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Definition Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome, complete genome.
Accession NC_004917
Length 1,799,146

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The map label for this gene is 32266604

Identifier: 32266604

GI number: 32266604

Start: 1074682

End: 1077012

Strand: Direct

Name: 32266604

Synonym: HH1105

Alternate gene names: NA

Gene position: 1074682-1077012 (Clockwise)

Preceding gene: 32266599

Following gene: 32266605

Centisome position: 59.73

GC content: 35.86

Gene sequence:

>2331_bases
ATGCCAATTTTGCAGCATTTTTTTGAGACTTTCCATAGTGCGCAACCACCGCTTCCTATGGAAAAAATACAAGATTCTAT
TTTTAATACGCTTTCTCCACAGGCTTTGAGCATTCTACTTTGCACCAATGAGCGCAATATTGCGTTATTTATGCAATGCC
AAAGTTTTATAAAAATTTTAGAATCTTTGCACATATCACAAATAAATTCTCAATTAGATGCTTATGCTTCAAATGAAGAT
AAATCTATGATTCTTAGCGCGCTTTTAAAAGATGTATTTACCCTTCAAGCAACTATCATAGAATATAATCCACATTTCTT
TGAGGAGCTTTTGCCATTTTTTATTCAGCTTAATCTTGCACATATCATTGATGATTTTGAACTTGATTTGTTTGCTTCGC
TTAAAAATACTTTTTATTCTCAAAAAACATCACAAAAAGTAGATACAAAAGAAATACGAAGTCTTAAATCTCTTCATAGT
GCCCTTGCTTTGCTTCATAACAACCTTTCACCTCTGCTTCCTCAAGAAACTCTTAAAAACTCACTTACGCACATAATGGA
AAAATTAGAGAATCAACATTTTTCTATCGGTATTACAGGAGTGTTAAGTGCAGGGAAATCCACATTTTTAAATGCGCTTT
TATCTCAAGAAATTTTAGGAAGCTCAAGTGTGCCAGAAACTGCCAACCTTACCATTTTGCGCTATGGAGAATCTGCAGGA
GCAAGAGTGCATTTTTGGAGCAAAGAACAATGGGCTGATTTATGTGAGCAAAGCGCGTATGATACAAATCTTAAAGCCTT
TATAGAAGAAAGTCAGGCTCATTTTGGCACACAATTAGACACATTTATTACCCAGCCACATACAACAAAAGACATTCAAA
CACACGAATTAAGCATTTATACTTCGGCAAATCATCAAAGTAAATTTTGCAATCTTATCCAAGAAGTAGAGCTTTTTACA
CCATTGTCATTTCTAAAAAATGGTGTAGAGATTGTTGATACACCCGGACTTGATGACCCAATCACAAAACGTGAAGAAAT
CACTCGCTCTTATATTCAACATTGTGATGTGCTTATCCACGTGATGAATGCAAGCTGTGCAGCAACGCAAGTAGACATTG
ATTTTATTTTAGAATCCCTGCTTGAACAAAACATCTCACGCCTACTTGTAGTGCTTACACGCATAGATTTGCTTACACCA
CAAGAGCTTGATTCTTCGCTTGAATACACCAAATCAAGCCTCATTGCCCAACTCAAAAAAGCACATTACAAAGGCGATAT
TGAATCCATTATCAATCGTATTGATTTTATTCCACTTGCGGGATATGCTGCACTGCTTTATCGCACAAATGCAGATACAA
GCAACCTCTCTCTCACTTTAGAACAATGCGGTATCCTTAAGATAGAATCTTATTTACAAAAAATGCTTCTTGGTGAAGAT
AGCCTTAAGGCAAAAGATATGCTTTATCTCGCCTACAAAGCCACACTTAAAGTTGCTCAAGATACAGAAGAGATTATCAA
TTTAGAATCTTCTTTGTTAAATGCAAATGGCGAGGAGTTAGAGGAGCTTATTGCTCAAGATAAAGCACATAATGATGCCC
TTATGCGCGAACTCTATGAGCTTGAAGAGCATCTTAGTGCCCTCCATAATGAGCTAAGTGAATTTCTTAAATCTCTTGAA
CTTTTTAGTGCAAATACTCTTAGTAAAGCTTCTATGCTCATCAAGGATAAGGTATTTAATGATATTATTTATGATTATAC
ACGTGGAGCAAAACCTGATACAAATGCACTGCACAAAATGATAGAGCTAGGGCTTAAAGATTGTTTCGCCGATGTGGGGA
GAGAGTATAAATATAAATTAGGCAAGAAAATTGCTCAACTTAAAAGCGCTATAACACTCTCAGAGGAGCTAGATTCTCCG
CCTCCACATATTCATTTCCAGCTCAAAAACGCACAAATAAGTGCGATTACTCAAGAGTTACTTTCTGCACTTCCTTCGCT
TGTGCGCTCTTTTAATAAATCTAGTCAAAATAAACTTAGCAACGCACTTGATAAACTTTTTGCAGATATGTTTAGCTCCT
TTAGTGAGATTATTCAAAATAAAAACAAAGACATCGCAGCTCTGTTTTTAGCACATTTTCACGAGATTACTCAATGTGCT
AAAAACCATATTCAAATGCAAATTGCTTATAAACAAGAAAGTCTCAACGCTGCTTTAGCCAAGCGAGAAAGTGGCGATAC
TCAAGCACTTAAAGATGCTCTTTACACCAAGCGAGAACAGCTTACAGGTATTATAAATGAACTTATGCAAGGTTTGCATA
GTTTGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTTTTACGGCATTTTGAGTGATAATTATTAATTTATTTTACTTTTGGTATTTTGATGTAAAATTACGCTCTACAAATAA
ATAAATGGGGACATCTTAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGAGATGAAAGGGTGCAAGAAACAATAATGGAACAAATAAGTGAAAATCTGCTAGAAAACTTTATTAACGAATATATCAG
CGCAAAAAATCAGCTTTTGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Dynamin-Like Protein

Number of amino acids: Translated: 776; Mature: 775

Protein sequence:

>776_residues
MPILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKILESLHISQINSQLDAYASNED
KSMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLAHIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHS
ALALLHNNLSPLLPQETLKNSLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAG
ARVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIYTSANHQSKFCNLIQEVELFT
PLSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIHVMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTP
QELDSSLEYTKSSLIAQLKKAHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGED
SLKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYELEEHLSALHNELSEFLKSLE
LFSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKMIELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSP
PPHIHFQLKNAQISAITQELLSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCA
KNHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ

Sequences:

>Translated_776_residues
MPILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKILESLHISQINSQLDAYASNED
KSMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLAHIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHS
ALALLHNNLSPLLPQETLKNSLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAG
ARVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIYTSANHQSKFCNLIQEVELFT
PLSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIHVMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTP
QELDSSLEYTKSSLIAQLKKAHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGED
SLKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYELEEHLSALHNELSEFLKSLE
LFSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKMIELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSP
PPHIHFQLKNAQISAITQELLSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCA
KNHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ
>Mature_775_residues
PILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKILESLHISQINSQLDAYASNEDK
SMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLAHIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHSA
LALLHNNLSPLLPQETLKNSLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAGA
RVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIYTSANHQSKFCNLIQEVELFTP
LSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIHVMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTPQ
ELDSSLEYTKSSLIAQLKKAHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGEDS
LKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYELEEHLSALHNELSEFLKSLEL
FSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKMIELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSPP
PHIHFQLKNAQISAITQELLSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCAK
NHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ

Specific function: Unknown

COG id: COG0699

COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 87573; Mature: 87442

Theoretical pI: Translated: 5.26; Mature: 5.26

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKIL
CCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHH
ESLHISQINSQLDAYASNEDKSMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHSALALLHNNLSPLLPQETLKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
SLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAG
HHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCC
ARVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIY
CEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEE
TSANHQSKFCNLIQEVELFTPLSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIH
ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTPQELDSSLEYTKSSLIAQLKK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGED
HHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCC
SLKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
LEEHLSALHNELSEFLKSLELFSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
IELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSPPPHIHFQLKNAQISAITQEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHH
LSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCA
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ
HHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
PILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKIL
CHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHH
ESLHISQINSQLDAYASNEDKSMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH
HIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHSALALLHNNLSPLLPQETLKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH
SLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAG
HHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCC
ARVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIY
CEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEE
TSANHQSKFCNLIQEVELFTPLSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIH
ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTPQELDSSLEYTKSSLIAQLKK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGED
HHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCC
SLKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH
LEEHLSALHNELSEFLKSLELFSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKM
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH
IELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSPPPHIHFQLKNAQISAITQEL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHH
LSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCA
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ
HHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA