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The map label for this gene is yjaE

Identifier: 15672864

GI number: 15672864

Start: 904024

End: 906423

Strand: Direct

Name: yjaE

Synonym: L103741

Alternate gene names: 15672864

Gene position: 904024-906423 (Clockwise)

Preceding gene: 15672862

Following gene: 15672865

Centisome position: 38.22

GC content: 36.04

Gene sequence:

>2400_bases
ATGTTAAAAAAAGAATGGCAAGCCATTTTAAAGCACAAATTTTTTATTATTGTTATTATCGCTTTGGCACTTGTACCAGC
AATTTATAACTATATTTTCTTAGGTTCTATGTGGGATCCTTACGGTAAATTGAATGACTTACCAGTAGCGGTTGTAAATT
TAGACAAGACGTCTGAATTGAACGGAAAAAAATTCAAACTTGGTGATGATGTCATTGCTGAAATGAAAAAATCAAAGGAT
TTAGATTATCATTTTGTTTCGGAGTATAAAGCTTCTAAAGGGATAAAAAAAGGTGATTATTACATGGTTATCACTTTTCC
AGAAAACTTTTCAGAAAATGCAACAACCTTAATGAATAAGAAACCAAAAACGGTTCAGTTAGATTATCAAACGACACGTG
GTCATAACTATATTTCATCAAAAATGAGCGAAAGTGCGATGAATCAGCTGAAATCAGAGGTTTCTAAAAATATCACGGAA
ACTTACACCAAAGAAATTTTCGCTAAACTTGGTGATATGAAGTCAGGAATGAAAGAAGCTTCTGACGGTTCAAATAAATT
GGCTGATGGAACTTCGTCAGCATTAAATGGTTCAAAAGAATTAAGTAGTAATTTGAATACTTTATCTTCATCAAGTTTAA
CTTTTACTGACGGCGCAAATAATTTGAATTCAGGCTTAAATAAATATGTATCAGGAGTGAATCAAGCTGCCAATGGGGGA
CAACAACTTTCTTCTGGTGCAGACCAATTTGTCAGTGGAACGCAACAATTAGCAGCAGGTACACAAACACTGGCTGATAA
ATCAAAAGAGCTGTCAGCAGGAATTTCACAAATTTCTCAAGGGTCAGAAGCGGTGAGTCAATTGCAATCGGGTGTGCAAC
AATTATCTGAAGGCTTAAGTCAAATGGCTCAAAAAACAACTTTATCCGAAACTCAACAGCAAAATATTAGTGCTGTACAA
AATGGTCTTACTGAATTAAATCAGGAGTTACAAAAAAATACGATTGACCCAAATTTGGCTGCCAATATCCAAAATAACTT
GAAAGGTCTTGGAGCTACGGTCACAAATCTAGCTAATGATCAAGTGGCGGCCTCTAAGACAGCAGTTGAAAGTACTGAGA
CTTTTAAAACTTTAAGCGAAAGTCAGAAAACAGATATAAGAAATGCATTAGATAATTCTGTTGGTGCTGGAGCAGTTCAA
ACCGATTTACTATCTTTAAATAAGAATATTAAAGGAGTCCAAGACAGTCTTACAAGTCTACTACCAATGTTTGGAAAAAT
TGCTGATCTTAAAACATTAGTTCCAGGAGCAAGTCAAATAATTGCTGACCTTTCAGGTGGTCTGAACGAAGTAAACACTA
ATGTAAACACAAAATTTATTCCTGGTATCAATCAGTTAAATGCTGGTTTGACGAATTTTAATGACCAGTTAACTTCTGGA
AGTCAAAAATTAACTTCTGGTTTTGCCCAATATGCTGACGGAGTTAATCAAGCAAACGCTGGCGCTCAACAATTAGCAAG
TAAATCAAAAGATTTACAAAGCGGGACAATGCAATTAGTTTCTGGATTGTCACAATTACAAGCGAATGGTTCAACTTTAA
CTTCAGGTTCAAATCAATTGGCAGGGGGTGCTCAACAAATTTCCTCTGTTTCACAACAATTGGCAAATGGAGGTTCAAGT
TTAACAAGTGGTTTGGGAACGCTAAATACAGGGGCTAATAACTTGTCAACAGCGTTAACCAAAGCAGATGATACTCTCTC
AGCAACTAATAATTCTAATGAAAATGCTAAAAAAGTAGCTGCACCGTTGAAACTTAAACATACTGACCATGACAATGTAC
CAGAAAATGGTGCAGGAATGACACCATACATGATTAATGTTGCTCTCTTTATTGGTGCCCTTGCGACAAATGTTGTGATT
GGAATTGGTTTCTCAGGTGAAAAATGGAAATCTGGTCGCGAATTTATGTTGGCGAAAATTGGTACAAATGGTTTGGTAGC
ACTTTTACAAGGAATCATCGTCTGGGGAGCAGTTGCTCTTCTTGGATTGAGACCAAATCATTTGTGGGAAATGTTGTTGT
CAGTACTTTTAATCAGCTTCGCTTACATGGCAATCAATACTTTCTTCTTAACGGCTCTAGGTAAGATTGGTGAATTCCTT
ATGATTGTTGTCTTAGTTCTACAACTGGCGACGAGTGCAGGAACTTACCCCTTACAACTTGCGCCTAAAATATATCAAGT
CATCAGTCCTTGGTTACCAATGACTTATGGTTTAAAAATGTTACGCGAAACCATTGGTTTGAATGGAGCAATTTTACCAG
AAGCAATCCTATTTGTAGTTATTATCGCTCTCTTTACTTTCATGTTGAGTTTCTTCAAGAAATTCTCACGTTTTGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCCAAAACTGAATGGATAATAATTGTCAAATTTTCTAAAAAGTTTATAATACGTATTGTAACAATTTTTGGACGTATTGT
CCATAAAGAAAGGGGAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAAATTACTGACAGAAAAAATTTATTCATAAAATTTTCTGTCAGTAATTTTTTATCTAGAAATTTTAAAATAAATTTG
GTAAAATAAAGCTGTAAAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: ORFB [H]

Number of amino acids: Translated: 799; Mature: 799

Protein sequence:

>799_residues
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVIAEMKKSKD
LDYHFVSEYKASKGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKKPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITE
TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALNGSKELSSNLNTLSSSSLTFTDGANNLNSGLNKYVSGVNQAANGG
QQLSSGADQFVSGTQQLAAGTQTLADKSKELSAGISQISQGSEAVSQLQSGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ
NGLTELNQELQKNTIDPNLAANIQNNLKGLGATVTNLANDQVAASKTAVESTETFKTLSESQKTDIRNALDNSVGAGAVQ
TDLLSLNKNIKGVQDSLTSLLPMFGKIADLKTLVPGASQIIADLSGGLNEVNTNVNTKFIPGINQLNAGLTNFNDQLTSG
SQKLTSGFAQYADGVNQANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLSQLQANGSTLTSGSNQLAGGAQQISSVSQQLANGGSS
LTSGLGTLNTGANNLSTALTKADDTLSATNNSNENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPENGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI
GIGFSGEKWKSGREFMLAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLRPNHLWEMLLSVLLISFAYMAINTFFLTALGKIGEFL
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIALFTFMLSFFKKFSRFA

Sequences:

>Translated_799_residues
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVIAEMKKSKD
LDYHFVSEYKASKGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKKPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITE
TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALNGSKELSSNLNTLSSSSLTFTDGANNLNSGLNKYVSGVNQAANGG
QQLSSGADQFVSGTQQLAAGTQTLADKSKELSAGISQISQGSEAVSQLQSGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ
NGLTELNQELQKNTIDPNLAANIQNNLKGLGATVTNLANDQVAASKTAVESTETFKTLSESQKTDIRNALDNSVGAGAVQ
TDLLSLNKNIKGVQDSLTSLLPMFGKIADLKTLVPGASQIIADLSGGLNEVNTNVNTKFIPGINQLNAGLTNFNDQLTSG
SQKLTSGFAQYADGVNQANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLSQLQANGSTLTSGSNQLAGGAQQISSVSQQLANGGSS
LTSGLGTLNTGANNLSTALTKADDTLSATNNSNENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPENGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI
GIGFSGEKWKSGREFMLAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLRPNHLWEMLLSVLLISFAYMAINTFFLTALGKIGEFL
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIALFTFMLSFFKKFSRFA
>Mature_799_residues
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSELNGKKFKLGDDVIAEMKKSKD
LDYHFVSEYKASKGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNKKPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITE
TYTKEIFAKLGDMKSGMKEASDGSNKLADGTSSALNGSKELSSNLNTLSSSSLTFTDGANNLNSGLNKYVSGVNQAANGG
QQLSSGADQFVSGTQQLAAGTQTLADKSKELSAGISQISQGSEAVSQLQSGVQQLSEGLSQMAQKTTLSETQQQNISAVQ
NGLTELNQELQKNTIDPNLAANIQNNLKGLGATVTNLANDQVAASKTAVESTETFKTLSESQKTDIRNALDNSVGAGAVQ
TDLLSLNKNIKGVQDSLTSLLPMFGKIADLKTLVPGASQIIADLSGGLNEVNTNVNTKFIPGINQLNAGLTNFNDQLTSG
SQKLTSGFAQYADGVNQANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLSQLQANGSTLTSGSNQLAGGAQQISSVSQQLANGGSS
LTSGLGTLNTGANNLSTALTKADDTLSATNNSNENAKKVAAPLKLKHTDHDNVPENGAGMTPYMINVALFIGALATNVVI
GIGFSGEKWKSGREFMLAKIGTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLRPNHLWEMLLSVLLISFAYMAINTFFLTALGKIGEFL
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVVIIALFTFMLSFFKKFSRFA

Specific function: Unknown

COG id: COG1511

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013525
- InterPro:   IPR022703
- InterPro:   IPR017501
- InterPro:   IPR017500 [H]

Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 85150; Mature: 85150

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.6 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.6 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSEL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCC
NGKKFKLGDDVIAEMKKSKDLDYHFVSEYKASKGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNK
CCCEEECCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHCC
KPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITETYTKEIFAKLGDMKSGMKEA
CCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SDGSNKLADGTSSALNGSKELSSNLNTLSSSSLTFTDGANNLNSGLNKYVSGVNQAANGG
CCCCCHHCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
QQLSSGADQFVSGTQQLAAGTQTLADKSKELSAGISQISQGSEAVSQLQSGVQQLSEGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QMAQKTTLSETQQQNISAVQNGLTELNQELQKNTIDPNLAANIQNNLKGLGATVTNLAND
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QVAASKTAVESTETFKTLSESQKTDIRNALDNSVGAGAVQTDLLSLNKNIKGVQDSLTSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
LPMFGKIADLKTLVPGASQIIADLSGGLNEVNTNVNTKFIPGINQLNAGLTNFNDQLTSG
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCEECCCHHHHHCCCCCCCHHHHCC
SQKLTSGFAQYADGVNQANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLSQLQANGSTLTSGSNQL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHH
AGGAQQISSVSQQLANGGSSLTSGLGTLNTGANNLSTALTKADDTLSATNNSNENAKKVA
CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHH
APLKLKHTDHDNVPENGAGMTPYMINVALFIGALATNVVIGIGFSGEKWKSGREFMLAKI
CCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCEEEECC
GTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLRPNHLWEMLLSVLLISFAYMAINTFFLTALGKIGEFL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVV
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
IIALFTFMLSFFKKFSRFA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MLKKEWQAILKHKFFIIVIIALALVPAIYNYIFLGSMWDPYGKLNDLPVAVVNLDKTSEL
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCC
NGKKFKLGDDVIAEMKKSKDLDYHFVSEYKASKGIKKGDYYMVITFPENFSENATTLMNK
CCCEEECCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHCC
KPKTVQLDYQTTRGHNYISSKMSESAMNQLKSEVSKNITETYTKEIFAKLGDMKSGMKEA
CCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
SDGSNKLADGTSSALNGSKELSSNLNTLSSSSLTFTDGANNLNSGLNKYVSGVNQAANGG
CCCCCHHCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
QQLSSGADQFVSGTQQLAAGTQTLADKSKELSAGISQISQGSEAVSQLQSGVQQLSEGLS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QMAQKTTLSETQQQNISAVQNGLTELNQELQKNTIDPNLAANIQNNLKGLGATVTNLAND
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
QVAASKTAVESTETFKTLSESQKTDIRNALDNSVGAGAVQTDLLSLNKNIKGVQDSLTSL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
LPMFGKIADLKTLVPGASQIIADLSGGLNEVNTNVNTKFIPGINQLNAGLTNFNDQLTSG
HHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCEECCCHHHHHCCCCCCCHHHHCC
SQKLTSGFAQYADGVNQANAGAQQLASKSKDLQSGTMQLVSGLSQLQANGSTLTSGSNQL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECCCCCHH
AGGAQQISSVSQQLANGGSSLTSGLGTLNTGANNLSTALTKADDTLSATNNSNENAKKVA
CCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHH
APLKLKHTDHDNVPENGAGMTPYMINVALFIGALATNVVIGIGFSGEKWKSGREFMLAKI
CCCEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCCCCCEEEECC
GTNGLVALLQGIIVWGAVALLGLRPNHLWEMLLSVLLISFAYMAINTFFLTALGKIGEFL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
MIVVLVLQLATSAGTYPLQLAPKIYQVISPWLPMTYGLKMLRETIGLNGAILPEAILFVV
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
IIALFTFMLSFFKKFSRFA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]