| Definition | Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_008312 |
| Length | 7,750,108 |
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The map label for this gene is 113475229
Identifier: 113475229
GI number: 113475229
Start: 2330508
End: 2332670
Strand: Reverse
Name: 113475229
Synonym: Tery_1536
Alternate gene names: NA
Gene position: 2332670-2330508 (Counterclockwise)
Preceding gene: 113475234
Following gene: 113475226
Centisome position: 30.1
GC content: 30.84
Gene sequence:
>2163_bases ATGAAAACTCACTCTTTTTTCAAACCGTTAAATACTAAATTAAATTCACAGCCTAGCTTTTTGACTAATATAATTATTTT CTTGACAGTAGTTTTAATAATTATTGCTATAACATCAATATATGTATCCAATGAAGATACAATTTATTGGTGGGACTTTG TAGGATATCAGAATGCTGCGAATAATTTAACAAATTTATTTAGAGTATCCTTTCAAAGAGCTATTGATGATATTAATGGT TCTTTATCTCAACAGAAAAATTATCTAATTACATTGCCATTAATCCCATTTCTCTATATTTTTGGCAACCAAAGAATTAT CTATATCTTGAGTATTAATCTTATCTATTTATTACCCTTTAGTTTATTACTAGGAGCAATAGCTATAAAATTAATTCCCG TTCATTCTCGATGGGTATTTTGGTCAACTGTAGCGATCGCTTTACTAATACCTATGAGCTGGAGCCCGAGTTTAAGAGGA TATCCCGATATTGGGGCAACTTTATTTATTTTATTGGGGGCTTTATTTTACTTAAAAAATATTAGATTAACTACTTGGTG GCAACTTCCTATTATTGGATTTTGTCTAGGAATATCTATAGTTTTAAGACGACATTTTGCTTATAGTGTGATCGCCTTTA TAGGAGCTATTAGTTGTCAAATTATCCTCGACTCTTTAACTAATTTCAAATTTAGTAAAACTTCTGTGAAAAGACTTTTA GAAGGTGCTATAAAAATTAGTCTTATTTCCCTAACTTGTTTCCTAACTATATCAATTTTTGCCTGGGGCTTTATCCAAAA CTCTTTAACAGAAAATTATCGAACTCTTTATGCTGCCTGGAGCTTATCAATACCTGACATATTCTGGCGTTACAGCTGTT TCTATGGCTTAATAACTTTACTATTAGTTGCCATAGGATTTTTTGTAGGAGTTATGAGAAAATTTTTAATTCCATCTACT ACTATTTTTCTCTTATTATTCGGAATATTTTCTGTAGCTGAATGGTTGATTTTACTCCGCTATGGCAATATTCATTACTC TCTACATTTGACACCGATAGTAGTTTTAGGACTATCCTCATTTATTTGGATAACTATTCATACTTTTCGACGCAAAACTA GATTAATTATTTTTAGTATTGCGGGAATATATTTAATTATTAATCTCATCTTTGGTTTAACTCCTATCGGTAAATTTAAT AACCCTCTACGCCCATTATTTGCTAGTAACTTTTCCCCATTAATTCGTTCCGACTACAATCAAGTTTTACAGTTGACTGA TTATCTAAATAAATTAGCACCGAATCAAGAATTAGTGTATGTAGCTGCTTCTTCAAATCAGTTTAATGCTAATATTATTA GAAACGCTAACCGGATAATTAATCCGAAAAATTGGTCGAACTTAAAAGCAATAAGTAAACCACATATTGACACCCGTGAT ACTTACCCATTGCCAGAATTATTAGCAGCACAATATATAGTCATCGCTCATCCATTTCAGAGAGTATTATTAACTGATGA ACAAGTCTTAAAACCAGGGCAACAAGATTTAGTCAGATTTGTCTATGATGCCTTTACTCAAAATTTATCTATTAGTCAAG ATTTCCAAAAATTGCCAGAAGAATTTGTTTTAGATGGAGGAGTAACTGTTAGTTTTTATCAAAGAATTCGTCCTACTTCT ATAAGCACTGCCCTACAAACTTTATCAGCAATGCAAAAACAAGTTCCCCAGCGTCCGGGTAGACAGTTAGACTGGATAAG TTTAAATCAATCTCCTTATATTACTTATAACTATTCAGCAGTTACTCAAGTTTCAGATAGTGCTTATAATTTAATGACAG ATCCTTCAGATATTACTAAGCAAACATCTAAATATTTTCTCTATTTAGGGCAATTATCTTCTTCTATAAAAATCACTGGT AAGCTAGATTTTCTTCATCAAGAATGTAATGGTTTATCTCTTAAGTTTTCTATATTAGATGACCAAGGAATTTTGCTTGA TACAAATGTCAATAATTATTTTCCTGGAGTTGATTCTGATTTTATTTTTTCTCTAGCAGGTAAAAATCCTGTTTATCTAC TTCTAGAAAATATCAGTATTGACGGTGATAATTTAACTGATAAATGTGGATGGATAATTAATCATCTAGTTGTTGATGAC TAG
Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAAAAAATCCAGGGATAATTTATAATATTATGTATATTTTCTCTTTAAGAAATTTCCATGGAATGTCTATACCTATTCC TCAGTTATGAGTTCGATCTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 720; Mature: 720
Protein sequence:
>720_residues MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAANNLTNLFRVSFQRAIDDING SLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPFSLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRG YPDIGATLFILLGALFYLKNIRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITLLLVAIGFFVGVMRKFLIPST TIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSSFIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFN NPLRPLFASNFSPLIRSDYNQVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPEEFVLDGGVTVSFYQRIRPTS ISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSAVTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITG KLDFLHQECNGLSLKFSILDDQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD
Sequences:
>Translated_720_residues MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAANNLTNLFRVSFQRAIDDING SLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPFSLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRG YPDIGATLFILLGALFYLKNIRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITLLLVAIGFFVGVMRKFLIPST TIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSSFIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFN NPLRPLFASNFSPLIRSDYNQVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPEEFVLDGGVTVSFYQRIRPTS ISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSAVTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITG KLDFLHQECNGLSLKFSILDDQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD >Mature_720_residues MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAANNLTNLFRVSFQRAIDDING SLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPFSLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRG YPDIGATLFILLGALFYLKNIRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITLLLVAIGFFVGVMRKFLIPST TIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSSFIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFN NPLRPLFASNFSPLIRSDYNQVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPEEFVLDGGVTVSFYQRIRPTS ISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSAVTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITG KLDFLHQECNGLSLKFSILDDQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 81945; Mature: 81945
Theoretical pI: Translated: 9.36; Mature: 9.36
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 0.7 %Met (Translated Protein) 1.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 0.7 %Met (Mature Protein) 1.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAA CCCCCHHCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEECCCHHHH NNLTNLFRVSFQRAIDDINGSLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPF HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHH SLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRGYPDIGATLFILLGALFYLKN HHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC IRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH LLVAIGFFVGVMRKFLIPSTTIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSS HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEEHHHHHHHHHHH FIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFNNPLRPLFASNFSPLIRSDYN HHEEEEHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHH QVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPE CCCCHHHHHHCEEEEECHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCH EFVLDGGVTVSFYQRIRPTSISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSA HHHHCCCCEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEECHH VTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITGKLDFLHQECNGLSLKFSILD HEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCEEEEEEEC DQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD CCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MKTHSFFKPLNTKLNSQPSFLTNIIIFLTVVLIIIAITSIYVSNEDTIYWWDFVGYQNAA CCCCCHHCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCEEEEEEECCCHHHH NNLTNLFRVSFQRAIDDINGSLSQQKNYLITLPLIPFLYIFGNQRIIYILSINLIYLLPF HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHCCCEEEEEEEHHHHHHHHH SLLLGAIAIKLIPVHSRWVFWSTVAIALLIPMSWSPSLRGYPDIGATLFILLGALFYLKN HHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC IRLTTWWQLPIIGFCLGISIVLRRHFAYSVIAFIGAISCQIILDSLTNFKFSKTSVKRLL CCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHH EGAIKISLISLTCFLTISIFAWGFIQNSLTENYRTLYAAWSLSIPDIFWRYSCFYGLITL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHH LLVAIGFFVGVMRKFLIPSTTIFLLLFGIFSVAEWLILLRYGNIHYSLHLTPIVVLGLSS HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCEEEEEEHHHHHHHHHHH FIWITIHTFRRKTRLIIFSIAGIYLIINLIFGLTPIGKFNNPLRPLFASNFSPLIRSDYN HHEEEEHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHHH QVLQLTDYLNKLAPNQELVYVAASSNQFNANIIRNANRIINPKNWSNLKAISKPHIDTRD HHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC TYPLPELLAAQYIVIAHPFQRVLLTDEQVLKPGQQDLVRFVYDAFTQNLSISQDFQKLPE CCCCHHHHHHCEEEEECHHHHHHCCCHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCH EFVLDGGVTVSFYQRIRPTSISTALQTLSAMQKQVPQRPGRQLDWISLNQSPYITYNYSA HHHHCCCCEEEHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEECHH VTQVSDSAYNLMTDPSDITKQTSKYFLYLGQLSSSIKITGKLDFLHQECNGLSLKFSILD HEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEEEHHHHHHHCCCCEEEEEEEC DQGILLDTNVNNYFPGVDSDFIFSLAGKNPVYLLLENISIDGDNLTDKCGWIINHLVVDD CCCEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA