| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is zip
Identifier: 46446033
GI number: 46446033
Start: 534541
End: 537063
Strand: Direct
Name: zip
Synonym: pc0399
Alternate gene names: NA
Gene position: 534541-537063 (Clockwise)
Preceding gene: 46446032
Following gene: 46446034
Centisome position: 22.14
GC content: 34.48
Gene sequence:
>2523_bases ATGCCAAGTCCATTGACTTCTTTTGAAAATTTTAGTTTGACAGCTCAAACAACAGCTTATTTATATAGCTTAAACCAAGA AAGCTATTTAAAAGCTTTTGGTGCTAAGCTTGTGAGTCCCGTTGCTATTATTAGTGCTAGTGCCGTTGATGTAATAGTTC ACGCAACAGGATTTGCTAGTAAACTTATTCTAGGTGGGTTGACACTCCCTTGGAATTTTGTTGTAACCCCTTTCTCAGCT TCTTTGTCAACATCTCGTAGTTCCGGTTTAGCTTCTTCACTCATTCACCTCAATCGTCTAGTTGAAAGTATTTTTACTGC AGCCATTCTGCCTTTCATTTACCTTATTAATGCCGAAAGTGCTTATCAGTTTGTGCGTTCACGCTTAGAGAATTTGTCTG AAAAGCAAAACTCAACATTAAAGAATGAGATCTCATCTTTAAAAAATCAAATTAGCAAGCAACAACAAGAGCTCAATCAA AAAAGGGTTGATTTAGAAGCGGCTAGAAGAGATCTGGGAAGTTTGACTCCTAATCTTAACGCATTGCAAAAAGATATTCG ATCTTTAGAAGAAAAGAAAAGTCAAGATGAGCAGGCTTTACAACAAGCCAACCAAGCTTTGCAAAATTTACAAAGAGAAA AAGCTTCACGTGAGGCTCAGGCTGGAGATTTAGAATTAGAAAAAACGACGTTATTAAGTAAAATTGCTGAGATTGAAGCG TCTTTAAAAAAGGCTTTAGAACAAGTCGAGCAAGAACGGAAAGACAACGCTAGTAAAGAAAACACAATTGTTGCTCTTCA AGGTCAGCTAACGGAGTTGAATAAGCAGTTATCTACTCTCAATCGAAACCATCTAAAAAATGAAGATGAGCAGGCTTTAC AACAAGCCAACCAAGCTTTGCAAAATCTACAAAGAGAAAAAGCTTCTCGTGAAGCGCAGGCTGAGGAGTTAGAATTAGAA AAAACGACGTTATTAAGTAAAATTGCTGAGATTGAAGCGTCTTTAAAAAAGGCTTTAGAACAAGCCGAACAAGAACGGAA AGATAACGCTAGTAAAGAAAACACAATTGTTGATCTTCAAGGTCAGTTAACCGAGTTGAATAAGCAGTTATCTACTCTCA ATCGAAACCATCAAGAGCATCTAGATCAAGAAAAAGAGGATTTAAAAAATCAACTAGAATCCCTCAAGCGACAATTAAAT GAGGAAAGACAAGCAACACTATGGGCAAATAATAAAGTTATAGAAGCAGAAAAAAAAATAGAGGAAGAGAAAAATCGACT TACCAAGTTTTCAGCAGATATGTTGGAAATGTTAAAGGGTAAAAGATTAGTAAATCAAAACCTCATAGAATCAAAAAAAG AATTAGAACAACAAATTCAATCTATAAAAACAGAATTAGCGGCAGCAGAAGAACAAAAGCAAGTTTTATCATTGCAAGTT GAGACTTCGAAAATGGATGCCAATCAGTTGCAAGAAAAGATTAATAGTTTGGAAAATGAGAAGCAAGAGTTATTAAATAG AATTAAAGTTTTAGAAGAGACTATCGCTAAAGAAGGAGAGTCCAAAAACGCTTTGGAACAAATTGAATCCGCCGTTTCAA ACATGGAAACAGTTGCTGAAATTTCTATCCTGAACGTTTTAGCTCGTTCTGCGACATTTGAATCCTCAGCACAAAATGAT AGAGCATTTACAATTTCAACTTTGGAAAATGGGGAATTGTCAAATGACAATGGCAATAGAGCTAACTTACTTGAGCAAAT TCGTGGATGCTATAAAAAACTTAAATCAACGTCAACAACTGTTGATAGGGTGAAATCGGGGGATTTTGAGCTACGTCCTA AACATAAAAGCTCGCTAGATAAATATATGGGCCCTGCTTTACATGAACTTATTGTTGAAATCGAAGAGCTTATTGAAGCT TTGGAATGGGGTAAATTTGAGCCTGTAAAGAAAAATTCAATGATGCGAAGTATGATTGAAGAAACTCCAGATGTAGAAAA CGAAATTGAGCCGTTTAAAAATTATCTTGAATTTTTCTTAAAAAAATTAAAAGAAAAACATCGCGAAAATTCAAAAGGAA AAGCTGACGGACGACGATCCATAGAAGAACACCTTGCTAAAGTTCGAGAGATAGATCGTGCACAAGCTGAAGAACGAATC GAAAAATTAAGAAAAGAGTTAGTGAAGCAAATTTCTTTTAAAATTAGTGGTCAAGAAACTACTAATATTGATTCATTCTT TGATAAACTTTCCCCATTTACTTTAATTTCAATTCAAAGGGAATTTGTAGAAGAAAATAAAGAGTTTAGCAAGCCTCAAT ATCAAACCTGGGGAGGGCCTTTCAAAGACTTTGAAGAATTTAAGACAAATTATCGAGATTTTGTAAAATTACTTGATGAA ATGAGCTTAATAAAAAATGAGTTTGACAAAGGTTTATTTAAAAGGTTATCCTATATTGTTAAACTCATATCCGAGATAAC AAGTAGAGGTAAAAAACCTTTTAAAGAATTTGAATTGAGCTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGTTAACTTTTTCTTAATAAGATTTTTATTTATTTTTAATTTCCTTGTAATAAGATTTGCAGAAATAAGTATAATAATCT CTCTATTTTAGGAGATTCTA
Downstream 100 bases:
>100_bases TAGAATAAAAACTCATTGAGTGAAATTAAAAAACAATAACTAGAAAGACTGTTTGCTTGGTCCAAATTGCCATCAGCGGG CTTTTTTTAATAGATCACGT
Product: putative eucaryotic myosin heavy chain
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 840; Mature: 839
Protein sequence:
>840_residues MPSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFASKLILGGLTLPWNFVVTPFSA SLSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAESAYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQ KRVDLEAARRDLGSLTPNLNALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEA SLKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAEELELE KTTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQGQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLN EERQATLWANNKVIEAEKKIEEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQV ETSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAEISILNVLARSATFESSAQND RAFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTTVDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEA LEWGKFEPVKKNSMMRSMIEETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERI EKLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGPFKDFEEFKTNYRDFVKLLDE MSLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS
Sequences:
>Translated_840_residues MPSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFASKLILGGLTLPWNFVVTPFSA SLSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAESAYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQ KRVDLEAARRDLGSLTPNLNALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEA SLKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAEELELE KTTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQGQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLN EERQATLWANNKVIEAEKKIEEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQV ETSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAEISILNVLARSATFESSAQND RAFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTTVDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEA LEWGKFEPVKKNSMMRSMIEETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERI EKLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGPFKDFEEFKTNYRDFVKLLDE MSLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS >Mature_839_residues PSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFASKLILGGLTLPWNFVVTPFSAS LSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAESAYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQK RVDLEAARRDLGSLTPNLNALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEAS LKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAEELELEK TTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQGQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLNE ERQATLWANNKVIEAEKKIEEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQVE TSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAEISILNVLARSATFESSAQNDR AFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTTVDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEAL EWGKFEPVKKNSMMRSMIEETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERIE KLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGPFKDFEEFKTNYRDFVKLLDEM SLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 95892; Mature: 95760
Theoretical pI: Translated: 5.43; Mature: 5.43
Prosite motif: PS51082 WH2 ; PS00974 MANNITOL_DHGENASE
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 1.2 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 1.1 %Met (Mature Protein) 1.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFAS CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLILGGLTLPWNFVVTPFSASLSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAES HHHHCCCCCCCHHEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH AYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQKRVDLEAARRDLGSLTPNLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH ALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEA HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SLKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQAL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH QNLQREKASREAQAEELELEKTTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECC GQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLNEERQATLWANNKVIEAEKKI HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH EEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAE HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISILNVLARSATFESSAQNDRAFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH VDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEALEWGKFEPVKKNSMMRSMIE HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH ETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERI HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGP HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCC FKDFEEFKTNYRDFVKLLDEMSLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCC >Mature Secondary Structure PSPLTSFENFSLTAQTTAYLYSLNQESYLKAFGAKLVSPVAIISASAVDVIVHATGFAS CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KLILGGLTLPWNFVVTPFSASLSTSRSSGLASSLIHLNRLVESIFTAAILPFIYLINAES HHHHCCCCCCCHHEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH AYQFVRSRLENLSEKQNSTLKNEISSLKNQISKQQQELNQKRVDLEAARRDLGSLTPNLN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHH ALQKDIRSLEEKKSQDEQALQQANQALQNLQREKASREAQAGDLELEKTTLLSKIAEIEA HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH SLKKALEQVEQERKDNASKENTIVALQGQLTELNKQLSTLNRNHLKNEDEQALQQANQAL HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH QNLQREKASREAQAEELELEKTTLLSKIAEIEASLKKALEQAEQERKDNASKENTIVDLQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECC GQLTELNKQLSTLNRNHQEHLDQEKEDLKNQLESLKRQLNEERQATLWANNKVIEAEKKI HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHH EEEKNRLTKFSADMLEMLKGKRLVNQNLIESKKELEQQIQSIKTELAAAEEQKQVLSLQV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETSKMDANQLQEKINSLENEKQELLNRIKVLEETIAKEGESKNALEQIESAVSNMETVAE HHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ISILNVLARSATFESSAQNDRAFTISTLENGELSNDNGNRANLLEQIRGCYKKLKSTSTT HHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHH VDRVKSGDFELRPKHKSSLDKYMGPALHELIVEIEELIEALEWGKFEPVKKNSMMRSMIE HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH ETPDVENEIEPFKNYLEFFLKKLKEKHRENSKGKADGRRSIEEHLAKVREIDRAQAEERI HCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKLRKELVKQISFKISGQETTNIDSFFDKLSPFTLISIQREFVEENKEFSKPQYQTWGGP HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCCCCC FKDFEEFKTNYRDFVKLLDEMSLIKNEFDKGLFKRLSYIVKLISEITSRGKKPFKEFELS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA