Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113475229

Identifier: 113475229

GI number: 113475229

Start: 2330508

End: 2332670

Strand: Reverse

Name: 113475229

Synonym: Tery_1536

Alternate gene names: NA

Gene position: 2332670-2330508 (Counterclockwise)

Preceding gene: 113475234

Following gene: 113475226

Centisome position: 30.1

GC content: 30.84

Gene sequence:

>2163_bases
ATGAAAACTCACTCTTTTTTCAAACCGTTAAATACTAAATTAAATTCACAGCCTAGCTTTTTGACTAATATAATTATTTT
CTTGACAGTAGTTTTAATAATTATTGCTATAACATCAATATATGTATCCAATGAAGATACAATTTATTGGTGGGACTTTG
TAGGATATCAGAATGCTGCGAATAATTTAACAAATTTATTTAGAGTATCCTTTCAAAGAGCTATTGATGATATTAATGGT
TCTTTATCTCAACAGAAAAATTATCTAATTACATTGCCATTAATCCCATTTCTCTATATTTTTGGCAACCAAAGAATTAT
CTATATCTTGAGTATTAATCTTATCTATTTATTACCCTTTAGTTTATTACTAGGAGCAATAGCTATAAAATTAATTCCCG
TTCATTCTCGATGGGTATTTTGGTCAACTGTAGCGATCGCTTTACTAATACCTATGAGCTGGAGCCCGAGTTTAAGAGGA
TATCCCGATATTGGGGCAACTTTATTTATTTTATTGGGGGCTTTATTTTACTTAAAAAATATTAGATTAACTACTTGGTG
GCAACTTCCTATTATTGGATTTTGTCTAGGAATATCTATAGTTTTAAGACGACATTTTGCTTATAGTGTGATCGCCTTTA
TAGGAGCTATTAGTTGTCAAATTATCCTCGACTCTTTAACTAATTTCAAATTTAGTAAAACTTCTGTGAAAAGACTTTTA
GAAGGTGCTATAAAAATTAGTCTTATTTCCCTAACTTGTTTCCTAACTATATCAATTTTTGCCTGGGGCTTTATCCAAAA
CTCTTTAACAGAAAATTATCGAACTCTTTATGCTGCCTGGAGCTTATCAATACCTGACATATTCTGGCGTTACAGCTGTT
TCTATGGCTTAATAACTTTACTATTAGTTGCCATAGGATTTTTTGTAGGAGTTATGAGAAAATTTTTAATTCCATCTACT
ACTATTTTTCTCTTATTATTCGGAATATTTTCTGTAGCTGAATGGTTGATTTTACTCCGCTATGGCAATATTCATTACTC
TCTACATTTGACACCGATAGTAGTTTTAGGACTATCCTCATTTATTTGGATAACTATTCATACTTTTCGACGCAAAACTA
GATTAATTATTTTTAGTATTGCGGGAATATATTTAATTATTAATCTCATCTTTGGTTTAACTCCTATCGGTAAATTTAAT
AACCCTCTACGCCCATTATTTGCTAGTAACTTTTCCCCATTAATTCGTTCCGACTACAATCAAGTTTTACAGTTGACTGA
TTATCTAAATAAATTAGCACCGAATCAAGAATTAGTGTATGTAGCTGCTTCTTCAAATCAGTTTAATGCTAATATTATTA
GAAACGCTAACCGGATAATTAATCCGAAAAATTGGTCGAACTTAAAAGCAATAAGTAAACCACATATTGACACCCGTGAT
ACTTACCCATTGCCAGAATTATTAGCAGCACAATATATAGTCATCGCTCATCCATTTCAGAGAGTATTATTAACTGATGA
ACAAGTCTTAAAACCAGGGCAACAAGATTTAGTCAGATTTGTCTATGATGCCTTTACTCAAAATTTATCTATTAGTCAAG
ATTTCCAAAAATTGCCAGAAGAATTTGTTTTAGATGGAGGAGTAACTGTTAGTTTTTATCAAAGAATTCGTCCTACTTCT
ATAAGCACTGCCCTACAAACTTTATCAGCAATGCAAAAACAAGTTCCCCAGCGTCCGGGTAGACAGTTAGACTGGATAAG
TTTAAATCAATCTCCTTATATTACTTATAACTATTCAGCAGTTACTCAAGTTTCAGATAGTGCTTATAATTTAATGACAG
ATCCTTCAGATATTACTAAGCAAACATCTAAATATTTTCTCTATTTAGGGCAATTATCTTCTTCTATAAAAATCACTGGT
AAGCTAGATTTTCTTCATCAAGAATGTAATGGTTTATCTCTTAAGTTTTCTATATTAGATGACCAAGGAATTTTGCTTGA
TACAAATGTCAATAATTATTTTCCTGGAGTTGATTCTGATTTTATTTTTTCTCTAGCAGGTAAAAATCCTGTTTATCTAC
TTCTAGAAAATATCAGTATTGACGGTGATAATTTAACTGATAAATGTGGATGGATAATTAATCATCTAGTTGTTGATGAC
TAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATAAACCCCGACAGTTTTTTCACAAATTATTTATGATTACTATATAACTTAATCACAGATAATAAAAGATAACTTTCCC
TAAGTAGTCAGCTATAAAAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAAAAAATCCAGGGATAATTTATAATATTATGTATATTTTCTCTTTAAGAAATTTCCATGGAATGTCTATACCTATTCC
TCAGTTATGAGTTCGATCTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 720

Protein sequence:

>720_residues
MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAANNLTNLFRVSFQRAIDDING
SLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPFSLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRG
YPDIGATLFILLGALFYLKNIRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL
EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITLLLVAIGFFVGVMRKFLIPST
TIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSSFIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFN
NPLRPLFASNFSPLIRSDYNQVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD
TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPEEFVLDGGVTVSFYQRIRPTS
ISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSAVTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITG
KLDFLHQECNGLSLKFSILDDQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD

Sequences:

>Translated_720_residues
MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAANNLTNLFRVSFQRAIDDING
SLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPFSLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRG
YPDIGATLFILLGALFYLKNIRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL
EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITLLLVAIGFFVGVMRKFLIPST
TIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSSFIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFN
NPLRPLFASNFSPLIRSDYNQVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD
TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPEEFVLDGGVTVSFYQRIRPTS
ISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSAVTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITG
KLDFLHQECNGLSLKFSILDDQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD
>Mature_720_residues
MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAANNLTNLFRVSFQRAIDDING
SLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPFSLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRG
YPDIGATLFILLGALFYLKNIRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL
EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITLLLVAIGFFVGVMRKFLIPST
TIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSSFIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFN
NPLRPLFASNFSPLIRSDYNQVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD
TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPEEFVLDGGVTVSFYQRIRPTS
ISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSAVTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITG
KLDFLHQECNGLSLKFSILDDQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 81945; Mature: 81945

Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
1.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
0.7 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAA
CCCCCHHCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEECCCHHHH
NNLTNLFRVSFQRAIDDINGSLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHH
SLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRGYPDIGATLFILLGALFYLKN
HHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
IRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL
CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LLVAIGFFVGVMRKFLIPSTTIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEEHHHHHHHHHHH
FIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFNNPLRPLFASNFSPLIRSDYN
HHEEEEHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHH
QVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD
HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPE
CCCCHHHHHHCEEEEECHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCH
EFVLDGGVTVSFYQRIRPTSISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSA
HHHHCCCCEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEECHH
VTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITGKLDFLHQECNGLSLKFSILD
HEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCEEEEEEEC
DQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD
CCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAA
CCCCCHHCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEECCCHHHH
NNLTNLFRVSFQRAIDDINGSLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPF
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SLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRGYPDIGATLFILLGALFYLKN
HHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
IRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL
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EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITL
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LLVAIGFFVGVMRKFLIPSTTIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEEHHHHHHHHHHH
FIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFNNPLRPLFASNFSPLIRSDYN
HHEEEEHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPE
CCCCHHHHHHCEEEEECHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCH
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VTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITGKLDFLHQECNGLSLKFSILD
HEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCEEEEEEEC
DQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD
CCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA