Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is icmF

Identifier: 52840703

GI number: 52840703

Start: 497705

End: 500626

Strand: Reverse

Name: icmF

Synonym: lpg0458

Alternate gene names: NA

Gene position: 500626-497705 (Counterclockwise)

Preceding gene: 52840704

Following gene: 52840702

Centisome position: 14.73

GC content: 36.62

Gene sequence:

>2922_bases
ATGGACAATTCATTACGCGCATTATGTGATGCTATAAAAAAAATTCTCTCTCAATTAAAACCACAAACTAATCAATTATC
TTTTGTTGTCATCACCGGAAAAAACGCCCAAGGCAAATCGGCACTGTTAAAGCAAAGTAATATGGAAGAAATGCCCGTAT
TCAGCGAAGAGCATGCCAAACTGTATTTTAATCAAAAGGGAATCATAGTAGAGCTTGGTGAAAATTGGCTTACCAATAGC
AAAACATTATTGCTCACAACACTTAAACAATTAAATAAATGCAATCGCCATCTCAAAATTACAGGCTTGATTTTATGTGT
GGATGTCAATGATTTACTGATCGCCGAACCAGCACAATTCACTGAACAAAAAAAATCTCATTTGCAACTTATTCAACGTT
TAGGTGTTAACCTGGGATATCAGGCTGAATTAGCTTTAATATTCACCAAAATGGATACCTTGGCTGGCTTTTCTGAGTTT
TATCAAATGGATCATGTCAATGATCTATCTAAACCTCTTGGCTTTTCCCTTGATTGTGTCAACCAATTAAGTAAAAAAAT
TGAAACGTTTTCCCTTCAATTCAATCAATTAATTGAAGCTTTAGGACAGCAAGTTATCAATAAAATGCACCCGGCACGTT
CTACTATTAAGCGCAGTTTGATACGCGAATTTCCTTTGCAATTAGCCAGCTTGAGAGCCCCAATTCAGTCGTTAATTCAG
GGGATTTCGCCAAAATTATTCCATGTTCACTCTATTTTTTTCACGAGTGCCGAGCAAGGTGGAGTCAGTGTAGATAGGCT
AAACAAAAAAATTCAGCATGAATACGCTCTGGTTGTTCAGGATACTTTCCCTCAAGCGACCAATTTCAGATCCTATTTTG
TAGAAGGTGCACTGCAAACAATCCAGGAACAATGCATCCAGGTACCACAGACTACAAAATTTTCTCAAAAACCATTCATT
GCTGTTGCAGTAAGTTTGGCCGGGCTCAGTTTATTAACGCTGGTCTATAACCACTACAAAACCTCTCATATTCTTGATGA
GGCTAGTAAAGAATTGCTTGCCTATGAAGCACTGAATAATCAGGGCACTAGTGGTGCACAAGCGCTATATCACTTATCGC
AGGCTGCAAATAAAATGAATCACATTACATCAAACTCCATATCGCTGCCTACTGTGCACCAATTAAAATTAAACCTTCAC
AACAATGCTCAAAATCGTTTACAAGGAGAATTTCTTCCCTCCTTAGCTAATGAGTTAGAACAAGTCATCACAAGTCCTGG
CAACACCCCTATCACTCGTTATAAGGCTTTAAAAATTTATTTAATGTTAGGAAACTCAAAATATTTTTCATCCCAACCCA
TTCTGGATTGGTTTCAACAACAATGGCAGGGACGTGCACCAGGCACTACGCAAAAACAGTTGGCTCTTTTAAAACAAACT
CTTAGCAATCCTCCTCAAAATATACCCATCAAATCACAAATAATCAGTGATGCGAGGAATTATCTTAATGCACTTCCAAC
AAGCTATTTATATTACTCTATTGCGAAAGAATATTTCCCTCAGGAAAAACAAAAGATTGTGATTGAAGGTTTTTCTATAC
CTACGGATGAAGTGCCAACCTATTTTACTAAAACCGGATTTACAAAAATTATTAACGAATTACCTAAAATTACCAGTACA
CTTCAATCAGAAAACTGGGTACTTGCGAGACAGGATTTGTCTCAATTACACAATATGCTGATTCAGGCTTATTGTTTTGA
TTACGTCACTTGGTGGCAAACGTTCATGAAGAAATCCCAACCATTACGTTATCAGGATTATCAGCAAGGTCGTCAATTAA
CAAAATTAATACAACAATCCAATTCGTTTTATAAATTCGCTAATCTTATTCAGCAGGAAACCAAACCGGATTTAACCGAA
GGCATATCCACCTTTAATCAATTCATTGCCAATCAATTTACTGATTTAAATTTAACAACTTTATCCAGCATTAAGGAATT
AGATTTTAGAATTTCTGAATTAGAACGATTTATTGCAACTTTATCTGTTGTAAATGATGGAGGTAAAACAGCGTTTACCA
TTACACGCTCGCGTTTTCTCAATGAAAATTCCTCTGACCCTGTGAGTTTGCTCTACAGCCAGGCACGACAATTACCTGAA
CCATTGAGTTCGTGGACAAAGCAAATAGCTGGTGACATTTGGGTTATACTGATTAGAGATAGTCGTCAATACATTAATAA
TCAGTGGCAAAAAACCGTCTATAGAGAGTTCCAAAACTCTATTGCCCAGCGCTATCCTTTTGACTCGTCACAAACTGCAG
AAATAGATATTGCAGATTTTAATCGCTTTTTCTCAACACATGGCTTATTGAACACCTACTCTGAACAATACATTAAGCCA
TTTCTTGACACTTCATCTCCAGAATGGAAGCCTAAAGCTGTGAATGATTTCATCTTGCCTATTTCAAATGAAGTAATTGA
TGAGTTAATTCGCGCCAATATCATTACTAATATGTTCTTTCCTGATCACAGTGATGAAAGCAAAATTGATTTTAGCTTGC
AAAAGATCTCTCTGGATCCTGTAGTTTCTAATCTAGTCCTTGAAATTGGCGGCACTAAATTGATGGATAATCAAACAAGC
GATTCACTAATTCGCTTCACCTGGCCTCAAAACAACGCTAAATTGGCTCTTGATTCTATTGAAGGGAATCATTACGAGCT
CGCAGAATATGGAACCTGGGCAATATTTAAATTACTTGAAAAAGTCAATGTGCTTGTGGATGAACAAGATAGTTCAAGCC
TCCAAATACTTTTTGAAGTGAATAGCAACTCCGGCCGCTATTTATTAAAAACAAACAACCAAATTAATCCTTTTACTCCA
GGAATTCTAAATGGGTTTACTTTAAACGACCATATTGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTATTGTAATTCTAGCTTTTGTTACTAGCCATGTTTTATTAGAAAACAAAGCTAAAACTGTTTTATTTGGACATACCCAA
CTTGCTATGCTGGAAAACTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATGAAACAAAATACCAAACACAGCATTATTGCTGGATTATACGGAAATGCTTTGGAGTGGTATGATTTCTTGCTCTAT
GCCAGTTTTGCTCCTGTCTT

Product: IcmF

Products: NA

Alternate protein names: ImcF Domain-Containing Protein; IcmF-Related Protein; IcmF Family Protein; IcmF-Like Protein; Lipoprotein; Inner Membrane Protein; ImcF-Like Protein; ImcF Family Protein; Secretion Protein IcmF; ImcF-Related; Replication Related Protein; Protein Conserved In Bacteria; Fis Family Transcriptional Regulator

Number of amino acids: Translated: 973; Mature: 973

Protein sequence:

>973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQTNQLSFVVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQLSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLVYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGNSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA

Sequences:

>Translated_973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQTNQLSFVVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQLSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLVYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGNSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA
>Mature_973_residues
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQTNQLSFVVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAKLYFNQKGIIVELGENWLTNS
KTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQFTEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEF
YQMDHVNDLSKPLGFSLDCVNQLSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQTIQEQCIQVPQTTKFSQKPFI
AVAVSLAGLSLLTLVYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNNQGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLH
NNAQNRLQGEFLPSLANELEQVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGNSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPTYFTKTGFTKIINELPKITST
LQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQPLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTE
GISTFNQFIANQFTDLNLTTLSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADFNRFFSTHGLLNTYSEQYIKP
FLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFFPDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTS
DSLIRFTWPQNNAKLALDSIEGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
GILNGFTLNDHIA

Specific function: Unknown

COG id: COG3523

COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 110809; Mature: 110809

Theoretical pI: Translated: 7.50; Mature: 7.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQTNQLSFVVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCE
LYFNQKGIIVELGENWLTNSKTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQF
EEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEECCHHH
TEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEFYQMDHVNDLSKPLGFSLDCV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
NQLSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQT
CCCCCCEEHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IQEQCIQVPQTTKFSQKPFIAVAVSLAGLSLLTLVYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNN
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLHNNAQNRLQGEFLPSLANELE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGNSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
HHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPT
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC
YFTKTGFTKIINELPKITSTLQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQ
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTEGISTFNQFIANQFTDLNLTT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCH
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADF
HHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHH
NRFFSTHGLLNTYSEQYIKPFLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFF
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTSDSLIRFTWPQNNAKLALDSI
CCCCCCCCEEEEHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEC
EGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
GILNGFTLNDHIA
HHHCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MDNSLRALCDAIKKILSQLKPQTNQLSFVVITGKNAQGKSALLKQSNMEEMPVFSEEHAK
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCE
LYFNQKGIIVELGENWLTNSKTLLLTTLKQLNKCNRHLKITGLILCVDVNDLLIAEPAQF
EEECCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEECCCCEEECCHHH
TEQKKSHLQLIQRLGVNLGYQAELALIFTKMDTLAGFSEFYQMDHVNDLSKPLGFSLDCV
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
NQLSKKIETFSLQFNQLIEALGQQVINKMHPARSTIKRSLIREFPLQLASLRAPIQSLIQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GISPKLFHVHSIFFTSAEQGGVSVDRLNKKIQHEYALVVQDTFPQATNFRSYFVEGALQT
CCCCCCEEHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IQEQCIQVPQTTKFSQKPFIAVAVSLAGLSLLTLVYNHYKTSHILDEASKELLAYEALNN
HHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
QGTSGAQALYHLSQAANKMNHITSNSISLPTVHQLKLNLHNNAQNRLQGEFLPSLANELE
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QVITSPGNTPITRYKALKIYLMLGNSKYFSSQPILDWFQQQWQGRAPGTTQKQLALLKQT
HHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
LSNPPQNIPIKSQIISDARNYLNALPTSYLYYSIAKEYFPQEKQKIVIEGFSIPTDEVPT
HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC
YFTKTGFTKIINELPKITSTLQSENWVLARQDLSQLHNMLIQAYCFDYVTWWQTFMKKSQ
HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PLRYQDYQQGRQLTKLIQQSNSFYKFANLIQQETKPDLTEGISTFNQFIANQFTDLNLTT
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHH
LSSIKELDFRISELERFIATLSVVNDGGKTAFTITRSRFLNENSSDPVSLLYSQARQLPE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCH
PLSSWTKQIAGDIWVILIRDSRQYINNQWQKTVYREFQNSIAQRYPFDSSQTAEIDIADF
HHHHHHHHHCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEHHHH
NRFFSTHGLLNTYSEQYIKPFLDTSSPEWKPKAVNDFILPISNEVIDELIRANIITNMFF
HHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDHSDESKIDFSLQKISLDPVVSNLVLEIGGTKLMDNQTSDSLIRFTWPQNNAKLALDSI
CCCCCCCCEEEEHEEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEEC
EGNHYELAEYGTWAIFKLLEKVNVLVDEQDSSSLQILFEVNSNSGRYLLKTNNQINPFTP
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCC
GILNGFTLNDHIA
HHHCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA