Definition Clostridium difficile 630 chromosome, complete genome.
Accession NC_009089
Length 4,290,252

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The map label for this gene is mleN [H]

Identifier: 126700349

GI number: 126700349

Start: 3170622

End: 3172064

Strand: Direct

Name: mleN [H]

Synonym: CD2734

Alternate gene names: 126700349

Gene position: 3170622-3172064 (Clockwise)

Preceding gene: 126700348

Following gene: 126700351

Centisome position: 73.9

GC content: 32.02

Gene sequence:

>1443_bases
ATGAAAATGAATACAGAAAGAAAAATACCTTCATTTAGATATTCCTTGTTAGTAATGCTTGCAATAATAGCTCTAACATC
AGTTGGTATAGTTGTATTTAATGCTTCTATAACTACAATGTTTTTACTTTCATGGCTTATAGTAGTTCCTGCAGCCATGA
AACTTGGTTATACTAATGATGAAATAGAAGCTTTTGGATTTGAAGTTGGCAAAGATGCCTTTCAATCAAACTTAATTATA
CTTTCTGTTGGTGTACTAATAGCAGCTTGGATAGCTGCTGGTACAATACCAACAGTAGTATATAGTGGACTAACAATAAT
AACCCCTAAATATTTTCTGCTTACAACATTAATCGTATGTTCATTAACTTCTGTTGCTACTGGTACATCTTGGGGGACTC
TTGGAACTTCTGGTATAGCAATGATGAGTATTGGTACTAGTATGGGTATTCCTCTTGGTTTAACAGCTGGTGCAGTCATT
TCTGGTGCTTTCTTTGGAGATAAGATGTCACCTCTATCAGATTCTACAAACTTAGCTGCAGCAGTTTGTAAGACAGATGT
AATTACACATATGAAGCATATGTTTTATACCACAGGACCTGCATACGTAATATGTATAGTTCTGTATACAGTAATTGGAT
TTAAGTATTCAAATAATACTATAGACTATGTTCAAATAAATCAAATCAAGGATGTATTAAATTCAAACTTTCATATTGGT
TTAGTAGCAATGATTCCAATAATATTTTTATTATTACTTTTATTGCTACAAAAGCCACCCATTATATCTATACTAAGTTC
AGCTATCATGGGACTTATTATAGCAGTATTTCAAGAAGGAGAAAAAATAGGTGATGTTTTAAATTACATGCTATCAGGAT
TTACTATAGATACTGGATTTGTCTATGCCGACAAACTATTAAATCGTGGTGGAATAATGAGTATGGCTGAAACCGTTTTA
CTAGTATTTGTAGTTTTCGTTATTGCTGGTATTCTCCAAAAAACTGGATTCTTAGAAGTACTGCTTCAACCTCTTATAAC
TAAAATAGGAAAATCAAGAACTAAATTGGTTGGGTCTACTTTTATAGTAAGCTACTTTGCAAATGCATTTAGTTCATCAA
TGATGTTCACTTCTGTATTTGTCGGAACTCTAATGTCTCCAATATACAAAGAATTTAAATTAAAACCACAAAATCTATCT
AGAATTATAGAAGATACAGCTACACTTGGTGGTCCATTAATACCATGGAATTCAAATGCTGTTTTCTGTGCTCAGACTCT
TGGTGTAAGTCCACTAGAATTTATTCCATATTGTTTCTTAAGTTGGATTACACCTATAATTTCATTTATTTATGGTGTAA
CTGGTTTTACTATGCTTACATACACAGATGATGAAATTGAAGAGTTAGAAATATTTGATACTGCTCAGAGAAGAGTTGAT
TGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAAAGAATAAACTTAGCTTGTCCAAGAAGTATGCTTGAAGAAGCTCTTATAAGAATAAAAAATGCAATTAACTAAAAAT
ATTTAAGGAGAATTTGCACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATATGAAATTTGAATACTATTACTTAATTCAGGATATTGCAGGTATATTATTGGCATTTATAGGACTTAGAATGTCTATT
ATTGGATTTAGGATACTTTC

Product: malate-2H(+)/Na(+)-lactate antiporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 480

Protein sequence:

>480_residues
MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTNDEIEAFGFEVGKDAFQSNLII
LSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVCSLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVI
SGAFFGDKMSPLSDSTNLAAAVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG
LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGFVYADKLLNRGGIMSMAETVL
LVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGSTFIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLS
RIIEDTATLGGPLIPWNSNAVFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD

Sequences:

>Translated_480_residues
MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTNDEIEAFGFEVGKDAFQSNLII
LSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVCSLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVI
SGAFFGDKMSPLSDSTNLAAAVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG
LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGFVYADKLLNRGGIMSMAETVL
LVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGSTFIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLS
RIIEDTATLGGPLIPWNSNAVFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD
>Mature_480_residues
MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTNDEIEAFGFEVGKDAFQSNLII
LSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVCSLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVI
SGAFFGDKMSPLSDSTNLAAAVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG
LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGFVYADKLLNRGGIMSMAETVL
LVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGSTFIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLS
RIIEDTATLGGPLIPWNSNAVFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD

Specific function: Couples proton uptake and Na(+) efflux to the substrate- product malate/lactate antiport, in an electroneutral malate- 2H(+)/Na(+)-lactate exchange. Plays a role in supporting growth to high density on malate at reduced protonmotive force [H]

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the nhaC Na(+)/H(+) antiporter family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR004770
- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52205; Mature: 52205

Theoretical pI: Translated: 5.79; Mature: 5.79

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
5.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTND
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
EIEAFGFEVGKDAFQSNLIILSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVC
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHH
SLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVISGAFFGDKMSPLSDSTNLAA
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH
AVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCEEECCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCH
LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEECHH
VYADKLLNRGGIMSMAETVLLVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGST
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
FIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLSRIIEDTATLGGPLIPWNSNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
VFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD
EEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKMNTERKIPSFRYSLLVMLAIIALTSVGIVVFNASITTMFLLSWLIVVPAAMKLGYTND
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC
EIEAFGFEVGKDAFQSNLIILSVGVLIAAWIAAGTIPTVVYSGLTIITPKYFLLTTLIVC
HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHH
SLTSVATGTSWGTLGTSGIAMMSIGTSMGIPLGLTAGAVISGAFFGDKMSPLSDSTNLAA
HHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHH
AVCKTDVITHMKHMFYTTGPAYVICIVLYTVIGFKYSNNTIDYVQINQIKDVLNSNFHIG
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCEEECCCEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCH
LVAMIPIIFLLLLLLLQKPPIISILSSAIMGLIIAVFQEGEKIGDVLNYMLSGFTIDTGF
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCEEECHH
VYADKLLNRGGIMSMAETVLLVFVVFVIAGILQKTGFLEVLLQPLITKIGKSRTKLVGST
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
FIVSYFANAFSSSMMFTSVFVGTLMSPIYKEFKLKPQNLSRIIEDTATLGGPLIPWNSNA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
VFCAQTLGVSPLEFIPYCFLSWITPIISFIYGVTGFTMLTYTDDEIEELEIFDTAQRRVD
EEEEHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8969508; 9384377; 10903309 [H]