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Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46447016

Identifier: 46447016

GI number: 46447016

Start: 1658367

End: 1659815

Strand: Direct

Name: 46447016

Synonym: pc1382

Alternate gene names: NA

Gene position: 1658367-1659815 (Clockwise)

Preceding gene: 46447015

Following gene: 46447017

Centisome position: 68.68

GC content: 37.41

Gene sequence:

>1449_bases
TTGAATATGAGTGCTAACTTTACAATTGATGGAATTGGTTCCGTTCCTTCGAATGTTGCAGAGTATACGAGTGGGTCTGT
TGTCAAAGCATATCTTGAAAGTATCAATATTATTGCAGAAATTTTCAATAGACGCAGTAGTAATCCAAACAGTAGTGATT
CTCCCTTAAGTGATACGGACTTTGATAATTTAATTGCAGCTATGAATAAGCTACGAGATTTGGCTAAGAATGGGGTAACT
GATGGAAATCCTCCCTTAACATTCTATTTAACCGCAGAAATGGCCACCAATCTTGATTTAGTTTTTAAATCTTTAAAAGC
AGCAGGTATCGTTCTTGATGTTACCTATCCTTCTGGCAAAACAACTCTGCTAGAAAGTTGGCAAAGCCTGGCTGGATTTG
GCGTTCAGCAAATCATGAATGCGGCTACAAGCGTTTCCACAAGTTCCACTCGCACCTTGCAAAGTATGGTAGAGCTAGAA
TATGTCAAACAAGGTAATGACCTTTTGGCTGTAAAATTTCAGGCTTTAGAGCAAAGTTTGAAAACAACACAAGGAATTTT
AGATACCTTAGCTCTCATTCAAGGAATTTCAAATCAAGTTACTATCACAAATAAAGGAGATTTTGCCTTTCCTCCTACGA
ATAACTGGCAAATCCCTTCTACAGCCGTTGCCCAAATTCAACAAGCTTTCAATGAGATTGCAAACGGGCAAGATTCGAGT
GATTTGATTAACAGAATGAGAAATTTTCAAACCACTTATAATAATGACGTAGCCACTGCCAAACAAAATGCTGCTGCGAA
TGGAACGACATTCAGCACTGAATTTAGTAAGTTAACTAATGCCTCCAAGCTTATGAGTGACGTTGTCCTTCATAACTGGG
AAACATCCACTGGAAGTGGGAAAGATAGTTCTACAGAAAATATGAAAATTGAATATTACACAAAAATTTATAAAGTTGTT
GCAAGCGCACAATTTACTCAAGTATTTCCAGTTGCTACACCGACAAGTACAGCGGCAACAGAATTATTGGCAGCCAAACA
AAAATTATATCAACGTTTGGTGGATTTAGAAGCTATTTCTCCAGACAATACACGCTCTGTCGAAGGCACATTAGCCAGTA
TGATCTTTAAAGTGGTTCAAGACATTAGTTCCGCTTTTCTTGGACTCGATGGATCCACAGCAACGCCAGAACAACTAAAA
ACAGCAGTTTCCAAATGGATTATAGATAATCAAGATCAAAAAATTAGCTCACAGGCTGGAAATAATGTAGGTTCGATCCA
AGATCGAATTACGCAGGCAATTACAGCCGCACAATCTTTAAACGATACAGAAAAAGAAAACGTTAGAAACTATCAATTTG
TTTTTCAACAATTCTATCAATCCGCAAGCACTGTTTTACAAAAAGTGACCCAAATTGTAGAAAAATTAGCACAAGGGATA
TCTAGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGAGTAATTATTTGTTTAATTAAATAATTAATAATATAATAAAATTATAGAAATTTTTAATTATTTACTTACATGTTAAT
AAGTAAGTAATTTAAGGAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAACATATTTTTTGAATTATTAATAGTTTTTAGAAATTAAAAATATGAAATTGAAATAAAGCTATTTCCTTGAGGTCCT
TAAGGAGGATGAATATGGCT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 482; Mature: 482

Protein sequence:

>482_residues
MNMSANFTIDGIGSVPSNVAEYTSGSVVKAYLESINIIAEIFNRRSSNPNSSDSPLSDTDFDNLIAAMNKLRDLAKNGVT
DGNPPLTFYLTAEMATNLDLVFKSLKAAGIVLDVTYPSGKTTLLESWQSLAGFGVQQIMNAATSVSTSSTRTLQSMVELE
YVKQGNDLLAVKFQALEQSLKTTQGILDTLALIQGISNQVTITNKGDFAFPPTNNWQIPSTAVAQIQQAFNEIANGQDSS
DLINRMRNFQTTYNNDVATAKQNAAANGTTFSTEFSKLTNASKLMSDVVLHNWETSTGSGKDSSTENMKIEYYTKIYKVV
ASAQFTQVFPVATPTSTAATELLAAKQKLYQRLVDLEAISPDNTRSVEGTLASMIFKVVQDISSAFLGLDGSTATPEQLK
TAVSKWIIDNQDQKISSQAGNNVGSIQDRITQAITAAQSLNDTEKENVRNYQFVFQQFYQSASTVLQKVTQIVEKLAQGI
SR

Sequences:

>Translated_482_residues
MNMSANFTIDGIGSVPSNVAEYTSGSVVKAYLESINIIAEIFNRRSSNPNSSDSPLSDTDFDNLIAAMNKLRDLAKNGVT
DGNPPLTFYLTAEMATNLDLVFKSLKAAGIVLDVTYPSGKTTLLESWQSLAGFGVQQIMNAATSVSTSSTRTLQSMVELE
YVKQGNDLLAVKFQALEQSLKTTQGILDTLALIQGISNQVTITNKGDFAFPPTNNWQIPSTAVAQIQQAFNEIANGQDSS
DLINRMRNFQTTYNNDVATAKQNAAANGTTFSTEFSKLTNASKLMSDVVLHNWETSTGSGKDSSTENMKIEYYTKIYKVV
ASAQFTQVFPVATPTSTAATELLAAKQKLYQRLVDLEAISPDNTRSVEGTLASMIFKVVQDISSAFLGLDGSTATPEQLK
TAVSKWIIDNQDQKISSQAGNNVGSIQDRITQAITAAQSLNDTEKENVRNYQFVFQQFYQSASTVLQKVTQIVEKLAQGI
SR
>Mature_482_residues
MNMSANFTIDGIGSVPSNVAEYTSGSVVKAYLESINIIAEIFNRRSSNPNSSDSPLSDTDFDNLIAAMNKLRDLAKNGVT
DGNPPLTFYLTAEMATNLDLVFKSLKAAGIVLDVTYPSGKTTLLESWQSLAGFGVQQIMNAATSVSTSSTRTLQSMVELE
YVKQGNDLLAVKFQALEQSLKTTQGILDTLALIQGISNQVTITNKGDFAFPPTNNWQIPSTAVAQIQQAFNEIANGQDSS
DLINRMRNFQTTYNNDVATAKQNAAANGTTFSTEFSKLTNASKLMSDVVLHNWETSTGSGKDSSTENMKIEYYTKIYKVV
ASAQFTQVFPVATPTSTAATELLAAKQKLYQRLVDLEAISPDNTRSVEGTLASMIFKVVQDISSAFLGLDGSTATPEQLK
TAVSKWIIDNQDQKISSQAGNNVGSIQDRITQAITAAQSLNDTEKENVRNYQFVFQQFYQSASTVLQKVTQIVEKLAQGI
SR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52374; Mature: 52374

Theoretical pI: Translated: 4.74; Mature: 4.74

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNMSANFTIDGIGSVPSNVAEYTSGSVVKAYLESINIIAEIFNRRSSNPNSSDSPLSDTD
CCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
FDNLIAAMNKLRDLAKNGVTDGNPPLTFYLTAEMATNLDLVFKSLKAAGIVLDVTYPSGK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCC
TTLLESWQSLAGFGVQQIMNAATSVSTSSTRTLQSMVELEYVKQGNDLLAVKFQALEQSL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHH
KTTQGILDTLALIQGISNQVTITNKGDFAFPPTNNWQIPSTAVAQIQQAFNEIANGQDSS
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
DLINRMRNFQTTYNNDVATAKQNAAANGTTFSTEFSKLTNASKLMSDVVLHNWETSTGSG
HHHHHHHHHCHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KDSSTENMKIEYYTKIYKVVASAQFTQVFPVATPTSTAATELLAAKQKLYQRLVDLEAIS
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDNTRSVEGTLASMIFKVVQDISSAFLGLDGSTATPEQLKTAVSKWIIDNQDQKISSQAG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCC
NNVGSIQDRITQAITAAQSLNDTEKENVRNYQFVFQQFYQSASTVLQKVTQIVEKLAQGI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SR
CC
>Mature Secondary Structure
MNMSANFTIDGIGSVPSNVAEYTSGSVVKAYLESINIIAEIFNRRSSNPNSSDSPLSDTD
CCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
FDNLIAAMNKLRDLAKNGVTDGNPPLTFYLTAEMATNLDLVFKSLKAAGIVLDVTYPSGK
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCC
TTLLESWQSLAGFGVQQIMNAATSVSTSSTRTLQSMVELEYVKQGNDLLAVKFQALEQSL
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHH
KTTQGILDTLALIQGISNQVTITNKGDFAFPPTNNWQIPSTAVAQIQQAFNEIANGQDSS
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH
DLINRMRNFQTTYNNDVATAKQNAAANGTTFSTEFSKLTNASKLMSDVVLHNWETSTGSG
HHHHHHHHHCHHCCCCHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCC
KDSSTENMKIEYYTKIYKVVASAQFTQVFPVATPTSTAATELLAAKQKLYQRLVDLEAIS
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDNTRSVEGTLASMIFKVVQDISSAFLGLDGSTATPEQLKTAVSKWIIDNQDQKISSQAG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCC
NNVGSIQDRITQAITAAQSLNDTEKENVRNYQFVFQQFYQSASTVLQKVTQIVEKLAQGI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SR
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA