| Definition | Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009954 |
| Length | 2,077,567 |
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The map label for this gene is atpI [H]
Identifier: 159041944
GI number: 159041944
Start: 1453395
End: 1455902
Strand: Reverse
Name: atpI [H]
Synonym: Cmaq_1380
Alternate gene names: 159041944
Gene position: 1455902-1453395 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159041946
Following gene: 159041940
Centisome position: 70.08
GC content: 42.22
Gene sequence:
>2508_bases ATGGAGGACCTATTTGATTTAAACTTAAAAATCAAGCCCAGTGAGCCTAATGTGCCCATAGAGAGGATTGTGGAGTATAA GATAACGGTACCTAGGCATGCGGCATTGGATTTAATATTCAGGGTGGGTTTACTTGGTGAATTCATGCCCATTGATAGAC CCCCTAAGTTACCTGCCCCCTCAATTGACCAGGAAACCTACACTAGCGTTAGGAGATTGACTGAAGCCGCTAGGACAATA TCAAGGTATGGTCAAACCCAACAGGAGCCATCAATAGGTAGGTTTAGGGTTAAGGCAACCTCTTTCAAGGACTTCATAGA CTCAGTGTATAAGAATGGTGAGGAATTGATAGGTAGGATTAGGCAAATTGAGGATTCACTAAATAATGCTGAAGAGGAGT TAACGAAACTTAGGCTAATGATAAGCGTTAATTCCCTAATAGGATTAATGCAGCTTAAGAATATTAGGTACATTGTCGTC GAGACCCCCCATAGGGCTTTAAGTGACTTCGAGAACTCCATTAAGCAGATTGAGGATGTAGTCTTAACTAGGCTTGGTGA AGTTAATGATAGGATTCACTTACTTATAATTGCCCCAACCTGGGAGTTGAGGAGGATTAATGACATCATTAGGCTGCATA ACGTTAAGGTAATTGAATTACCTGAGAGTGATTTAAGTAATGTGGAGGCCAGGGTTAAGGAGACTGAGGCAACCATAAGT AGCTTAAGGAGTCAACTTGAGTCATTAATAAGTAGTAATAAGCAGGTGATAAGGGGTATTTTAGAGGCTGCAGGTGTTGC TGAGAATGTTATTCAAACTTACGTTAATAGTGCCGTTGAAGAGGGGGGTGAGGTTATTGCTAGGATTGATGCAATTAAGA CTCAGATGGTGGAAATGGAGAGTAGGTTAAGTAGGCTTAGGTTACTCATCGAGGCGTATAATGGTTTAATTAGAAGTGGG ATTAAGGAGATGGGGCTTAAGGCGCTAGATTACTCATTATTCATAATTAAGGGTCAAATACCCCCTGACCTAGATAAGTA CTCGGGGTACGTTATCAACATAGGTGATGAATTATCAGCCTACTTAATCATGAGCAACGTGGATTATCCAGAATCCAACA ATATTGTTAAGGCGCCAAGGGAGCATTTAACAAACCTGGAGGCGTCAGTGGAGTTGCTTAGTAGGGAGATTAGGGAAATG GAGAGGAGGCTGGGTGAATTGAAGAATGAGCTTAATGAAATGATTAGGGAGAGGGAGGAGGCTTGTAATTACAGTATTGA GGAGGCTAGGCAGGTAAGTGACCTAGTTACTATTAGGGGTTTTGTGATTGAGAAGAATGTGAAGCTTTTCGAGGACTTCC TGTACAGGACCTTAACCGACCTAGCCGTTGACGCTAGGGTTAGGAAGTTCACCAGGATTATTCAAGTTAATACAATTAAC CCGCATGAAGCACCCACCAGTGAGGAGTATCCAACACCCATTAATGCTTTTAGGGAGATAACCTACATGTACGGTATACC AAGGTATGGTGAATTAAGCCCAGTAACATTAACCGCCGTATTATTCCCAGTCTTCTTCGGCTGGATGTTCCCAGATGCTG GACAAGGTGCAATACTACTACTCTTCGGTATACTCATGAATGTGCTTAAGTATAATGGTAGGAATAGTATACTTAGGGCG ATGTTTTCAGGGAAGGCTAATCTATGGGGTCAATTATTCGTAATGATGGGTACCTGGGCCATAGTGTTCTCAATACTGAA TAGTGGTGAAGTCTTCGGAATGGATTTAATTAAGCCAATACTACCGTGGGGCCGAGTCTTCGTTAATGGTACAATAAGCG AGTATTGGATAAACTGGGTGCTACCATTGGCAATGCTCTTCGGCTTCACACTACTGGTGATGTCACTGATACTTAAGCCA CTGAATAGGGCTAGACTTGGGCACAGGTTAGATGCCTTATCACTGGCTTGGGTTCCACTGGTCTTCATAGGCTTTGGCCT ACTCATGATGAATGTTGGAATAATACCGGTAGCCCTATTAAACCCGGTATTCTCAGCATTATTAACCCCCCAAGTTAGGT TAATTGGTGCGGCATTAATGGTTATAGGCTTCGGTGGGTTCTTCGGCTCATTCATGTACATTAAATCAATGCCCAACACT GAGGTTGATGCCGCTGAGTTAATGGTTGGGTTAACCATAGAGGGTATACTGGATGCAATAGCCAATACCTTATCATTCAT GAGGCTTGGAATAATAGCATTGGTGCACAGTATATTCACCTACATGACGTACCACCTGGCGTTAACATATGGGTTACTAA CCCCAGCCGGCTTACTAATAATGATATTACTCAATGCACTAATCATTGCTGGGGAAGGATTCCTAACCTTCATTCAGACA AGTAGGTTAACATTCTATGAAGTATACTCCAAGTTCTATGAAGGATCAGGTAAATTATATATGCCGTTAAGGTATGCCCT CACTGCACTAAGTATTGAATTACCCTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CAATACCAGACCTCATGCTCAATGCGTATGCTTCAGTATTTTAAAATACAACCGCATTCATCACAATTATTAATGATGCG TACTCGGTATTTAAGAATAA
Downstream 100 bases:
>100_bases GGCATATTGAGTGAAAAATTAATTTACAACCTAAGTTAAGCCTAACTGGTGGAGGGCCCGTAGCTCAGCCAGGTTAGAGC GGCGGCCTTCGGAGCCGTAG
Product: V-type ATPase 116 kDa subunit
Products: ADP; phosphate; H+
Alternate protein names: V-ATPase subunit I [H]
Number of amino acids: Translated: 835; Mature: 835
Protein sequence:
>835_residues MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAPSIDQETYTSVRRLTEAARTI SRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRIRQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVV ETPHRALSDFENSIKQIEDVVLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEMESRLSRLRLLIEAYNGLIRSG IKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSAYLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREM ERRLGELKNELNEMIREREEACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILLLFGILMNVLKYNGRNSILRA MFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPILPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKP LNRARLGHRLDALSLAWVPLVFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLIMILLNALIIAGEGFLTFIQT SRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP
Sequences:
>Translated_835_residues MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAPSIDQETYTSVRRLTEAARTI SRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRIRQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVV ETPHRALSDFENSIKQIEDVVLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEMESRLSRLRLLIEAYNGLIRSG IKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSAYLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREM ERRLGELKNELNEMIREREEACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILLLFGILMNVLKYNGRNSILRA MFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPILPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKP LNRARLGHRLDALSLAWVPLVFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLIMILLNALIIAGEGFLTFIQT SRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP >Mature_835_residues MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAPSIDQETYTSVRRLTEAARTI SRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRIRQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVV ETPHRALSDFENSIKQIEDVVLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEMESRLSRLRLLIEAYNGLIRSG IKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSAYLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREM ERRLGELKNELNEMIREREEACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILLLFGILMNVLKYNGRNSILRA MFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPILPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKP LNRARLGHRLDALSLAWVPLVFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLIMILLNALIIAGEGFLTFIQT SRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP
Specific function: Produces ATP from ADP in the presence of a proton gradient across the membrane [H]
COG id: COG1269
COG function: function code C; Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase subunit I
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the V-ATPase 116 kDa subunit family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002490 [H]
Pfam domain/function: PF01496 V_ATPase_I [H]
EC number: 3.6.3.14
Molecular weight: Translated: 94289; Mature: 94289
Theoretical pI: Translated: 5.55; Mature: 5.55
Prosite motif: PS00422 GRANINS_1
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.5 %Met (Translated Protein) 3.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.5 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAP CCCCEECCEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC SIDQETYTSVRRLTEAARTISRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH RQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVVETPHRALSDFENSIKQIEDV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS HHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEME HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SRLSRLRLLIEAYNGLIRSGIKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHCCEEEEECCCCEE YLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREMERRLGELKNELNEMIREREE EEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILL CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH LFGILMNVLKYNGRNSILRAMFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPI HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHH LPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKPLNRARLGHRLDALSLAWVPL CCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MILLNALIIAGEGFLTFIQTSRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHEECC >Mature Secondary Structure MEDLFDLNLKIKPSEPNVPIERIVEYKITVPRHAALDLIFRVGLLGEFMPIDRPPKLPAP CCCCEECCEEEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC SIDQETYTSVRRLTEAARTISRYGQTQQEPSIGRFRVKATSFKDFIDSVYKNGEELIGRI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHH RQIEDSLNNAEEELTKLRLMISVNSLIGLMQLKNIRYIVVETPHRALSDFENSIKQIEDV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHH VLTRLGEVNDRIHLLIIAPTWELRRINDIIRLHNVKVIELPESDLSNVEARVKETEATIS HHHHHCCCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH SLRSQLESLISSNKQVIRGILEAAGVAENVIQTYVNSAVEEGGEVIARIDAIKTQMVEME HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH SRLSRLRLLIEAYNGLIRSGIKEMGLKALDYSLFIIKGQIPPDLDKYSGYVINIGDELSA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCEEEEEEECCCCCCHHHHCCEEEEECCCCEE YLIMSNVDYPESNNIVKAPREHLTNLEASVELLSREIREMERRLGELKNELNEMIREREE EEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ACNYSIEEARQVSDLVTIRGFVIEKNVKLFEDFLYRTLTDLAVDARVRKFTRIIQVNTIN HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCC PHEAPTSEEYPTPINAFREITYMYGIPRYGELSPVTLTAVLFPVFFGWMFPDAGQGAILL CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHH LFGILMNVLKYNGRNSILRAMFSGKANLWGQLFVMMGTWAIVFSILNSGEVFGMDLIKPI HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEECHHHHHHH LPWGRVFVNGTISEYWINWVLPLAMLFGFTLLVMSLILKPLNRARLGHRLDALSLAWVPL CCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VFIGFGLLMMNVGIIPVALLNPVFSALLTPQVRLIGAALMVIGFGGFFGSFMYIKSMPNT HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC EVDAAELMVGLTIEGILDAIANTLSFMRLGIIALVHSIFTYMTYHLALTYGLLTPAGLLI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH MILLNALIIAGEGFLTFIQTSRLTFYEVYSKFYEGSGKLYMPLRYALTALSIELP HHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: ATP; H2O; H+
Specific reaction: ATP + H2O + H+(in) = ADP + phosphate + H+(out)
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 10701121; 11427726 [H]