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The map label for this gene is nhaB [H]

Identifier: 30995374

GI number: 30995374

Start: 449613

End: 451157

Strand: Direct

Name: nhaB [H]

Synonym: HI0427

Alternate gene names: 30995374

Gene position: 449613-451157 (Clockwise)

Preceding gene: 16272373

Following gene: 16272376

Centisome position: 24.57

GC content: 34.76

Gene sequence:

>1545_bases
ATGACAAACATTCAGGCTTTTATGAAAAACTTTCTTGGGGCAAGTCCAGAATGGTACAAACTTGCCATTGTGGTTTTTCT
TATTATAAATCCAATTGTTTTCTTTTTTATTAGTCCTTTTATTGCGGGTTGGTTACTGGTTGCAGAATTTATTTTCACAT
TGGCAATGGCATTAAAATGCTACCCTCTTCAACCAGGTGGTCTATTAGCAATTGAAGCTATTATTATTGGAATGACAAAT
GCCAAACACGTCAAAGCAGAAATTATGGCAAACTTTGAAGTGATCTTGCTACTGATATTTATGGTGGCAGGTATTTTCTT
TATGAAACAATTACTGCTTTATGTATTTACTAAATTACTTGTCAAAATTCGTTCTAAAATTGCACTTTCTATTGCCTTTT
GTTTTAGTGCTGCTTTTTTATCGGCTTTTCTCGATGCTTTAACGGTTGTTGCTGTTATCATTAGTGTCGCAATGGGATTT
TATGGTGTGTATCACAAAGTTGCATCAGGCAATAATTTAATTGATGCGGTTGATATTTCAGACGATAGAAAAATTATTGA
ACAACAGCACGAAATCTTAGAAAAATTCCGTGCATTCTTACGTAGTTTAATGATGCATGCGGGTGTAGGAACTGCACTCG
GTGGTGTAATGACCGTTGTTGGAGAACCACAAAACTTAATTATTGCAGAACAAGCAAAATGGAACTTTATGGAATTTTTC
CTCCGTATGGCACCCGTGACTATTCCTGTGTTTATCTGCGGATTACTCACTTGTTTCTTGGTCGAAAAATTCAAATTATT
TGGTTATGGCGAGAAATTACCAGACGAAGTGTGGAAAATCTTATCAGATTTAGATCGCACTAATTCAGAAAAAATGTCTA
AACAAGATAAAATTAAATTAGGTATGCAAGCGTTAATCGCAATTTGGTTAATTGTTGGATTAGCATTCCATCTTGCCGCA
GTCGGTTTAATTGGTTTAAGTATCATCATTTTTGCTACGTCTTTCACTGGTGTGACGGATGAACATACTATCGGTAAAGC
CTTTCAGGAATCTTTACCCTTTACTGCATTGCTCGTTGTATTCTTTTCTGTTGTTGCAGTAATTATTGATCAAAAACTTT
TTTCACCAATTATTCACTTCGTTCTTTCTGCGGAAGAAAATACACAACTTGCTTTATTCTATTTGTTTAATGGCTTGCTT
TCTTCTATTTCTGATAATGTATTTGTTGCAACGGTTTATATTAATGAAGCTAAAGCTGCACTGACTAATGGAGTAATTGC
ACCGCATCAATTTGAATTGCTTTCTGTTGCCATTAATACAGGTACAAACTTACCATCAGTTGCAACACCAAATGGACAAG
CTGCTTTCTTATTCTTATTGACTTCATCAATTTCGCCATTAATTCGCCTTTCTTATGGCAGAATGGTTTATATGGCTTTA
CCTTACACGATTGTACTTTCAATCATTGGTTTACTGGCTATTGAATTTATTTTACCAGCTGCCACAATTTGGTTAGCAAG
TTTAGGTTTAATTTTGCCAATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CAAAAAAAATGCAATTTTATAAAAAAATTACTTGGTTTTTATTATCCTTTAAAGGGGGATATATTACAATGTTCGCGTGA
TAAAAATAATGGAGTTCACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGAAAAAATGCTCGCGCTATTAAAACAATTTTCTGAAAAACGTTTTGTGTGGTTTTTATTGGCTTTTTCAAGTTTAGC
CTTAGAATCCACCGCACTTT

Product: sodium/proton antiporter

Products: Na (I) [Periplasm]; Proton [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: Sodium/proton antiporter nhaB [H]

Number of amino acids: Translated: 514; Mature: 513

Protein sequence:

>514_residues
MTNIQAFMKNFLGASPEWYKLAIVVFLIINPIVFFFISPFIAGWLLVAEFIFTLAMALKCYPLQPGGLLAIEAIIIGMTN
AKHVKAEIMANFEVILLLIFMVAGIFFMKQLLLYVFTKLLVKIRSKIALSIAFCFSAAFLSAFLDALTVVAVIISVAMGF
YGVYHKVASGNNLIDAVDISDDRKIIEQQHEILEKFRAFLRSLMMHAGVGTALGGVMTVVGEPQNLIIAEQAKWNFMEFF
LRMAPVTIPVFICGLLTCFLVEKFKLFGYGEKLPDEVWKILSDLDRTNSEKMSKQDKIKLGMQALIAIWLIVGLAFHLAA
VGLIGLSIIIFATSFTGVTDEHTIGKAFQESLPFTALLVVFFSVVAVIIDQKLFSPIIHFVLSAEENTQLALFYLFNGLL
SSISDNVFVATVYINEAKAALTNGVIAPHQFELLSVAINTGTNLPSVATPNGQAAFLFLLTSSISPLIRLSYGRMVYMAL
PYTIVLSIIGLLAIEFILPAATIWLASLGLILPI

Sequences:

>Translated_514_residues
MTNIQAFMKNFLGASPEWYKLAIVVFLIINPIVFFFISPFIAGWLLVAEFIFTLAMALKCYPLQPGGLLAIEAIIIGMTN
AKHVKAEIMANFEVILLLIFMVAGIFFMKQLLLYVFTKLLVKIRSKIALSIAFCFSAAFLSAFLDALTVVAVIISVAMGF
YGVYHKVASGNNLIDAVDISDDRKIIEQQHEILEKFRAFLRSLMMHAGVGTALGGVMTVVGEPQNLIIAEQAKWNFMEFF
LRMAPVTIPVFICGLLTCFLVEKFKLFGYGEKLPDEVWKILSDLDRTNSEKMSKQDKIKLGMQALIAIWLIVGLAFHLAA
VGLIGLSIIIFATSFTGVTDEHTIGKAFQESLPFTALLVVFFSVVAVIIDQKLFSPIIHFVLSAEENTQLALFYLFNGLL
SSISDNVFVATVYINEAKAALTNGVIAPHQFELLSVAINTGTNLPSVATPNGQAAFLFLLTSSISPLIRLSYGRMVYMAL
PYTIVLSIIGLLAIEFILPAATIWLASLGLILPI
>Mature_513_residues
TNIQAFMKNFLGASPEWYKLAIVVFLIINPIVFFFISPFIAGWLLVAEFIFTLAMALKCYPLQPGGLLAIEAIIIGMTNA
KHVKAEIMANFEVILLLIFMVAGIFFMKQLLLYVFTKLLVKIRSKIALSIAFCFSAAFLSAFLDALTVVAVIISVAMGFY
GVYHKVASGNNLIDAVDISDDRKIIEQQHEILEKFRAFLRSLMMHAGVGTALGGVMTVVGEPQNLIIAEQAKWNFMEFFL
RMAPVTIPVFICGLLTCFLVEKFKLFGYGEKLPDEVWKILSDLDRTNSEKMSKQDKIKLGMQALIAIWLIVGLAFHLAAV
GLIGLSIIIFATSFTGVTDEHTIGKAFQESLPFTALLVVFFSVVAVIIDQKLFSPIIHFVLSAEENTQLALFYLFNGLLS
SISDNVFVATVYINEAKAALTNGVIAPHQFELLSVAINTGTNLPSVATPNGQAAFLFLLTSSISPLIRLSYGRMVYMALP
YTIVLSIIGLLAIEFILPAATIWLASLGLILPI

Specific function: Na(+)/H(+) antiporter that extrudes sodium in exchange for external protons [H]

COG id: COG3067

COG function: function code P; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the nhaB Na(+)/H(+) (TC 2.A.34) antiporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787435, Length=507, Percent_Identity=70.0197238658777, Blast_Score=707, Evalue=0.0,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004671 [H]

Pfam domain/function: PF06450 NhaB [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56541; Mature: 56409

Theoretical pI: Translated: 6.95; Mature: 6.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
TNIQAFMKNFLGASPEWYKLAIVVFLIINPIVFFFISPFIAGWLLVAEFIFTLAMALKC
CCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: 3 Proton [Periplasm]; Na (I) [Cytoplasm] [C]

Specific reaction: 3 Proton [Periplasm] + 2 Na (I) [Cytoplasm] = 2 Na (I) [Periplasm] + 3 Proton [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA