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The map label for this gene is 59710880

Identifier: 59710880

GI number: 59710880

Start: 278182

End: 280761

Strand: Reverse

Name: 59710880

Synonym: VF_0273

Alternate gene names: NA

Gene position: 280761-278182 (Counterclockwise)

Preceding gene: 59710881

Following gene: 59710879

Centisome position: 9.69

GC content: 40.93

Gene sequence:

>2580_bases
ATGACGCAACAATCTTCACCGTCGCAAGATGTGCAAGAAATGGTGGCCCAATCTGATACCGGGGCTCGTTCACCGCAAGG
ATTATCTGGCCGTATTTTATGGTTTATTCCACTATGTTGGTCTTTATTCCAGCTTTGGTATGCCTCCCCTTTACCGTTCA
TTTTTGATTTCGGCATACTTAATGATACAGAAGCGCGATCTATACACTTAGCTTTTGCTATTTTTTTAGCATTCACCGCT
TACCCTGCACTCAAAAACTCACCAAGAGACCGTATTCCTGCGATTGATTGGGTTCTGGCTTTATTAGGCAGCTTCGCTGC
TGCTTATATCTATATTTTTTATACCGAACTTGCAGGCCGCTCTGGTGCGCCAACCACATTTGATATTGTGGCTGCTGTTA
CCGGTATGATTTTACTACTTGAAGCAACTCGACGAGCATTAGGTCCACCACTCATGGTTGTGGCAGCCGTGTTTCTTCTA
TACACCTTTGCTGGTCCACATATGCCAGATGTTATTGCTCATAAAGGTGCAAGCTTAAATAAAGCGATGTCTCACTTATG
GCTAACAACTGAAGGGGTATTTGGTGTTGCTTTAGGCGTATCAACCTCATTTGTTTTCTTATTTGTGCTTTTTGGCGCCA
TGTTAGAAAAAGCAGGTGCTGGTGCTTACTTTATTAAAGTAGCTTTCTCTTTACTCGGTCATATGAAAGGTGGCCCAGCA
AAAGCAGCGGTTGTTGCTTCAGGTTTATCAGGTTTAGTTTCAGGTTCTTCTATTGCCAATGTTGTAACAACTGGCACATT
CACCATTCCACTAATGAAACGCGTTGGTTTCCCAGGAACAAAAGCGGGTGCCGTTGAAGTTGCAGCATCAACGAATGGTC
AATTAACACCGCCTATTATGGGGGCTGCGGCATTCTTAATGGTGGAGTACGTGGGTATTTCGTATGTTGAAGTAATTAAA
GCCGCTTTATTACCAGCACTTATCTCTTACATCGCATTACTTTATATTGTCCACCTTGAAGCCTGTAAAGCAGGAATGAA
AGGCTTACCACGTCGTCATAACCCAACACTCGTTCAAAGTTTGCTCTCTTTTACAGGAACTATTCTTGGTTTGTGTATTA
TTAGTGCTGCTGTTTATTATGGTATAGGTTGGACCAAAGGAGTCTTTGGAGATGCAGCAACCCCAATTGTTACTATTGCA
TTGCTGCTATCTTATGTTGGCTTAATTCGTATTTCAGCTAAATATCAAGAACATGCCATGATGGCAATTGATGAAGAGTT
AACTGAAGTGCCAGATCCTGGTCCAACAATCAAATCAGGTTTGCATTTCTTATTACCTATCGTGGTATTAGTGTGGTGTT
TGACTGTTGAGCGATTTTCTCCTGGTCTATCTGCATTCTGGGCATCAGTATTTATGATCTTTATCTTGTTAACTCAACGA
CCATTAATCAGCTTTTTTACTAAAGAAGGCGATATGTTCGAAAGTGTAAAACAAGGATTTGATGATTTACTAGAAAGTCT
GGTATCAGGTGCTAGAAACATGATTGGTATCGGTGTTGCAACGGCAGCAGCTGGTACGGTTGTTGGTGTAGTAACACTTA
CGGGTATCGGCCTTGTTATGACTGATTTCGTAGAATTTATTTCTGGCGGTAGCATCATATTAATGCTGTTATTTACTGCG
GTGATCAGTTTAATTCTTGGTATGGGCTTACCAACAACAGCAAACTATATCGTTGTATCAACGCTCATGGCACCCGTTAT
TGTGACATTAGGTGCAGCTCATGGATTAATCATTCCACTCATTGCTGTTCATTTATTTGTCTTTTATTTTGGTATTTTAG
CGGATGATACACCGCCAGTAGGTCTTGCTGCATTTGCAGCAGCAGCGATTGCGAAATCCGATCCAATACGAACAGGTATC
CAAGGTTTTACCTATGATATCCGTACTGCAATACTGCCATTTATGTTTATTTTCAATACTCAACTATTGTTAATGGGGAT
TGATTCATGGTGGCACCTAGCATTAACGGTTATTTCATCGATCATTGCGATGTTAACTTTTTCTGCAGCAACACAAGGTT
GGTGGTTTACTAAAACAAAATGGTGGGAAACCGCTCTTTTATTGTTAATTACTTTCTCTTTATTCCGTCCGGGGTACTGG
TGGGATCAATTGTATCCAGCAAAAGATTATCACCAAGGAATTGAGATTGCTCAAATCGCAGAAGGGCTAAATATAGGACA
ATCACTGGAATTACAAGTGAGTGGTGAAAACCTAGAAGGTGACATCATAAACAAAACTGTTCGTTTACCTTTTGATGAGA
GAGCTATTACTGGTGAAGAACGGGTCAGTTCAATGGGGCTAATGCTATCTGAAGTCGACAACAAAATGATTGTCGATATG
GTTGAGTTTGGAAGTCCTGCTGAAGCATCTGGTATTGATTTTGATTGGGAAATCAAACAAGTTGTCCTTGATGCAGATCG
TCCATTAAAAGAGTGGGTATTTGTTCCAACTCTACTACTACTTTTGGCATTAGGCTTAAATCAACGTCGCCGAGCAAAAA
AGGATAACTTAGCGGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTAAAGATCAGCTTTTTTGGCCTATATATTGGCTATATTCGGAAACCTAATACTTATTTGAAAGAGTATTAAATTCGA
CCATCACTAAGGAAAAGTAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGAATGGAATCTATGGGGAGTATCATCTCCCCAAATTAGGTAATAAAAATATGTATAAACAGATCTTGGTTCCAGTAGA
TTTAAACGAAAAAGGGTTTG

Product: transporter

Products: NA

Alternate protein names: Trap Transporter 4tm/12tm Fusion Protein; TRAP Transporter; TRAP-Type Transport System Permease Protein; TRAP-Type Transport System Fused Permease Component; TRAP-Type Transport System Permease Component; TRAP-Type Transporter 4TM/12TM Fusion Protein; TRAP-Type Transporter Fused Permease Components; TRAP-T Family Transporter With Fused DctQ/DctM Subunits; Inner Membrane Protein; TRAP-Type Transporter Permease Component; C4-Dicarboxylate Anaerobic Carrier; Permease; TRAP-Type Transport System Permease; TRAP Transporter Large Permease; TRAP Transporter 4TM/12TM Fusion Family; C4-Dicarboxylate Transporter; TRAP Type Transporter Protein; TRAP-T Family Transporter Fused Inner Membrane Subunits; TRAP Transporter Transmembrane Protein; TRAP Transporter Permease; Integral Membrane Protein; Trap Family Transporter; N-Carbamoyl-L-Amino Acid Hydrolase; TRAP-Type Transporter; 4TM/12TM TRAP Transporter; TRAP Transporter Membrane-Spanning Component; TRAP-Type Transport System

Number of amino acids: Translated: 859; Mature: 858

Protein sequence:

>859_residues
MTQQSSPSQDVQEMVAQSDTGARSPQGLSGRILWFIPLCWSLFQLWYASPLPFIFDFGILNDTEARSIHLAFAIFLAFTA
YPALKNSPRDRIPAIDWVLALLGSFAAAYIYIFYTELAGRSGAPTTFDIVAAVTGMILLLEATRRALGPPLMVVAAVFLL
YTFAGPHMPDVIAHKGASLNKAMSHLWLTTEGVFGVALGVSTSFVFLFVLFGAMLEKAGAGAYFIKVAFSLLGHMKGGPA
KAAVVASGLSGLVSGSSIANVVTTGTFTIPLMKRVGFPGTKAGAVEVAASTNGQLTPPIMGAAAFLMVEYVGISYVEVIK
AALLPALISYIALLYIVHLEACKAGMKGLPRRHNPTLVQSLLSFTGTILGLCIISAAVYYGIGWTKGVFGDAATPIVTIA
LLLSYVGLIRISAKYQEHAMMAIDEELTEVPDPGPTIKSGLHFLLPIVVLVWCLTVERFSPGLSAFWASVFMIFILLTQR
PLISFFTKEGDMFESVKQGFDDLLESLVSGARNMIGIGVATAAAGTVVGVVTLTGIGLVMTDFVEFISGGSIILMLLFTA
VISLILGMGLPTTANYIVVSTLMAPVIVTLGAAHGLIIPLIAVHLFVFYFGILADDTPPVGLAAFAAAAIAKSDPIRTGI
QGFTYDIRTAILPFMFIFNTQLLLMGIDSWWHLALTVISSIIAMLTFSAATQGWWFTKTKWWETALLLLITFSLFRPGYW
WDQLYPAKDYHQGIEIAQIAEGLNIGQSLELQVSGENLEGDIINKTVRLPFDERAITGEERVSSMGLMLSEVDNKMIVDM
VEFGSPAEASGIDFDWEIKQVVLDADRPLKEWVFVPTLLLLLALGLNQRRRAKKDNLAA

Sequences:

>Translated_859_residues
MTQQSSPSQDVQEMVAQSDTGARSPQGLSGRILWFIPLCWSLFQLWYASPLPFIFDFGILNDTEARSIHLAFAIFLAFTA
YPALKNSPRDRIPAIDWVLALLGSFAAAYIYIFYTELAGRSGAPTTFDIVAAVTGMILLLEATRRALGPPLMVVAAVFLL
YTFAGPHMPDVIAHKGASLNKAMSHLWLTTEGVFGVALGVSTSFVFLFVLFGAMLEKAGAGAYFIKVAFSLLGHMKGGPA
KAAVVASGLSGLVSGSSIANVVTTGTFTIPLMKRVGFPGTKAGAVEVAASTNGQLTPPIMGAAAFLMVEYVGISYVEVIK
AALLPALISYIALLYIVHLEACKAGMKGLPRRHNPTLVQSLLSFTGTILGLCIISAAVYYGIGWTKGVFGDAATPIVTIA
LLLSYVGLIRISAKYQEHAMMAIDEELTEVPDPGPTIKSGLHFLLPIVVLVWCLTVERFSPGLSAFWASVFMIFILLTQR
PLISFFTKEGDMFESVKQGFDDLLESLVSGARNMIGIGVATAAAGTVVGVVTLTGIGLVMTDFVEFISGGSIILMLLFTA
VISLILGMGLPTTANYIVVSTLMAPVIVTLGAAHGLIIPLIAVHLFVFYFGILADDTPPVGLAAFAAAAIAKSDPIRTGI
QGFTYDIRTAILPFMFIFNTQLLLMGIDSWWHLALTVISSIIAMLTFSAATQGWWFTKTKWWETALLLLITFSLFRPGYW
WDQLYPAKDYHQGIEIAQIAEGLNIGQSLELQVSGENLEGDIINKTVRLPFDERAITGEERVSSMGLMLSEVDNKMIVDM
VEFGSPAEASGIDFDWEIKQVVLDADRPLKEWVFVPTLLLLLALGLNQRRRAKKDNLAA
>Mature_858_residues
TQQSSPSQDVQEMVAQSDTGARSPQGLSGRILWFIPLCWSLFQLWYASPLPFIFDFGILNDTEARSIHLAFAIFLAFTAY
PALKNSPRDRIPAIDWVLALLGSFAAAYIYIFYTELAGRSGAPTTFDIVAAVTGMILLLEATRRALGPPLMVVAAVFLLY
TFAGPHMPDVIAHKGASLNKAMSHLWLTTEGVFGVALGVSTSFVFLFVLFGAMLEKAGAGAYFIKVAFSLLGHMKGGPAK
AAVVASGLSGLVSGSSIANVVTTGTFTIPLMKRVGFPGTKAGAVEVAASTNGQLTPPIMGAAAFLMVEYVGISYVEVIKA
ALLPALISYIALLYIVHLEACKAGMKGLPRRHNPTLVQSLLSFTGTILGLCIISAAVYYGIGWTKGVFGDAATPIVTIAL
LLSYVGLIRISAKYQEHAMMAIDEELTEVPDPGPTIKSGLHFLLPIVVLVWCLTVERFSPGLSAFWASVFMIFILLTQRP
LISFFTKEGDMFESVKQGFDDLLESLVSGARNMIGIGVATAAAGTVVGVVTLTGIGLVMTDFVEFISGGSIILMLLFTAV
ISLILGMGLPTTANYIVVSTLMAPVIVTLGAAHGLIIPLIAVHLFVFYFGILADDTPPVGLAAFAAAAIAKSDPIRTGIQ
GFTYDIRTAILPFMFIFNTQLLLMGIDSWWHLALTVISSIIAMLTFSAATQGWWFTKTKWWETALLLLITFSLFRPGYWW
DQLYPAKDYHQGIEIAQIAEGLNIGQSLELQVSGENLEGDIINKTVRLPFDERAITGEERVSSMGLMLSEVDNKMIVDMV
EFGSPAEASGIDFDWEIKQVVLDADRPLKEWVFVPTLLLLLALGLNQRRRAKKDNLAA

Specific function: Unknown

COG id: COG4666

COG function: function code R; TRAP-type uncharacterized transport system, fused permease components

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 92680; Mature: 92549

Theoretical pI: Translated: 5.78; Mature: 5.78

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTQQSSPSQDVQEMVAQSDTGARSPQGLSGRILWFIPLCWSLFQLWYASPLPFIFDFGIL
CCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCC
NDTEARSIHLAFAIFLAFTAYPALKNSPRDRIPAIDWVLALLGSFAAAYIYIFYTELAGR
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SGAPTTFDIVAAVTGMILLLEATRRALGPPLMVVAAVFLLYTFAGPHMPDVIAHKGASLN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCHHH
KAMSHLWLTTEGVFGVALGVSTSFVFLFVLFGAMLEKAGAGAYFIKVAFSLLGHMKGGPA
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCH
KAAVVASGLSGLVSGSSIANVVTTGTFTIPLMKRVGFPGTKAGAVEVAASTNGQLTPPIM
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCHHH
GAAAFLMVEYVGISYVEVIKAALLPALISYIALLYIVHLEACKAGMKGLPRRHNPTLVQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
LLSFTGTILGLCIISAAVYYGIGWTKGVFGDAATPIVTIALLLSYVGLIRISAKYQEHAM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MAIDEELTEVPDPGPTIKSGLHFLLPIVVLVWCLTVERFSPGLSAFWASVFMIFILLTQR
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PLISFFTKEGDMFESVKQGFDDLLESLVSGARNMIGIGVATAAAGTVVGVVTLTGIGLVM
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TDFVEFISGGSIILMLLFTAVISLILGMGLPTTANYIVVSTLMAPVIVTLGAAHGLIIPL
HHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAVHLFVFYFGILADDTPPVGLAAFAAAAIAKSDPIRTGIQGFTYDIRTAILPFMFIFNT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
QLLLMGIDSWWHLALTVISSIIAMLTFSAATQGWWFTKTKWWETALLLLITFSLFRPGYW
HHHEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
WDQLYPAKDYHQGIEIAQIAEGLNIGQSLELQVSGENLEGDIINKTVRLPFDERAITGEE
HHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHCCEEECCCCCCCCCHHH
RVSSMGLMLSEVDNKMIVDMVEFGSPAEASGIDFDWEIKQVVLDADRPLKEWVFVPTLLL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LLALGLNQRRRAKKDNLAA
HHHHCCCHHHHCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TQQSSPSQDVQEMVAQSDTGARSPQGLSGRILWFIPLCWSLFQLWYASPLPFIFDFGIL
CCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHCCCCC
NDTEARSIHLAFAIFLAFTAYPALKNSPRDRIPAIDWVLALLGSFAAAYIYIFYTELAGR
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
SGAPTTFDIVAAVTGMILLLEATRRALGPPLMVVAAVFLLYTFAGPHMPDVIAHKGASLN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCHHH
KAMSHLWLTTEGVFGVALGVSTSFVFLFVLFGAMLEKAGAGAYFIKVAFSLLGHMKGGPA
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KAAVVASGLSGLVSGSSIANVVTTGTFTIPLMKRVGFPGTKAGAVEVAASTNGQLTPPIM
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GAAAFLMVEYVGISYVEVIKAALLPALISYIALLYIVHLEACKAGMKGLPRRHNPTLVQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH
LLSFTGTILGLCIISAAVYYGIGWTKGVFGDAATPIVTIALLLSYVGLIRISAKYQEHAM
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HHHCCCCHHHHCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCHHHCCEEECCCCCCCCCHHH
RVSSMGLMLSEVDNKMIVDMVEFGSPAEASGIDFDWEIKQVVLDADRPLKEWVFVPTLLL
HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
LLALGLNQRRRAKKDNLAA
HHHHCCCHHHHCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA