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The map label for this gene is yueF [H]

Identifier: 18310895

GI number: 18310895

Start: 2191188

End: 2192294

Strand: Direct

Name: yueF [H]

Synonym: CPE1913

Alternate gene names: 18310895

Gene position: 2191188-2192294 (Clockwise)

Preceding gene: 18310894

Following gene: 18310896

Centisome position: 72.28

GC content: 27.1

Gene sequence:

>1107_bases
TTGTTTAAAAAACATAATTTTCACTTTAATTGGCTCCCACTAATATTGATATCAACAGTTTCAATCATGTTAATTTTTAA
TATTAGGAGCATTTTAAGTGAAGGTATTAGACCATTTTTATCAGTTTTAACACCATTTTTTTGGGCTTTTGGTATAGCTT
ATTTAATAAATCCTCTCATGATGCTTATAGAAAAGAAGTTTAAACTTAAGAGAGCTTTTTCCTTAATGATAAGCTATATT
TTAGTTATAATATGTGTTTACATATTAATTGCAATTATTGTTCCTACAATATTTGATAGTTTGTCAGAATTATTTAGTAA
TCTTAGTGAATATGCATCCTCTGCTGAAAGTTGGATTAATAACACCTTAGCAAGTATGAATGTTCCTTTAGATTTAAATC
ATTTAAATACTTCTGCTACGGAATTTATTTCTAAAACATCAACCTTACTATCTAATATAGTAGGTAGCTTGTTAACTCAA
ACTATAAAAATAACTTCATCTGTTGTTAAATTTGTATTTGGATTTATTATTTCCATATACATGTTAATGGATAAGGAAAC
TTTAATTGAAGGGTGTAAAAAAATTATAATTGCAGTTATGCCATCTGAAAAATCTTCAGAACTTTTTATTAGTTTCATGG
CAGAAGCTCATAATATCTTTAGTAGATTTATAATAGGTAAAATTATAGATTCACTTATAATAGGAGTGCTTTGTTACATA
GGTTTATTATTAATGGGTACTCAATATGCGGTGCTTATTTCTTTCATAGTTGGATTAACAAATATGATTCCATATTTCGG
TCCATTTATAGGAATGATTCCTGCATTTTTATTGACACTTATTGTTCAGCCATCTATGGCAATATGGGTTCTTTTATTCA
TATTCATCCTTCAACAATTTGATGGTTGGTACTTAGGTCCAAAAATATTAGGAGATCAAGTAGGTGTTTCTCCACTATTT
ATAATATTCGCTGTTACAGTTGGTGGTGGAATATTTGGTGTTTTAGGAATGTTCTTAAGTGTTCCTATAATAGCCTTAAT
AAAAATATATACAGAAAAATTCATTGAATACAGATTAGAAAATAAAAAACAAAACTTTAGTGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAACAAAATAATTCATGCTCTTATAGAAGATTAATAATCCTGCTATTATTATTAGCAAAAATCGTTATAAAATTTATAT
AATTTAGGGGGAAAACATAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATAAAGGGGATATTTTATAATATCCTCTTTATTTTTTTATATTTATTATTTAACTAATTGTTAATAATTATTTAAATAT
GATGTTCTAAAATAAATATT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 368; Mature: 368

Protein sequence:

>368_residues
MFKKHNFHFNWLPLILISTVSIMLIFNIRSILSEGIRPFLSVLTPFFWAFGIAYLINPLMMLIEKKFKLKRAFSLMISYI
LVIICVYILIAIIVPTIFDSLSELFSNLSEYASSAESWINNTLASMNVPLDLNHLNTSATEFISKTSTLLSNIVGSLLTQ
TIKITSSVVKFVFGFIISIYMLMDKETLIEGCKKIIIAVMPSEKSSELFISFMAEAHNIFSRFIIGKIIDSLIIGVLCYI
GLLLMGTQYAVLISFIVGLTNMIPYFGPFIGMIPAFLLTLIVQPSMAIWVLLFIFILQQFDGWYLGPKILGDQVGVSPLF
IIFAVTVGGGIFGVLGMFLSVPIIALIKIYTEKFIEYRLENKKQNFSE

Sequences:

>Translated_368_residues
MFKKHNFHFNWLPLILISTVSIMLIFNIRSILSEGIRPFLSVLTPFFWAFGIAYLINPLMMLIEKKFKLKRAFSLMISYI
LVIICVYILIAIIVPTIFDSLSELFSNLSEYASSAESWINNTLASMNVPLDLNHLNTSATEFISKTSTLLSNIVGSLLTQ
TIKITSSVVKFVFGFIISIYMLMDKETLIEGCKKIIIAVMPSEKSSELFISFMAEAHNIFSRFIIGKIIDSLIIGVLCYI
GLLLMGTQYAVLISFIVGLTNMIPYFGPFIGMIPAFLLTLIVQPSMAIWVLLFIFILQQFDGWYLGPKILGDQVGVSPLF
IIFAVTVGGGIFGVLGMFLSVPIIALIKIYTEKFIEYRLENKKQNFSE
>Mature_368_residues
MFKKHNFHFNWLPLILISTVSIMLIFNIRSILSEGIRPFLSVLTPFFWAFGIAYLINPLMMLIEKKFKLKRAFSLMISYI
LVIICVYILIAIIVPTIFDSLSELFSNLSEYASSAESWINNTLASMNVPLDLNHLNTSATEFISKTSTLLSNIVGSLLTQ
TIKITSSVVKFVFGFIISIYMLMDKETLIEGCKKIIIAVMPSEKSSELFISFMAEAHNIFSRFIIGKIIDSLIIGVLCYI
GLLLMGTQYAVLISFIVGLTNMIPYFGPFIGMIPAFLLTLIVQPSMAIWVLLFIFILQQFDGWYLGPKILGDQVGVSPLF
IIFAVTVGGGIFGVLGMFLSVPIIALIKIYTEKFIEYRLENKKQNFSE

Specific function: Unknown

COG id: COG0628

COG function: function code R; Predicted permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0118 (perM) family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788838, Length=235, Percent_Identity=24.6808510638298, Blast_Score=88, Evalue=1e-18,
Organism=Escherichia coli, GI87082271, Length=320, Percent_Identity=20.3125, Blast_Score=64, Evalue=2e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002549 [H]

Pfam domain/function: PF01594 UPF0118 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 41430; Mature: 41430

Theoretical pI: Translated: 8.72; Mature: 8.72

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
4.1 %Met     (Translated Protein)
4.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
4.1 %Met     (Mature Protein)
4.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFKKHNFHFNWLPLILISTVSIMLIFNIRSILSEGIRPFLSVLTPFFWAFGIAYLINPLM
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLIEKKFKLKRAFSLMISYILVIICVYILIAIIVPTIFDSLSELFSNLSEYASSAESWIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NTLASMNVPLDLNHLNTSATEFISKTSTLLSNIVGSLLTQTIKITSSVVKFVFGFIISIY
HHHHHCCCCEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLMDKETLIEGCKKIIIAVMPSEKSSELFISFMAEAHNIFSRFIIGKIIDSLIIGVLCYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLLMGTQYAVLISFIVGLTNMIPYFGPFIGMIPAFLLTLIVQPSMAIWVLLFIFILQQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DGWYLGPKILGDQVGVSPLFIIFAVTVGGGIFGVLGMFLSVPIIALIKIYTEKFIEYRLE
CCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKKQNFSE
HHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFKKHNFHFNWLPLILISTVSIMLIFNIRSILSEGIRPFLSVLTPFFWAFGIAYLINPLM
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLIEKKFKLKRAFSLMISYILVIICVYILIAIIVPTIFDSLSELFSNLSEYASSAESWIN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NTLASMNVPLDLNHLNTSATEFISKTSTLLSNIVGSLLTQTIKITSSVVKFVFGFIISIY
HHHHHCCCCEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MLMDKETLIEGCKKIIIAVMPSEKSSELFISFMAEAHNIFSRFIIGKIIDSLIIGVLCYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLLLMGTQYAVLISFIVGLTNMIPYFGPFIGMIPAFLLTLIVQPSMAIWVLLFIFILQQF
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
DGWYLGPKILGDQVGVSPLFIIFAVTVGGGIFGVLGMFLSVPIIALIKIYTEKFIEYRLE
CCCCCCHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NKKQNFSE
HHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]