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The map label for this gene is 116493333

Identifier: 116493333

GI number: 116493333

Start: 1576151

End: 1577887

Strand: Reverse

Name: 116493333

Synonym: PEPE_1605

Alternate gene names: NA

Gene position: 1577887-1576151 (Counterclockwise)

Preceding gene: 116493334

Following gene: 116493332

Centisome position: 86.11

GC content: 31.26

Gene sequence:

>1737_bases
GTGGAATTAAGTAATGCAAAAGCGGACAGAATCGGTATAAAAAATATTTTATTCATTTTTTTTATCAGTTTTATATTGGT
TTTACCTCAAATAATGAACAAAAGTATTATTTTAGGTGCCGATTCGATTTTTCATTTTAATAGGTTTTATGATACATATA
TGCAGTTTAGGACAGGAAACTTTAGCTATTTTCAGACAAATTTTGGCTTTCAGCAAAGTGGCAGGATAATAAATGCTCTG
TACGGTCCTTTGTTAGCATATGGGATGGGAGCACTACTATATATAGTGCATAGTTGGCTAAAGTTTCAAGTCTTAACATC
TTTTTTTGTATTTTTTTTAAGTGGCTATACTATGAATGTTTTAGCGGTGAAGGTAGGGTCTTCACGAAGAGTAGCTAATA
TTACGTCGGTTTTATTTATGGGAAGCTTTTGGGTTGGAAAATGGACAATAGATCAAAATTTTATGTCCATAGGGAACGCC
TTAATGCCATTAATTGTTTTAATGGGTATAAAGATGTTAAAGAACGATGAGGAGAATCTCCGGGTTTTACAACTCGCCTT
ATGTGTTTCGTTAGTTATTCAAGTACATTTATTAAGTGCAGCTATTGCGATAGGTGTTTTGTTATCGTTTTTTGTTGTAA
GTATTGTAAAAAATGATAATAAATTAGATCTGTTTTTTAAATGTGTAAAAGCTGCATTATTAAGTTTAATACTAACTTTT
AACGTATGGTGGGCACTTATAGAAGTCTATACGGGAAATAGTTTGTACGGTCCTTACCCATCTAATTTGGCTAAATCGGC
GGTTAATTTATCTCTAGATAAACCAGATTTTTGGCATCTAGGGTTGGCAGTAAGTGCACTATTTTTGGTCCAAATATCTT
TACTTGTAGTACATTGGACAGAGTTTACGGTAATAAATAAGGTAACAACAATTTTAGGTACAATTTTGTTAGTACTAGCA
TCAAATTTGTTTCCATGGGAGTTTGTGGATAATAATTACCCTGTAATTAAAACATTCCTTCAATTTCCAGCTCGTTTTGA
AACTATGGCATTTATTTTATTGGTACTAGGGTTAAATTTAAGTATTCTAGAAATAAAAACTAGGATCAGTACTGAAATAC
TTACTACTTTTACTTTAGTAATAGCCCTACTTGGAGTAATACAAACATATGGCAACATTCAAAATTTAAGTGTTAGATGT
AGTTCTGGGAGCCCGGTAGCAAATAAAACAAATGTTATTTTTAAAAGTAATAATGACAGTGAAATAAAAAAAGCATTCAG
AAGCAATAATTTGAAAAGGGGATTAGAAATAGTGGAAAAGCCTACCCCAGATTACATGCCGATGCCTAATTTAAAAAGTA
AGGCCGAGCATTCTTATGCACAATACAATGAAGATTTTATTAGTACTAAGAACCAAGCAAGCAAAAAAGTGCGTGGAAAT
ATATTGGTAATTAGTTGGCACGCTTCAAAAGTTGGAAGTAAAAAGAAAATACCAATTACTCTTTATAAGAATTCAATTTT
AACTTTAAATGGAAAAAAAATATCTAAAAATGAAATGAAGTTGGATAGAATGAGTGTTCCGACAATAGTATCAGATAAAA
AGGGTAAAAATGTAGTGAAATTAGAATATAAATCTAAAATTGTAAGTAAAGTAAGTTTAAGTGCTATGTATATGTGCTGG
GGGATTTCTCTAGTATCTTATACATTTGGAAGAAGGAAGCGGCATGAAGTTTCTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCAGTACAACATAAAGTTAGGTAATTAAAAGTAAAAACCATGATTTGAGATATAGATGTATATCTAATTCATGGTTTTT
ATTAAGGAGGAGTGGTTAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTAAAAAATATATAATTATTTTTTTCTTTATTCTAATTTGCAGTGTAGGCGCTGTGATCTTTAAAAATCGGACTACGC
AAACGATTAAACCAACTATA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 578; Mature: 578

Protein sequence:

>578_residues
MELSNAKADRIGIKNILFIFFISFILVLPQIMNKSIILGADSIFHFNRFYDTYMQFRTGNFSYFQTNFGFQQSGRIINAL
YGPLLAYGMGALLYIVHSWLKFQVLTSFFVFFLSGYTMNVLAVKVGSSRRVANITSVLFMGSFWVGKWTIDQNFMSIGNA
LMPLIVLMGIKMLKNDEENLRVLQLALCVSLVIQVHLLSAAIAIGVLLSFFVVSIVKNDNKLDLFFKCVKAALLSLILTF
NVWWALIEVYTGNSLYGPYPSNLAKSAVNLSLDKPDFWHLGLAVSALFLVQISLLVVHWTEFTVINKVTTILGTILLVLA
SNLFPWEFVDNNYPVIKTFLQFPARFETMAFILLVLGLNLSILEIKTRISTEILTTFTLVIALLGVIQTYGNIQNLSVRC
SSGSPVANKTNVIFKSNNDSEIKKAFRSNNLKRGLEIVEKPTPDYMPMPNLKSKAEHSYAQYNEDFISTKNQASKKVRGN
ILVISWHASKVGSKKKIPITLYKNSILTLNGKKISKNEMKLDRMSVPTIVSDKKGKNVVKLEYKSKIVSKVSLSAMYMCW
GISLVSYTFGRRKRHEVS

Sequences:

>Translated_578_residues
MELSNAKADRIGIKNILFIFFISFILVLPQIMNKSIILGADSIFHFNRFYDTYMQFRTGNFSYFQTNFGFQQSGRIINAL
YGPLLAYGMGALLYIVHSWLKFQVLTSFFVFFLSGYTMNVLAVKVGSSRRVANITSVLFMGSFWVGKWTIDQNFMSIGNA
LMPLIVLMGIKMLKNDEENLRVLQLALCVSLVIQVHLLSAAIAIGVLLSFFVVSIVKNDNKLDLFFKCVKAALLSLILTF
NVWWALIEVYTGNSLYGPYPSNLAKSAVNLSLDKPDFWHLGLAVSALFLVQISLLVVHWTEFTVINKVTTILGTILLVLA
SNLFPWEFVDNNYPVIKTFLQFPARFETMAFILLVLGLNLSILEIKTRISTEILTTFTLVIALLGVIQTYGNIQNLSVRC
SSGSPVANKTNVIFKSNNDSEIKKAFRSNNLKRGLEIVEKPTPDYMPMPNLKSKAEHSYAQYNEDFISTKNQASKKVRGN
ILVISWHASKVGSKKKIPITLYKNSILTLNGKKISKNEMKLDRMSVPTIVSDKKGKNVVKLEYKSKIVSKVSLSAMYMCW
GISLVSYTFGRRKRHEVS
>Mature_578_residues
MELSNAKADRIGIKNILFIFFISFILVLPQIMNKSIILGADSIFHFNRFYDTYMQFRTGNFSYFQTNFGFQQSGRIINAL
YGPLLAYGMGALLYIVHSWLKFQVLTSFFVFFLSGYTMNVLAVKVGSSRRVANITSVLFMGSFWVGKWTIDQNFMSIGNA
LMPLIVLMGIKMLKNDEENLRVLQLALCVSLVIQVHLLSAAIAIGVLLSFFVVSIVKNDNKLDLFFKCVKAALLSLILTF
NVWWALIEVYTGNSLYGPYPSNLAKSAVNLSLDKPDFWHLGLAVSALFLVQISLLVVHWTEFTVINKVTTILGTILLVLA
SNLFPWEFVDNNYPVIKTFLQFPARFETMAFILLVLGLNLSILEIKTRISTEILTTFTLVIALLGVIQTYGNIQNLSVRC
SSGSPVANKTNVIFKSNNDSEIKKAFRSNNLKRGLEIVEKPTPDYMPMPNLKSKAEHSYAQYNEDFISTKNQASKKVRGN
ILVISWHASKVGSKKKIPITLYKNSILTLNGKKISKNEMKLDRMSVPTIVSDKKGKNVVKLEYKSKIVSKVSLSAMYMCW
GISLVSYTFGRRKRHEVS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 65183; Mature: 65183

Theoretical pI: Translated: 10.38; Mature: 10.38

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.9 %Met     (Translated Protein)
3.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.9 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MELSNAKADRIGIKNILFIFFISFILVLPQIMNKSIILGADSIFHFNRFYDTYMQFRTGN
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
FSYFQTNFGFQQSGRIINALYGPLLAYGMGALLYIVHSWLKFQVLTSFFVFFLSGYTMNV
EEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
LAVKVGSSRRVANITSVLFMGSFWVGKWTIDQNFMSIGNALMPLIVLMGIKMLKNDEENL
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
RVLQLALCVSLVIQVHLLSAAIAIGVLLSFFVVSIVKNDNKLDLFFKCVKAALLSLILTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NVWWALIEVYTGNSLYGPYPSNLAKSAVNLSLDKPDFWHLGLAVSALFLVQISLLVVHWT
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFTVINKVTTILGTILLVLASNLFPWEFVDNNYPVIKTFLQFPARFETMAFILLVLGLNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
SILEIKTRISTEILTTFTLVIALLGVIQTYGNIQNLSVRCSSGSPVANKTNVIFKSNNDS
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCHH
EIKKAFRSNNLKRGLEIVEKPTPDYMPMPNLKSKAEHSYAQYNEDFISTKNQASKKVRGN
HHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHCCCHHHHHHHCCC
ILVISWHASKVGSKKKIPITLYKNSILTLNGKKISKNEMKLDRMSVPTIVSDKKGKNVVK
EEEEEEECHHCCCCCCCEEEEECCEEEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCEECCCCCCCEEE
LEYKSKIVSKVSLSAMYMCWGISLVSYTFGRRKRHEVS
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MELSNAKADRIGIKNILFIFFISFILVLPQIMNKSIILGADSIFHFNRFYDTYMQFRTGN
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
FSYFQTNFGFQQSGRIINALYGPLLAYGMGALLYIVHSWLKFQVLTSFFVFFLSGYTMNV
EEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
LAVKVGSSRRVANITSVLFMGSFWVGKWTIDQNFMSIGNALMPLIVLMGIKMLKNDEENL
EEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
RVLQLALCVSLVIQVHLLSAAIAIGVLLSFFVVSIVKNDNKLDLFFKCVKAALLSLILTF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NVWWALIEVYTGNSLYGPYPSNLAKSAVNLSLDKPDFWHLGLAVSALFLVQISLLVVHWT
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EFTVINKVTTILGTILLVLASNLFPWEFVDNNYPVIKTFLQFPARFETMAFILLVLGLNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCC
SILEIKTRISTEILTTFTLVIALLGVIQTYGNIQNLSVRCSSGSPVANKTNVIFKSNNDS
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCEEEEECCCHH
EIKKAFRSNNLKRGLEIVEKPTPDYMPMPNLKSKAEHSYAQYNEDFISTKNQASKKVRGN
HHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHCCCHHHHHHHCCC
ILVISWHASKVGSKKKIPITLYKNSILTLNGKKISKNEMKLDRMSVPTIVSDKKGKNVVK
EEEEEEECHHCCCCCCCEEEEECCEEEEECCCCCCCCHHHHHHCCCCCEECCCCCCCEEE
LEYKSKIVSKVSLSAMYMCWGISLVSYTFGRRKRHEVS
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA