Definition Flavobacterium johnsoniae UW101 chromosome, complete genome.
Accession NC_009441
Length 6,096,872

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The map label for this gene is 146298791

Identifier: 146298791

GI number: 146298791

Start: 1173890

End: 1175086

Strand: Direct

Name: 146298791

Synonym: Fjoh_1030

Alternate gene names: NA

Gene position: 1173890-1175086 (Clockwise)

Preceding gene: 146298790

Following gene: 146298796

Centisome position: 19.25

GC content: 27.65

Gene sequence:

>1197_bases
ATGAAAAACATTTTATTACTTAAATTAAATAATGAAAGACTAAGAGAGATTTTATTTTTTTTAGGAGTCTTATTATTGAT
AATAATTCCAAAAGGAGGATTTAAGATTGCCGGAATTCCTTTGACATGGGGATATTTATATCTGGGTTTTTTATTAATTC
TTTCGACAATTATTATAGTCAGCAAATATAAATTCCCGGTTAACAGCCGGCATTTTATGTGCTATGTGGCAACTTTACCA
TTTGTGGTATATTTTTCACTTCATTTATTAATATTTGGATACGAAGGTTCAACGGGTAATTTTATTGCTTTCTACATCAG
CTTTGTTTTCCTGCCTTTTTTATTTTATATTATTTTAGGATATTTTCTAACTAAAATAAATCATGATTATATTGAAAAAA
TAATAGCTAATGCTGTTTTTCTAATCTCTGTTTATGGTATTTTCTTGTTTTCATACAAACAGATTTATGGTCATTTTTTA
GAAATTCCCTATATAACGGTTAATGCTGATGATTTGGGAGAGCTGGCAAGATCTAAATTTAATCAAAGAGGTTCTATTGC
TAAATTAATCTCAACGTATAATAATGGAAATATTTTTGGAGTATGTACTTTAATGCTTTTTCCTGTTTTTTATAAAAAAA
CAACATCAAAAATTAAAATTTTCATTGTTATCCTGGCTTTACTATTAACCTTATCAAGAACAGTTTGGATTGGTTTACTT
TTCTTCTTTTTAATTCTTTATAGGAATAAATTATATCAATTAGCTAAAATTTATCTTGCAGGAGCGATTTTACTTTTTGT
TATTGGATCAGTTCTTATGACCAGATATTTTCAATATGGTTCCCTGGAAGGATTTATTCTAGACTCAAATCTTGGCGGAA
GGATTTTACAAATTAGAAAAGTAAATGATATCACACTTTTTGGAAATGGCCCTTATACGATAATTGATGAAATTGTGTAC
TTATCTATATTTAGACAATTTGGTATTGTTGGTTTATTTTTATTTTGCGTTTCTTTTTTTGCTCCGGTATATATTTTTTT
ACAAACTAAAAATAACAACCAGGTTTACTTATTAGGAATATTAACGTATTTATTTGTTTGTTTAAGCGACGGATGTATGC
TTTTAATACCTACACTAGTTTTTTTCTATTTCATTTGTACGATGGCCTTCATTCGTCACAACAGAGCCGAGGAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGCTTTTATTAGTATAGTATTTTTAAAAAGATTTTATAAAAAACAACAGGCATTACAAGCCTAATTATTATCGTAGGC
AGTCATTTCTTATTTTTAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AACATCGCAGAGAAGAAAAATGTAAATTCCGTATTGACGAACCAGAATATTTTCGGTCAAAAAAGAAAAAGAAAACAACA
GAGAAATCGAAAAATATAAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 398; Mature: 398

Protein sequence:

>398_residues
MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIVSKYKFPVNSRHFMCYVATLP
FVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILGYFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFL
EIPYITVNADDLGELARSKFNQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL
FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRKVNDITLFGNGPYTIIDEIVY
LSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGILTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE

Sequences:

>Translated_398_residues
MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIVSKYKFPVNSRHFMCYVATLP
FVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILGYFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFL
EIPYITVNADDLGELARSKFNQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL
FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRKVNDITLFGNGPYTIIDEIVY
LSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGILTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE
>Mature_398_residues
MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIVSKYKFPVNSRHFMCYVATLP
FVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILGYFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFL
EIPYITVNADDLGELARSKFNQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL
FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRKVNDITLFGNGPYTIIDEIVY
LSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGILTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 45894; Mature: 45894

Theoretical pI: Translated: 9.66; Mature: 9.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.5 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
1.5 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIV
CCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKYKFPVNSRHFMCYVATLPFVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILG
HHCCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFLEIPYITVNADDLGELARSKF
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHH
NQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL
CCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEE
VNDITLFGNGPYTIIDEIVYLSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGI
ECEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEHHH
LTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MKNILLLKLNNERLREILFFLGVLLLIIIPKGGFKIAGIPLTWGYLYLGFLLILSTIIIV
CCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SKYKFPVNSRHFMCYVATLPFVVYFSLHLLIFGYEGSTGNFIAFYISFVFLPFLFYIILG
HHCCCCCCCCHHEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFLTKINHDYIEKIIANAVFLISVYGIFLFSYKQIYGHFLEIPYITVNADDLGELARSKF
HHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECHHHHHHHHHHHH
NQRGSIAKLISTYNNGNIFGVCTLMLFPVFYKKTTSKIKIFIVILALLLTLSRTVWIGLL
CCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FFFLILYRNKLYQLAKIYLAGAILLFVIGSVLMTRYFQYGSLEGFILDSNLGGRILQIRK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCEEEEEE
VNDITLFGNGPYTIIDEIVYLSIFRQFGIVGLFLFCVSFFAPVYIFLQTKNNNQVYLLGI
ECEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEHHH
LTYLFVCLSDGCMLLIPTLVFFYFICTMAFIRHNRAEE
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA