Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is ywbL [H]

Identifier: 159897000

GI number: 159897000

Start: 545911

End: 548373

Strand: Reverse

Name: ywbL [H]

Synonym: Haur_0468

Alternate gene names: 159897000

Gene position: 548373-545911 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159897001

Following gene: 159896999

Centisome position: 8.64

GC content: 52.62

Gene sequence:

>2463_bases
GTGTGCGTCCCTCCATCAAGCAACTTAAGGAGCAAAGGGCGTGAACTGTTGGCATGCAGGTCACGTCCTTTGTCGGTTTA
CTATGCTGTTGCCCAACGTGAGCAGCAGCAAATCACATTTTTAGGAGCTTGTATGTGGTTGCGTCGTTTTTTGCTGGCGT
TGGTCGTCTCTTTATTGCCATGGTCGGCCATGGCAGCCGAACCATCACCAGCCCAAGCCAGCGAATCGGTGCGTTCGCTG
CTGGTGCAAGCCCAATTAATTCTCACCAATGATCCTGCTCAAGCCCAAAGCCTGCTTAACCAAGCCCAAGCCTTGTACGA
TCAGGCCTTGGCTAAAGATTTGACCAATTTAGCGCCCCAACAAGCAGCGGAAATCGCCACACGTTGGACCGATTTAGCCC
AAGCCTTGGAAAAACAAGATGTGGCCGGATTTGCCCAACAACGGGCTTTGCTCTGGACGCATTTGCTCAAGGCCAGTTAT
GGAATTGTTGGTCAAGCGATCGATACTGGCAAACCTGAGCAAGCACTGCAATGGCTGCCCGTTCGCGAATTTCGCAATGC
CACCCGTTTTTCGCGCCCCAACGGCGATGCTGCTCGGGCAATCGAGCAATGGAAACAAGCAGCCTACAGCGCCGCCGATG
CGCGAACTGCCCTTGATGCCGATTTGTTGGATACCTATCAGGCCAAGCTTAACGAGAGTTTGCGCACTCTACGCAGCGCT
GCCCAAAAAGGCAATTTAATTCAACAAGCTGAGGCTGGTGCGGCGATTCAAGGCTATTTTGCTATTTTAGAGCCAGCCTA
TCGTAGCCAGCACCCTGAGAAGGTCGATGCAGCTTTGGTTAATGCTGAAAACTTACGTCAAGCAGCACTCAGCAACAACC
AGCTTGAAGCGGCAATCGGCAGCTTTGAAGGCTCGCTGAGCGGTTTTCGGGCGGCTCCCCTTAGCCCATCGGAGCAAGTA
CGCCGCGCTGGCCAGATGCGCCGTTTCTTAAGCTTAGTGCCAGTAGAATATGAACGAGGCGTGCGCAACGGCCAAGTTAC
GCTGGATCTCGAAATTCAAGAAGCAACGACCTTTCGCAATGGCGCAGCCGCTGCCTTTAGCGACCTCGAAAGCCTTTTGA
TCGCAATTGATTCGACCAAAACTCAACAAGTCGCCAGCGATCTACGCGAGCTGGAAACGATGCTGACCGCTGCAGCTCAA
CGGACGAGTGTGGCCGAGCCAGATGCGGTTCAAGCCAAAGTCGATCATATCACCACAACCTTGGCCGAAATTATGCCCGC
CGAGTGGCAGAAATCCAGCCTCGAAGGCGATTTCGATGTAATCGCTTCAATGCTTGATCAGATGGAAAATGCGGTGGCTG
GCGACCAATATGATCTCGCCGAATCGGCCCGTTTGGAAGCCTACGCTGTGTTGGAATCTGGCCCAGAAGCGCGTTTGATT
GTGTTTGCTCCTGAATATAAAGCGCCAATTGAAAACCTGTTTTGGTATGGCAAAGATGAATTTACTGGCCTAGCTGAGTT
GATTCGCCAAAAAGCTTCGCTCAGCGATATTCGCGCTAGCCGCCAAGCCTTGGATAAACAATTGGATTTAGCCCAAGATG
CGCTTGGCGGCTCTAGCACGCCCGAAGCGGTAGCAACTAGCGCCGCCGTGATTGTGTTTCGCGAAGGCTTAGAGGCGGTG
TTAATTTTGGCTTCGTTGTTGGCAAGCCTCAAAATTGGCGAACAACGTGGCTATCGCAAACCAATTTGGATCGGTGCAAC
CCTCGCCATGTTAGCAACGGTATTGACGTGGGTGCTGGCGCGGGGCTTGATCACCGAACTGATTCGGCGTGGCGATCAAG
AAAAGATCGAAGCGATTGTTTCATTAATTGCCATCGCCGTGCTGTTGTTAATCACCAACTGGTTTTTCCACAAAGTCTAC
TGGACTGGCTGGATGGCCAATTTTCATGCCCAAAAGCGCCGAATTATTGGTGGCAAGGCTGGGCTTTGGCTCGGTTTGAT
CACCTTGGGCTTTACCAGCATCTACCGTGAAGGCGTTGAAACTGTGCTCTTTTTGCAAGCGCTCGTGCTTGAAGCCAGCA
CCCAAGTGGTGTTAGCCGGCGTGGCTATGGGGCTTGGTGGCACAGCCTTGGTTGGTGTGCTGGTCTTTGGACTGCAAGCC
AAATTGCCCCATAAGAAGATGCTGATCGTGACTGGGGTGATGATTGGCGCGGTCTTGTTGATTATGGTTGGCAACACCAT
GCACATTATGCAGTTGGTTGGCTGGATGCCGCTGCACCCAATTCGTAGCCTCGAAATCCCCTACTGGGCCAATATGTGGC
TGGGTTTCTATGCGACGTGGGAAGGCATTGCGGCCCAAGTTGCAGCTGGCGCATTTGTGATTGGCTCTTATGTGATTGCC
GAGCACTTGCAGCATCGCAAAACTGAGGTTGCCGTCAAACGCCAAAGTGCAACCGCCAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAACAAATCCTCGTACAATAGATATGCTGGCTACACCACAGGTATATCTATGCTATCAATGAGCAAGAAGTTGCGACAG
AGCAAGGTTGATGGAGCTGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATAATGAAATGCCCTCACCCCAACCCCTCTCGCAAGAGTAGGTTTTAACGCCCCCTCACCCCAACCCCTCTCCCGCTGCG
GCAGGCGAGGGGCTTTGATT

Product: iron permease FTR1

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 820; Mature: 820

Protein sequence:

>820_residues
MCVPPSSNLRSKGRELLACRSRPLSVYYAVAQREQQQITFLGACMWLRRFLLALVVSLLPWSAMAAEPSPAQASESVRSL
LVQAQLILTNDPAQAQSLLNQAQALYDQALAKDLTNLAPQQAAEIATRWTDLAQALEKQDVAGFAQQRALLWTHLLKASY
GIVGQAIDTGKPEQALQWLPVREFRNATRFSRPNGDAARAIEQWKQAAYSAADARTALDADLLDTYQAKLNESLRTLRSA
AQKGNLIQQAEAGAAIQGYFAILEPAYRSQHPEKVDAALVNAENLRQAALSNNQLEAAIGSFEGSLSGFRAAPLSPSEQV
RRAGQMRRFLSLVPVEYERGVRNGQVTLDLEIQEATTFRNGAAAAFSDLESLLIAIDSTKTQQVASDLRELETMLTAAAQ
RTSVAEPDAVQAKVDHITTTLAEIMPAEWQKSSLEGDFDVIASMLDQMENAVAGDQYDLAESARLEAYAVLESGPEARLI
VFAPEYKAPIENLFWYGKDEFTGLAELIRQKASLSDIRASRQALDKQLDLAQDALGGSSTPEAVATSAAVIVFREGLEAV
LILASLLASLKIGEQRGYRKPIWIGATLAMLATVLTWVLARGLITELIRRGDQEKIEAIVSLIAIAVLLLITNWFFHKVY
WTGWMANFHAQKRRIIGGKAGLWLGLITLGFTSIYREGVETVLFLQALVLEASTQVVLAGVAMGLGGTALVGVLVFGLQA
KLPHKKMLIVTGVMIGAVLLIMVGNTMHIMQLVGWMPLHPIRSLEIPYWANMWLGFYATWEGIAAQVAAGAFVIGSYVIA
EHLQHRKTEVAVKRQSATAK

Sequences:

>Translated_820_residues
MCVPPSSNLRSKGRELLACRSRPLSVYYAVAQREQQQITFLGACMWLRRFLLALVVSLLPWSAMAAEPSPAQASESVRSL
LVQAQLILTNDPAQAQSLLNQAQALYDQALAKDLTNLAPQQAAEIATRWTDLAQALEKQDVAGFAQQRALLWTHLLKASY
GIVGQAIDTGKPEQALQWLPVREFRNATRFSRPNGDAARAIEQWKQAAYSAADARTALDADLLDTYQAKLNESLRTLRSA
AQKGNLIQQAEAGAAIQGYFAILEPAYRSQHPEKVDAALVNAENLRQAALSNNQLEAAIGSFEGSLSGFRAAPLSPSEQV
RRAGQMRRFLSLVPVEYERGVRNGQVTLDLEIQEATTFRNGAAAAFSDLESLLIAIDSTKTQQVASDLRELETMLTAAAQ
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LILASLLASLKIGEQRGYRKPIWIGATLAMLATVLTWVLARGLITELIRRGDQEKIEAIVSLIAIAVLLLITNWFFHKVY
WTGWMANFHAQKRRIIGGKAGLWLGLITLGFTSIYREGVETVLFLQALVLEASTQVVLAGVAMGLGGTALVGVLVFGLQA
KLPHKKMLIVTGVMIGAVLLIMVGNTMHIMQLVGWMPLHPIRSLEIPYWANMWLGFYATWEGIAAQVAAGAFVIGSYVIA
EHLQHRKTEVAVKRQSATAK
>Mature_820_residues
MCVPPSSNLRSKGRELLACRSRPLSVYYAVAQREQQQITFLGACMWLRRFLLALVVSLLPWSAMAAEPSPAQASESVRSL
LVQAQLILTNDPAQAQSLLNQAQALYDQALAKDLTNLAPQQAAEIATRWTDLAQALEKQDVAGFAQQRALLWTHLLKASY
GIVGQAIDTGKPEQALQWLPVREFRNATRFSRPNGDAARAIEQWKQAAYSAADARTALDADLLDTYQAKLNESLRTLRSA
AQKGNLIQQAEAGAAIQGYFAILEPAYRSQHPEKVDAALVNAENLRQAALSNNQLEAAIGSFEGSLSGFRAAPLSPSEQV
RRAGQMRRFLSLVPVEYERGVRNGQVTLDLEIQEATTFRNGAAAAFSDLESLLIAIDSTKTQQVASDLRELETMLTAAAQ
RTSVAEPDAVQAKVDHITTTLAEIMPAEWQKSSLEGDFDVIASMLDQMENAVAGDQYDLAESARLEAYAVLESGPEARLI
VFAPEYKAPIENLFWYGKDEFTGLAELIRQKASLSDIRASRQALDKQLDLAQDALGGSSTPEAVATSAAVIVFREGLEAV
LILASLLASLKIGEQRGYRKPIWIGATLAMLATVLTWVLARGLITELIRRGDQEKIEAIVSLIAIAVLLLITNWFFHKVY
WTGWMANFHAQKRRIIGGKAGLWLGLITLGFTSIYREGVETVLFLQALVLEASTQVVLAGVAMGLGGTALVGVLVFGLQA
KLPHKKMLIVTGVMIGAVLLIMVGNTMHIMQLVGWMPLHPIRSLEIPYWANMWLGFYATWEGIAAQVAAGAFVIGSYVIA
EHLQHRKTEVAVKRQSATAK

Specific function: Unknown

COG id: COG0672

COG function: function code P; High-affinity Fe2+/Pb2+ permease

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the oxidase-dependent Fe transporter (OFeT) (TC 9.A.10.1) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005217
- InterPro:   IPR004923 [H]

Pfam domain/function: PF03239 FTR1 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89525; Mature: 89525

Theoretical pI: Translated: 6.54; Mature: 6.54

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
2.6 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
2.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCVPPSSNLRSKGRELLACRSRPLSVYYAVAQREQQQITFLGACMWLRRFLLALVVSLLP
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
WSAMAAEPSPAQASESVRSLLVQAQLILTNDPAQAQSLLNQAQALYDQALAKDLTNLAPQ
CHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
QAAEIATRWTDLAQALEKQDVAGFAQQRALLWTHLLKASYGIVGQAIDTGKPEQALQWLP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCHHHHHHHCC
VREFRNATRFSRPNGDAARAIEQWKQAAYSAADARTALDADLLDTYQAKLNESLRTLRSA
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AQKGNLIQQAEAGAAIQGYFAILEPAYRSQHPEKVDAALVNAENLRQAALSNNQLEAAIG
HHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SFEGSLSGFRAAPLSPSEQVRRAGQMRRFLSLVPVEYERGVRNGQVTLDLEIQEATTFRN
HHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHCC
GAAAAFSDLESLLIAIDSTKTQQVASDLRELETMLTAAAQRTSVAEPDAVQAKVDHITTT
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LAEIMPAEWQKSSLEGDFDVIASMLDQMENAVAGDQYDLAESARLEAYAVLESGPEARLI
HHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEEE
VFAPEYKAPIENLFWYGKDEFTGLAELIRQKASLSDIRASRQALDKQLDLAQDALGGSST
EECCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PEAVATSAAVIVFREGLEAVLILASLLASLKIGEQRGYRKPIWIGATLAMLATVLTWVLA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHH
RGLITELIRRGDQEKIEAIVSLIAIAVLLLITNWFFHKVYWTGWMANFHAQKRRIIGGKA
HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH
GLWLGLITLGFTSIYREGVETVLFLQALVLEASTQVVLAGVAMGLGGTALVGVLVFGLQA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHC
KLPHKKMLIVTGVMIGAVLLIMVGNTMHIMQLVGWMPLHPIRSLEIPYWANMWLGFYATW
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
EGIAAQVAAGAFVIGSYVIAEHLQHRKTEVAVKRQSATAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MCVPPSSNLRSKGRELLACRSRPLSVYYAVAQREQQQITFLGACMWLRRFLLALVVSLLP
CCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
WSAMAAEPSPAQASESVRSLLVQAQLILTNDPAQAQSLLNQAQALYDQALAKDLTNLAPQ
CHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
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AQKGNLIQQAEAGAAIQGYFAILEPAYRSQHPEKVDAALVNAENLRQAALSNNQLEAAIG
HHHCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHCHHHHCCCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
SFEGSLSGFRAAPLSPSEQVRRAGQMRRFLSLVPVEYERGVRNGQVTLDLEIQEATTFRN
HHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHCC
GAAAAFSDLESLLIAIDSTKTQQVASDLRELETMLTAAAQRTSVAEPDAVQAKVDHITTT
CHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
LAEIMPAEWQKSSLEGDFDVIASMLDQMENAVAGDQYDLAESARLEAYAVLESGPEARLI
HHHHCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCEEE
VFAPEYKAPIENLFWYGKDEFTGLAELIRQKASLSDIRASRQALDKQLDLAQDALGGSST
EECCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
PEAVATSAAVIVFREGLEAVLILASLLASLKIGEQRGYRKPIWIGATLAMLATVLTWVLA
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CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
EGIAAQVAAGAFVIGSYVIAEHLQHRKTEVAVKRQSATAK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7934828; 9384377 [H]