| Definition | Vibrio fischeri ES114 chromosome I, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006840 |
| Length | 2,897,536 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is abgT [H]
Identifier: 59711246
GI number: 59711246
Start: 697495
End: 699054
Strand: Direct
Name: abgT [H]
Synonym: VF_0639
Alternate gene names: 59711246
Gene position: 697495-699054 (Clockwise)
Preceding gene: 59711245
Following gene: 59711250
Centisome position: 24.07
GC content: 39.49
Gene sequence:
>1560_bases ATGAGTAACCAAGTAGCAGAGAAAACACCTAAGCTTAGCGGCATGGATCGTTTTCTGAATACAATTGAACGAGTAGGTAA CAAGATACCAGATCCTGCACTACTGTTTTTCTGGGGCCTTTTAATTGTTTGGGGTCTTTCAGCGCTATTATCACAAGTAC AATTTGACTTAATTCACCCAGTAACCCAAGACGCGGTTCAAGTGAAAAACCTTTTAACTGGTGATTCTCTAGCAAACTTT TTAGCAACAATGGTAACGAACTTCACGGGCTTTGCTCCTTTAGGTATCGTATTAGTTGCTATGTTAGGTGTAGGTGTTGC AGATACTTCTGGCTTTATTCAAACAGGCCTAAAGAAAATGCTTAACTTTACGCCAGCTAAACTATTAACACCTATGCTTA TTCTTGTTGCTATCGTTTCGCATACAGCAGCAGATGCGGGTTACGTTTTAGTTATTCCTCTAGGTGGTATTATTTTCCAC GCAGCAGGCCGTCATCCACTAGCTGGTATCGCAGCAGCATTTGCTGGTGTATCTGGTGGTTTCTCTGCAAACTTTATCCC ATCAGGTATTGATCCATTACTAGCTGGCTTTACTCAAACAGCCGCTCAAGTACTAGATACTTCTTATATTGTTAACCCAT TAGCAAATATTTACTTTACTGGTCTTTCTTCAATTCTAATTGTTGTGATCGGTTGGTATGTAACAGATAAGATTATCGAA CCTCGTTTAGCAAATACACCAGTAGACGAAGATGCTGAAGAAGCACCTGATCTAGGTTCATTTACTGAGATTGAATCTAA AGCATTCAAATTTGCTGGTTGGGCGATGGTTGCAGGTATTGCATTATTAATTGCTTTAATCTACCCAGAAAATTCAGCAC TTCGTTCTCCTGATGGTGAAATTACGTCATTCTCAGCACCATTAATGAAGTCAATTGTTCCACTTATCTTCATTCTATTT ATTATTCCTGGCATTGTTTATGGGCGTGTTTCAGGAACATTTAAAAGCAGTAATGATGTAATTAAAGCAATGTCACAAAC GATGGGTACAATGGGTGCATACATGGTTATGTCATTCTTCTGTGCGCAATTCTTAGTAGCATTCAGTCAATCAAATATCG GTACAATTTTAGCAATGTACGGTGCTGATTTCTTAAAAGCGATGGACCTACCTGGTCAAATGACCATTATTGGTATGATT TTGCTAACGGCAATGGTTAACTTATTGATTGGTTCAGCATCAGCTAAATGGGCTCTAATTGGCCCTGTATTAGTACCTAT GTTAATGGGTGTTGGTATTTCACCAGAACTTTCTCAAGCGGCTTACCGTGTTGGTGATTCAGTTTCGAATATCATCTCTC CTTTAATGGTATTTTTCCCATTAGTAGTGGTTTACTGCCAACGTTACGTTAAGTCTACGGGTATCGGTACTCTTGCTTCT CTAATGATGCCATTCTCTATTGCTATGTTAGTTGGTTGGACAGTATTCCTACTTGCATACTGGGCTCTAGGCATTCCACT AGGTATCCAAGCGCCATACACATATAACCTTCCAGGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATATCTGGTTTACACTGATTTAGCAAAGGAATAGATAAAGAATAAAAAAAATCAAATCTCTTTATCTTTAAATACAACAT TACAGAAAATGGAGTTACGA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTGTATTAGTAAAAATAAAGCCCTGAGAATGTTGAGTTCTCAGGGCTTTTTTTATGAGAGTAAAGAAAGGGGATTACTT GAACTTTCTTAGGTATCGAT
Product: aminobenzoyl-glutamate transport protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 519; Mature: 518
Protein sequence:
>519_residues MSNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHPVTQDAVQVKNLLTGDSLANF LATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKMLNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFH AAGRHPLAGIAAAFAGVSGGFSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIE PRLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGEITSFSAPLMKSIVPLIFILF IIPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFFCAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMI LLTAMVNLLIGSASAKWALIGPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLAS LMMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG
Sequences:
>Translated_519_residues MSNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHPVTQDAVQVKNLLTGDSLANF LATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKMLNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFH AAGRHPLAGIAAAFAGVSGGFSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIE PRLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGEITSFSAPLMKSIVPLIFILF IIPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFFCAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMI LLTAMVNLLIGSASAKWALIGPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLAS LMMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG >Mature_518_residues SNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHPVTQDAVQVKNLLTGDSLANFL ATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKMLNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFHA AGRHPLAGIAAAFAGVSGGFSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIEP RLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGEITSFSAPLMKSIVPLIFILFI IPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFFCAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMIL LTAMVNLLIGSASAKWALIGPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLASL MMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG
Specific function: Essential for aminobenzoyl-glutamate utilization. May transport aminobenzoyl-glutamate into the cell. Seems also to increase the sensitivity to low levels of aminobenzoyl-glutamate. Sufficient to confer aminobenzoyl-glutamate utilization phenotype [H]
COG id: COG2978
COG function: function code H; Putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI87081879, Length=487, Percent_Identity=35.3182751540041, Blast_Score=303, Evalue=2e-83,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004697 - InterPro: IPR011540 [H]
Pfam domain/function: PF03806 ABG_transport [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55196; Mature: 55065
Theoretical pI: Translated: 5.34; Mature: 5.34
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 4.6 %Met (Translated Protein) 5.0 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 4.4 %Met (Mature Protein) 4.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHP CCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VTQDAVQVKNLLTGDSLANFLATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH LNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFHAAGRHPLAGIAAAFAGVSGG HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC FSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIE CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PRLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGE CCCCCCCCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC ITSFSAPLMKSIVPLIFILFIIPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMILLTAMVNLLIGSASAKWALI HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH GPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLAS HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH LMMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCC >Mature Secondary Structure SNQVAEKTPKLSGMDRFLNTIERVGNKIPDPALLFFWGLLIVWGLSALLSQVQFDLIHP CCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VTQDAVQVKNLLTGDSLANFLATMVTNFTGFAPLGIVLVAMLGVGVADTSGFIQTGLKKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH LNFTPAKLLTPMLILVAIVSHTAADAGYVLVIPLGGIIFHAAGRHPLAGIAAAFAGVSGG HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC FSANFIPSGIDPLLAGFTQTAAQVLDTSYIVNPLANIYFTGLSSILIVVIGWYVTDKIIE CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC PRLANTPVDEDAEEAPDLGSFTEIESKAFKFAGWAMVAGIALLIALIYPENSALRSPDGE CCCCCCCCCCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC ITSFSAPLMKSIVPLIFILFIIPGIVYGRVSGTFKSSNDVIKAMSQTMGTMGAYMVMSFF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH CAQFLVAFSQSNIGTILAMYGADFLKAMDLPGQMTIIGMILLTAMVNLLIGSASAKWALI HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH GPVLVPMLMGVGISPELSQAAYRVGDSVSNIISPLMVFFPLVVVYCQRYVKSTGIGTLAS HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH LMMPFSIAMLVGWTVFLLAYWALGIPLGIQAPYTYNLPG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9829935; 9097039; 9278503; 2825131; 7567469 [H]