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Definition Borrelia garinii PBi chromosome chromosome linear, complete sequence.
Accession NC_006156
Length 904,246

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The map label for this gene is 51598512

Identifier: 51598512

GI number: 51598512

Start: 257790

End: 260090

Strand: Direct

Name: 51598512

Synonym: BG0255

Alternate gene names: NA

Gene position: 257790-260090 (Clockwise)

Preceding gene: 51598511

Following gene: 51598514

Centisome position: 28.51

GC content: 26.6

Gene sequence:

>2301_bases
ATGGACTTTGAAAGTCTAAGCATTAGATATAGGAAAATTATATTCACAATATTTATATTAATTACTATTTTTTTAGGGTT
TTTTTTAAAAAATCTTAAATTCGATGCAAACATCTTAAAACTTATCCCCAAAACTAAAGAAACTGAAAGCTTAATAGACA
TTGATAAAAGTAATTCACTTTTATCTACAATAGTAATATTTCAAGATAAAAAAAATATTTTCAATAAAAAAAATTTTGAA
ACAATAAACAGTGTAATCAATGAAATAACCAAAATTTTAAAAGTATCTCCAAATGCCGTAACAAGCATATTTTCTTATTT
TCCGCAATTTAAAAAAGAAATTTACACAGATAAAGACATAGAAGAAATAAAAAATAAAATAAAGTCAACTCCATTCGTAA
AAAACACATTTTTAGGCAACTCAGAAAATTTAATATACTTCATAATAATCCCATCAGAAAGTGACAAAATTAACTTCAGT
AGAAATTTAAAAAATGAACTTGATGAGATGGAGGAAACAATTAAAAAATATGAAACAGACAATCTAAAGTTGTATCTTAC
AGGAGATTTAATAGTAAGAGAAAAAATCTTAAACTACATGGTTGAAGACTTCAAGATTTTAGGACCTCTTGCTGCTTTTG
TAGTAATAATTTCACTTTATCTTATTATAAAAAATCTAATGGGTGCATTAATTCCCATTTTTATTGCATTATTATCATTG
ATTTGGACTTTTGGAATTAAAGGACTTGTAAACTCCCCCATTACAGTGCCAGAAACTTCAATGATTGTTTTACTCATTTC
AATCGGATGTGATAATGCTGTACATATAATAAATGGAATATTTAAATTAATAAAAAAAGAACAACTCTCAAAAGAATCAA
TAAAAACAACAATTAAAAAACTTAAAACACCAATACTTCTAACATCTCTTACAACTGCATTTGGATTTTTATCTCTTACA
ACCTCTTCAATTAATGCTTACAAAACAATGGGTATATTCATGTCAATTGGAGTAATTATCTCAATGGCAATCTCATTAAC
CGTTTTACCTGGAATAATAACATTAATTCCATTTACAAAAAAAAAGTCTCTTGAAAAACAAAAAGAAAATAAACCGTATA
GAATATTTTTCCTTGAAAAACTTGCCAAACTAAATACACAAATAACAAAGTCTATATTAAAAAGAAAATACATATCCTCT
ATAGTAGTCATCATCATACTGGGAATTTCTATTGCGGGTCTTTTAAAAATAGAAATCAATTTTGATGAAAAAGATTACTT
TAAAGAAAGCACAAGTGTAAAAAAAACATTAAACCTAATGCAAAAAGAAATGGGAGGAATATCGATTTTCAAAATAGAAC
TTGAAGGCAAACCCGGTGAATTTAAAAATGCTAAAGCAATGCAAACCTTAGATTTAATTACAGACAAACTTGATGAATTT
TCTGCAAAAACTCAATCAAGCTCTATTAATGGAATTTTAAAATTTGTAAATTTTAAAATTAAAAAAGAATCCCCGCTAGA
GTATAAACTGCCCGAAAGCAAAACCATATTAAACAAACTAATAAATTTGATAGATAAAAGCGATTGGACTAAAGACAATA
AAAAAATGTATATTAATGATGATTGGTCATTAATATCTATTATGGTAAGAATTGAAGACAACTCAACCGAAGGAATAAAA
AAATTTGAAAAATATGCTATTGAAACAATTAATGAACATATGAGAAATAATAAATATCATTTTTCAGGGGTATATGATAA
GGTGTTAATAGCTAAAACAATGGTAAGAGAGCAGGTTATGAACATTGTAACAACTCTTGGATCAATAACACTGCTACTTA
TGTTTTTCTTCAAATCTATAAAAACTGGAATAATTATTGCAATCCCAGTGGCATGGTCAGTGTTTCTAAACTTTGCTGTA
ATGAGATTATTTGGGATAACTTTAAACCCTGCAACAGCAACAATTGCATCTGTAAGCATGGGAGTCGGAGTAGATTATTC
AATTCATTTTTTTAACACGTTTATTTTAAAATACCAAAAAAGTCAAATCTACAAAAATGCACTACTTAAATCAATACCCA
GCGTATTTAATGGAATATTCGCAAATTCTATTTCTGTTGGAATAGGTTTTTTAACCTTAACATTTTCAGCATATAAAATA
ATATCAACTCTTGGGGCAATAATTGCTTTTACAATGCTAACGACATCCCTTGCATCACTAACTCTTCTTCCATTATTAAT
TTATTTATTTAAACCTAGAGTTAGAGTTAAACTGGCCTTAAATAACAATTTAAAAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAAAATAAAAGCAAACTTATTAAATAAAAAAATTGTAAAAATAATTGCAATTAAAAACAAGCTTGTCAACATAGTGATA
AAGTAAAAAAGAGGCATTAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACAATAATTTAATGACCTCGCACATATTATCTACAAGATAAAAATTAATACCGCTCTTAATGTTAATAGGAATCTCTTC
TAAGTCAACTCTATTTGCCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Integral Membrane Protein; RND Efflux Transporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; RND Superfamily Exporter; Exporter Of RND Superfamily Protein; Exporters Of RND Superfamily; Histidine Kinase; Exporter Of RND Superfamily; MMPL Domain-Containing Protein; Mmpl Family; Sterol-Sensing 5tm Box Domain Protein; MMPL Domain Protein; Transporter RND Superfamily

Number of amino acids: Translated: 766; Mature: 766

Protein sequence:

>766_residues
MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE
TINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFS
RNLKNELDEMEETIKKYETDNLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL
IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKKLKTPILLTSLTTAFGFLSLT
TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTKKKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISS
IVVIIILGISIAGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF
SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYINDDWSLISIMVRIEDNSTEGIK
KFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVMNIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV
MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN

Sequences:

>Translated_766_residues
MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE
TINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFS
RNLKNELDEMEETIKKYETDNLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL
IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKKLKTPILLTSLTTAFGFLSLT
TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTKKKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISS
IVVIIILGISIAGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF
SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYINDDWSLISIMVRIEDNSTEGIK
KFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVMNIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV
MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN
>Mature_766_residues
MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE
TINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFS
RNLKNELDEMEETIKKYETDNLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL
IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKKLKTPILLTSLTTAFGFLSLT
TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTKKKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISS
IVVIIILGISIAGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF
SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYINDDWSLISIMVRIEDNSTEGIK
KFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVMNIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV
MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 86897; Mature: 86897

Theoretical pI: Translated: 10.24; Mature: 10.24

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCH
LSTIVIFQDKKNIFNKKNFETINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDI
HHHHEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFSRNLKNELDEMEETIKKYETD
HHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKK
HHHHCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKTPILLTSLTTAFGFLSLTTSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
KKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISSIVVIIILGISIAGLLKIEIN
HHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEE
FDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYIND
HHHCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECC
DWSLISIMVRIEDNSTEGIKKFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVM
CCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAVMRLFGITLNPATATIASVSM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
GVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCH
LSTIVIFQDKKNIFNKKNFETINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDI
HHHHEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
EEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFSRNLKNELDEMEETIKKYETD
HHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
NLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL
CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKK
HHHHCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LKTPILLTSLTTAFGFLSLTTSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTK
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
KKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISSIVVIIILGISIAGLLKIEIN
HHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEE
FDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYIND
HHHCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECC
DWSLISIMVRIEDNSTEGIKKFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVM
CCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAVMRLFGITLNPATATIASVSM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
GVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI
CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA