Definition Borrelia burgdorferi B31 chromosome, complete genome.
Accession NC_001318
Length 910,724

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 15594404

Identifier: 15594404

GI number: 15594404

Start: 53534

End: 55504

Strand: Reverse

Name: 15594404

Synonym: BB0058

Alternate gene names: NA

Gene position: 55504-53534 (Counterclockwise)

Preceding gene: 15594405

Following gene: 15594403

Centisome position: 6.09

GC content: 27.25

Gene sequence:

>1971_bases
ATGAATTTTAATTGGTTTTTAATGTTATTCCTTTTTAATTTTAGTGTTCTATTAGGAAGTGATACTACAGCATTAGGACA
TTATCAAAGGGCTAATGAGTATTATTTATCTAAAAGGTATTATGATGCTATTGATGAGCTTGTTGAGGCTATAAAAATTA
ATCCCAATTATTATGAAGCTTATAAATTTATTGCATCAATTTACTATTCCCTTAAGATATATACTCAAGCACAATTTTTC
ATAGAGAAAGCCTCTAAAATGTCCAATGAAGACACTGAATATAAAATTCTTTATGCAAATATATTGTTAAAAAACGATAA
AATTGATCAAGCAAAAAAAATCTATTCTGAGGTTTTAGTCAAACAAAGGAATAATATTGATGCTTTGGTTGGACTTGCTT
CAATTTTTGAAAAAAATGGATTATTTATAGCTGCTGCTAATTATTATTTATCTATTCTTGATTATAGTCAAAATAATTAT
AGTGCTTTTGAGCATCTTATTGACATTTATCAAAGGCTAGGAATGCATGACAAGATTAGACATTTGATAAATAAAGTCAG
GGTAAATTTTTTATCTTTTCCAGATTTTCATAAAAGAGTCGCTGAATTTTATATTAGTATTAATAATTTGGGGCTTGCTG
AAAAGTATGCTTTAAATTATTTGGCTTTAATTGAAAGCTCTTACAAAGATTTTGGAGTTGTTGATGCGTATCGATTGCTT
GCGCTTGTTTATTTGCATGAATTTAAATATGAGGATGCAATAGAAGCATTGCAGAAAGCTATTTTAGTTAATAAAGATTC
TGATGAGCTTTATTATTTATTGGGGTATTCTTACTTAAGATTTGGAGATATTGAAAAGGCTATTTTAAATTTAGAGCGAG
CTAAAAATCTCAAAAAAGATTTAGAATTTTATAATATTGCTCTTGAGGAGAGTTTTTTTGCATCTAATTTTAGAAATTTT
TTGAAAAATAATTCCAATGCTAGAATTTCTAAGCATTATGAAAATGAGGGGCTTAAAGCTTTTAAATCTTTAAATTTAAA
CAAAGCATTGTTTAATGCAAAAAATGCTGTTGATATTTGGCCTGATAATGATAGTGCTAGGTTTTTGCTTTCAAAAATAT
ACAAGCTTATGAATTTAGATATTATGGCATATGAGCAGCTTTTTTATTTAGCAAAACAAAGAAATTCTACTGATTCTAGA
ATTTTAGATTTTTACGATGTTGTGTCTTTTGATGTTAGAAAGTCTTTATTTTATAAATATGGATACAAAAGCATTGCTGA
TTTTAATAAGCTTTACGATGACAGAGTGGTTTATAAAATGGCTATTTTTACTCAAAGTGAGAATAAGTTTTTTGGGGCAA
ATGATTTGATATTGAGATACGCTGAAAGGGTGCTTGAGCGTAATTTAAATATGGAAATAGTTAACTATAATTTTGATTAC
AATAAAAATAGAGACTATCTGATTAATAATTTTTCTGAAGGGTTTTCTTATTCAAGAAATAATAATTTGGATTTATTTTT
AATTTTTGATTTTAAGGCAGATATTTTGAAAAATACAGCTACCTTGGTAGTGAATATTTTTTCAGGTAAAACAGGGATTA
AGCTTGTTTCTTTCTCTTATGATGTGGGAGGTGTTAATTATTTAAGCAATGCTTTAAATTCTCTTTCAAAAGATTTTCAT
GATTATTTGCCCAAAAAAGGAAAGATTCTTCAAATTAAAAATGACGATGCTCTTATTAATCTTGGCCAAGTAAACGGTGT
TGTAAAAGGCGATGTTTTTTTGATTCTTAAAGAAGGTGCTTTAAACAGTGATACTAGAGATTCTGGTTTTATTGTTTACA
AAAAATCAGATATTTTAGGCGAGATTTTAATTGAGGATATAAGTGATTATATTTCTAGAGGCATTGTAAAATCTTCTACC
TTTTTAAAGGATTATGTTCAAGAAGGAGCCACTGTGCTTATAAAAAGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAAAAATGAAAAGGTGGAATATAACAATTTGGTTTTTTCGATTAAAAATATGCATCAAAGAAATATTAAGGTGATAAAG
ATTTCCGAGAAGGAAGGTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTGACACTTGTTGTTAATTTGTGATTTAATAATTCTAGTAAGAATAAAATCAAAAAATTGGAGGATTTTGTATGAAATT
GGCTATTAATGGCTTTGGGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Tetratricopeptide Repeat Family Protein

Number of amino acids: Translated: 656; Mature: 656

Protein sequence:

>656_residues
MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEAYKFIASIYYSLKIYTQAQFF
IEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLVKQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNY
SAFEHLIDIYQRLGMHDKIRHLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL
ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKDLEFYNIALEESFFASNFRNF
LKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIWPDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSR
ILDFYDVVSFDVRKSLFYKYGYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY
NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSYDVGGVNYLSNALNSLSKDFH
DYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGALNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSST
FLKDYVQEGATVLIKR

Sequences:

>Translated_656_residues
MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEAYKFIASIYYSLKIYTQAQFF
IEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLVKQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNY
SAFEHLIDIYQRLGMHDKIRHLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL
ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKDLEFYNIALEESFFASNFRNF
LKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIWPDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSR
ILDFYDVVSFDVRKSLFYKYGYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY
NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSYDVGGVNYLSNALNSLSKDFH
DYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGALNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSST
FLKDYVQEGATVLIKR
>Mature_656_residues
MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEAYKFIASIYYSLKIYTQAQFF
IEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLVKQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNY
SAFEHLIDIYQRLGMHDKIRHLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL
ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKDLEFYNIALEESFFASNFRNF
LKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIWPDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSR
ILDFYDVVSFDVRKSLFYKYGYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY
NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSYDVGGVNYLSNALNSLSKDFH
DYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGALNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSST
FLKDYVQEGATVLIKR

Specific function: Unknown

COG id: COG0457

COG function: function code R; FOG: TPR repeat

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 76396; Mature: 76396

Theoretical pI: Translated: 8.23; Mature: 8.23

Prosite motif: PS50005 TPR ; PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
1.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEA
CCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHH
YKFIASIYYSLKIYTQAQFFIEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLV
HHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
KQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNYSAFEHLIDIYQRLGMHDKIR
HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
HLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKD
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEFYNIALEESFFASNFRNFLKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEC
PDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSRILDFYDVVSFDVRKSLFYKY
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY
CCHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCC
NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSY
CCCCCCEECCCHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEE
DVGGVNYLSNALNSLSKDFHDYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEECCCCCEEECCEEEEEECCC
LNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSSTFLKDYVQEGATVLIKR
CCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC
>Mature Secondary Structure
MNFNWFLMLFLFNFSVLLGSDTTALGHYQRANEYYLSKRYYDAIDELVEAIKINPNYYEA
CCCHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCHHHH
YKFIASIYYSLKIYTQAQFFIEKASKMSNEDTEYKILYANILLKNDKIDQAKKIYSEVLV
HHHHHHHHHHHHEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHH
KQRNNIDALVGLASIFEKNGLFIAAANYYLSILDYSQNNYSAFEHLIDIYQRLGMHDKIR
HHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH
HLINKVRVNFLSFPDFHKRVAEFYISINNLGLAEKYALNYLALIESSYKDFGVVDAYRLL
HHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH
ALVYLHEFKYEDAIEALQKAILVNKDSDELYYLLGYSYLRFGDIEKAILNLERAKNLKKD
HHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCEEEEECCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
LEFYNIALEESFFASNFRNFLKNNSNARISKHYENEGLKAFKSLNLNKALFNAKNAVDIW
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCEEEC
PDNDSARFLLSKIYKLMNLDIMAYEQLFYLAKQRNSTDSRILDFYDVVSFDVRKSLFYKY
CCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYKSIADFNKLYDDRVVYKMAIFTQSENKFFGANDLILRYAERVLERNLNMEIVNYNFDY
CCHHHHHHHHHHCCHHEEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCC
NKNRDYLINNFSEGFSYSRNNNLDLFLIFDFKADILKNTATLVVNIFSGKTGIKLVSFSY
CCCCCCEECCCHHCCCCCCCCCEEEEEEECCCHHHHCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEEEE
DVGGVNYLSNALNSLSKDFHDYLPKKGKILQIKNDDALINLGQVNGVVKGDVFLILKEGA
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCEEEECCCCCEEECCEEEEEECCC
LNSDTRDSGFIVYKKSDILGEILIEDISDYISRGIVKSSTFLKDYVQEGATVLIKR
CCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA