| Definition | Rickettsia conorii str. Malish 7, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003103 |
| Length | 1,268,755 |
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The map label for this gene is 15892602
Identifier: 15892602
GI number: 15892602
Start: 657479
End: 659287
Strand: Reverse
Name: 15892602
Synonym: RC0679
Alternate gene names: NA
Gene position: 659287-657479 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15892603
Following gene: 15892601
Centisome position: 51.96
GC content: 30.96
Gene sequence:
>1809_bases ATGATCATAATACCAATATTAAGCATTTTTGGGTTTTCATCTTTTTTTGCCAAATATTTCAAAACAAAATTGACTTTCGC TATTCCCATAACAATCAGCATATTAGTACCGATTTTATATTGTTTTGCTATGTTAAAGCTATTACCGGCTGCAACATATA TATATTATTTCATCGGTATATTTTTAGCTTTCATATCATTCCTGCATTTTATAGGCGTTGTTGTAGGGGGTGGCTCCGCT CCTGCTATCCCGCGACTTGATCGCGGGATCCAGTTAAAAATGTTTAGTATTTTTAAGTTATATTTTTGGATACCGTGGTC AAGCCACGGTATGACACCGCACGCATTTCTTGATCTACGCAATAATACCTCCTTCATGTCATTTCTGTGGAAGCAGGAAT CTAGAAAAAATATAATTGAAATCATTGTATTTACTTTATTGATTCTTTTGTTTTTTCTTTATACCAGAGATGCATCGCTG CATTCTTATGATGATTTCTCACATTGGGGAATATTTACTAAAGAATTGTTATATTTCGGTGTTTTTGAAAATCAGTCTTC GTTAACTTCCATTATTACTACTCATGCCCATTATCCAAGAGGAGCTGCCGTTTATCATTATTTTATGCTGCTACTTTCAG GTTATTCGGACGGTAACGTATTATTTGCTCATTTCTTATTACATTTAGCATTTCTAGCTCCTTTAGCCGCAAATAAGAAA TTGTGGCAAACCGGAATGTTGTTTTCACTTTTACTTTGCGACGTAGTATTATATACGACCGGAATTCGTTCAATATATAA CGATAGTACTATTGGCTTAATGTTCGGAGCTATTTTTGCAATTTATATCCTTGCGGAAGACAAGAAAAAAGCATTATTGC TTATTTTACCTATTACGATATTACTTGCCTCTTTCCGAGAAATTGGAACATGGCTTGCTAGTTTTGCTTCGATAATTCTT ATAGCTCATTATACAATTTTTTATAAAAAGCCTAAAAAATCAAGTGATTATATTACGTATCTGATTTTACTTACTTTACC TATTTTGTGTAATTTTATTTGGATGAGTTATTTTAAAAACACCCATGATTTTTTTGATAGATGCGAACATAGTTTTAGCA ATTTAGTATATATTGCTGAAAATTTTAATGAACAGCATAGATCATTATTACTAAATTACGGTAAATTTCTCTTGTTATTC TTATTAAAAGAAGGAAGTTTAGTTGTATATACTATTTGTATAGCTGCATGGTACGGAATTCGTAAATATAAACCGGATTT GCTGAAAGAATATAAATTTTTCCTGATAAGTACGTTTGCGTGTTTTATAATTTTTGCTTTGTGGCGGTTATATTTATATT TCTTTAACTTTAGTTATGAAGAGGCAATTAGAGGGGCATCATTACTTAGATATCTTGGATGTTATGTTATAGCTATCGGA ATGATTGCAGCTTCGTATGTTAAAAATAGTATTTTCTTACACAAGCAAAGTAATAAAGAGTTATTTATATTCCTTCTGCT TCTTGCTGTTTCTACGTTTTCCGTAGTAAAAAATATACTAAGAATCAAACACTTAAACTTAGAACAAAAGAATTTTATCC AGCAAACAACAGAAGTTAAAAAGCTATTGGAGCAAGGCAATAAAATTGAATTTAACTTTAGCGGTAAGAAAGATAATTTA CAATGTTATATATTAAATTATAATCTAGTACCGTATTTAGGTAAGAAATCCTTACAAGAATGCATAAAAGCTTCTAAAGA AGCGATTATAGAAACAAAGGAAGAAGCGGTATACGCTCCTTTTAAATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases GTATTTTTTATTGTTTTTTGGACCCCGTGGTTAAGCCACGGGGTGACACAGTGGGTTTTACCGGTTCACGCAATGACCAA AAAATTATTTACAAATTAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases CGTTGAGGATTTGTTGCACAGCTCCTATGTCATTCCTGTGTGGCCTTGTTGTGTAGATATTACCCCATCATTGCGAGCAG TTGTAGTACTTGCGTGGCAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 602; Mature: 602
Protein sequence:
>602_residues MIIIPILSIFGFSSFFAKYFKTKLTFAIPITISILVPILYCFAMLKLLPAATYIYYFIGIFLAFISFLHFIGVVVGGGSA PAIPRLDRGIQLKMFSIFKLYFWIPWSSHGMTPHAFLDLRNNTSFMSFLWKQESRKNIIEIIVFTLLILLFFLYTRDASL HSYDDFSHWGIFTKELLYFGVFENQSSLTSIITTHAHYPRGAAVYHYFMLLLSGYSDGNVLFAHFLLHLAFLAPLAANKK LWQTGMLFSLLLCDVVLYTTGIRSIYNDSTIGLMFGAIFAIYILAEDKKKALLLILPITILLASFREIGTWLASFASIIL IAHYTIFYKKPKKSSDYITYLILLTLPILCNFIWMSYFKNTHDFFDRCEHSFSNLVYIAENFNEQHRSLLLNYGKFLLLF LLKEGSLVVYTICIAAWYGIRKYKPDLLKEYKFFLISTFACFIIFALWRLYLYFFNFSYEEAIRGASLLRYLGCYVIAIG MIAASYVKNSIFLHKQSNKELFIFLLLLAVSTFSVVKNILRIKHLNLEQKNFIQQTTEVKKLLEQGNKIEFNFSGKKDNL QCYILNYNLVPYLGKKSLQECIKASKEAIIETKEEAVYAPFK
Sequences:
>Translated_602_residues MIIIPILSIFGFSSFFAKYFKTKLTFAIPITISILVPILYCFAMLKLLPAATYIYYFIGIFLAFISFLHFIGVVVGGGSA PAIPRLDRGIQLKMFSIFKLYFWIPWSSHGMTPHAFLDLRNNTSFMSFLWKQESRKNIIEIIVFTLLILLFFLYTRDASL HSYDDFSHWGIFTKELLYFGVFENQSSLTSIITTHAHYPRGAAVYHYFMLLLSGYSDGNVLFAHFLLHLAFLAPLAANKK LWQTGMLFSLLLCDVVLYTTGIRSIYNDSTIGLMFGAIFAIYILAEDKKKALLLILPITILLASFREIGTWLASFASIIL IAHYTIFYKKPKKSSDYITYLILLTLPILCNFIWMSYFKNTHDFFDRCEHSFSNLVYIAENFNEQHRSLLLNYGKFLLLF LLKEGSLVVYTICIAAWYGIRKYKPDLLKEYKFFLISTFACFIIFALWRLYLYFFNFSYEEAIRGASLLRYLGCYVIAIG MIAASYVKNSIFLHKQSNKELFIFLLLLAVSTFSVVKNILRIKHLNLEQKNFIQQTTEVKKLLEQGNKIEFNFSGKKDNL QCYILNYNLVPYLGKKSLQECIKASKEAIIETKEEAVYAPFK >Mature_602_residues MIIIPILSIFGFSSFFAKYFKTKLTFAIPITISILVPILYCFAMLKLLPAATYIYYFIGIFLAFISFLHFIGVVVGGGSA PAIPRLDRGIQLKMFSIFKLYFWIPWSSHGMTPHAFLDLRNNTSFMSFLWKQESRKNIIEIIVFTLLILLFFLYTRDASL HSYDDFSHWGIFTKELLYFGVFENQSSLTSIITTHAHYPRGAAVYHYFMLLLSGYSDGNVLFAHFLLHLAFLAPLAANKK LWQTGMLFSLLLCDVVLYTTGIRSIYNDSTIGLMFGAIFAIYILAEDKKKALLLILPITILLASFREIGTWLASFASIIL IAHYTIFYKKPKKSSDYITYLILLTLPILCNFIWMSYFKNTHDFFDRCEHSFSNLVYIAENFNEQHRSLLLNYGKFLLLF LLKEGSLVVYTICIAAWYGIRKYKPDLLKEYKFFLISTFACFIIFALWRLYLYFFNFSYEEAIRGASLLRYLGCYVIAIG MIAASYVKNSIFLHKQSNKELFIFLLLLAVSTFSVVKNILRIKHLNLEQKNFIQQTTEVKKLLEQGNKIEFNFSGKKDNL QCYILNYNLVPYLGKKSLQECIKASKEAIIETKEEAVYAPFK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 69726; Mature: 69726
Theoretical pI: Translated: 9.57; Mature: 9.57
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.5 %Cys (Translated Protein) 1.7 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.5 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIIIPILSIFGFSSFFAKYFKTKLTFAIPITISILVPILYCFAMLKLLPAATYIYYFIGI CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLAFISFLHFIGVVVGGGSAPAIPRLDRGIQLKMFSIFKLYFWIPWSSHGMTPHAFLDLR HHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHEEEEC NNTSFMSFLWKQESRKNIIEIIVFTLLILLFFLYTRDASLHSYDDFSHWGIFTKELLYFG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH VFENQSSLTSIITTHAHYPRGAAVYHYFMLLLSGYSDGNVLFAHFLLHLAFLAPLAANKK EECCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH LWQTGMLFSLLLCDVVLYTTGIRSIYNDSTIGLMFGAIFAIYILAEDKKKALLLILPITI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHH LLASFREIGTWLASFASIILIAHYTIFYKKPKKSSDYITYLILLTLPILCNFIWMSYFKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC THDFFDRCEHSFSNLVYIAENFNEQHRSLLLNYGKFLLLFLLKEGSLVVYTICIAAWYGI HHHHHHHHHHHHHCEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH RKYKPDLLKEYKFFLISTFACFIIFALWRLYLYFFNFSYEEAIRGASLLRYLGCYVIAIG HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MIAASYVKNSIFLHKQSNKELFIFLLLLAVSTFSVVKNILRIKHLNLEQKNFIQQTTEVK HHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH KLLEQGNKIEFNFSGKKDNLQCYILNYNLVPYLGKKSLQECIKASKEAIIETKEEAVYAP HHHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCC FK CC >Mature Secondary Structure MIIIPILSIFGFSSFFAKYFKTKLTFAIPITISILVPILYCFAMLKLLPAATYIYYFIGI CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FLAFISFLHFIGVVVGGGSAPAIPRLDRGIQLKMFSIFKLYFWIPWSSHGMTPHAFLDLR HHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCHHEEEEC NNTSFMSFLWKQESRKNIIEIIVFTLLILLFFLYTRDASLHSYDDFSHWGIFTKELLYFG CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH VFENQSSLTSIITTHAHYPRGAAVYHYFMLLLSGYSDGNVLFAHFLLHLAFLAPLAANKK EECCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH LWQTGMLFSLLLCDVVLYTTGIRSIYNDSTIGLMFGAIFAIYILAEDKKKALLLILPITI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHH LLASFREIGTWLASFASIILIAHYTIFYKKPKKSSDYITYLILLTLPILCNFIWMSYFKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC THDFFDRCEHSFSNLVYIAENFNEQHRSLLLNYGKFLLLFLLKEGSLVVYTICIAAWYGI HHHHHHHHHHHHHCEEEEHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHH RKYKPDLLKEYKFFLISTFACFIIFALWRLYLYFFNFSYEEAIRGASLLRYLGCYVIAIG HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MIAASYVKNSIFLHKQSNKELFIFLLLLAVSTFSVVKNILRIKHLNLEQKNFIQQTTEVK HHHHHHHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH KLLEQGNKIEFNFSGKKDNLQCYILNYNLVPYLGKKSLQECIKASKEAIIETKEEAVYAP HHHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHCCCCC FK CC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA