| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159896858
Identifier: 159896858
GI number: 159896858
Start: 388096
End: 390231
Strand: Direct
Name: 159896858
Synonym: Haur_0325
Alternate gene names: NA
Gene position: 388096-390231 (Clockwise)
Preceding gene: 159896857
Following gene: 159896859
Centisome position: 6.12
GC content: 54.73
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AATAAGTAGGTTCCAACCTGCAATCGCCAATAGTCAATCCCAATCAGCGACTTAAGTCATAGCTAGTCGTGCTATAATCG TTCTAAATAGTACAACAAGA
Product: integral membrane sensor signal transduction histidine kinase
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 711; Mature: 711
Protein sequence:
>711_residues MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGRGPPVVDVGLPFWWRVISVVS LLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILGLVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLAL IMCFSLPIHALLTGPGRRNNLPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQVASIYIVLFATTLASLAYGL LSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASVEGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTP IPLLEQLPISNERRTSGIRLEAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHTKLSALIRSLPPATPHRLAQG GLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFIGEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGL VVDICDDGVGMQPHQSSSSGSGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA
Sequences:
>Translated_711_residues MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGRGPPVVDVGLPFWWRVISVVS LLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILGLVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLAL IMCFSLPIHALLTGPGRRNNLPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQVASIYIVLFATTLASLAYGL LSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASVEGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTP IPLLEQLPISNERRTSGIRLEAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHTKLSALIRSLPPATPHRLAQG GLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFIGEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGL VVDICDDGVGMQPHQSSSSGSGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA >Mature_711_residues MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGRGPPVVDVGLPFWWRVISVVS LLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILGLVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLAL IMCFSLPIHALLTGPGRRNNLPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQVASIYIVLFATTLASLAYGL LSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASVEGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTP IPLLEQLPISNERRTSGIRLEAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHTKLSALIRSLPPATPHRLAQG GLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFIGEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGL VVDICDDGVGMQPHQSSSSGSGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76830; Mature: 76830
Theoretical pI: Translated: 7.73; Mature: 7.73
Prosite motif: PS50109 HIS_KIN
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGR CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GPPVVDVGLPFWWRVISVVSLLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILG CCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLALIMCFSLPIHALLTGPGRRNN HHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCC LPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQ HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VASIYIVLFATTLASLAYGLLSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHH EGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTPIPLLEQLPISNERRTSGIRL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEE EAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM EECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH KLSALIRSLPPATPHRLAQGGLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFI HHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCEEEECCCCHHHCCCCHHHH GEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGLVVDICDDGVGMQPHQSSSSG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC SGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA CCCCCEECCCEEEEECCCEEECCCCCCCCEEEEEECHHHCCCCCCCHHCCC >Mature Secondary Structure MIFILQSIALAISIFNAIICLWLGMTVALDGGRERGPRLAAAGLLMAGVFFLIHAAIIGR CEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GPPVVDVGLPFWWRVISVVSLLAPYAWYATMIWYTGVSGKSLRIHKLLLFTMGIFIGILG CCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LVLTAIYPLPQEARILALKIVPAWLVANLPFIVAGYLLALIMCFSLPIHALLTGPGRRNN HHHHHHCCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCC LPHQAWLRVRSWLIRTSLLGLLAGIVALIGAVIVFSQGAVGRTPEVAWLADRAIELFFQL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH DVMVLIVVAAALGAAGQAMGAYAAFTDRPLPQWNRIDQWRWLVAIAGGFALMVGVSSALQ HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VASIYIVLFATTLASLAYGLLSWRYRVEHEAFMERLRPFVGSLHFQDRLLDGGASLSASV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHCCCCCHHHHH EGLVEAVSRDVLRAERACLLLRDAVPGLPNVISYHWGQTPIPLLEQLPISNERRTSGIRL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCEEE EAQSGAEWAVPLWDGRGLAGALVLGSPQAGAVYSEELMEVAAACCARLTDALAGERAARM EECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGDVLRQRIAEVKVLGSQGRRTLHDDVLPQIHAALIHLSAVSANDPMAQQTIQALSEAHT HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH KLSALIRSLPPATPHRLAQGGLAQTLHDMVLVDFGNAFDQVSYTVAPAAEARLADTPQFI HHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCEEEECCCCHHHCCCCHHHH GEVISYALQETLRNAARHARGNDPRRTLQMRVQIDWQHGLVVDICDDGVGMQPHQSSSSG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC SGSGLRLHRGLLMVIGGSLNIATPGQGGTHIHIQVPEELWNLPVLEPEEIA CCCCCEECCCEEEEECCCEEECCCCCCCCEEEEEECHHHCCCCCCCHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA