Definition Campylobacter jejuni RM1221, complete genome.
Accession NC_003912
Length 1,777,831

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The map label for this gene is 57237673

Identifier: 57237673

GI number: 57237673

Start: 856214

End: 857947

Strand: Reverse

Name: 57237673

Synonym: CJE0919

Alternate gene names: NA

Gene position: 857947-856214 (Counterclockwise)

Preceding gene: 57237674

Following gene: 57237672

Centisome position: 48.26

GC content: 34.2

Gene sequence:

>1734_bases
ATGAATAAATTTTTAGTTTCATTGTTTTTACCTTTAGTTGCATTTGCAAACTCCTCAGAAGCAGCTGCAAATGCTAATTT
ATTTGGAGCTTTTACGCTTATACCACCTTTAGTTGCTATTGCTTTAGCCTTTATCACAAAAGATGTTATTTTATCGCTCT
TTACTGGAGTTTTAAGTGGAACTTTTCTACTTAGCCTTTCTGCAAATATTTTTAAAGCACAACATTTAACTTTTGTAAAT
TATTACAATACTACAGTAGAATCTTTTTCAAAAATTATTTCCTATATCTTAGGTTCAACTTCAGATCCAGTAAATGCAGG
AATCATTTTACAAATTCTTTGTATAGGTGGTCTTGTGGCACTTATCACAAAAATGGGAGGTGCAAAAGCTGTAGCATTAA
AATTTGCCAAAAGAGCCAAATCAGCTGTATCAGCTCAAGTTAACACTTGGTTTTTAGGGCTTTTAATATTTTTTGATGAC
TATGCTAATTTACTAATCGTAGGTCCAATTATGCGTCCTTTGGCAGATAAATTTAAAATTTCTCGTGAAAAATTTGCCTT
TATTATCGACTCTACCGCAGCTCCTGTGGCAGGAATAGCTGTAATTTCTACTTGGATAGGCTTAGAAGTTTCTTTAATTA
AAACCGCTTATGAACACATAGGCATTAGCAATATTAGTGCTTTTGGAATTTTTGTTGAAACCATACCTTATCGTTTTTAT
AATATCTTCATGCTTTTTTTTGTAGTCATGACTGCAATCATGAGGCGTGAGTTTGGTTCTATGTACAAGGCTGAAGTGCG
TGCAAGAACCACAGGACAAATTGCTCCTCTACCTAAATCAGGCACACTAGATACTACTGAATTAGAAGATCAGTTTTTAG
CACCAAAAGAAGGTATTAAAATTCGTGCTTTTGATGCTATTGTTCCTATTTTTACTTTAATCATTTTAGCTATATTAGGA
TTTTATTTTAATGGACTTAGCACTTTAGAAGGCGAAGAACTTGCAAAAGCAAGTGCCAATCCTTTGTCTTTTGAAACTTT
TAGGGCTGCTTTTGGAAATGCTGATTCTTCTGTGGTGTTATTCCAAGCTGCTTTGTTTGCTGCTATTGTAGCGATTTTTA
TCGGGGTGCGTCGTAAAATTTTCAATCTTAAAGAAGCGGTAGAAACTTGGATATATGGCTGGAAAACCATGATTTTTACC
ATAGTATTGCTTTTATTTGCTTGGTCGCTTTCAAGTATAGTAAAAGATCTAGGAACTTCTTTATTTATCACTAGTTTGCT
TGCAGATAAATTGCCTGAGTTTATTTTGCCTGCTACTATTTTTGCTTTTGCTTCAGCCATTTCTTTTGCCATAGGAACAA
GCTATGGAACTATGGGGATTTTAATGCCTTTGGCTGTGCCTTTAGCTCATGAAATCGCCAAAATCAATGGTATGGATGCA
AATGCTATGCATCATTATATGGTTATTAATATAAGCTGCGTTTTAACAGGTGCGATTTTTGGAAACCATTGCTCACCAAT
TTCAGATAATGTAATCCTTTCATCTATGAGTGCAAAATGCGATCATATGGAGCATGTAAGAACACAAATTCCTTATGCTT
TATTTATCTGTGGCATTTCTTTAATCGCTGGATATATTCCTGTATCTTTAGGACTTAGCGTTTGGTTTGTCTTGCCTTTA
AATTTCATACTTATTGCACTTTTACTAAGACTCATCGGAAAGAAAGTTCCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAATGTCTATCATTAACCTACCAAGCCATATTAATGTTAATGAAATCGAGCTTATGCCGGTAACACAAACTTGGAATGGA
TTTTATATAGAAAGAGATGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTCTTGAAAATTTTGGAAATTTTCTTACTTTAGATGAAAAACATTCTTTCATAAAAAAATATTTTAAAGAATTTTATACA
AAGGATTTTAAACTTTTTGC

Product: Na+/H+ antiporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 577; Mature: 577

Protein sequence:

>577_residues
MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLTFVN
YYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD
YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY
NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG
FYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT
IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGLSVWFVLPL
NFILIALLLRLIGKKVP

Sequences:

>Translated_577_residues
MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLTFVN
YYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD
YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY
NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG
FYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT
IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGLSVWFVLPL
NFILIALLLRLIGKKVP
>Mature_577_residues
MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLTFVN
YYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD
YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY
NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG
FYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT
IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGLSVWFVLPL
NFILIALLLRLIGKKVP

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 62720; Mature: 62720

Theoretical pI: Translated: 9.01; Mature: 9.01

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
3.5 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSG
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFLLSLSANIFKAQHLTFVNYYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVA
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDDYANLLIVGPIMRPLADKFKI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHC
SREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY
CHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCE
IRAFDAIVPIFTLIILAILGFYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVL
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHH
FQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFTIVLLLFAWSLSSIVKDLGTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGIS
CHHHEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
LIAGYIPVSLGLSVWFVLPLNFILIALLLRLIGKKVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSG
CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TFLLSLSANIFKAQHLTFVNYYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVA
HHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDDYANLLIVGPIMRPLADKFKI
HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHC
SREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY
CHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCE
IRAFDAIVPIFTLIILAILGFYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVL
EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHH
FQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFTIVLLLFAWSLSSIVKDLGTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGIS
CHHHEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
LIAGYIPVSLGLSVWFVLPLNFILIALLLRLIGKKVP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]