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The map label for this gene is 108562930

Identifier: 108562930

GI number: 108562930

Start: 527797

End: 529404

Strand: Reverse

Name: 108562930

Synonym: HPAG1_0505

Alternate gene names: NA

Gene position: 529404-527797 (Counterclockwise)

Preceding gene: 108562931

Following gene: 108562929

Centisome position: 33.16

GC content: 36.13

Gene sequence:

>1608_bases
ATGTTTAATATTAAAAGGACTTTTTTAATAACGATCATAAGTTTTTTTCTCATTGTTCCTAATTGGTTGAAAGCTATTGA
TTTGCCCATTGTTTCAAATCTCAAAATTTACCAAACAGTTTATTGCATGCTGATACCGAGTTATGTTTTAACCAACAAAA
GTTTTGCAGATATTTTGACAGGCTATACATCTATTGGTGCATCAGGGAGTGGAAAGAGTTCAGGGCAGGGTGTGATTGAA
GCGCTTAGCACACCATTAGCCACAAGTTTAGCCGCTAGCAATCTGGTGAAATATTTGAATACTTTAGGTCCTTTATGGGG
ATCGGCATGGGCAAGTGTTGCTACAGCTATACAAGGTTTTGCTCTAACGCCATCAAGTGGCTGTAATTTTGGTTGGAACG
CATTGATAAATAAAAACATAGATGTATCCATGGATAGCGTGCTAGACAATTTGAGCAACAAGATTCAGAATTTTACCAAA
GGTGGTGTTGAGGACAATGTGAAAGGCAATATTCTTTTACAAATAATTGGCTCAATAACCGCTCAAGCTTCTACGAATAT
TACAGCTGATGGTTTAATTTGGCTGATTGGTAAAGAATTCACTGCAAATAAACTGCAAAACAACACTACAGCCATGCTTG
CTTTTGCCGCATTAGAATCTGTTGTCAAAGGAGCGGACGCTGCTGTTCTTCCTGCATATGGTGTAGTCAATCTGCCTGAT
ATTATCATAGGGCAAGGGTCATATCTTGATTTTGTTTCTTACCTGATTTATATTGTTTTTGGGATTTTTGTTTTTATTTC
TTTTATGAAATTGAGGGATATTTCAAATGGCATTCAGCTTAACATAGGTTTTGAATACATGCGATTTGTTGGGGGGACAT
TATTTAAAATGGCGATGGTCTCTTTTATCGCCTATGCAGGTTTTGGTTATCTTTATAAAATCTCTTATTCCATTTATTTT
GGTTTAGCAGGCGCTTTTGGGCTGAATCAAGTTCTTTTTTGGGCTTTAGATTTAGTGCTGAATTACACTGTTAATTCAAT
TTTACCTGCAGTAAGAGCTGTTTTTTCTAATGTTGGCAACAACGCTCCTAGTTTGTTACAAGGCTTGCAAGTGGCAGGTA
TTTCTTTATTTGCTATTTTTATGCAAGTAACTATCATTATGAGAATAAGCACTGTGGTTGTGAAACCTTTGATAGCGGGG
GCTTTTAGCGGTATTGTGTTCCCTATTGCAGTAAGTTTGATCGTGCTAGATTGGTTCAAAGATTCTATGAAAAACATATT
GATATGGTTTATTAATAATTTGTTTATCTTGGTTCTAGCTATTCCTATTTTGCTCTTTGGTGTTTTGGCATTATTGGCAT
TCAATTTGACCATAACGCCCTCTGTTGCTATACAAAACATCAATCAGGGGGGACTAGGTATCGATTCAACTATTGCGAGT
TTGATCACTCTATTTATTTTAAAAGGTTTCATAGAGACGATTATTGAGAGTGTCAATGCGATCGTTAATACCATTTTTAG
CTCTGTTTCTATGGATGGTAGCAGAATGGATAGAGAAAGAGATGCCTTAATGGTTGGAAGAGTTGGTGGATCTATATTTA
AAGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTCAAATCACAGATTTACAAAACGAACAGACGGTAAGCGAAATTTTGAGAAAGATTAAAGAAGTGGAATCAAAAAATAA
GGCATTAAAACAATAAGAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCCACTTTATTCTTGTGCTAAAATTACAAATATTTTTTAAGAGGAATTGTTGATGGGGCAGGCATTTTTTAAAAAAATTG
TTGGCTGTTTCTGTCTTGGT

Product: cag pathogenicity island protein W

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 535; Mature: 535

Protein sequence:

>535_residues
MFNIKRTFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTK
GGVEDNVKGNILLQIIGSITAQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQLNIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVSLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSIFKG

Sequences:

>Translated_535_residues
MFNIKRTFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTK
GGVEDNVKGNILLQIIGSITAQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQLNIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVSLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSIFKG
>Mature_535_residues
MFNIKRTFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILTGYTSIGASGSGKSSGQGVIE
ALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGFALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTK
GGVEDNVKGNILLQIIGSITAQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQLNIGFEYMRFVGGTLFKMAMVSFIAYAGFGYLYKISYSIYF
GLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGNNAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAG
AFSGIVFPIAVSLIVLDWFKDSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSIFKG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57677; Mature: 57677

Theoretical pI: Translated: 9.05; Mature: 9.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFNIKRTFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
GYTSIGASGSGKSSGQGVIEALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGF
HHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTKGGVEDNVKGNILLQIIGSIT
EECCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
HHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCH
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQLNIGFEYMRFVGGTLFKMAMV
HEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFIAYAGFGYLYKISYSIYFGLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGN
HHHHHHCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAGAFSGIVFPIAVSLIVLDWFK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSIFKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHEEEECCCCHHCCC
>Mature Secondary Structure
MFNIKRTFLITIISFFLIVPNWLKAIDLPIVSNLKIYQTVYCMLIPSYVLTNKSFADILT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
GYTSIGASGSGKSSGQGVIEALSTPLATSLAASNLVKYLNTLGPLWGSAWASVATAIQGF
HHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
ALTPSSGCNFGWNALINKNIDVSMDSVLDNLSNKIQNFTKGGVEDNVKGNILLQIIGSIT
EECCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHH
AQASTNITADGLIWLIGKEFTANKLQNNTTAMLAFAALESVVKGADAAVLPAYGVVNLPD
HHCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCCCH
IIIGQGSYLDFVSYLIYIVFGIFVFISFMKLRDISNGIQLNIGFEYMRFVGGTLFKMAMV
HEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHH
SFIAYAGFGYLYKISYSIYFGLAGAFGLNQVLFWALDLVLNYTVNSILPAVRAVFSNVGN
HHHHHHCCHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NAPSLLQGLQVAGISLFAIFMQVTIIMRISTVVVKPLIAGAFSGIVFPIAVSLIVLDWFK
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
DSMKNILIWFINNLFILVLAIPILLFGVLALLAFNLTITPSVAIQNINQGGLGIDSTIAS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCCCCCCCHHHHHHH
LITLFILKGFIETIIESVNAIVNTIFSSVSMDGSRMDRERDALMVGRVGGSIFKG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHCCHHHHHEEEECCCCHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA