| Definition | Vibrio splendidus LGP32 chromosome 1, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011753 |
| Length | 3,299,303 |
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The map label for this gene is 218708282
Identifier: 218708282
GI number: 218708282
Start: 214670
End: 216136
Strand: Direct
Name: 218708282
Synonym: VS_0220
Alternate gene names: NA
Gene position: 214670-216136 (Clockwise)
Preceding gene: 218708281
Following gene: 218708283
Centisome position: 6.51
GC content: 27.13
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases CTTTAAGGTTCTTGAGAGCCTATATTGATGCTTATGATTTTTCCGTGCTGATCATAGTGTTTAGCATTAGCGTGATTTCA TCGGAAATCAAGCATCTTGA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATTTAAGTATCATTATACCTGTTTATAACTTGGAAGATCTTGTTGTCAATTGTTTAAATAGTGTATTTAATCAAAATACG TCATATAATTATGAGGTAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488
Protein sequence:
>488_residues MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSILIQNFILFCFGLRLLSLPII FLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFKESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFF KRKQNLKVYAVLGCIIFGSVDIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVRENRALGITISDFLNIDNYTLGI DILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFFSAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFG VFCFIPLVFLGMLVSFVDTIMLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK TRVPECKK
Sequences:
>Translated_488_residues MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSILIQNFILFCFGLRLLSLPII FLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFKESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFF KRKQNLKVYAVLGCIIFGSVDIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVRENRALGITISDFLNIDNYTLGI DILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFFSAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFG VFCFIPLVFLGMLVSFVDTIMLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK TRVPECKK >Mature_488_residues MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSILIQNFILFCFGLRLLSLPII FLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFKESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFF KRKQNLKVYAVLGCIIFGSVDIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVRENRALGITISDFLNIDNYTLGI DILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFFSAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFG VFCFIPLVFLGMLVSFVDTIMLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK TRVPECKK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56682; Mature: 56682
Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
1.4 %Cys (Translated Protein) 2.9 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 1.4 %Cys (Mature Protein) 2.9 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSI CCCCCHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH LIQNFILFCFGLRLLSLPIIFLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFFKRKQNLKVYAVLGCIIFGSV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCC DIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVREN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC RALGITISDFLNIDNYTLGIDILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFF CEEEEEHHHHHCCCCEEEEHHHEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHH SAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFGVFCFIPLVFLGMLVSFVDTI HHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRVPECKK HCCCCCCC >Mature Secondary Structure MITGIPYLKEFFITMTLHKKDKILVLILYLIYTLTCLLFIELSSVNDWLLHVNVVIFSSI CCCCCHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH LIQNFILFCFGLRLLSLPIIFLFFSYVFSLSYPVLIYFNVDFGGMSSQVTNLVYGESVFK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH ESVNLAVFSILVMYIGFILTELLNLKEKKLSFLFFNNSFFKRKQNLKVYAVLGCIIFGSV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCC DIYLFKERLILMSSLGYMGVALHEFNFLLVLFSWIFPGFVFLLCYVNKESRIKIVLILLV HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH FLIYKSLQTLTGLRAFTVLQLVVFMIFYNLYISKLKMKSILTLSISIYFALCWFFVVREN HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC RALGITISDFLNIDNYTLGIDILIYSMSEFGVTLNVIAETYQSNIEWYGILGTQVLITFF CEEEEEHHHHHCCCCEEEEHHHEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHH SAIPFISKISPDLFYLNISEALNLYRYGGSYIADFYYDFGVFCFIPLVFLGMLVSFVDTI HHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MLHAKKRENILTVILLFPFIVQLIFTVRTSTFKIFRTLSWSFILMMIVMLIVILIVSFLK HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRVPECKK HCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA