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Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is zip

Identifier: 46446033

GI number: 46446033

Start: 534541

End: 537063

Strand: Direct

Name: zip

Synonym: pc0399

Alternate gene names: NA

Gene position: 534541-537063 (Clockwise)

Preceding gene: 46446032

Following gene: 46446034

Centisome position: 22.14

GC content: 34.48

Gene sequence:

>2523_bases
ATGCCAAGTCCATTGACTTCTTTTGAAAATTTTAGTTTGACAGCTCAAACAACAGCTTATTTATATAGCTTAAACCAAGA
AAGCTATTTAAAAGCTTTTGGTGCTAAGCTTGTGAGTCCCGTTGCTATTATTAGTGCTAGTGCCGTTGATGTAATAGTTC
ACGCAACAGGATTTGCTAGTAAACTTATTCTAGGTGGGTTGACACTCCCTTGGAATTTTGTTGTAACCCCTTTCTCAGCT
TCTTTGTCAACATCTCGTAGTTCCGGTTTAGCTTCTTCACTCATTCACCTCAATCGTCTAGTTGAAAGTATTTTTACTGC
AGCCATTCTGCCTTTCATTTACCTTATTAATGCCGAAAGTGCTTATCAGTTTGTGCGTTCACGCTTAGAGAATTTGTCTG
AAAAGCAAAACTCAACATTAAAGAATGAGATCTCATCTTTAAAAAATCAAATTAGCAAGCAACAACAAGAGCTCAATCAA
AAAAGGGTTGATTTAGAAGCGGCTAGAAGAGATCTGGGAAGTTTGACTCCTAATCTTAACGCATTGCAAAAAGATATTCG
ATCTTTAGAAGAAAAGAAAAGTCAAGATGAGCAGGCTTTACAACAAGCCAACCAAGCTTTGCAAAATTTACAAAGAGAAA
AAGCTTCACGTGAGGCTCAGGCTGGAGATTTAGAATTAGAAAAAACGACGTTATTAAGTAAAATTGCTGAGATTGAAGCG
TCTTTAAAAAAGGCTTTAGAACAAGTCGAGCAAGAACGGAAAGACAACGCTAGTAAAGAAAACACAATTGTTGCTCTTCA
AGGTCAGCTAACGGAGTTGAATAAGCAGTTATCTACTCTCAATCGAAACCATCTAAAAAATGAAGATGAGCAGGCTTTAC
AACAAGCCAACCAAGCTTTGCAAAATCTACAAAGAGAAAAAGCTTCTCGTGAAGCGCAGGCTGAGGAGTTAGAATTAGAA
AAAACGACGTTATTAAGTAAAATTGCTGAGATTGAAGCGTCTTTAAAAAAGGCTTTAGAACAAGCCGAACAAGAACGGAA
AGATAACGCTAGTAAAGAAAACACAATTGTTGATCTTCAAGGTCAGTTAACCGAGTTGAATAAGCAGTTATCTACTCTCA
ATCGAAACCATCAAGAGCATCTAGATCAAGAAAAAGAGGATTTAAAAAATCAACTAGAATCCCTCAAGCGACAATTAAAT
GAGGAAAGACAAGCAACACTATGGGCAAATAATAAAGTTATAGAAGCAGAAAAAAAAATAGAGGAAGAGAAAAATCGACT
TACCAAGTTTTCAGCAGATATGTTGGAAATGTTAAAGGGTAAAAGATTAGTAAATCAAAACCTCATAGAATCAAAAAAAG
AATTAGAACAACAAATTCAATCTATAAAAACAGAATTAGCGGCAGCAGAAGAACAAAAGCAAGTTTTATCATTGCAAGTT
GAGACTTCGAAAATGGATGCCAATCAGTTGCAAGAAAAGATTAATAGTTTGGAAAATGAGAAGCAAGAGTTATTAAATAG
AATTAAAGTTTTAGAAGAGACTATCGCTAAAGAAGGAGAGTCCAAAAACGCTTTGGAACAAATTGAATCCGCCGTTTCAA
ACATGGAAACAGTTGCTGAAATTTCTATCCTGAACGTTTTAGCTCGTTCTGCGACATTTGAATCCTCAGCACAAAATGAT
AGAGCATTTACAATTTCAACTTTGGAAAATGGGGAATTGTCAAATGACAATGGCAATAGAGCTAACTTACTTGAGCAAAT
TCGTGGATGCTATAAAAAACTTAAATCAACGTCAACAACTGTTGATAGGGTGAAATCGGGGGATTTTGAGCTACGTCCTA
AACATAAAAGCTCGCTAGATAAATATATGGGCCCTGCTTTACATGAACTTATTGTTGAAATCGAAGAGCTTATTGAAGCT
TTGGAATGGGGTAAATTTGAGCCTGTAAAGAAAAATTCAATGATGCGAAGTATGATTGAAGAAACTCCAGATGTAGAAAA
CGAAATTGAGCCGTTTAAAAATTATCTTGAATTTTTCTTAAAAAAATTAAAAGAAAAACATCGCGAAAATTCAAAAGGAA
AAGCTGACGGACGACGATCCATAGAAGAACACCTTGCTAAAGTTCGAGAGATAGATCGTGCACAAGCTGAAGAACGAATC
GAAAAATTAAGAAAAGAGTTAGTGAAGCAAATTTCTTTTAAAATTAGTGGTCAAGAAACTACTAATATTGATTCATTCTT
TGATAAACTTTCCCCATTTACTTTAATTTCAATTCAAAGGGAATTTGTAGAAGAAAATAAAGAGTTTAGCAAGCCTCAAT
ATCAAACCTGGGGAGGGCCTTTCAAAGACTTTGAAGAATTTAAGACAAATTATCGAGATTTTGTAAAATTACTTGATGAA
ATGAGCTTAATAAAAAATGAGTTTGACAAAGGTTTATTTAAAAGGTTATCCTATATTGTTAAACTCATATCCGAGATAAC
AAGTAGAGGTAAAAAACCTTTTAAAGAATTTGAATTGAGCTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTTAACTTTTTCTTAATAAGATTTTTATTTATTTTTAATTTCCTTGTAATAAGATTTGCAGAAATAAGTATAATAATCT
CTCTATTTTAGGAGATTCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TAGAATAAAAACTCATTGAGTGAAATTAAAAAACAATAACTAGAAAGACTGTTTGCTTGGTCCAAATTGCCATCAGCGGG
CTTTTTTTAATAGATCACGT

Product: putative eucaryotic myosin heavy chain

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 840; Mature: 839

Protein sequence:

>840_residues
MPSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFASKLILGGLTLPWNFVVTPFSA
SLSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAESAYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQ
KRVDLEAARRDLGSLTPNLNALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEA
SLKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAEELELE
KTTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQGQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLN
EERQATLWANNKVIEAEKKIEEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQV
ETSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAEISILNVLARSATFESSAQND
RAFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTTVDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEA
LEWGKFEPVKKNSMMRSMIEETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERI
EKLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGPFKDFEEFKTNYRDFVKLLDE
MSLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS

Sequences:

>Translated_840_residues
MPSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFASKLILGGLTLPWNFVVTPFSA
SLSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAESAYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQ
KRVDLEAARRDLGSLTPNLNALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEA
SLKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAEELELE
KTTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQGQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLN
EERQATLWANNKVIEAEKKIEEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQV
ETSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAEISILNVLARSATFESSAQND
RAFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTTVDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEA
LEWGKFEPVKKNSMMRSMIEETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERI
EKLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGPFKDFEEFKTNYRDFVKLLDE
MSLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS
>Mature_839_residues
PSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFASKLILGGLTLPWNFVVTPFSAS
LSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAESAYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQK
RVDLEAARRDLGSLTPNLNALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEAS
LKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAEELELEK
TTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQGQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLNE
ERQATLWANNKVIEAEKKIEEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQVE
TSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAEISILNVLARSATFESSAQNDR
AFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTTVDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEAL
EWGKFEPVKKNSMMRSMIEETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERIE
KLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGPFKDFEEFKTNYRDFVKLLDEM
SLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 95892; Mature: 95760

Theoretical pI: Translated: 5.43; Mature: 5.43

Prosite motif: PS51082 WH2 ; PS00974 MANNITOL_DHGENASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.1 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFAS
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLILGGLTLPWNFVVTPFSASLSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAES
HHHHCCCCCCCHHEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
AYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQKRVDLEAARRDLGSLTPNLN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH
ALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEA
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SLKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQAL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
QNLQREKASREAQAEELELEKTTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECC
GQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLNEERQATLWANNKVIEAEKKI
HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH
EEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ETSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAE
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ISILNVLARSATFESSAQNDRAFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTT
HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH
VDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEALEWGKFEPVKKNSMMRSMIE
HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
ETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERI
HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGP
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCC
FKDFEEFKTNYRDFVKLLDEMSLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCC
>Mature Secondary Structure 
PSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFAS
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KLILGGLTLPWNFVVTPFSASLSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAES
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AYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQKRVDLEAARRDLGSLTPNLN
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EEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQV
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FKDFEEFKTNYRDFVKLLDEMSLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA