| Definition | Shewanella sp. ANA-3 plasmid 1, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_008573 |
| Length | 278,942 |
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The map label for this gene is 117676324
Identifier: 117676324
GI number: 117676324
Start: 274941
End: 275921
Strand: Reverse
Name: 117676324
Synonym: Shewana3_4387
Alternate gene names: NA
Gene position: 275921-274941 (Counterclockwise)
Preceding gene: 117676325
Following gene: 117676323
Centisome position: 98.92
GC content: 43.63
Gene sequence:
>981_bases ATGTTTGTTGGCGATTTAGCGATAGCACTAAATTTATTGAGTGTTGCAGTGCTGGCATTTGCTATCAGTGTTGCGTGCAT CTCGATCGCCCTACGATTAACTTTGCCAAGATTCGAGCATCTTACTTTTAGGTTACGTAAAGTTATCCTATGGGCTTTGG TTACTGTACCTTGGTGGGTAGCCATAAGCTGTGCTGCCTTTTTCTGGCCAAGGCAGCAAGAGTTGTTTTCTACTGCTTGG TTAAATGAATTCGCTCATTGGCATCACGTCGACATCTTTAGCTTCAGCAGTTGGCATGCTTTTACCTTGTTGTCGGCCTT CGGTTATTTGATATGGTCGATGATCTCGACCATTTATGTACGTAAAAAGCAATCATCAACAATGGCATCTCTGATTGGAT TATCAGAGATCCAACCTCAGGTGACTATAACTCAGCAGCGCTATTATTCGTTAGCACAAGCAATTCCTGCGGCCTTCACC ACAGGTCTAGTGTCCCCTAAGATTTACCTGACCACAGGATTGCAAGAAAAGGTTACAGAACAGCAACTCGATATTATTGT TCGACATGAAATGGCGCATGTCGTGGCTCGAGACCCTTTATTTAAAGTCATCTTTGCTGCATTTGCTGGTTTTTATCCGA AAGCGGCCAAACGCAATTTAATCGGACATTTTACCCTGTTGACTGAACAGCTTGCAGATCATGCTGTGACCACTGAGCAT GACAATCTAGATGTCGCTCAAGCCTTGATAAATGTAGCTCGAATGCAGCGAAGCGTAACTCTTGGTTGTGATGGTTTACA GACAAGTTATTTCGGTAACGATCAAACCAGTGTTCGAGTACAGCGACTGATTCAACCTAGGTTAACGTCTTCCCGATTGG CGATCGGTTTAACGTTGTTATTCTTAGCCATCGTCCCACTTTTAACCGCTTCAACTGTCGATAGCCTTCACCACATTATC GAAACCTTCTTCACCCATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CATTTAGTTCCGCATCAGCTAATCTGAATGATGCCCAACTCGATATGCTAGAACATTTAATTGAAGAACAACGTAAACTT CGGAAAGGATAATTAGGGTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAAGGATTGGGAATGAGAGACTTGCTTTTTAACGTCAGAACTAAAAAACCGATTGGCTATCGGTTTTCCTCCATTGTGC TAGGAATGTGTTTAGTATTC
Product: peptidase M56, BlaR1
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 326; Mature: 326
Protein sequence:
>326_residues MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWVAISCAAFFWPRQQELFSTAW LNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYVRKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFT TGLVSPKIYLTTGLQEKVTEQQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLLFLAIVPLLTASTVDSLHHII ETFFTH
Sequences:
>Translated_326_residues MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWVAISCAAFFWPRQQELFSTAW LNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYVRKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFT TGLVSPKIYLTTGLQEKVTEQQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLLFLAIVPLLTASTVDSLHHII ETFFTH >Mature_326_residues MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWVAISCAAFFWPRQQELFSTAW LNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYVRKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFT TGLVSPKIYLTTGLQEKVTEQQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLLFLAIVPLLTASTVDSLHHII ETFFTH
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 36673; Mature: 36673
Theoretical pI: Translated: 9.12; Mature: 9.12
Prosite motif: PS00142 ZINC_PROTEASE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 2.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 2.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AISCAAFFWPRQQELFSTAWLNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYV HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFTTGLVSPKIYLTTGLQEKVTE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHH QQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH FLAIVPLLTASTVDSLHHIIETFFTH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MFVGDLAIALNLLSVAVLAFAISVACISIALRLTLPRFEHLTFRLRKVILWALVTVPWWV CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AISCAAFFWPRQQELFSTAWLNEFAHWHHVDIFSFSSWHAFTLLSAFGYLIWSMISTIYV HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RKKQSSTMASLIGLSEIQPQVTITQQRYYSLAQAIPAAFTTGLVSPKIYLTTGLQEKVTE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHHHHHH QQLDIIVRHEMAHVVARDPLFKVIFAAFAGFYPKAAKRNLIGHFTLLTEQLADHAVTTEH HHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC DNLDVAQALINVARMQRSVTLGCDGLQTSYFGNDQTSVRVQRLIQPRLTSSRLAIGLTLL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH FLAIVPLLTASTVDSLHHIIETFFTH HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 10.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA