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The map label for this gene is pksL [H]

Identifier: 117921281

GI number: 117921281

Start: 3386332

End: 3394206

Strand: Direct

Name: pksL [H]

Synonym: Shewana3_2840

Alternate gene names: 117921281

Gene position: 3386332-3394206 (Clockwise)

Preceding gene: 117921280

Following gene: 117921282

Centisome position: 68.11

GC content: 53.3

Gene sequence:

>7875_bases
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GCCGATTGCCATCGTAGGCATGGCGAGTATCTTTGCTAACTCCCGCTATTTGAATAAGTTTTGGGATTTAATTTGCGACA
AGATTGATGCCATTACCGACGTGCCCGAGTCCCACTGGTCGATTGATGACTATTACGATGCGGATAAATCCAAGGCCGAT
AAGAGCTACTGCAAGCGCGGCGGATTTATGCCAGAGGTCGATTTCAATCCGATGGAGTTTGGTCTGCCGCCCAATATTTT
AGAACTCACCGACAGTTCACAGTTACTCTCACTGGTCGTCGCCAAGGAAGTCCTACAGGATGCAAACCTGCCAGACGATT
ACGACCGCGACCGTATCGGCATCACCCTCGGCATTGGCGGTGGTCAAAAGCTAAGCCATAGCCTCAACGCGCGCCTGCAA
TATCCGGTGCTGAAAAAAGTATTTAAAAGCAGTGGCCTGAGCGATGAAGATAGCGAGCTGCTGATCAAAAAATTCCAAGA
TCAATATGTCCACTGGGAAGAAAACTCTTTCCCCGGCTCCCTTGGCAACGTGATTGCCGGACGCATCGCCAACCGTTTCG
ATTTAGGCGGGATGAACTGCGTCGTCGATGCCGCCTGCGCCGGCTCGCTTGCCGCCATGCGTATGGCGCTGACCGAACTG
ACCGAAGGTCGCAGCGACATGATGATCACCGGCGGTGTCTGTACCGACAACTCGCCCTATATGTATATGAGTTTCTCAAA
GACGCCGGCTTTTACCACCAACGAGCAGATTCAACCCTTCGATATCGACTCTAAGGGCATGATGATTGGCGAAGGGATCG
GCATGGTCGCCTTAAAACGCCTCGACGATGCCGAGCGCGATGGCGACCGTATCTATGCGGTAATCAAAGGCGTTGGCGCC
TCATCGGACGGTAAATTTAAGAGCATTTATGCGCCGCGTCCCGAAGGCCAAGCCAAGGCATTAGAGCGCGCCTATGATGA
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ATGGCTTAACCTCAGTATTCTCTAAGGATAATGAGCAGTTACAGCATATCGCCTTAGGCTCAGTTAAATCTCAGGTCGGT
CACACTAAGTCCACCGCGGGCACGGCGGGGGTGATTAAAGCCGCATTGGCGCTGCACCATAAAGTCTTGCCGCCTACGAT
CAACGTGAGTCAGCCTAACCCTAAATTAAACATTGCCCACTCGCCTTTTTATCTCAATACCGAGGCGCGCCCTTGGATCC
AACGCAGTGACGATACGCCACGCCGCGCAGGGATCAGCTCCTTCGGTTTTGGGGGCACTAACTTCCATTTAGTGCTCGAA
GAATACCGCCCAGAACACGCGCGCGATGACGCCTATCGCCAACGCAGCGTGGCACAAAGCTGGCTGTTTACCGCCGCCGA
CAAAACCGCGCTGCTGGGCGAGTTAAAAACCGCGCTGCAGCAAGCAACCGCCGCCAAGGCTGAGCTTTCTCAGGCGCATT
TTGTTGCCTTTGCAAAATCCTACGCCCTGCGTGAACTCCCCCCGCAATCGGCCCGTCTTGGCTTTATCGCCAAGGACTAT
GTCCAATTACAGGCTCTGTTAACCCAAGCAATAGCGCAGCTAGAATCCAATAGCGCCGAGAGCTGGCAACTACCCACAGG
GATAAGTTTTCGCGCCCAGGCACTGGTCAAGGATAACCACAAGGTCGCGGCCTTATTTGCAGGCCAAGGCTCACAGTACC
TGAATATGGGACTGGAAATTGCCAACAACTTCCCCGAGCTTCGCCGCCATATCCACACCAGCGATAAAGTGTTTAGCGAC
CGTGGTGAGGCAACGCTTTCAAGCGTGCTGTACCCAATCCCCGCCTTCGATGATGAGTCGAGAAAAGCGCAGGAAAGTGC
GTTAACCAATACCCTTTATGCTCAAAGCGCCATCGGCGCGCTCTCTATGGCGCAGTATGCCCTGTTGACTCAGGCGGGAT
TCGCCCCGGATATGCTCGCAGGCCATAGTTTTGGTGAACTCTCGGCCCTGTGCGCCGCTGGCGTGATTTCAGTAGACGAC
TACATCAAGCTTGCCTTCGAACGTGGACTGGCAATGGCGCAGTCACCTCAGGATGCCGACTCCAGTAGTGATGCTGGCGT
CATGTATGCCGTTATTCTTAAGCAAAAACAGGATATTGAGGCTATTAAAGAATCCCTGGCTCAGTTTGACGGCGTCAAGA
TTGCTAACTACAACTCACCCACTCAGTTGGTAATTGCAGGCGCTACCACAGCGACACAACAGGCCGCTAAGGCCATCGGC
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TATGCCGCTGGCGCACGGGTGTTTGTCGAGTTCGGCCCGAAAAACATTCTGCAAAAGTTGGCAGAAAATACCCTAGCCGC
GCAGTTAAACGAGCTTTGCCTTATCAGCATTAACCCGAATCCTAAAGCCGACTCCGACAGCCAACTGCGCAGCGCGGCGG
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GCCATGAATATCAAGCTCAACGCGACCAACTACATCAGCCCAGCGACCCGCAACAAAATGGTCGACTCGCTGCAATCGGG
CAAAATTACCAGCCGAGTGCAGTATGTGGATCGCATCGTTGAAAAAGTGGTTGAGAAAGTCGTTGAAAAACCCGTGATTG
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TGGCAAGCCTTGGCATCGCCATTCCGGAGAGCCTGCAACGCTCTATGGAGCTGTTCCACCAGCATCAGGCACAAACCCTA
AAGAGCCATGCTGAATTTATGCAATTGCAGACCAGCAGCAGCCAAGCGGCATTAGCCCTGCTCGGCCAAAAGCCAGCGCC
TCAGGTTCAAGCCCCCATTCAAACCGCAGCACCAGTGGCGGTAGCGGTGGCAACGCCAGTCGCTCCAGCACAGGCTCCCG
TGGTTCAAGCGTTAGCCGCAGAGCCAAAAGCGACTGTTGTGCCCGTGAGTGAGCCCAAAGTTCAGCAACCTCAAGTAACA
CAACAAGTAGCACAACCACAAGTGCAAACTGTGGCAGCAGCAACTCGCGCGCTTTCCGAGAAGCCAGTCGTGCAGCAAAT
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TACAGCAAGCCCGCAGTCAATTACACAAAGTGCAGTAGCCGCAAGTGCGGCGGTTTCTAATGATGAAATTGAGCGCACTA
TGATGGCGGTCGTCGCCGATAAGACCGGCTATCCCGTGGAAATGCTGGAACTGAGCATGGATATGGAAGCCGACCTTGGG
ATCGATTCGATTAAACGCGTGGAAATTCTAGGCACAGTGCAGGACGAATTACCCAAGCTGCCAGAACTGAGCCCAGAAGA
TCTTGCCGAGTGCCGCACCTTAGGGGAAATTGTGGCGCTGTTTAGCCAAGCGACTCCTGTAACAGCCATTACAGCAAGCC
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GTCGCCGACAAGACTGGTTATCCCGTGGAAATGCTGGAACTGAGCATGGATATGGAGGCCGACCTTGGTATCGATTCTAT
TAAGCGCGTGGAAATTCTAGGCACAGTACAAGACGAATTACCCAAGCTACCAGAACTCAGCCCGGAAGATCTCGCCGAGT
GTCGCACCCTCGGCGAAATTGTGGCGCTATTTAGCCAAGCGACTCCTGTAACAGCTGCGACCACAGTTAGCCATGCAACA
CAAAATGCACTACTCGCAAGTGCAGTAGCTGCAAGCGCGGCGGTTTCGAATGACGCGATTGAACGCACTATGATGGCGGT
CGTGGCCGACAAAACGGGCTATCCCGTGGAAATGCTGGAACTTGGCATGGATATGGAAGCCGACCTTGGGATCGATTCCA
TTAAGCGCGTGGAAATTCTAGGCACGGTACAAGACGAATTACCCAAGCTGCCAGAACTGAGCCCAGAAGATCTTGCCGAG
TGCCGCACCCTAGGCGAAATTGTGGCGCTCTTTAGCCAAGCGACTCCTGTAACAGCTGCTGCCTCAGTTAGCTATGCGAC
ACAAAGTGCCGTAGCCTCAAGCGCGGCAGTTTCTAATGACGAGATTGAACGCACTATGATGGCGGTCGTTGCTGATAAGA
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ATTTTAGGCACAGTACAAGATCAACTGCCGAACATGCCAGAACTGAGCCCTGAGGATTTAGCCGAGTGTCGAACCTTGGG
TGAAATTGTCGCCCTGTATGCTGGTTCGCAATCGTCAAGTGAGTCGCAACAGCAAAACCATGCTGCGCCAATTCAAGAGG
CAATTGCAGAAACAGTTGAGGACACCATCGACCTGCCGCCCCATAGTGAGGTGATGCTAAAAAAGTTGCCAGCGGCGGCT
GAGTTAGCGCGCATCATAGCAACTAGCGATGTTCAACTGACGGCAAACAGTTACGTCGTTATCGGCGACGATGGCCACAA
CGCGGGGGTGATTGCCGAAAAGCTTCACGCCCAAGGCGTTAAGGTCGCGGTTGTACGCTCACCGAAAACAGTTGTGACCA
GCGCATCGCCACTCGATAGCCATATTGCCAGCTTCACGCTGGAGGCGATTGATGATGAAAGCATTTGTGAGGTCATCAAT
CAGATTGAAGCGCTTGGCCAAATCGCCGGTTTTATTCATCTGCAGCCACAGCATAAGTCCGTTGCCGATAAAGGTGCTGG
CTTAGTGCTGGCAGACGAAGCCAAAGCTTCGGTCGAGCAAGCCTTCTTGTTTGCCAAGCACTTACAACCGCTTTTAACGG
AGCGCGACCACTGCCGCTTTGTCACCGTCAGCCGTATCGACGGCGGCTTTGGCTATATCGGTATGGACGAGTCGGCAGGC
GCTCTTATTAGCCAGAGTGAACTCAACCAAGCGGCGCTCTCTGGACTCACTAAAACCTTAAATCACGAGTGGCCGGGAGT
GGTCTGCCGCGCACTGGATATCGCGCCAAACTTAGATGCCAAAACGGTCGCCAATGCGGTAGTGCAGGAATACTACCTCC
AAGATGCGCCGGTCGAAGTCGGTATTGATAGCGAGCTTGAGCGAGCAACCTTAGTCGCGGGCAATGCCGTACTTCGCCGC
AGTGGCGCGTCTCTCTCGTCTGCGGACAAAATCCTCGTCACAGGCGGCGCTAAGGGCGTTACCTTCGAGTGCGCCTTAAG
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GCCTTAGTTTGGCCAGTACAAAGCAGCCTTGAAATCAGCCATGCCTTGCAGGCCTTTGAAGCAGTTGGCGCCAGCGCCGA
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GGCGGGTTTTTACGGCAATACTGGCCAGAGCGACTATGCCATGTCTAACGACATTCTCAATAAGGCTGCGCTACAACTTG
CGCAGCAATTGCCACAGGCCAAGGTGATGAGCTTTGACTGGGGTCCTTGGGATGGCGGCATGGTCAATCCTGCGCTGAAA
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GCTTACCCAGTGCCATTGGCGAGTTCGTGTCCTATTCGCCCTTAGGTTTTGGCGAGAAGGCGGTATTAGTGCTGGATGTT
ATCAAGCATTCGTCCCGAACACTTGAAGCCAATATTGCCCTCTATCATCAAGATGGCCGACTAAGCTGCGAGATGAAACG
GGCCAAGGTTACTGTCAGTAAGACGCTCAACCAAGCGTTTTTGGCCAATAAACCTCAGCAACCAATGCAAGTGCAGGCAG
TCGCCCAAAGCACGGCCGAGGTAAGTGTTAAGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACACTTTTTTAGCCCGCTTTCCTGGCGTACAAACCCCAAAAGCCATCGCTAAATCCCTTAATAAGGCAACGGCCAAACGC
TTTGCCAGTGGAGACTCGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CACTCGACCCAAGCGCACATGCCGCATTAAGCAATGCGACATTAAACAGTCCGCCTCCCAATGCCAAGCCACTGCGAATT
GCCGTATGGCTTGGTGATGG

Product: beta-ketoacyl synthase

Products: [acyl carrier protein]; acetoacetyl-ACP; CO2; [acyl carrier protein]; beta-ketoacyl-ACP [C]

Alternate protein names: PKS [H]

Number of amino acids: Translated: 2624; Mature: 2623

Protein sequence:

>2624_residues
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Sequences:

>Translated_2624_residues
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>Mature_2623_residues
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QVAQPQVQTVAAATRALSEKPVVQQIETAMMAVVADKTGYPVEMLELGMDMEADLGIDSIKRVEILGTVQDELPNLPELS
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KHSSRTLEANIALYHQDGRLSCEMKRAKVTVSKTLNQAFLANKPQQPMQVQAVAQSTAEVSVK

Specific function: Involved in some intermediate steps for the synthesis of the antibiotic polyketide bacillaene which is involved in secondary metabolism [H]

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 5 acyl carrier domains [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI41872631, Length=889, Percent_Identity=24.0719910011249, Blast_Score=170, Evalue=2e-41,
Organism=Homo sapiens, GI8923559, Length=289, Percent_Identity=32.1799307958478, Blast_Score=129, Evalue=4e-29,
Organism=Homo sapiens, GI223972627, Length=154, Percent_Identity=33.7662337662338, Blast_Score=75, Evalue=1e-12,
Organism=Escherichia coli, GI1787337, Length=289, Percent_Identity=30.7958477508651, Blast_Score=114, Evalue=6e-26,
Organism=Escherichia coli, GI1787334, Length=317, Percent_Identity=29.6529968454259, Blast_Score=102, Evalue=4e-22,
Organism=Escherichia coli, GI1788663, Length=392, Percent_Identity=24.7448979591837, Blast_Score=96, Evalue=2e-20,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI212642053, Length=765, Percent_Identity=24.8366013071895, Blast_Score=172, Evalue=3e-42,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI17550940, Length=543, Percent_Identity=26.5193370165746, Blast_Score=154, Evalue=6e-37,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71983541, Length=288, Percent_Identity=29.8611111111111, Blast_Score=122, Evalue=4e-27,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71983535, Length=261, Percent_Identity=30.2681992337165, Blast_Score=114, Evalue=6e-25,
Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6320904, Length=285, Percent_Identity=27.0175438596491, Blast_Score=107, Evalue=2e-23,
Organism=Drosophila melanogaster, GI221330659, Length=917, Percent_Identity=23.6641221374046, Blast_Score=171, Evalue=8e-42,
Organism=Drosophila melanogaster, GI19920632, Length=917, Percent_Identity=23.773173391494, Blast_Score=170, Evalue=1e-41,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24581345, Length=471, Percent_Identity=25.2653927813163, Blast_Score=135, Evalue=3e-31,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24644341, Length=311, Percent_Identity=31.1897106109325, Blast_Score=118, Evalue=5e-26,
Organism=Drosophila melanogaster, GI24665753, Length=328, Percent_Identity=29.2682926829268, Blast_Score=77, Evalue=2e-13,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

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Pfam domain/function: PF00109 ketoacyl-synt; PF02801 Ketoacyl-synt_C; PF08659 KR; PF00550 PP-binding [H]

EC number: 2.3.1.41 [C]

Molecular weight: Translated: 281007; Mature: 280876

Theoretical pI: Translated: 4.64; Mature: 4.64

Prosite motif: PS50075 ACP_DOMAIN ; PS00141 ASP_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
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>Mature Secondary Structure 
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PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: None [C]

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): 0.04 {acetyl-ACP}} 0.031 {acetyl-ACP}} 0.138 {cis-9-hexadecenoyl-ACP}} 0.017 {cis-9-hexadecenoyl-ACP}} 0.012 {cis-3-decenoyl-ACP}} [C]

Substrates: acetyl-ACP; malonyl-ACP; acyl-ACP [C]

Specific reaction: acetyl-ACP + malonyl-ACP = [acyl carrier protein] + acetoacetyl-ACP + CO2 acyl-ACP + malonyl-ACP = [acyl carrier protein] + beta-ketoacyl-ACP + CO2 [C]

General reaction: Acyl group transfer [C]

Inhibitor: Acetyl-CoA; Acyl-CoA; Iodoacetamide; N-Ethyl maleimide acyl -ACP-derivatives protect, malonyl-ACP-decarboxylation, Cerulenin [C]

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8344529; 9384377; 10568751 [H]