| Definition | Clostridium perfringens str. 13, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003366 |
| Length | 3,031,430 |
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The map label for this gene is 18311141
Identifier: 18311141
GI number: 18311141
Start: 2473482
End: 2476250
Strand: Reverse
Name: 18311141
Synonym: CPE2159
Alternate gene names: NA
Gene position: 2476250-2473482 (Counterclockwise)
Preceding gene: 18311142
Following gene: 18311140
Centisome position: 81.69
GC content: 23.26
Gene sequence:
>2769_bases ATGATAATTAAGAAAATAAATGTGAAGTCCTTTGGAAAATTAAAAAATAAAGAAATAGAATTAAAAGATGGATTAAACAT AATATATGGTGAAAATGAAAGTGGAAAAAGTACATTACAATCTTTCATAAAGGTAATGTTATATGGTGTTTGTAATAAAA GAGGCAAAAAAACTTTATCAGATAGAGCAAAGTTCACACCATTAGGGGAAGGAAGTTTTTCAGGAGAGTTACTTGTAGAG GATAATGGTGAGGAAATTTTAATAGATAGAAGTTTTGGTAAAACTAAAAAATATGATGAGGGAAATATATTAAATAATAT AACTGGAGAAAAGATAAATAAATACTCATGGCAAGAACCTGGTAAGGATATATTTAATCTTTCTAGTGAGGGATTTAAGA ATACTCTATTTATAAGTCAAATGGGGTGTATTGTAGAGAGTTCAAAGCAGGATGATGTATTAAATAAAATTATTAATATC TTAGAATGTGGAGCTGATGAGGTTTCTTATAAAAAAATAAAAAATAATTTAGAGGAAAATAAAAAATCCTTAACTAATTC AAGAAAAACAGGAAAACTTGATTTATTAAGAATTAAAGAAAGTGAGCTTTTAGAAGAAAGATATAAAAGAGTAAAAATTC ATGAGGAAAATATAGAAAATGAGCTTTACTTAAAGGAATTAAAAGAAAAAAGAACTGATTTAAATTTAAAAATAGAAGAA TTAGAATTACATAAGAAAAATTTAAAAAAATCAGAATTAAAAAATGAGTATGAAAATATAAATGAGTATTTAAATAAAAA AGAAAAATTAGAAGAGGAATTAAAAGTTTTATTAGAAGAGTTAAAAGATGTACAAGCTATCTGTGATTTAAAAAAGTTAA ATAACTTAAGAGATGAGTTTAAAAATTATGAGTTTTTAAAAGAATCACTAAAAGAAAAGGAAGATAAAATAGATAAGCTA AAAGAATATATTTATGAGTATAATGAAAAATTAAAGAGTTATGGAATCTTAAATGAAATATCAAATAATTTAGAAACTAA ATTAATAGAGCTTAGAATTGAAGATGATAGATTAAGAGAAAATTATAAGGTTATTCAAAAGGTAAAAGAAGAGCTTTATC AGTTAAATGAAAAGAAAGATGATTTTTTAAGTCATTTAAATGCTTTAAAATTAAATGATAATTTGGTGTTACAAATAGAA AAGGATTTAGAAAAATATAATAATGAAAAAATATATCCTTCAATAAATGCAAATTTAAAAGAGGAGAAGAATATTATTGA AGAGGAAAGTAAAAGTTTTTCAAGAAAAATTTTTCTCTTCAGAGTTGGAGAAGTAATAAGTATTTTATTATGTGCTTTCT TATTTATATCCTATTTCAAGAGCGAAAATATAATAACCTTAGCACTTTCAATTTTAGGCATGTTATTATTTATATTTTTA CTAGCTAAAAGTAGCTTAAATAAAAAAGAAAAAAATAATATAAGTAAAAGAATAAATGAAATAGATGAGCTTATAAATGA AAAAAAAGAAATAGAAGTATTAAAAAGTAAAATTGATGAATATAAACAATTCCTTAAGGTAAAAGATGAGTATTCTATTA AAGAAACTTTAGAGGATTATAGATTTATTAAAAAAGAGTTAGATATTCTCTATGTAGAAATTAAGGAAAAAGAGAAAAGT TTGATTTTATTAAAAGAAGATGAAACTAAGGAAAAAATATTAAGTAATGAAGCTTTTATAGATAAGTTACTAAGAGTTAC AGGGGCAGGTTCTATAGATGAAATCTTAGAACTCTCAAGGGAAAAGAAAAGCCAGGAAGATTTATTAATAAGAAAAAAAT CAGAGTTTAATGAGGCTAAGGAAGATTTAAATCAATTAAAAAATAGAAGATTAGAAATAGAAGAAAAAATAAAAGCTTAT TTAGAAAATACATCACTACAAAGTATTCCTTTAGATGAAGTATATTCTAGATTAGAAGAAATAGAAGCTAAAATAGAATA TAAGGAAGGCTTAAAAAATAAGTTAAATAGTGTAGAAGAAAATTGCAATCTATTACTTAAGGGAAGAGATATTTTAGAAG TTAAAAATGGACTTTCATATGAGGAATCAGAGATTAAAAATGAAGTTTATAACAGTGAAGAAGAAATATTAAATGAAATA AAATTAAAAAATAATGACTTGTTAAATATTGAAAAAGAAATAAAGGATGTAGAATATTTGATTAGTAGTAAAGAGTTAAC CTGTAGAAGTTTATTTTTAATAGATGAAGAGATAGCTGAAGTTAAGGAAAGGATTAGTTCCTTAGAGAAAAAACTTAAGG GGGTTGAGATTGCAACAAACTACATGGAAAAAGCCTTTAAGGAACTTCAAAAAAGTTTTGGACCTGTTATAAATAAAAAG GTAGAGGATATCTTTAAAGATGTAACTAAGGGTGCTTATAAAGATTTAAGAGTATCAGAAGATTATAACTTAGTTGTTAA GGATACAAAAAGCAATAAAATTATGGATGCTTCTTATTTAAGTAGTGGAACATATGACCAAATATATTTAGCATTGAGAC TTGGCATAATCGACATAATATTTGAAGATAAAAAAGTTCCAATAATATTAGATGAAAGTTTTACTCAATATGATGATAAT AGATTAAAAACTATGTTAGATATAATATATAAGAGAGTTTATAAAAATCAAATAATTTTATTTACATGCCAAAAAAGAGA AATAAATATTCTCAAAGATAAGGAAAAAGTAAATATAATAGAGCTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATCAAGGATGCTTTAGAATCTAATGAAGAGGATGAAGAGATACTAGATATAGCTTTTAGAATTGGTATGGAGAGTATTTT AGATGGAGAAGTGAATTTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTAAAATGAAGGGCTTATATCAAAATAAATTTTATATAACTTACAAACAATTATTAGCTAGACCTAGTAATTCTAGGAA TATGTTTATAAGTTTTATTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 922; Mature: 922
Protein sequence:
>922_residues MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLSDRAKFTPLGEGSFSGELLVE DNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEPGKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINI LECGADEVSYKKIKNNLEENKKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEFKNYEFLKESLKEKEDKIDKL KEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRENYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIE KDLEKYNNEKIYPSINANLKEEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDYRFIKKELDILYVEIKEKEKS LILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSREKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAY LENTSLQSIPLDEVYSRLEEIEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATNYMEKAFKELQKSFGPVINKK VEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYLSSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDN RLKTMLDIIYKRVYKNQIILFTCQKREINILKDKEKVNIIEL
Sequences:
>Translated_922_residues MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLSDRAKFTPLGEGSFSGELLVE DNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEPGKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINI LECGADEVSYKKIKNNLEENKKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEFKNYEFLKESLKEKEDKIDKL KEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRENYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIE KDLEKYNNEKIYPSINANLKEEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDYRFIKKELDILYVEIKEKEKS LILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSREKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAY LENTSLQSIPLDEVYSRLEEIEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATNYMEKAFKELQKSFGPVINKK VEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYLSSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDN RLKTMLDIIYKRVYKNQIILFTCQKREINILKDKEKVNIIEL >Mature_922_residues MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLSDRAKFTPLGEGSFSGELLVE DNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEPGKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINI LECGADEVSYKKIKNNLEENKKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEFKNYEFLKESLKEKEDKIDKL KEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRENYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIE KDLEKYNNEKIYPSINANLKEEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDYRFIKKELDILYVEIKEKEKS LILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSREKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAY LENTSLQSIPLDEVYSRLEEIEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATNYMEKAFKELQKSFGPVINKK VEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYLSSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDN RLKTMLDIIYKRVYKNQIILFTCQKREINILKDKEKVNIIEL
Specific function: Unknown
COG id: COG4717
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 108361; Mature: 108361
Theoretical pI: Translated: 5.20; Mature: 5.20
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.9 %Cys (Translated Protein) 0.8 %Met (Translated Protein) 1.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.9 %Cys (Mature Protein) 0.8 %Met (Mature Protein) 1.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLS CCEEECCCHHHCCCCCCCEECCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH DRAKFTPLGEGSFSGELLVEDNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEP HCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCC GKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINILECGADEVSYKKIKNNLEEN CHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH KKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE HHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEF HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNYEFLKESLKEKEDKIDKLKEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHEEEEEEEECHHHHHH NYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIEKDLEKYNNEKIYPSINANLK HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH EEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDY HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH RFIKKELDILYVEIKEKEKSLILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSR HHHHHHHCEEEEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH EKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAYLENTSLQSIPLDEVYSRLEE HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH IEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHH KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATN HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH YMEKAFKELQKSFGPVINKKVEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYL HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCEEEEECCCCCEEEHHHH SSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDNRLKTMLDIIYKRVYKNQIIL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE FTCQKREINILKDKEKVNIIEL EEECCCCCCCCCCCCCCCEECC >Mature Secondary Structure MIIKKINVKSFGKLKNKEIELKDGLNIIYGENESGKSTLQSFIKVMLYGVCNKRGKKTLS CCEEECCCHHHCCCCCCCEECCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH DRAKFTPLGEGSFSGELLVEDNGEEILIDRSFGKTKKYDEGNILNNITGEKINKYSWQEP HCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHCCCCCCCC GKDIFNLSSEGFKNTLFISQMGCIVESSKQDDVLNKIINILECGADEVSYKKIKNNLEEN CHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH KKSLTNSRKTGKLDLLRIKESELLEERYKRVKIHEENIENELYLKELKEKRTDLNLKIEE HHHHHCCCCCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHH LELHKKNLKKSELKNEYENINEYLNKKEKLEEELKVLLEELKDVQAICDLKKLNNLRDEF HHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KNYEFLKESLKEKEDKIDKLKEYIYEYNEKLKSYGILNEISNNLETKLIELRIEDDRLRE HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCHHHEEEEEEEECHHHHHH NYKVIQKVKEELYQLNEKKDDFLSHLNALKLNDNLVLQIEKDLEKYNNEKIYPSINANLK HHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHEEECCCEEEEEHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCH EEKNIIEEESKSFSRKIFLFRVGEVISILLCAFLFISYFKSENIITLALSILGMLLFIFL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LAKSSLNKKEKNNISKRINEIDELINEKKEIEVLKSKIDEYKQFLKVKDEYSIKETLEDY HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH RFIKKELDILYVEIKEKEKSLILLKEDETKEKILSNEAFIDKLLRVTGAGSIDEILELSR HHHHHHHCEEEEEEECCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH EKKSQEDLLIRKKSEFNEAKEDLNQLKNRRLEIEEKIKAYLENTSLQSIPLDEVYSRLEE HHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH IEAKIEYKEGLKNKLNSVEENCNLLLKGRDILEVKNGLSYEESEIKNEVYNSEEEILNEI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHH KLKNNDLLNIEKEIKDVEYLISSKELTCRSLFLIDEEIAEVKERISSLEKKLKGVEIATN HCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH YMEKAFKELQKSFGPVINKKVEDIFKDVTKGAYKDLRVSEDYNLVVKDTKSNKIMDASYL HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCEEEEECCCCCEEEHHHH SSGTYDQIYLALRLGIIDIIFEDKKVPIILDESFTQYDDNRLKTMLDIIYKRVYKNQIIL CCCCHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEECCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE FTCQKREINILKDKEKVNIIEL EEECCCCCCCCCCCCCCCEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA