Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

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The map label for this gene is 18311141

Identifier: 18311141

GI number: 18311141

Start: 2473482

End: 2476250

Strand: Reverse

Name: 18311141

Synonym: CPE2159

Alternate gene names: NA

Gene position: 2476250-2473482 (Counterclockwise)

Preceding gene: 18311142

Following gene: 18311140

Centisome position: 81.69

GC content: 23.26

Gene sequence:

>2769_bases
ATGATAATTAAGAAAATAAATGTGAAGTCCTTTGGAAAATTAAAAAATAAAGAAATAGAATTAAAAGATGGATTAAACAT
AATATATGGTGAAAATGAAAGTGGAAAAAGTACATTACAATCTTTCATAAAGGTAATGTTATATGGTGTTTGTAATAAAA
GAGGCAAAAAAACTTTATCAGATAGAGCAAAGTTCACACCATTAGGGGAAGGAAGTTTTTCAGGAGAGTTACTTGTAGAG
GATAATGGTGAGGAAATTTTAATAGATAGAAGTTTTGGTAAAACTAAAAAATATGATGAGGGAAATATATTAAATAATAT
AACTGGAGAAAAGATAAATAAATACTCATGGCAAGAACCTGGTAAGGATATATTTAATCTTTCTAGTGAGGGATTTAAGA
ATACTCTATTTATAAGTCAAATGGGGTGTATTGTAGAGAGTTCAAAGCAGGATGATGTATTAAATAAAATTATTAATATC
TTAGAATGTGGAGCTGATGAGGTTTCTTATAAAAAAATAAAAAATAATTTAGAGGAAAATAAAAAATCCTTAACTAATTC
AAGAAAAACAGGAAAACTTGATTTATTAAGAATTAAAGAAAGTGAGCTTTTAGAAGAAAGATATAAAAGAGTAAAAATTC
ATGAGGAAAATATAGAAAATGAGCTTTACTTAAAGGAATTAAAAGAAAAAAGAACTGATTTAAATTTAAAAATAGAAGAA
TTAGAATTACATAAGAAAAATTTAAAAAAATCAGAATTAAAAAATGAGTATGAAAATATAAATGAGTATTTAAATAAAAA
AGAAAAATTAGAAGAGGAATTAAAAGTTTTATTAGAAGAGTTAAAAGATGTACAAGCTATCTGTGATTTAAAAAAGTTAA
ATAACTTAAGAGATGAGTTTAAAAATTATGAGTTTTTAAAAGAATCACTAAAAGAAAAGGAAGATAAAATAGATAAGCTA
AAAGAATATATTTATGAGTATAATGAAAAATTAAAGAGTTATGGAATCTTAAATGAAATATCAAATAATTTAGAAACTAA
ATTAATAGAGCTTAGAATTGAAGATGATAGATTAAGAGAAAATTATAAGGTTATTCAAAAGGTAAAAGAAGAGCTTTATC
AGTTAAATGAAAAGAAAGATGATTTTTTAAGTCATTTAAATGCTTTAAAATTAAATGATAATTTGGTGTTACAAATAGAA
AAGGATTTAGAAAAATATAATAATGAAAAAATATATCCTTCAATAAATGCAAATTTAAAAGAGGAGAAGAATATTATTGA
AGAGGAAAGTAAAAGTTTTTCAAGAAAAATTTTTCTCTTCAGAGTTGGAGAAGTAATAAGTATTTTATTATGTGCTTTCT
TATTTATATCCTATTTCAAGAGCGAAAATATAATAACCTTAGCACTTTCAATTTTAGGCATGTTATTATTTATATTTTTA
CTAGCTAAAAGTAGCTTAAATAAAAAAGAAAAAAATAATATAAGTAAAAGAATAAATGAAATAGATGAGCTTATAAATGA
AAAAAAAGAAATAGAAGTATTAAAAAGTAAAATTGATGAATATAAACAATTCCTTAAGGTAAAAGATGAGTATTCTATTA
AAGAAACTTTAGAGGATTATAGATTTATTAAAAAAGAGTTAGATATTCTCTATGTAGAAATTAAGGAAAAAGAGAAAAGT
TTGATTTTATTAAAAGAAGATGAAACTAAGGAAAAAATATTAAGTAATGAAGCTTTTATAGATAAGTTACTAAGAGTTAC
AGGGGCAGGTTCTATAGATGAAATCTTAGAACTCTCAAGGGAAAAGAAAAGCCAGGAAGATTTATTAATAAGAAAAAAAT
CAGAGTTTAATGAGGCTAAGGAAGATTTAAATCAATTAAAAAATAGAAGATTAGAAATAGAAGAAAAAATAAAAGCTTAT
TTAGAAAATACATCACTACAAAGTATTCCTTTAGATGAAGTATATTCTAGATTAGAAGAAATAGAAGCTAAAATAGAATA
TAAGGAAGGCTTAAAAAATAAGTTAAATAGTGTAGAAGAAAATTGCAATCTATTACTTAAGGGAAGAGATATTTTAGAAG
TTAAAAATGGACTTTCATATGAGGAATCAGAGATTAAAAATGAAGTTTATAACAGTGAAGAAGAAATATTAAATGAAATA
AAATTAAAAAATAATGACTTGTTAAATATTGAAAAAGAAATAAAGGATGTAGAATATTTGATTAGTAGTAAAGAGTTAAC
CTGTAGAAGTTTATTTTTAATAGATGAAGAGATAGCTGAAGTTAAGGAAAGGATTAGTTCCTTAGAGAAAAAACTTAAGG
GGGTTGAGATTGCAACAAACTACATGGAAAAAGCCTTTAAGGAACTTCAAAAAAGTTTTGGACCTGTTATAAATAAAAAG
GTAGAGGATATCTTTAAAGATGTAACTAAGGGTGCTTATAAAGATTTAAGAGTATCAGAAGATTATAACTTAGTTGTTAA
GGATACAAAAAGCAATAAAATTATGGATGCTTCTTATTTAAGTAGTGGAACATATGACCAAATATATTTAGCATTGAGAC
TTGGCATAATCGACATAATATTTGAAGATAAAAAAGTTCCAATAATATTAGATGAAAGTTTTACTCAATATGATGATAAT
AGATTAAAAACTATGTTAGATATAATATATAAGAGAGTTTATAAAAATCAAATAATTTTATTTACATGCCAAAAAAGAGA
AATAAATATTCTCAAAGATAAGGAAAAAGTAAATATAATAGAGCTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATCAAGGATGCTTTAGAATCTAATGAAGAGGATGAAGAGATACTAGATATAGCTTTTAGAATTGGTATGGAGAGTATTTT
AGATGGAGAAGTGAATTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTAAAATGAAGGGCTTATATCAAAATAAATTTTATATAACTTACAAACAATTATTAGCTAGACCTAGTAATTCTAGGAA
TATGTTTATAAGTTTTATTT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 922; Mature: 922

Protein sequence:

>922_residues
MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLSDRAKFTPLGEGSFSGELLVE
DNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEPGKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINI
LECGADEVSYKKIKNNLEENKKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE
LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEFKNYEFLKESLKEKEDKIDKL
KEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRENYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIE
KDLEKYNNEKIYPSINANLKEEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL
LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDYRFIKKELDILYVEIKEKEKS
LILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSREKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAY
LENTSLQSIPLDEVYSRLEEIEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI
KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATNYMEKAFKELQKSFGPVINKK
VEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYLSSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDN
RLKTMLDIIYKRVYKNQIILFTCQKREINILKDKEKVNIIEL

Sequences:

>Translated_922_residues
MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLSDRAKFTPLGEGSFSGELLVE
DNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEPGKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINI
LECGADEVSYKKIKNNLEENKKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE
LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEFKNYEFLKESLKEKEDKIDKL
KEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRENYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIE
KDLEKYNNEKIYPSINANLKEEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL
LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDYRFIKKELDILYVEIKEKEKS
LILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSREKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAY
LENTSLQSIPLDEVYSRLEEIEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI
KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATNYMEKAFKELQKSFGPVINKK
VEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYLSSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDN
RLKTMLDIIYKRVYKNQIILFTCQKREINILKDKEKVNIIEL
>Mature_922_residues
MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLSDRAKFTPLGEGSFSGELLVE
DNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEPGKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINI
LECGADEVSYKKIKNNLEENKKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE
LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEFKNYEFLKESLKEKEDKIDKL
KEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRENYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIE
KDLEKYNNEKIYPSINANLKEEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL
LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDYRFIKKELDILYVEIKEKEKS
LILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSREKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAY
LENTSLQSIPLDEVYSRLEEIEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI
KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATNYMEKAFKELQKSFGPVINKK
VEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYLSSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDN
RLKTMLDIIYKRVYKNQIILFTCQKREINILKDKEKVNIIEL

Specific function: Unknown

COG id: COG4717

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 108361; Mature: 108361

Theoretical pI: Translated: 5.20; Mature: 5.20

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
0.8 %Met     (Translated Protein)
1.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
0.8 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLS
CCEEECCCHHHCCCCCCCEECCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
DRAKFTPLGEGSFSGELLVEDNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEP
HCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCC
GKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINILECGADEVSYKKIKNNLEEN
CHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE
HHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH
LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEF
HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNYEFLKESLKEKEDKIDKLKEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHEEEEEEEECHHHHHH
NYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIEKDLEKYNNEKIYPSINANLK
HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH
EEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDY
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
RFIKKELDILYVEIKEKEKSLILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSR
HHHHHHHCEEEEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
EKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAYLENTSLQSIPLDEVYSRLEE
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH
IEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATN
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
YMEKAFKELQKSFGPVINKKVEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYL
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCEEEEECCCCCEEEHHHH
SSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDNRLKTMLDIIYKRVYKNQIIL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
FTCQKREINILKDKEKVNIIEL
EEECCCCCCCCCCCCCCCEECC
>Mature Secondary Structure
MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLS
CCEEECCCHHHCCCCCCCEECCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
DRAKFTPLGEGSFSGELLVEDNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEP
HCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCC
GKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINILECGADEVSYKKIKNNLEEN
CHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE
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LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEF
HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHEEEEEEEECHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
RFIKKELDILYVEIKEKEKSLILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSR
HHHHHHHCEEEEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
EKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAYLENTSLQSIPLDEVYSRLEE
HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH
IEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHH
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HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
YMEKAFKELQKSFGPVINKKVEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYL
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCEEEEECCCCCEEEHHHH
SSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDNRLKTMLDIIYKRVYKNQIIL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
FTCQKREINILKDKEKVNIIEL
EEECCCCCCCCCCCCCCCEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA