| Definition | Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_001318 |
| Length | 910,724 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 15594404
Identifier: 15594404
GI number: 15594404
Start: 53534
End: 55504
Strand: Reverse
Name: 15594404
Synonym: BB0058
Alternate gene names: NA
Gene position: 55504-53534 (Counterclockwise)
Preceding gene: 15594405
Following gene: 15594403
Centisome position: 6.09
GC content: 27.25
Gene sequence:
>1971_bases ATGAATTTTAATTGGTTTTTAATGTTATTCCTTTTTAATTTTAGTGTTCTATTAGGAAGTGATACTACAGCATTAGGACA TTATCAAAGGGCTAATGAGTATTATTTATCTAAAAGGTATTATGATGCTATTGATGAGCTTGTTGAGGCTATAAAAATTA ATCCCAATTATTATGAAGCTTATAAATTTATTGCATCAATTTACTATTCCCTTAAGATATATACTCAAGCACAATTTTTC ATAGAGAAAGCCTCTAAAATGTCCAATGAAGACACTGAATATAAAATTCTTTATGCAAATATATTGTTAAAAAACGATAA AATTGATCAAGCAAAAAAAATCTATTCTGAGGTTTTAGTCAAACAAAGGAATAATATTGATGCTTTGGTTGGACTTGCTT CAATTTTTGAAAAAAATGGATTATTTATAGCTGCTGCTAATTATTATTTATCTATTCTTGATTATAGTCAAAATAATTAT AGTGCTTTTGAGCATCTTATTGACATTTATCAAAGGCTAGGAATGCATGACAAGATTAGACATTTGATAAATAAAGTCAG GGTAAATTTTTTATCTTTTCCAGATTTTCATAAAAGAGTCGCTGAATTTTATATTAGTATTAATAATTTGGGGCTTGCTG AAAAGTATGCTTTAAATTATTTGGCTTTAATTGAAAGCTCTTACAAAGATTTTGGAGTTGTTGATGCGTATCGATTGCTT GCGCTTGTTTATTTGCATGAATTTAAATATGAGGATGCAATAGAAGCATTGCAGAAAGCTATTTTAGTTAATAAAGATTC TGATGAGCTTTATTATTTATTGGGGTATTCTTACTTAAGATTTGGAGATATTGAAAAGGCTATTTTAAATTTAGAGCGAG CTAAAAATCTCAAAAAAGATTTAGAATTTTATAATATTGCTCTTGAGGAGAGTTTTTTTGCATCTAATTTTAGAAATTTT TTGAAAAATAATTCCAATGCTAGAATTTCTAAGCATTATGAAAATGAGGGGCTTAAAGCTTTTAAATCTTTAAATTTAAA CAAAGCATTGTTTAATGCAAAAAATGCTGTTGATATTTGGCCTGATAATGATAGTGCTAGGTTTTTGCTTTCAAAAATAT ACAAGCTTATGAATTTAGATATTATGGCATATGAGCAGCTTTTTTATTTAGCAAAACAAAGAAATTCTACTGATTCTAGA ATTTTAGATTTTTACGATGTTGTGTCTTTTGATGTTAGAAAGTCTTTATTTTATAAATATGGATACAAAAGCATTGCTGA TTTTAATAAGCTTTACGATGACAGAGTGGTTTATAAAATGGCTATTTTTACTCAAAGTGAGAATAAGTTTTTTGGGGCAA ATGATTTGATATTGAGATACGCTGAAAGGGTGCTTGAGCGTAATTTAAATATGGAAATAGTTAACTATAATTTTGATTAC AATAAAAATAGAGACTATCTGATTAATAATTTTTCTGAAGGGTTTTCTTATTCAAGAAATAATAATTTGGATTTATTTTT AATTTTTGATTTTAAGGCAGATATTTTGAAAAATACAGCTACCTTGGTAGTGAATATTTTTTCAGGTAAAACAGGGATTA AGCTTGTTTCTTTCTCTTATGATGTGGGAGGTGTTAATTATTTAAGCAATGCTTTAAATTCTCTTTCAAAAGATTTTCAT GATTATTTGCCCAAAAAAGGAAAGATTCTTCAAATTAAAAATGACGATGCTCTTATTAATCTTGGCCAAGTAAACGGTGT TGTAAAAGGCGATGTTTTTTTGATTCTTAAAGAAGGTGCTTTAAACAGTGATACTAGAGATTCTGGTTTTATTGTTTACA AAAAATCAGATATTTTAGGCGAGATTTTAATTGAGGATATAAGTGATTATATTTCTAGAGGCATTGTAAAATCTTCTACC TTTTTAAAGGATTATGTTCAAGAAGGAGCCACTGTGCTTATAAAAAGATAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGAAAAATGAAAAGGTGGAATATAACAATTTGGTTTTTTCGATTAAAAATATGCATCAAAGAAATATTAAGGTGATAAAG ATTTCCGAGAAGGAAGGTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTGACACTTGTTGTTAATTTGTGATTTAATAATTCTAGTAAGAATAAAATCAAAAAATTGGAGGATTTTGTATGAAATT GGCTATTAATGGCTTTGGGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Tetratricopeptide Repeat Family Protein
Number of amino acids: Translated: 656; Mature: 656
Protein sequence:
>656_residues MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEAYKFIASIYYSLKIYTQAQFF IEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLVKQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNY SAFEHLIDIYQRLGMHDKIRHLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKDLEFYNIALEESFFASNFRNF LKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIWPDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSR ILDFYDVVSFDVRKSLFYKYGYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSYDVGGVNYLSNALNSLSKDFH DYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGALNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSST FLKDYVQEGATVLIKR
Sequences:
>Translated_656_residues MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEAYKFIASIYYSLKIYTQAQFF IEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLVKQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNY SAFEHLIDIYQRLGMHDKIRHLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKDLEFYNIALEESFFASNFRNF LKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIWPDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSR ILDFYDVVSFDVRKSLFYKYGYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSYDVGGVNYLSNALNSLSKDFH DYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGALNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSST FLKDYVQEGATVLIKR >Mature_656_residues MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEAYKFIASIYYSLKIYTQAQFF IEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLVKQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNY SAFEHLIDIYQRLGMHDKIRHLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKDLEFYNIALEESFFASNFRNF LKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIWPDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSR ILDFYDVVSFDVRKSLFYKYGYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSYDVGGVNYLSNALNSLSKDFH DYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGALNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSST FLKDYVQEGATVLIKR
Specific function: Unknown
COG id: COG0457
COG function: function code R; FOG: TPR repeat
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76396; Mature: 76396
Theoretical pI: Translated: 8.23; Mature: 8.23
Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.2 %Met (Mature Protein) 1.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEA CCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHH YKFIASIYYSLKIYTQAQFFIEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLV HHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH KQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNYSAFEHLIDIYQRLGMHDKIR HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH HLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKD HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LEFYNIALEESFFASNFRNFLKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEC PDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSRILDFYDVVSFDVRKSLFYKY CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY CCHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCC NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSY CCCCCCEECCCHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEE DVGGVNYLSNALNSLSKDFHDYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEECCCCCEEECCEEEEEECCC LNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSSTFLKDYVQEGATVLIKR CCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC >Mature Secondary Structure MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEA CCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHH YKFIASIYYSLKIYTQAQFFIEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLV HHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH KQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNYSAFEHLIDIYQRLGMHDKIR HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH HLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKD HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LEFYNIALEESFFASNFRNFLKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIW HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEC PDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSRILDFYDVVSFDVRKSLFYKY CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY CCHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCC NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSY CCCCCCEECCCHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEE DVGGVNYLSNALNSLSKDFHDYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGA CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEECCCCCEEECCEEEEEECCC LNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSSTFLKDYVQEGATVLIKR CCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA