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The map label for this gene is glyS [H]

Identifier: 123966059

GI number: 123966059

Start: 744280

End: 746439

Strand: Reverse

Name: glyS [H]

Synonym: P9515_08241

Alternate gene names: 123966059

Gene position: 746439-744280 (Counterclockwise)

Preceding gene: 123966061

Following gene: 123966057

Centisome position: 43.8

GC content: 28.52

Gene sequence:

>2160_bases
TTGTCTAAATATTTACTTGAGATAGGAACAGAAGAGTTACCGGCCAATTTTTCTCATTCTGTAATAAACCAAATTTACTC
TAATATCAAATTTGAATTTGATAAGAAACTTATCAAATACAAGAATATTATTTGCACCTCCACACCAAGAAGAATAGTTC
TATTTTTAGAAGGTTTAGTTGATTATGCCGATGATAAGAGAGTTACAAGAAAAGGGCCTAAAGCTTCTGCTGCATTTTTA
AATGGAGTTCCAACCCAAGCTGCTCTTGGTTTTGCAAATAGTTTAGGGATTAATATAGAAGATCTCCAAATAAGAAAAAC
AGAAAAGGGTGAGTTTGTATTTGGAACGAAAATTGAAAAAGGAGAATCTACAAAGTCTGCTTTATCTTTAATAATTCCAA
AATTAATAAAAAATTTGCAAGGTCCTCGATTTATGAAATGGGGGTACGGTAGCTTTAAATTTTCAAGACCTATCCGCTGG
ATTGTCTCACTTTATGATGATGAAATTCTTGATTTTGCTTTCGATGAATGTGATCCTAGGATCAAAATAGGTAACAAATC
AAACGGTCACAGGTTAATAAATAAAGTTATTGAAATCCAATCTTCATATAATTATTTTGGATTAATGGCTGAAAGTGGAG
TTTTTGTTAACAGAGAAGAAAGAAAAGAAAAAATTGATAATCTAATAAACCAGGAATCTCAATTGTTAAAATTAGACCCT
AGTCTCTCTGAGAGTTTGCTCAACGAACTAACTGATTTAGTTGAATCACCTAATTTAATAACTTGTAATTTTGATAAGCA
ATTTCTTAATTTGCCTGTTGAAGTTCTTTCAACAGTAATGAAAAATCATCAAAGATACATTCCTCTTCTAAAAAAGAATA
AAAAATTTTCCAAATTAGGTTTGAGTTCTGAAGAAATTATAAGTACAAAATTCTTTGTCCTATCTAATGGTCTTAAAGAA
TCTAACAATACTATTGCAAAGGGGAATGAAAAAGTACTTAGGGCAAGATTCTCTGATGCAAGGTTTTTTGTAGAAAGTGA
CAAAAAAGTTGCTTCTAATGTCCGTAATGAAAAACTAAAATCTGTTTCTTATTTGAAAGGTATGGGTAATGTTTTTCAGA
GAGTAAAAAGAATTCAGGCCACCTCAGAGAAGATTTTAAATTATTTAAATGATCAATCTTTAGATAGTAATAAAATTATA
GAAGCTGCAAAGTACTGTAAAAACGATTTGTGTAGTGAAATTGTTTATGAATTTCCCGAATTGCAAGGGATAATGGGAGG
TAAATACTTACGAAATGAAGGTTTTAGCAAAGAAATTTGTATTGCTGTAGCTGAACATTATTTGCCACGTTTTTATAAAG
ATGATTTACCTTCTACAAAATACGGAGCTATTGTTTCTATCTCTGACAAAATAGAAACTTTAATAAGTATATTTATTTCG
GGAAAAAGACCAAGTGGTTCCTCTGACCCTTATGCACTTAGAAGAAATTTAAATGGGGTTATTTTAATTATTTGGCAATT
TGAACTTGATATAGCTATTGAAAATATATTTAGGGAACTTATTGAATATTGGGAAATTTCATTACCTAATTTAAAATTTG
AGAAAGAAAAAGTTTTAACTGACTTAATTGAATTTTCTAATCAAAGAATTGCTAGCCATCTTGATGAACTATCAATCAGT
AAAGATGTAATTAAAGCTACTTGTTTTACTGATTCATCAGTTGAAACAAGAATAGTGAATATTTTGGATTTAAAAAAAAG
GATTAATACTATTAAACAGCTTAAAGAGAAAGCAAATTTTTCTGAGATTCAAAAAGTCATCTCTAGAGTTTGTAAATTAG
CTGAAAGTGGTAATTTAAAAAGATCAATTTTTGCAAGCAAGGATTATGTTAATCCAAATTTATTTGAAAAAGAATGTGAA
ACCAAAGTATTTCAATTCATCAAAGAAATAGAAGTATTTATTTCATCAACTAATTGGGATTATTTTGAGCTTTTTAATTT
ATTTGAAAATAATACCAATAACCTTAATGAACTGTTTGATAATGATAAGGGGGTTTTGATTATGTCAGAAGATCCAGAAA
TCAAAAATAATCGATTAAATTTACTAGGTTTGATCAGAAATTACTCTTTAAAAATTGCTGATTTTACTAAACTAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GACCTTGATCAAGGGACCAAAACATATCTCTTTTTATACATTAGCGAAAAGCTTATTTAACCGGTAGTAAATTATAGTTG
TAATAGCCCATAAATTATTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAATTCAAAAACAATTGTTATTGACTTTTATTTTTTTTAATCCCACCTTTAATTGAGCTAACCGCCAACATCTTATCAAC
TTCCTTGTCATCTCTTACAG

Product: glycyl-tRNA synthetase beta subunit

Products: NA

Alternate protein names: Glycine--tRNA ligase beta subunit; GlyRS [H]

Number of amino acids: Translated: 719; Mature: 718

Protein sequence:

>719_residues
MSKYLLEIGTEELPANFSHSVINQIYSNIKFEFDKKLIKYKNIICTSTPRRIVLFLEGLVDYADDKRVTRKGPKASAAFL
NGVPTQAALGFANSLGINIEDLQIRKTEKGEFVFGTKIEKGESTKSALSLIIPKLIKNLQGPRFMKWGYGSFKFSRPIRW
IVSLYDDEILDFAFDECDPRIKIGNKSNGHRLINKVIEIQSSYNYFGLMAESGVFVNREERKEKIDNLINQESQLLKLDP
SLSESLLNELTDLVESPNLITCNFDKQFLNLPVEVLSTVMKNHQRYIPLLKKNKKFSKLGLSSEEIISTKFFVLSNGLKE
SNNTIAKGNEKVLRARFSDARFFVESDKKVASNVRNEKLKSVSYLKGMGNVFQRVKRIQATSEKILNYLNDQSLDSNKII
EAAKYCKNDLCSEIVYEFPELQGIMGGKYLRNEGFSKEICIAVAEHYLPRFYKDDLPSTKYGAIVSISDKIETLISIFIS
GKRPSGSSDPYALRRNLNGVILIIWQFELDIAIENIFRELIEYWEISLPNLKFEKEKVLTDLIEFSNQRIASHLDELSIS
KDVIKATCFTDSSVETRIVNILDLKKRINTIKQLKEKANFSEIQKVISRVCKLAESGNLKRSIFASKDYVNPNLFEKECE
TKVFQFIKEIEVFISSTNWDYFELFNLFENNTNNLNELFDNDKGVLIMSEDPEIKNNRLNLLGLIRNYSLKIADFTKLN

Sequences:

>Translated_719_residues
MSKYLLEIGTEELPANFSHSVINQIYSNIKFEFDKKLIKYKNIICTSTPRRIVLFLEGLVDYADDKRVTRKGPKASAAFL
NGVPTQAALGFANSLGINIEDLQIRKTEKGEFVFGTKIEKGESTKSALSLIIPKLIKNLQGPRFMKWGYGSFKFSRPIRW
IVSLYDDEILDFAFDECDPRIKIGNKSNGHRLINKVIEIQSSYNYFGLMAESGVFVNREERKEKIDNLINQESQLLKLDP
SLSESLLNELTDLVESPNLITCNFDKQFLNLPVEVLSTVMKNHQRYIPLLKKNKKFSKLGLSSEEIISTKFFVLSNGLKE
SNNTIAKGNEKVLRARFSDARFFVESDKKVASNVRNEKLKSVSYLKGMGNVFQRVKRIQATSEKILNYLNDQSLDSNKII
EAAKYCKNDLCSEIVYEFPELQGIMGGKYLRNEGFSKEICIAVAEHYLPRFYKDDLPSTKYGAIVSISDKIETLISIFIS
GKRPSGSSDPYALRRNLNGVILIIWQFELDIAIENIFRELIEYWEISLPNLKFEKEKVLTDLIEFSNQRIASHLDELSIS
KDVIKATCFTDSSVETRIVNILDLKKRINTIKQLKEKANFSEIQKVISRVCKLAESGNLKRSIFASKDYVNPNLFEKECE
TKVFQFIKEIEVFISSTNWDYFELFNLFENNTNNLNELFDNDKGVLIMSEDPEIKNNRLNLLGLIRNYSLKIADFTKLN
>Mature_718_residues
SKYLLEIGTEELPANFSHSVINQIYSNIKFEFDKKLIKYKNIICTSTPRRIVLFLEGLVDYADDKRVTRKGPKASAAFLN
GVPTQAALGFANSLGINIEDLQIRKTEKGEFVFGTKIEKGESTKSALSLIIPKLIKNLQGPRFMKWGYGSFKFSRPIRWI
VSLYDDEILDFAFDECDPRIKIGNKSNGHRLINKVIEIQSSYNYFGLMAESGVFVNREERKEKIDNLINQESQLLKLDPS
LSESLLNELTDLVESPNLITCNFDKQFLNLPVEVLSTVMKNHQRYIPLLKKNKKFSKLGLSSEEIISTKFFVLSNGLKES
NNTIAKGNEKVLRARFSDARFFVESDKKVASNVRNEKLKSVSYLKGMGNVFQRVKRIQATSEKILNYLNDQSLDSNKIIE
AAKYCKNDLCSEIVYEFPELQGIMGGKYLRNEGFSKEICIAVAEHYLPRFYKDDLPSTKYGAIVSISDKIETLISIFISG
KRPSGSSDPYALRRNLNGVILIIWQFELDIAIENIFRELIEYWEISLPNLKFEKEKVLTDLIEFSNQRIASHLDELSISK
DVIKATCFTDSSVETRIVNILDLKKRINTIKQLKEKANFSEIQKVISRVCKLAESGNLKRSIFASKDYVNPNLFEKECET
KVFQFIKEIEVFISSTNWDYFELFNLFENNTNNLNELFDNDKGVLIMSEDPEIKNNRLNLLGLIRNYSLKIADFTKLN

Specific function: Unknown

COG id: COG0751

COG function: function code J; Glycyl-tRNA synthetase, beta subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the class-II aminoacyl-tRNA synthetase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1789982, Length=729, Percent_Identity=28.8065843621399, Blast_Score=298, Evalue=1e-81,

Paralogues:

None

Copy number: 80 Molecules/Cell In: Growth Phase, Minimal Media (Based on E. coli). 400 Molecules/Cell In: Growth-Phase, Minimal-Media (Based on E. coli). 1,800 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR008909
- InterPro:   IPR006194
- InterPro:   IPR015944
- InterPro:   IPR002311 [H]

Pfam domain/function: PF05746 DALR_1; PF02092 tRNA_synt_2f [H]

EC number: =6.1.1.14 [H]

Molecular weight: Translated: 82519; Mature: 82388

Theoretical pI: Translated: 8.87; Mature: 8.87

Prosite motif: PS50861 AA_TRNA_LIGASE_II_GLYAB

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSKYLLEIGTEELPANFSHSVINQIYSNIKFEFDKKLIKYKNIICTSTPRRIVLFLEGLV
CCCCEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCEEECCCCHHHHHHHHHHH
DYADDKRVTRKGPKASAAFLNGVPTQAALGFANSLGINIEDLQIRKTEKGEFVFGTKIEK
HHCCCCHHHCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHCCHHHCCCCEEEEEEEECCCCCEEEECEECC
GESTKSALSLIIPKLIKNLQGPRFMKWGYGSFKFSRPIRWIVSLYDDEILDFAFDECDPR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
IKIGNKSNGHRLINKVIEIQSSYNYFGLMAESGVFVNREERKEKIDNLINQESQLLKLDP
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECC
SLSESLLNELTDLVESPNLITCNFDKQFLNLPVEVLSTVMKNHQRYIPLLKKNKKFSKLG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHCCCHHHCCCCHHHCC
LSSEEIISTKFFVLSNGLKESNNTIAKGNEKVLRARFSDARFFVESDKKVASNVRNEKLK
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
SVSYLKGMGNVFQRVKRIQATSEKILNYLNDQSLDSNKIIEAAKYCKNDLCSEIVYEFPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LQGIMGGKYLRNEGFSKEICIAVAEHYLPRFYKDDLPSTKYGAIVSISDKIETLISIFIS
HHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHC
GKRPSGSSDPYALRRNLNGVILIIWQFELDIAIENIFRELIEYWEISLPNLKFEKEKVLT
CCCCCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
DLIEFSNQRIASHLDELSISKDVIKATCFTDSSVETRIVNILDLKKRINTIKQLKEKANF
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
SEIQKVISRVCKLAESGNLKRSIFASKDYVNPNLFEKECETKVFQFIKEIEVFISSTNWD
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
YFELFNLFENNTNNLNELFDNDKGVLIMSEDPEIKNNRLNLLGLIRNYSLKIADFTKLN
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCEEEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SKYLLEIGTEELPANFSHSVINQIYSNIKFEFDKKLIKYKNIICTSTPRRIVLFLEGLV
CCCEEECCCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCEEECCCCHHHHHHHHHHH
DYADDKRVTRKGPKASAAFLNGVPTQAALGFANSLGINIEDLQIRKTEKGEFVFGTKIEK
HHCCCCHHHCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHCCHHHCCCCEEEEEEEECCCCCEEEECEECC
GESTKSALSLIIPKLIKNLQGPRFMKWGYGSFKFSRPIRWIVSLYDDEILDFAFDECDPR
CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
IKIGNKSNGHRLINKVIEIQSSYNYFGLMAESGVFVNREERKEKIDNLINQESQLLKLDP
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECC
SLSESLLNELTDLVESPNLITCNFDKQFLNLPVEVLSTVMKNHQRYIPLLKKNKKFSKLG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHCCCHHHCCCCHHHCC
LSSEEIISTKFFVLSNGLKESNNTIAKGNEKVLRARFSDARFFVESDKKVASNVRNEKLK
CCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHH
SVSYLKGMGNVFQRVKRIQATSEKILNYLNDQSLDSNKIIEAAKYCKNDLCSEIVYEFPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHC
GKRPSGSSDPYALRRNLNGVILIIWQFELDIAIENIFRELIEYWEISLPNLKFEKEKVLT
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DLIEFSNQRIASHLDELSISKDVIKATCFTDSSVETRIVNILDLKKRINTIKQLKEKANF
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
YFELFNLFENNTNNLNELFDNDKGVLIMSEDPEIKNNRLNLLGLIRNYSLKIADFTKLN
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHCCEEEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8590279; 8905231 [H]