| Definition | Borrelia garinii PBi chromosome chromosome linear, complete sequence. |
|---|---|
| Accession | NC_006156 |
| Length | 904,246 |
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The map label for this gene is 51598512
Identifier: 51598512
GI number: 51598512
Start: 257790
End: 260090
Strand: Direct
Name: 51598512
Synonym: BG0255
Alternate gene names: NA
Gene position: 257790-260090 (Clockwise)
Preceding gene: 51598511
Following gene: 51598514
Centisome position: 28.51
GC content: 26.6
Gene sequence:
>2301_bases ATGGACTTTGAAAGTCTAAGCATTAGATATAGGAAAATTATATTCACAATATTTATATTAATTACTATTTTTTTAGGGTT TTTTTTAAAAAATCTTAAATTCGATGCAAACATCTTAAAACTTATCCCCAAAACTAAAGAAACTGAAAGCTTAATAGACA TTGATAAAAGTAATTCACTTTTATCTACAATAGTAATATTTCAAGATAAAAAAAATATTTTCAATAAAAAAAATTTTGAA ACAATAAACAGTGTAATCAATGAAATAACCAAAATTTTAAAAGTATCTCCAAATGCCGTAACAAGCATATTTTCTTATTT TCCGCAATTTAAAAAAGAAATTTACACAGATAAAGACATAGAAGAAATAAAAAATAAAATAAAGTCAACTCCATTCGTAA AAAACACATTTTTAGGCAACTCAGAAAATTTAATATACTTCATAATAATCCCATCAGAAAGTGACAAAATTAACTTCAGT AGAAATTTAAAAAATGAACTTGATGAGATGGAGGAAACAATTAAAAAATATGAAACAGACAATCTAAAGTTGTATCTTAC AGGAGATTTAATAGTAAGAGAAAAAATCTTAAACTACATGGTTGAAGACTTCAAGATTTTAGGACCTCTTGCTGCTTTTG TAGTAATAATTTCACTTTATCTTATTATAAAAAATCTAATGGGTGCATTAATTCCCATTTTTATTGCATTATTATCATTG ATTTGGACTTTTGGAATTAAAGGACTTGTAAACTCCCCCATTACAGTGCCAGAAACTTCAATGATTGTTTTACTCATTTC AATCGGATGTGATAATGCTGTACATATAATAAATGGAATATTTAAATTAATAAAAAAAGAACAACTCTCAAAAGAATCAA TAAAAACAACAATTAAAAAACTTAAAACACCAATACTTCTAACATCTCTTACAACTGCATTTGGATTTTTATCTCTTACA ACCTCTTCAATTAATGCTTACAAAACAATGGGTATATTCATGTCAATTGGAGTAATTATCTCAATGGCAATCTCATTAAC CGTTTTACCTGGAATAATAACATTAATTCCATTTACAAAAAAAAAGTCTCTTGAAAAACAAAAAGAAAATAAACCGTATA GAATATTTTTCCTTGAAAAACTTGCCAAACTAAATACACAAATAACAAAGTCTATATTAAAAAGAAAATACATATCCTCT ATAGTAGTCATCATCATACTGGGAATTTCTATTGCGGGTCTTTTAAAAATAGAAATCAATTTTGATGAAAAAGATTACTT TAAAGAAAGCACAAGTGTAAAAAAAACATTAAACCTAATGCAAAAAGAAATGGGAGGAATATCGATTTTCAAAATAGAAC TTGAAGGCAAACCCGGTGAATTTAAAAATGCTAAAGCAATGCAAACCTTAGATTTAATTACAGACAAACTTGATGAATTT TCTGCAAAAACTCAATCAAGCTCTATTAATGGAATTTTAAAATTTGTAAATTTTAAAATTAAAAAAGAATCCCCGCTAGA GTATAAACTGCCCGAAAGCAAAACCATATTAAACAAACTAATAAATTTGATAGATAAAAGCGATTGGACTAAAGACAATA AAAAAATGTATATTAATGATGATTGGTCATTAATATCTATTATGGTAAGAATTGAAGACAACTCAACCGAAGGAATAAAA AAATTTGAAAAATATGCTATTGAAACAATTAATGAACATATGAGAAATAATAAATATCATTTTTCAGGGGTATATGATAA GGTGTTAATAGCTAAAACAATGGTAAGAGAGCAGGTTATGAACATTGTAACAACTCTTGGATCAATAACACTGCTACTTA TGTTTTTCTTCAAATCTATAAAAACTGGAATAATTATTGCAATCCCAGTGGCATGGTCAGTGTTTCTAAACTTTGCTGTA ATGAGATTATTTGGGATAACTTTAAACCCTGCAACAGCAACAATTGCATCTGTAAGCATGGGAGTCGGAGTAGATTATTC AATTCATTTTTTTAACACGTTTATTTTAAAATACCAAAAAAGTCAAATCTACAAAAATGCACTACTTAAATCAATACCCA GCGTATTTAATGGAATATTCGCAAATTCTATTTCTGTTGGAATAGGTTTTTTAACCTTAACATTTTCAGCATATAAAATA ATATCAACTCTTGGGGCAATAATTGCTTTTACAATGCTAACGACATCCCTTGCATCACTAACTCTTCTTCCATTATTAAT TTATTTATTTAAACCTAGAGTTAGAGTTAAACTGGCCTTAAATAACAATTTAAAAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GCAAAATAAAAGCAAACTTATTAAATAAAAAAATTGTAAAAATAATTGCAATTAAAAACAAGCTTGTCAACATAGTGATA AAGTAAAAAAGAGGCATTAT
Downstream 100 bases:
>100_bases AACAATAATTTAATGACCTCGCACATATTATCTACAAGATAAAAATTAATACCGCTCTTAATGTTAATAGGAATCTCTTC TAAGTCAACTCTATTTGCCT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Integral Membrane Protein; RND Efflux Transporter; Exporter Of RND Superfamily Protein-Like Protein; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; RND Superfamily Exporter; Exporter Of RND Superfamily Protein; Exporters Of RND Superfamily; Histidine Kinase; Exporter Of RND Superfamily; MMPL Domain-Containing Protein; Mmpl Family; Sterol-Sensing 5tm Box Domain Protein; MMPL Domain Protein; Transporter RND Superfamily
Number of amino acids: Translated: 766; Mature: 766
Protein sequence:
>766_residues MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE TINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFS RNLKNELDEMEETIKKYETDNLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKKLKTPILLTSLTTAFGFLSLT TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTKKKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISS IVVIIILGISIAGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYINDDWSLISIMVRIEDNSTEGIK KFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVMNIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN
Sequences:
>Translated_766_residues MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE TINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFS RNLKNELDEMEETIKKYETDNLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKKLKTPILLTSLTTAFGFLSLT TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTKKKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISS IVVIIILGISIAGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYINDDWSLISIMVRIEDNSTEGIK KFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVMNIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN >Mature_766_residues MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSLLSTIVIFQDKKNIFNKKNFE TINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDIEEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFS RNLKNELDEMEETIKKYETDNLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKKLKTPILLTSLTTAFGFLSLT TSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTKKKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISS IVVIIILGISIAGLLKIEINFDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYINDDWSLISIMVRIEDNSTEGIK KFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVMNIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAV MRLFGITLNPATATIASVSMGVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN
Specific function: Unknown
COG id: COG1033
COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 86897; Mature: 86897
Theoretical pI: Translated: 10.24; Mature: 10.24
Prosite motif: PS50156 SSD
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCH LSTIVIFQDKKNIFNKKNFETINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDI HHHHEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH EEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFSRNLKNELDEMEETIKKYETD HHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKK HHHHCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKTPILLTSLTTAFGFLSLTTSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTK HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH KKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISSIVVIIILGISIAGLLKIEIN HHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEE FDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYIND HHHCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECC DWSLISIMVRIEDNSTEGIKKFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVM CCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAVMRLFGITLNPATATIASVSM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH GVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCC >Mature Secondary Structure MDFESLSIRYRKIIFTIFILITIFLGFFLKNLKFDANILKLIPKTKETESLIDIDKSNSL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCH LSTIVIFQDKKNIFNKKNFETINSVINEITKILKVSPNAVTSIFSYFPQFKKEIYTDKDI HHHHEEEECCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH EEIKNKIKSTPFVKNTFLGNSENLIYFIIIPSESDKINFSRNLKNELDEMEETIKKYETD HHHHHHHCCCCCCHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC NLKLYLTGDLIVREKILNYMVEDFKILGPLAAFVVIISLYLIIKNLMGALIPIFIALLSL CEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IWTFGIKGLVNSPITVPETSMIVLLISIGCDNAVHIINGIFKLIKKEQLSKESIKTTIKK HHHHCCHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LKTPILLTSLTTAFGFLSLTTSSINAYKTMGIFMSIGVIISMAISLTVLPGIITLIPFTK HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH KKSLEKQKENKPYRIFFLEKLAKLNTQITKSILKRKYISSIVVIIILGISIAGLLKIEIN HHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEE FDEKDYFKESTSVKKTLNLMQKEMGGISIFKIELEGKPGEFKNAKAMQTLDLITDKLDEF CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SAKTQSSSINGILKFVNFKIKKESPLEYKLPESKTILNKLINLIDKSDWTKDNKKMYIND HHHCCCCHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECC DWSLISIMVRIEDNSTEGIKKFEKYAIETINEHMRNNKYHFSGVYDKVLIAKTMVREQVM CCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHH NIVTTLGSITLLLMFFFKSIKTGIIIAIPVAWSVFLNFAVMRLFGITLNPATATIASVSM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH GVGVDYSIHFFNTFILKYQKSQIYKNALLKSIPSVFNGIFANSISVGIGFLTLTFSAYKI CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISTLGAIIAFTMLTTSLASLTLLPLLIYLFKPRVRVKLALNNNLKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA