: P9515_15731

Alternate gene names: NA

Gene position: 1387273-1385528 (Counterclockwise)

Preceding gene: 123966810

Following gene: 123966805

Centisome position: 81.4

GC content: 24.34

Gene sequence:

>1746_bases
TTGACGCAATTTTATAAATTGTTTATTTTGACTAAATTAAAAAATTTTTTGAGCGATAAAGAAAAAATAATTACCTCATT
ATTTATTTTTTTAGTTTTGATATCTCATTCAATTATCTCCTTGTTTCATTTTCACGAATGTGACTCAAGTGATGTTTATA
AATACTTAACTGATTCTTCATTATTTTCAAAAGGCCATTTTATTGGTCATATATGGAAAACAGGCTTTATTTTTGCTCCT
CTTAGAATTGTGTTTGCTTTAACAGTCTCAATTATTCCATTTGATTTTATAAGTTCCTTAATATTATTACCTTTAAAAAT
GACATATCCTCCTCTAGAGGGTTTTATTTATGGACTATATTTACCTGATCGATTTGGGTCGTTTTATGAATACGCTTCAT
TTATAAATATAGTTTTTTTTATTTCAGTAATACTACTTTTCTATCAATCTCTTAAATTTGTTGGCGTATCAAAATACATA
TCATTTCTTTGTTCGTTTGGTATTCTAAGTTTTTATTCTATAAATTCATATACCTATCATTTAGGAAGTACTATTTGGTT
TATTTCAGGTTCGTTAATATCTATTTCTTCAACAATATTTTTTCGTAATAAGGCTTCAAAATATGGATTTAGTCTTGCTT
TAATAACTAGTTATCCTTCAATCGTTCACTTTTTTGCTCATAATATTTATCTTTATATTAAGAGGATTTTTACAAAAAAA
TTAAGGGCAAACAATAAGAATAAAAACATATTAATTGATAAATTTATTTTGATAATTAATTCGAATAAAATAGGCTTTCT
AACATTGTTATTTATAATCTTATTGTTTTTTCCTTTTAATAGCGGTAATAGAATTGATTTTGACTTTAGAGGTTTTTTGA
CCCCATTTGCTTTTTTTCCTCAGTATTCAAAAATTAGCATTCTTACAATTTTTACCTCAATCTCATTGTTTGTTATATCT
TTCTACACCATATATAAAAGATTTTTAAATGAGATAAAGATTTCGATTCCATATAAAAACTCTAAATCATTAAATTTTGC
TATTGATATTTCAATAATTAATTTAATTTTTATAACTCTCTTAATAAGTATTGGGCAGTTATCTTTTGGCTTAACAAGAC
ATTCACTATTTATAGCACCATATATTTTGTTCTTGGTTGCAGTTGGTTTACAGTTGATATATTTGGAGTTCAAAAAAAAA
TTTTTTAAAGCATTTCTAATTAAAAAAATATTAAGCATTTCATTACTTACATTTTTAATGATCTTGTCAACTTATTCTTC
TTATTTACGTTTTGATCCGCTTAAAACTAACGAAATTCCATTGAATATTAGAGAATTTGTTGCCAAAAATAATACTAATA
CAATGTCTTTAGTTGATTGTGATACTCATTATTTATATAACGATTTTTCAGAGATAAGGGCTACATATAATAAAAAAGAT
CCTCAAACATATGTTCCATTAGATTTTATTGGAACAAGATTATTAGTTACCCAAAGTATCAGAGAAATAGAAAATTTTTC
ATTCGATTTAAAAAAAGGCGATGAGCTAATAACTAAATATAAAAATGTAAAAATTACGCTTGTTGACGAACCTTACTTTA
AAGAAAGTAATATATTCTTTGATTCTATGAATTTCGATAAGAATTCTTCACTATATGCAAAAAGGGATAATCTCTTTAGT
AGATCTAATAGTATATATATTTTTCCAATAAAAGTAGTTCCTTCTAGTCTAGAATTATTATCTTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCATAAAAAATAATAAGCTACATAATCAATATTTTAGGACGATTATCAATCAATTTAAAATATTTTGATAACTTCGATAT
TTAAGTTATTTTTATATTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GAAATTTAAAACTGCACTATAAGATGTCTGCAATTTTAAGAAAAATTCCTCTTATAGATAAGTGGATAATATCGAAATTA
ATACCAATATTATTTTTTGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 581; Mature: 580

Protein sequence:

>581_residues
MTQFYKLFILTKLKNFLSDKEKIITSLFIFLVLISHSIISLFHFHECDSSDVYKYLTDSSLFSKGHFIGHIWKTGFIFAP
LRIVFALTVSIIPFDFISSLILLPLKMTYPPLEGFIYGLYLPDRFGSFYEYASFINIVFFISVILLFYQSLKFVGVSKYI
SFLCSFGILSFYSINSYTYHLGSTIWFISGSLISISSTIFFRNKASKYGFSLALITSYPSIVHFFAHNIYLYIKRIFTKK
LRANNKNKNILIDKFILIINSNKIGFLTLLFIILLFFPFNSGNRIDFDFRGFLTPFAFFPQYSKISILTIFTSISLFVIS
FYTIYKRFLNEIKISIPYKNSKSLNFAIDISIINLIFITLLISIGQLSFGLTRHSLFIAPYILFLVAVGLQLIYLEFKKK
FFKAFLIKKILSISLLTFLMILSTYSSYLRFDPLKTNEIPLNIREFVAKNNTNTMSLVDCDTHYLYNDFSEIRATYNKKD
PQTYVPLDFIGTRLLVTQSIREIENFSFDLKKGDELITKYKNVKITLVDEPYFKESNIFFDSMNFDKNSSLYAKRDNLFS
RSNSIYIFPIKVVPSSLELLS

Sequences:

>Translated_581_residues
MTQFYKLFILTKLKNFLSDKEKIITSLFIFLVLISHSIISLFHFHECDSSDVYKYLTDSSLFSKGHFIGHIWKTGFIFAP
LRIVFALTVSIIPFDFISSLILLPLKMTYPPLEGFIYGLYLPDRFGSFYEYASFINIVFFISVILLFYQSLKFVGVSKYI
SFLCSFGILSFYSINSYTYHLGSTIWFISGSLISISSTIFFRNKASKYGFSLALITSYPSIVHFFAHNIYLYIKRIFTKK
LRANNKNKNILIDKFILIINSNKIGFLTLLFIILLFFPFNSGNRIDFDFRGFLTPFAFFPQYSKISILTIFTSISLFVIS
FYTIYKRFLNEIKISIPYKNSKSLNFAIDISIINLIFITLLISIGQLSFGLTRHSLFIAPYILFLVAVGLQLIYLEFKKK
FFKAFLIKKILSISLLTFLMILSTYSSYLRFDPLKTNEIPLNIREFVAKNNTNTMSLVDCDTHYLYNDFSEIRATYNKKD
PQTYVPLDFIGTRLLVTQSIREIENFSFDLKKGDELITKYKNVKITLVDEPYFKESNIFFDSMNFDKNSSLYAKRDNLFS
RSNSIYIFPIKVVPSSLELLS
>Mature_580_residues
TQFYKLFILTKLKNFLSDKEKIITSLFIFLVLISHSIISLFHFHECDSSDVYKYLTDSSLFSKGHFIGHIWKTGFIFAPL
RIVFALTVSIIPFDFISSLILLPLKMTYPPLEGFIYGLYLPDRFGSFYEYASFINIVFFISVILLFYQSLKFVGVSKYIS
FLCSFGILSFYSINSYTYHLGSTIWFISGSLISISSTIFFRNKASKYGFSLALITSYPSIVHFFAHNIYLYIKRIFTKKL
RANNKNKNILIDKFILIINSNKIGFLTLLFIILLFFPFNSGNRIDFDFRGFLTPFAFFPQYSKISILTIFTSISLFVISF
YTIYKRFLNEIKISIPYKNSKSLNFAIDISIINLIFITLLISIGQLSFGLTRHSLFIAPYILFLVAVGLQLIYLEFKKKF
FKAFLIKKILSISLLTFLMILSTYSSYLRFDPLKTNEIPLNIREFVAKNNTNTMSLVDCDTHYLYNDFSEIRATYNKKDP
QTYVPLDFIGTRLLVTQSIREIENFSFDLKKGDELITKYKNVKITLVDEPYFKESNIFFDSMNFDKNSSLYAKRDNLFSR
SNSIYIFPIKVVPSSLELLS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67629; Mature: 67498

Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
0.9 %Met     (Translated Protein)
1.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
0.7 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTQFYKLFILTKLKNFLSDKEKIITSLFIFLVLISHSIISLFHFHECDSSDVYKYLTDSS
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCH
LFSKGHFIGHIWKTGFIFAPLRIVFALTVSIIPFDFISSLILLPLKMTYPPLEGFIYGLY
HHHCCCCEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEE
LPDRFGSFYEYASFINIVFFISVILLFYQSLKFVGVSKYISFLCSFGILSFYSINSYTYH
CCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
LGSTIWFISGSLISISSTIFFRNKASKYGFSLALITSYPSIVHFFAHNIYLYIKRIFTKK
CCCEEEEEECCEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRANNKNKNILIDKFILIINSNKIGFLTLLFIILLFFPFNSGNRIDFDFRGFLTPFAFFP
HHCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCC
QYSKISILTIFTSISLFVISFYTIYKRFLNEIKISIPYKNSKSLNFAIDISIINLIFITL
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHH
LISIGQLSFGLTRHSLFIAPYILFLVAVGLQLIYLEFKKKFFKAFLIKKILSISLLTFLM
HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILSTYSSYLRFDPLKTNEIPLNIREFVAKNNTNTMSLVDCDTHYLYNDFSEIRATYNKKD
HHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHCHHHHHHHCCCCC
PQTYVPLDFIGTRLLVTQSIREIENFSFDLKKGDELITKYKNVKITLVDEPYFKESNIFF
CCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCEEE
DSMNFDKNSSLYAKRDNLFSRSNSIYIFPIKVVPSSLELLS
ECCCCCCCCCCEEECCCHHCCCCCEEEEEEEECCCHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TQFYKLFILTKLKNFLSDKEKIITSLFIFLVLISHSIISLFHFHECDSSDVYKYLTDSS
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCH
LFSKGHFIGHIWKTGFIFAPLRIVFALTVSIIPFDFISSLILLPLKMTYPPLEGFIYGLY
HHHCCCCEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEE
LPDRFGSFYEYASFINIVFFISVILLFYQSLKFVGVSKYISFLCSFGILSFYSINSYTYH
CCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEE
LGSTIWFISGSLISISSTIFFRNKASKYGFSLALITSYPSIVHFFAHNIYLYIKRIFTKK
CCCEEEEEECCEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LRANNKNKNILIDKFILIINSNKIGFLTLLFIILLFFPFNSGNRIDFDFRGFLTPFAFFP
HHCCCCCCEEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCC
QYSKISILTIFTSISLFVISFYTIYKRFLNEIKISIPYKNSKSLNFAIDISIINLIFITL
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHH
LISIGQLSFGLTRHSLFIAPYILFLVAVGLQLIYLEFKKKFFKAFLIKKILSISLLTFLM
HHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILSTYSSYLRFDPLKTNEIPLNIREFVAKNNTNTMSLVDCDTHYLYNDFSEIRATYNKKD
HHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHCHHHHHHHCCCCC
PQTYVPLDFIGTRLLVTQSIREIENFSFDLKKGDELITKYKNVKITLVDEPYFKESNIFF
CCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHCCEEEEEECCCCCCCCCEEE
DSMNFDKNSSLYAKRDNLFSRSNSIYIFPIKVVPSSLELLS
ECCCCCCCCCCEEECCCHHCCCCCEEEEEEEECCCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA