| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57237673
Identifier: 57237673
GI number: 57237673
Start: 856214
End: 857947
Strand: Reverse
Name: 57237673
Synonym: CJE0919
Alternate gene names: NA
Gene position: 857947-856214 (Counterclockwise)
Preceding gene: 57237674
Following gene: 57237672
Centisome position: 48.26
GC content: 34.2
Gene sequence:
>1734_bases ATGAATAAATTTTTAGTTTCATTGTTTTTACCTTTAGTTGCATTTGCAAACTCCTCAGAAGCAGCTGCAAATGCTAATTT ATTTGGAGCTTTTACGCTTATACCACCTTTAGTTGCTATTGCTTTAGCCTTTATCACAAAAGATGTTATTTTATCGCTCT TTACTGGAGTTTTAAGTGGAACTTTTCTACTTAGCCTTTCTGCAAATATTTTTAAAGCACAACATTTAACTTTTGTAAAT TATTACAATACTACAGTAGAATCTTTTTCAAAAATTATTTCCTATATCTTAGGTTCAACTTCAGATCCAGTAAATGCAGG AATCATTTTACAAATTCTTTGTATAGGTGGTCTTGTGGCACTTATCACAAAAATGGGAGGTGCAAAAGCTGTAGCATTAA AATTTGCCAAAAGAGCCAAATCAGCTGTATCAGCTCAAGTTAACACTTGGTTTTTAGGGCTTTTAATATTTTTTGATGAC TATGCTAATTTACTAATCGTAGGTCCAATTATGCGTCCTTTGGCAGATAAATTTAAAATTTCTCGTGAAAAATTTGCCTT TATTATCGACTCTACCGCAGCTCCTGTGGCAGGAATAGCTGTAATTTCTACTTGGATAGGCTTAGAAGTTTCTTTAATTA AAACCGCTTATGAACACATAGGCATTAGCAATATTAGTGCTTTTGGAATTTTTGTTGAAACCATACCTTATCGTTTTTAT AATATCTTCATGCTTTTTTTTGTAGTCATGACTGCAATCATGAGGCGTGAGTTTGGTTCTATGTACAAGGCTGAAGTGCG TGCAAGAACCACAGGACAAATTGCTCCTCTACCTAAATCAGGCACACTAGATACTACTGAATTAGAAGATCAGTTTTTAG CACCAAAAGAAGGTATTAAAATTCGTGCTTTTGATGCTATTGTTCCTATTTTTACTTTAATCATTTTAGCTATATTAGGA TTTTATTTTAATGGACTTAGCACTTTAGAAGGCGAAGAACTTGCAAAAGCAAGTGCCAATCCTTTGTCTTTTGAAACTTT TAGGGCTGCTTTTGGAAATGCTGATTCTTCTGTGGTGTTATTCCAAGCTGCTTTGTTTGCTGCTATTGTAGCGATTTTTA TCGGGGTGCGTCGTAAAATTTTCAATCTTAAAGAAGCGGTAGAAACTTGGATATATGGCTGGAAAACCATGATTTTTACC ATAGTATTGCTTTTATTTGCTTGGTCGCTTTCAAGTATAGTAAAAGATCTAGGAACTTCTTTATTTATCACTAGTTTGCT TGCAGATAAATTGCCTGAGTTTATTTTGCCTGCTACTATTTTTGCTTTTGCTTCAGCCATTTCTTTTGCCATAGGAACAA GCTATGGAACTATGGGGATTTTAATGCCTTTGGCTGTGCCTTTAGCTCATGAAATCGCCAAAATCAATGGTATGGATGCA AATGCTATGCATCATTATATGGTTATTAATATAAGCTGCGTTTTAACAGGTGCGATTTTTGGAAACCATTGCTCACCAAT TTCAGATAATGTAATCCTTTCATCTATGAGTGCAAAATGCGATCATATGGAGCATGTAAGAACACAAATTCCTTATGCTT TATTTATCTGTGGCATTTCTTTAATCGCTGGATATATTCCTGTATCTTTAGGACTTAGCGTTTGGTTTGTCTTGCCTTTA AATTTCATACTTATTGCACTTTTACTAAGACTCATCGGAAAGAAAGTTCCATGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TAATGTCTATCATTAACCTACCAAGCCATATTAATGTTAATGAAATCGAGCTTATGCCGGTAACACAAACTTGGAATGGA TTTTATATAGAAAGAGATGA
Downstream 100 bases:
>100_bases GTCTTGAAAATTTTGGAAATTTTCTTACTTTAGATGAAAAACATTCTTTCATAAAAAAATATTTTAAAGAATTTTATACA AAGGATTTTAAACTTTTTGC
Product: Na+/H+ antiporter family protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 577; Mature: 577
Protein sequence:
>577_residues MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLTFVN YYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG FYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGLSVWFVLPL NFILIALLLRLIGKKVP
Sequences:
>Translated_577_residues MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLTFVN YYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG FYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGLSVWFVLPL NFILIALLLRLIGKKVP >Mature_577_residues MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSGTFLLSLSANIFKAQHLTFVN YYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVALITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDD YANLLIVGPIMRPLADKFKISREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIKIRAFDAIVPIFTLIILAILG FYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVLFQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFT IVLLLFAWSLSSIVKDLGTSLFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGISLIAGYIPVSLGLSVWFVLPL NFILIALLLRLIGKKVP
Specific function: Unknown
COG id: COG1757
COG function: function code C; Na+/H+ antiporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR018461 [H]
Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 62720; Mature: 62720
Theoretical pI: Translated: 9.01; Mature: 9.01
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSG CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TFLLSLSANIFKAQHLTFVNYYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVA HHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDDYANLLIVGPIMRPLADKFKI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHC SREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY CHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCE IRAFDAIVPIFTLIILAILGFYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVL EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHH FQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFTIVLLLFAWSLSSIVKDLGTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGIS CHHHEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH LIAGYIPVSLGLSVWFVLPLNFILIALLLRLIGKKVP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MNKFLVSLFLPLVAFANSSEAAANANLFGAFTLIPPLVAIALAFITKDVILSLFTGVLSG CCHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TFLLSLSANIFKAQHLTFVNYYNTTVESFSKIISYILGSTSDPVNAGIILQILCIGGLVA HHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LITKMGGAKAVALKFAKRAKSAVSAQVNTWFLGLLIFFDDYANLLIVGPIMRPLADKFKI HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHC SREKFAFIIDSTAAPVAGIAVISTWIGLEVSLIKTAYEHIGISNISAFGIFVETIPYRFY CHHHEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH NIFMLFFVVMTAIMRREFGSMYKAEVRARTTGQIAPLPKSGTLDTTELEDQFLAPKEGIK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCE IRAFDAIVPIFTLIILAILGFYFNGLSTLEGEELAKASANPLSFETFRAAFGNADSSVVL EEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHH FQAALFAAIVAIFIGVRRKIFNLKEAVETWIYGWKTMIFTIVLLLFAWSLSSIVKDLGTS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LFITSLLADKLPEFILPATIFAFASAISFAIGTSYGTMGILMPLAVPLAHEIAKINGMDA HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC NAMHHYMVINISCVLTGAIFGNHCSPISDNVILSSMSAKCDHMEHVRTQIPYALFICGIS CHHHEEEEEEEHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH LIAGYIPVSLGLSVWFVLPLNFILIALLLRLIGKKVP HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 7542800 [H]