Definition Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome.
Accession NC_006840
Length 2,897,536

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is abgT [H]

Identifier: 59711246

GI number: 59711246

Start: 697495

End: 699054

Strand: Direct

Name: abgT [H]

Synonym: VF_0639

Alternate gene names: 59711246

Gene position: 697495-699054 (Clockwise)

Preceding gene: 59711245

Following gene: 59711250

Centisome position: 24.07

GC content: 39.49

Gene sequence:

>1560_bases
ATGAGTAACCAAGTAGCAGAGAAAACACCTAAGCTTAGCGGCATGGATCGTTTTCTGAATACAATTGAACGAGTAGGTAA
CAAGATACCAGATCCTGCACTACTGTTTTTCTGGGGCCTTTTAATTGTTTGGGGTCTTTCAGCGCTATTATCACAAGTAC
AATTTGACTTAATTCACCCAGTAACCCAAGACGCGGTTCAAGTGAAAAACCTTTTAACTGGTGATTCTCTAGCAAACTTT
TTAGCAACAATGGTAACGAACTTCACGGGCTTTGCTCCTTTAGGTATCGTATTAGTTGCTATGTTAGGTGTAGGTGTTGC
AGATACTTCTGGCTTTATTCAAACAGGCCTAAAGAAAATGCTTAACTTTACGCCAGCTAAACTATTAACACCTATGCTTA
TTCTTGTTGCTATCGTTTCGCATACAGCAGCAGATGCGGGTTACGTTTTAGTTATTCCTCTAGGTGGTATTATTTTCCAC
GCAGCAGGCCGTCATCCACTAGCTGGTATCGCAGCAGCATTTGCTGGTGTATCTGGTGGTTTCTCTGCAAACTTTATCCC
ATCAGGTATTGATCCATTACTAGCTGGCTTTACTCAAACAGCCGCTCAAGTACTAGATACTTCTTATATTGTTAACCCAT
TAGCAAATATTTACTTTACTGGTCTTTCTTCAATTCTAATTGTTGTGATCGGTTGGTATGTAACAGATAAGATTATCGAA
CCTCGTTTAGCAAATACACCAGTAGACGAAGATGCTGAAGAAGCACCTGATCTAGGTTCATTTACTGAGATTGAATCTAA
AGCATTCAAATTTGCTGGTTGGGCGATGGTTGCAGGTATTGCATTATTAATTGCTTTAATCTACCCAGAAAATTCAGCAC
TTCGTTCTCCTGATGGTGAAATTACGTCATTCTCAGCACCATTAATGAAGTCAATTGTTCCACTTATCTTCATTCTATTT
ATTATTCCTGGCATTGTTTATGGGCGTGTTTCAGGAACATTTAAAAGCAGTAATGATGTAATTAAAGCAATGTCACAAAC
GATGGGTACAATGGGTGCATACATGGTTATGTCATTCTTCTGTGCGCAATTCTTAGTAGCATTCAGTCAATCAAATATCG
GTACAATTTTAGCAATGTACGGTGCTGATTTCTTAAAAGCGATGGACCTACCTGGTCAAATGACCATTATTGGTATGATT
TTGCTAACGGCAATGGTTAACTTATTGATTGGTTCAGCATCAGCTAAATGGGCTCTAATTGGCCCTGTATTAGTACCTAT
GTTAATGGGTGTTGGTATTTCACCAGAACTTTCTCAAGCGGCTTACCGTGTTGGTGATTCAGTTTCGAATATCATCTCTC
CTTTAATGGTATTTTTCCCATTAGTAGTGGTTTACTGCCAACGTTACGTTAAGTCTACGGGTATCGGTACTCTTGCTTCT
CTAATGATGCCATTCTCTATTGCTATGTTAGTTGGTTGGACAGTATTCCTACTTGCATACTGGGCTCTAGGCATTCCACT
AGGTATCCAAGCGCCATACACATATAACCTTCCAGGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATCTGGTTTACACTGATTTAGCAAAGGAATAGATAAAGAATAAAAAAAATCAAATCTCTTTATCTTTAAATACAACAT
TACAGAAAATGGAGTTACGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTGTATTAGTAAAAATAAAGCCCTGAGAATGTTGAGTTCTCAGGGCTTTTTTTATGAGAGTAAAGAAAGGGGATTACTT
GAACTTTCTTAGGTATCGAT

Product: aminobenzoyl-glutamate transport protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 519; Mature: 518

Protein sequence:

>519_residues
MSNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHPVTQDAVQVKNLLTGDSLANF
LATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKMLNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFH
AAGRHPLAGIAAAFAGVSGGFSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIE
PRLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGEITSFSAPLMKSIVPLIFILF
IIPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFFCAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMI
LLTAMVNLLIGSASAKWALIGPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLAS
LMMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG

Sequences:

>Translated_519_residues
MSNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHPVTQDAVQVKNLLTGDSLANF
LATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKMLNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFH
AAGRHPLAGIAAAFAGVSGGFSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIE
PRLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGEITSFSAPLMKSIVPLIFILF
IIPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFFCAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMI
LLTAMVNLLIGSASAKWALIGPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLAS
LMMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG
>Mature_518_residues
SNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHPVTQDAVQVKNLLTGDSLANFL
ATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKMLNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFHA
AGRHPLAGIAAAFAGVSGGFSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIEP
RLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGEITSFSAPLMKSIVPLIFILFI
IPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFFCAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMIL
LTAMVNLLIGSASAKWALIGPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLASL
MMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG

Specific function: Essential for aminobenzoyl-glutamate utilization. May transport aminobenzoyl-glutamate into the cell. Seems also to increase the sensitivity to low levels of aminobenzoyl-glutamate. Sufficient to confer aminobenzoyl-glutamate utilization phenotype [H]

COG id: COG2978

COG function: function code H; Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI87081879, Length=487, Percent_Identity=35.3182751540041, Blast_Score=303, Evalue=2e-83,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004697
- InterPro:   IPR011540 [H]

Pfam domain/function: PF03806 ABG_transport [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55196; Mature: 55065

Theoretical pI: Translated: 5.34; Mature: 5.34

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
4.6 %Met     (Translated Protein)
5.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
4.4 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCC
>Mature Secondary Structure 
SNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHP
CCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VTQDAVQVKNLLTGDSLANFLATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFHAAGRHPLAGIAAAFAGVSGG
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC
FSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIE
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
PRLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGE
CCCCCCCCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
ITSFSAPLMKSIVPLIFILFIIPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFF
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
CAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMILLTAMVNLLIGSASAKWALI
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
GPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLAS
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
LMMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9829935; 9097039; 9278503; 2825131; 7567469 [H]