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Definition Shewanella sp. ANA-3 plasmid 1, complete sequence.
Accession NC_008573
Length 278,942

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The map label for this gene is 117676324

Identifier: 117676324

GI number: 117676324

Start: 274941

End: 275921

Strand: Reverse

Name: 117676324

Synonym: Shewana3_4387

Alternate gene names: NA

Gene position: 275921-274941 (Counterclockwise)

Preceding gene: 117676325

Following gene: 117676323

Centisome position: 98.92

GC content: 43.63

Gene sequence:

>981_bases
ATGTTTGTTGGCGATTTAGCGATAGCACTAAATTTATTGAGTGTTGCAGTGCTGGCATTTGCTATCAGTGTTGCGTGCAT
CTCGATCGCCCTACGATTAACTTTGCCAAGATTCGAGCATCTTACTTTTAGGTTACGTAAAGTTATCCTATGGGCTTTGG
TTACTGTACCTTGGTGGGTAGCCATAAGCTGTGCTGCCTTTTTCTGGCCAAGGCAGCAAGAGTTGTTTTCTACTGCTTGG
TTAAATGAATTCGCTCATTGGCATCACGTCGACATCTTTAGCTTCAGCAGTTGGCATGCTTTTACCTTGTTGTCGGCCTT
CGGTTATTTGATATGGTCGATGATCTCGACCATTTATGTACGTAAAAAGCAATCATCAACAATGGCATCTCTGATTGGAT
TATCAGAGATCCAACCTCAGGTGACTATAACTCAGCAGCGCTATTATTCGTTAGCACAAGCAATTCCTGCGGCCTTCACC
ACAGGTCTAGTGTCCCCTAAGATTTACCTGACCACAGGATTGCAAGAAAAGGTTACAGAACAGCAACTCGATATTATTGT
TCGACATGAAATGGCGCATGTCGTGGCTCGAGACCCTTTATTTAAAGTCATCTTTGCTGCATTTGCTGGTTTTTATCCGA
AAGCGGCCAAACGCAATTTAATCGGACATTTTACCCTGTTGACTGAACAGCTTGCAGATCATGCTGTGACCACTGAGCAT
GACAATCTAGATGTCGCTCAAGCCTTGATAAATGTAGCTCGAATGCAGCGAAGCGTAACTCTTGGTTGTGATGGTTTACA
GACAAGTTATTTCGGTAACGATCAAACCAGTGTTCGAGTACAGCGACTGATTCAACCTAGGTTAACGTCTTCCCGATTGG
CGATCGGTTTAACGTTGTTATTCTTAGCCATCGTCCCACTTTTAACCGCTTCAACTGTCGATAGCCTTCACCACATTATC
GAAACCTTCTTCACCCATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTTAGTTCCGCATCAGCTAATCTGAATGATGCCCAACTCGATATGCTAGAACATTTAATTGAAGAACAACGTAAACTT
CGGAAAGGATAATTAGGGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGGATTGGGAATGAGAGACTTGCTTTTTAACGTCAGAACTAAAAAACCGATTGGCTATCGGTTTTCCTCCATTGTGC
TAGGAATGTGTTTAGTATTC

Product: peptidase M56, BlaR1

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 326; Mature: 326

Protein sequence:

>326_residues
MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWVAISCAAFFWPRQQELFSTAW
LNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYVRKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFT
TGLVSPKIYLTTGLQEKVTEQQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH
DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLLFLAIVPLLTASTVDSLHHII
ETFFTH

Sequences:

>Translated_326_residues
MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWVAISCAAFFWPRQQELFSTAW
LNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYVRKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFT
TGLVSPKIYLTTGLQEKVTEQQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH
DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLLFLAIVPLLTASTVDSLHHII
ETFFTH
>Mature_326_residues
MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWVAISCAAFFWPRQQELFSTAW
LNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYVRKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFT
TGLVSPKIYLTTGLQEKVTEQQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH
DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLLFLAIVPLLTASTVDSLHHII
ETFFTH

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 36673; Mature: 36673

Theoretical pI: Translated: 9.12; Mature: 9.12

Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
2.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
2.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AISCAAFFWPRQQELFSTAWLNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYV
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFTTGLVSPKIYLTTGLQEKVTE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHH
QQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FLAIVPLLTASTVDSLHHIIETFFTH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWV
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AISCAAFFWPRQQELFSTAWLNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYV
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFTTGLVSPKIYLTTGLQEKVTE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHH
QQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH
HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
FLAIVPLLTASTVDSLHHIIETFFTH
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 10.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA