| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113475066
Identifier: 113475066
GI number: 113475066
Start: 2035337
End: 2037400
Strand: Direct
Name: 113475066
Synonym: Tery_1338
Alternate gene names: NA
Gene position: 2035337-2037400 (Clockwise)
Preceding gene: 113475062
Following gene: 113475079
Centisome position: 26.26
GC content: 29.94
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases TACAACTTTGATTTGTCAGCCATAATTATAATTATTACTATAGTATAGCAACCCTAAATTATTTGTAAAAAAAAGGTAGG GGTTTGGTCTTTTTATCCTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 687; Mature: 687
Protein sequence:
>687_residues MWQFKKYSWYFSLSLFTVIVIGSFIARGYTFPVGNHYTHVPQIKSMLNSELYINDYYVQEMLQFTPRYYYQYLVYFLSKI TGSLSLTYLIYYLTSFISFILGLFALSKIFTPSKLSAAVLIFLSLKSYTLIGYLKLFPNTPIPATFAMSFTVWGIYFCFQ QRWIIGYLFFGIASILQFLVGVLPGIIMIPIMLIETIKKYNYKQVKHQFIVLLSSRILKVKSITKLIDFWFRYELIFLVI IPLVIWLSFACLVYLPMLLTGTTSTDQLTNEEFVFIYGWVRNPHHIIPTYWNWKSRLDFVCFILGGCLCINKIDIAKSKY FLHQPITEKKQIYRYPFSEVEIGNIKEKKVGENFCISNNMRCLEKWKFYLIVAESIFALFLGYIFLEVYPLALFAKLQLA RTVPFAQLIIFIAVGILVNQLYQQKKLGIALLLIISLILPIPYQGICFFILSVGLFFLEKWHHKLIIFLMLLVGLIFYFL HPSIDLIVNRLFVMPGLFLVLIFPFILDEIDIAIAQKKLMTYCLALSTILVLILGLFEALPGKILEVFEQQVKFNRVPQD EVTKLALRFREISNKDDVILIPPFVSNFQFFSERAVIVDFKHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQ QTGKELVSVAKKYGAGYILTRVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD
Sequences:
>Translated_687_residues MWQFKKYSWYFSLSLFTVIVIGSFIARGYTFPVGNHYTHVPQIKSMLNSELYINDYYVQEMLQFTPRYYYQYLVYFLSKI TGSLSLTYLIYYLTSFISFILGLFALSKIFTPSKLSAAVLIFLSLKSYTLIGYLKLFPNTPIPATFAMSFTVWGIYFCFQ QRWIIGYLFFGIASILQFLVGVLPGIIMIPIMLIETIKKYNYKQVKHQFIVLLSSRILKVKSITKLIDFWFRYELIFLVI IPLVIWLSFACLVYLPMLLTGTTSTDQLTNEEFVFIYGWVRNPHHIIPTYWNWKSRLDFVCFILGGCLCINKIDIAKSKY FLHQPITEKKQIYRYPFSEVEIGNIKEKKVGENFCISNNMRCLEKWKFYLIVAESIFALFLGYIFLEVYPLALFAKLQLA RTVPFAQLIIFIAVGILVNQLYQQKKLGIALLLIISLILPIPYQGICFFILSVGLFFLEKWHHKLIIFLMLLVGLIFYFL HPSIDLIVNRLFVMPGLFLVLIFPFILDEIDIAIAQKKLMTYCLALSTILVLILGLFEALPGKILEVFEQQVKFNRVPQD EVTKLALRFREISNKDDVILIPPFVSNFQFFSERAVIVDFKHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQ QTGKELVSVAKKYGAGYILTRVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD >Mature_687_residues MWQFKKYSWYFSLSLFTVIVIGSFIARGYTFPVGNHYTHVPQIKSMLNSELYINDYYVQEMLQFTPRYYYQYLVYFLSKI TGSLSLTYLIYYLTSFISFILGLFALSKIFTPSKLSAAVLIFLSLKSYTLIGYLKLFPNTPIPATFAMSFTVWGIYFCFQ QRWIIGYLFFGIASILQFLVGVLPGIIMIPIMLIETIKKYNYKQVKHQFIVLLSSRILKVKSITKLIDFWFRYELIFLVI IPLVIWLSFACLVYLPMLLTGTTSTDQLTNEEFVFIYGWVRNPHHIIPTYWNWKSRLDFVCFILGGCLCINKIDIAKSKY FLHQPITEKKQIYRYPFSEVEIGNIKEKKVGENFCISNNMRCLEKWKFYLIVAESIFALFLGYIFLEVYPLALFAKLQLA RTVPFAQLIIFIAVGILVNQLYQQKKLGIALLLIISLILPIPYQGICFFILSVGLFFLEKWHHKLIIFLMLLVGLIFYFL HPSIDLIVNRLFVMPGLFLVLIFPFILDEIDIAIAQKKLMTYCLALSTILVLILGLFEALPGKILEVFEQQVKFNRVPQD EVTKLALRFREISNKDDVILIPPFVSNFQFFSERAVIVDFKHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQ QTGKELVSVAKKYGAGYILTRVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 80126; Mature: 80126
Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46
Prosite motif: PS00430 TONB_DEPENDENT_REC_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MWQFKKYSWYFSLSLFTVIVIGSFIARGYTFPVGNHYTHVPQIKSMLNSELYINDYYVQE CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEHHHHHHH MLQFTPRYYYQYLVYFLSKITGSLSLTYLIYYLTSFISFILGLFALSKIFTPSKLSAAVL HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH IFLSLKSYTLIGYLKLFPNTPIPATFAMSFTVWGIYFCFQQRWIIGYLFFGIASILQFLV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVLPGIIMIPIMLIETIKKYNYKQVKHQFIVLLSSRILKVKSITKLIDFWFRYELIFLVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IPLVIWLSFACLVYLPMLLTGTTSTDQLTNEEFVFIYGWVRNPHHIIPTYWNWKSRLDFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEECCCCCCHHHHHHHH CFILGGCLCINKIDIAKSKYFLHQPITEKKQIYRYPFSEVEIGNIKEKKVGENFCISNNM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHCCCCCCCCCCH RCLEKWKFYLIVAESIFALFLGYIFLEVYPLALFAKLQLARTVPFAQLIIFIAVGILVNQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH LYQQKKLGIALLLIISLILPIPYQGICFFILSVGLFFLEKWHHKLIIFLMLLVGLIFYFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HPSIDLIVNRLFVMPGLFLVLIFPFILDEIDIAIAQKKLMTYCLALSTILVLILGLFEAL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PGKILEVFEQQVKFNRVPQDEVTKLALRFREISNKDDVILIPPFVSNFQFFSERAVIVDF CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCEEEEEE KHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQQTGKELVSVAKKYGAGYILT HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE RVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD EEEECCCCCCEEECCCCCEEEEEEECC >Mature Secondary Structure MWQFKKYSWYFSLSLFTVIVIGSFIARGYTFPVGNHYTHVPQIKSMLNSELYINDYYVQE CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEHHHHHHH MLQFTPRYYYQYLVYFLSKITGSLSLTYLIYYLTSFISFILGLFALSKIFTPSKLSAAVL HHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH IFLSLKSYTLIGYLKLFPNTPIPATFAMSFTVWGIYFCFQQRWIIGYLFFGIASILQFLV HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GVLPGIIMIPIMLIETIKKYNYKQVKHQFIVLLSSRILKVKSITKLIDFWFRYELIFLVI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IPLVIWLSFACLVYLPMLLTGTTSTDQLTNEEFVFIYGWVRNPHHIIPTYWNWKSRLDFV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEECCCCCCHHHHHHHH CFILGGCLCINKIDIAKSKYFLHQPITEKKQIYRYPFSEVEIGNIKEKKVGENFCISNNM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCEECCCCHHHCCCCCCCCCCH RCLEKWKFYLIVAESIFALFLGYIFLEVYPLALFAKLQLARTVPFAQLIIFIAVGILVNQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH LYQQKKLGIALLLIISLILPIPYQGICFFILSVGLFFLEKWHHKLIIFLMLLVGLIFYFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HPSIDLIVNRLFVMPGLFLVLIFPFILDEIDIAIAQKKLMTYCLALSTILVLILGLFEAL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PGKILEVFEQQVKFNRVPQDEVTKLALRFREISNKDDVILIPPFVSNFQFFSERAVIVDF CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCEEEEEE KHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQQTGKELVSVAKKYGAGYILT HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE RVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD EEEECCCCCCEEECCCCCEEEEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA