| Definition | Helicobacter hepaticus ATCC 51449 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_004917 |
| Length | 1,799,146 |
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The map label for this gene is 32266604
Identifier: 32266604
GI number: 32266604
Start: 1074682
End: 1077012
Strand: Direct
Name: 32266604
Synonym: HH1105
Alternate gene names: NA
Gene position: 1074682-1077012 (Clockwise)
Preceding gene: 32266599
Following gene: 32266605
Centisome position: 59.73
GC content: 35.86
Gene sequence:
>2331_bases ATGCCAATTTTGCAGCATTTTTTTGAGACTTTCCATAGTGCGCAACCACCGCTTCCTATGGAAAAAATACAAGATTCTAT TTTTAATACGCTTTCTCCACAGGCTTTGAGCATTCTACTTTGCACCAATGAGCGCAATATTGCGTTATTTATGCAATGCC AAAGTTTTATAAAAATTTTAGAATCTTTGCACATATCACAAATAAATTCTCAATTAGATGCTTATGCTTCAAATGAAGAT AAATCTATGATTCTTAGCGCGCTTTTAAAAGATGTATTTACCCTTCAAGCAACTATCATAGAATATAATCCACATTTCTT TGAGGAGCTTTTGCCATTTTTTATTCAGCTTAATCTTGCACATATCATTGATGATTTTGAACTTGATTTGTTTGCTTCGC TTAAAAATACTTTTTATTCTCAAAAAACATCACAAAAAGTAGATACAAAAGAAATACGAAGTCTTAAATCTCTTCATAGT GCCCTTGCTTTGCTTCATAACAACCTTTCACCTCTGCTTCCTCAAGAAACTCTTAAAAACTCACTTACGCACATAATGGA AAAATTAGAGAATCAACATTTTTCTATCGGTATTACAGGAGTGTTAAGTGCAGGGAAATCCACATTTTTAAATGCGCTTT TATCTCAAGAAATTTTAGGAAGCTCAAGTGTGCCAGAAACTGCCAACCTTACCATTTTGCGCTATGGAGAATCTGCAGGA GCAAGAGTGCATTTTTGGAGCAAAGAACAATGGGCTGATTTATGTGAGCAAAGCGCGTATGATACAAATCTTAAAGCCTT TATAGAAGAAAGTCAGGCTCATTTTGGCACACAATTAGACACATTTATTACCCAGCCACATACAACAAAAGACATTCAAA CACACGAATTAAGCATTTATACTTCGGCAAATCATCAAAGTAAATTTTGCAATCTTATCCAAGAAGTAGAGCTTTTTACA CCATTGTCATTTCTAAAAAATGGTGTAGAGATTGTTGATACACCCGGACTTGATGACCCAATCACAAAACGTGAAGAAAT CACTCGCTCTTATATTCAACATTGTGATGTGCTTATCCACGTGATGAATGCAAGCTGTGCAGCAACGCAAGTAGACATTG ATTTTATTTTAGAATCCCTGCTTGAACAAAACATCTCACGCCTACTTGTAGTGCTTACACGCATAGATTTGCTTACACCA CAAGAGCTTGATTCTTCGCTTGAATACACCAAATCAAGCCTCATTGCCCAACTCAAAAAAGCACATTACAAAGGCGATAT TGAATCCATTATCAATCGTATTGATTTTATTCCACTTGCGGGATATGCTGCACTGCTTTATCGCACAAATGCAGATACAA GCAACCTCTCTCTCACTTTAGAACAATGCGGTATCCTTAAGATAGAATCTTATTTACAAAAAATGCTTCTTGGTGAAGAT AGCCTTAAGGCAAAAGATATGCTTTATCTCGCCTACAAAGCCACACTTAAAGTTGCTCAAGATACAGAAGAGATTATCAA TTTAGAATCTTCTTTGTTAAATGCAAATGGCGAGGAGTTAGAGGAGCTTATTGCTCAAGATAAAGCACATAATGATGCCC TTATGCGCGAACTCTATGAGCTTGAAGAGCATCTTAGTGCCCTCCATAATGAGCTAAGTGAATTTCTTAAATCTCTTGAA CTTTTTAGTGCAAATACTCTTAGTAAAGCTTCTATGCTCATCAAGGATAAGGTATTTAATGATATTATTTATGATTATAC ACGTGGAGCAAAACCTGATACAAATGCACTGCACAAAATGATAGAGCTAGGGCTTAAAGATTGTTTCGCCGATGTGGGGA GAGAGTATAAATATAAATTAGGCAAGAAAATTGCTCAACTTAAAAGCGCTATAACACTCTCAGAGGAGCTAGATTCTCCG CCTCCACATATTCATTTCCAGCTCAAAAACGCACAAATAAGTGCGATTACTCAAGAGTTACTTTCTGCACTTCCTTCGCT TGTGCGCTCTTTTAATAAATCTAGTCAAAATAAACTTAGCAACGCACTTGATAAACTTTTTGCAGATATGTTTAGCTCCT TTAGTGAGATTATTCAAAATAAAAACAAAGACATCGCAGCTCTGTTTTTAGCACATTTTCACGAGATTACTCAATGTGCT AAAAACCATATTCAAATGCAAATTGCTTATAAACAAGAAAGTCTCAACGCTGCTTTAGCCAAGCGAGAAAGTGGCGATAC TCAAGCACTTAAAGATGCTCTTTACACCAAGCGAGAACAGCTTACAGGTATTATAAATGAACTTATGCAAGGTTTGCATA GTTTGCAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATTTTTACGGCATTTTGAGTGATAATTATTAATTTATTTTACTTTTGGTATTTTGATGTAAAATTACGCTCTACAAATAA ATAAATGGGGACATCTTAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases TGAGATGAAAGGGTGCAAGAAACAATAATGGAACAAATAAGTGAAAATCTGCTAGAAAACTTTATTAACGAATATATCAG CGCAAAAAATCAGCTTTTGC
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Dynamin-Like Protein
Number of amino acids: Translated: 776; Mature: 775
Protein sequence:
>776_residues MPILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKILESLHISQINSQLDAYASNED KSMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLAHIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHS ALALLHNNLSPLLPQETLKNSLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAG ARVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIYTSANHQSKFCNLIQEVELFT PLSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIHVMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTP QELDSSLEYTKSSLIAQLKKAHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGED SLKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYELEEHLSALHNELSEFLKSLE LFSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKMIELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSP PPHIHFQLKNAQISAITQELLSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCA KNHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ
Sequences:
>Translated_776_residues MPILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKILESLHISQINSQLDAYASNED KSMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLAHIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHS ALALLHNNLSPLLPQETLKNSLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAG ARVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIYTSANHQSKFCNLIQEVELFT PLSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIHVMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTP QELDSSLEYTKSSLIAQLKKAHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGED SLKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYELEEHLSALHNELSEFLKSLE LFSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKMIELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSP PPHIHFQLKNAQISAITQELLSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCA KNHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ >Mature_775_residues PILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKILESLHISQINSQLDAYASNEDK SMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLAHIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHSA LALLHNNLSPLLPQETLKNSLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAGA RVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIYTSANHQSKFCNLIQEVELFTP LSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIHVMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTPQ ELDSSLEYTKSSLIAQLKKAHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGEDS LKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYELEEHLSALHNELSEFLKSLEL FSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKMIELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSPP PHIHFQLKNAQISAITQELLSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCAK NHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ
Specific function: Unknown
COG id: COG0699
COG function: function code R; Predicted GTPases (dynamin-related)
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 87573; Mature: 87442
Theoretical pI: Translated: 5.26; Mature: 5.26
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.2 %Cys (Translated Protein) 1.8 %Met (Translated Protein) 3.0 %Cys+Met (Translated Protein) 1.2 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 2.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MPILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKIL CCHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHH ESLHISQINSQLDAYASNEDKSMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH HIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHSALALLHNNLSPLLPQETLKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH SLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAG HHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCC ARVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIY CEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEE TSANHQSKFCNLIQEVELFTPLSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIH ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTPQELDSSLEYTKSSLIAQLKK HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGED HHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCC SLKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH LEEHLSALHNELSEFLKSLELFSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH IELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSPPPHIHFQLKNAQISAITQEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHH LSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCA HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH KNHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ HHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure PILQHFFETFHSAQPPLPMEKIQDSIFNTLSPQALSILLCTNERNIALFMQCQSFIKIL CHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCEEHHHHHHHHHHHH ESLHISQINSQLDAYASNEDKSMILSALLKDVFTLQATIIEYNPHFFEELLPFFIQLNLA HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH HIIDDFELDLFASLKNTFYSQKTSQKVDTKEIRSLKSLHSALALLHNNLSPLLPQETLKN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHH SLTHIMEKLENQHFSIGITGVLSAGKSTFLNALLSQEILGSSSVPETANLTILRYGESAG HHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCC ARVHFWSKEQWADLCEQSAYDTNLKAFIEESQAHFGTQLDTFITQPHTTKDIQTHELSIY CEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEE TSANHQSKFCNLIQEVELFTPLSFLKNGVEIVDTPGLDDPITKREEITRSYIQHCDVLIH ECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VMNASCAATQVDIDFILESLLEQNISRLLVVLTRIDLLTPQELDSSLEYTKSSLIAQLKK HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AHYKGDIESIINRIDFIPLAGYAALLYRTNADTSNLSLTLEQCGILKIESYLQKMLLGED HHCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHEECCCCCCCCEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCC SLKAKDMLYLAYKATLKVAQDTEEIINLESSLLNANGEELEELIAQDKAHNDALMRELYE CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHH LEEHLSALHNELSEFLKSLELFSANTLSKASMLIKDKVFNDIIYDYTRGAKPDTNALHKM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHH IELGLKDCFADVGREYKYKLGKKIAQLKSAITLSEELDSPPPHIHFQLKNAQISAITQEL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHH LSALPSLVRSFNKSSQNKLSNALDKLFADMFSSFSEIIQNKNKDIAALFLAHFHEITQCA HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH KNHIQMQIAYKQESLNAALAKRESGDTQALKDALYTKREQLTGIINELMQGLHSLQ HHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA