Definition Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome, complete genome.
Accession NC_008312
Length 7,750,108

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The map label for this gene is 113475066

Identifier: 113475066

GI number: 113475066

Start: 2035337

End: 2037400

Strand: Direct

Name: 113475066

Synonym: Tery_1338

Alternate gene names: NA

Gene position: 2035337-2037400 (Clockwise)

Preceding gene: 113475062

Following gene: 113475079

Centisome position: 26.26

GC content: 29.94

Gene sequence:

>2064_bases
ATGTGGCAGTTTAAAAAATATAGTTGGTATTTTTCCCTATCCTTATTTACCGTTATAGTTATTGGTTCATTCATTGCCAG
AGGATATACTTTTCCCGTAGGAAATCATTACACTCATGTTCCTCAAATCAAATCAATGTTGAATTCTGAACTCTATATAA
ATGACTACTACGTTCAGGAAATGTTGCAGTTTACTCCTAGATATTACTATCAATACTTGGTTTATTTTCTATCCAAAATT
ACTGGCAGTCTTTCCCTAACTTATTTAATTTATTATCTGACTTCATTTATTAGTTTTATTTTGGGTTTATTTGCTCTAAG
TAAAATTTTTACTCCTTCTAAACTATCAGCAGCAGTTTTAATTTTTCTGAGTTTAAAATCTTATACTTTAATTGGATATT
TAAAACTTTTTCCTAATACTCCCATACCTGCCACATTTGCTATGAGTTTTACTGTTTGGGGTATTTATTTCTGTTTTCAG
CAAAGATGGATAATTGGTTATTTATTTTTTGGTATTGCTTCAATTTTACAATTTTTGGTCGGTGTTTTGCCTGGAATTAT
AATGATTCCTATTATGTTAATTGAAACTATAAAAAAATATAATTATAAACAAGTAAAACACCAATTTATAGTACTTCTAT
CCTCTAGAATACTTAAAGTTAAAAGTATTACTAAATTGATTGATTTCTGGTTTCGTTATGAATTGATTTTTTTGGTAATT
ATACCCTTAGTTATTTGGTTGAGTTTTGCTTGTTTAGTTTATCTACCTATGTTATTAACTGGCACTACTAGTACCGATCA
ATTAACTAATGAAGAATTTGTTTTTATCTATGGTTGGGTAAGGAATCCTCATCATATTATTCCTACTTATTGGAATTGGA
AAAGTAGGTTAGATTTTGTATGCTTTATTCTGGGTGGTTGTTTGTGTATTAATAAAATTGATATTGCCAAATCGAAATAT
TTCTTGCACCAGCCAATAACAGAGAAAAAACAAATCTACAGATATCCTTTTTCAGAGGTAGAAATAGGAAATATAAAAGA
AAAAAAGGTCGGGGAAAATTTTTGCATTTCTAATAATATGAGATGTTTAGAGAAATGGAAGTTTTATCTAATTGTTGCTG
AGTCAATTTTTGCTTTGTTTTTAGGTTATATTTTTCTGGAAGTTTACCCCTTGGCTTTATTTGCTAAGTTACAGTTGGCA
AGAACTGTTCCTTTTGCTCAATTGATAATATTTATTGCTGTTGGTATTTTGGTTAATCAGTTATATCAACAAAAAAAATT
AGGAATTGCTTTACTCTTAATAATCTCTCTAATTTTGCCTATACCTTATCAGGGCATTTGCTTTTTTATCTTATCGGTGG
GATTGTTTTTTCTGGAGAAATGGCACCACAAACTAATAATTTTTTTGATGCTGTTAGTAGGGTTAATATTTTACTTCTTA
CATCCATCCATAGATTTAATTGTTAATCGTTTGTTTGTTATGCCTGGTTTATTTTTGGTTTTGATATTTCCATTTATTTT
AGATGAGATTGATATAGCGATCGCTCAGAAAAAGTTAATGACTTATTGTTTAGCGCTATCCACAATTTTAGTATTGATTT
TAGGATTATTTGAAGCATTGCCAGGAAAAATTTTGGAGGTATTTGAGCAACAGGTAAAATTTAACAGAGTTCCCCAAGAT
GAAGTTACAAAACTAGCTTTAAGATTTAGGGAAATTAGCAATAAAGATGATGTAATTTTAATTCCTCCATTTGTGTCAAA
TTTCCAGTTTTTTTCGGAAAGAGCAGTTATTGTTGACTTTAAACATTTTCCGCAAACTGATAGGGGAATTAGAGAATGGA
AAAATCGGATGGAAGATGTTTTTGGTGTTCCTTTGAATGATAAGTTAGCGGTGGGAGCCATGGAAACTTTGTTTCAACAA
CAGACTGGAAAAGAATTAGTTAGTGTGGCGAAAAAATATGGGGCTGGATATATTTTGACTAGGGTTAACTGGCATGGAGA
TATTGAAGGAAAGGTTATAGATAAACAAGGAGAATGGGGGATTTTTCAAATAAATTATGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATAAGTCCTAAGTTATAGAAATAGTATTTAGCTATAGGCAATTTAAGAATATTAATTTAATAAATTTTTCTGATTACT
TCTTCTTTGTCTGATAACAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TACAACTTTGATTTGTCAGCCATAATTATAATTATTACTATAGTATAGCAACCCTAAATTATTTGTAAAAAAAAGGTAGG
GGTTTGGTCTTTTTATCCTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 687; Mature: 687

Protein sequence:

>687_residues
MWQFKKYSWYFSLSLFTVIVIGSFIARGYTFPVGNHYTHVPQIKSMLNSELYINDYYVQEMLQFTPRYYYQYLVYFLSKI
TGSLSLTYLIYYLTSFISFILGLFALSKIFTPSKLSAAVLIFLSLKSYTLIGYLKLFPNTPIPATFAMSFTVWGIYFCFQ
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IPLVIWLSFACLVYLPMLLTGTTSTDQLTNEEFVFIYGWVRNPHHIIPTYWNWKSRLDFVCFILGGCLCINKIDIAKSKY
FLHQPITEKKQIYRYPFSEVEIGNIKEKKVGENFCISNNMRCLEKWKFYLIVAESIFALFLGYIFLEVYPLALFAKLQLA
RTVPFAQLIIFIAVGILVNQLYQQKKLGIALLLIISLILPIPYQGICFFILSVGLFFLEKWHHKLIIFLMLLVGLIFYFL
HPSIDLIVNRLFVMPGLFLVLIFPFILDEIDIAIAQKKLMTYCLALSTILVLILGLFEALPGKILEVFEQQVKFNRVPQD
EVTKLALRFREISNKDDVILIPPFVSNFQFFSERAVIVDFKHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQ
QTGKELVSVAKKYGAGYILTRVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD

Sequences:

>Translated_687_residues
MWQFKKYSWYFSLSLFTVIVIGSFIARGYTFPVGNHYTHVPQIKSMLNSELYINDYYVQEMLQFTPRYYYQYLVYFLSKI
TGSLSLTYLIYYLTSFISFILGLFALSKIFTPSKLSAAVLIFLSLKSYTLIGYLKLFPNTPIPATFAMSFTVWGIYFCFQ
QRWIIGYLFFGIASILQFLVGVLPGIIMIPIMLIETIKKYNYKQVKHQFIVLLSSRILKVKSITKLIDFWFRYELIFLVI
IPLVIWLSFACLVYLPMLLTGTTSTDQLTNEEFVFIYGWVRNPHHIIPTYWNWKSRLDFVCFILGGCLCINKIDIAKSKY
FLHQPITEKKQIYRYPFSEVEIGNIKEKKVGENFCISNNMRCLEKWKFYLIVAESIFALFLGYIFLEVYPLALFAKLQLA
RTVPFAQLIIFIAVGILVNQLYQQKKLGIALLLIISLILPIPYQGICFFILSVGLFFLEKWHHKLIIFLMLLVGLIFYFL
HPSIDLIVNRLFVMPGLFLVLIFPFILDEIDIAIAQKKLMTYCLALSTILVLILGLFEALPGKILEVFEQQVKFNRVPQD
EVTKLALRFREISNKDDVILIPPFVSNFQFFSERAVIVDFKHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQ
QTGKELVSVAKKYGAGYILTRVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD
>Mature_687_residues
MWQFKKYSWYFSLSLFTVIVIGSFIARGYTFPVGNHYTHVPQIKSMLNSELYINDYYVQEMLQFTPRYYYQYLVYFLSKI
TGSLSLTYLIYYLTSFISFILGLFALSKIFTPSKLSAAVLIFLSLKSYTLIGYLKLFPNTPIPATFAMSFTVWGIYFCFQ
QRWIIGYLFFGIASILQFLVGVLPGIIMIPIMLIETIKKYNYKQVKHQFIVLLSSRILKVKSITKLIDFWFRYELIFLVI
IPLVIWLSFACLVYLPMLLTGTTSTDQLTNEEFVFIYGWVRNPHHIIPTYWNWKSRLDFVCFILGGCLCINKIDIAKSKY
FLHQPITEKKQIYRYPFSEVEIGNIKEKKVGENFCISNNMRCLEKWKFYLIVAESIFALFLGYIFLEVYPLALFAKLQLA
RTVPFAQLIIFIAVGILVNQLYQQKKLGIALLLIISLILPIPYQGICFFILSVGLFFLEKWHHKLIIFLMLLVGLIFYFL
HPSIDLIVNRLFVMPGLFLVLIFPFILDEIDIAIAQKKLMTYCLALSTILVLILGLFEALPGKILEVFEQQVKFNRVPQD
EVTKLALRFREISNKDDVILIPPFVSNFQFFSERAVIVDFKHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQ
QTGKELVSVAKKYGAGYILTRVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80126; Mature: 80126

Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46

Prosite motif: PS00430 TONB_DEPENDENT_REC_1

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
1.9 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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EEEECCCCCCEEECCCCCEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCEEEHHHHHHH
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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
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CHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHHHHHCCCEEEEEE
KHFPQTDRGIREWKNRMEDVFGVPLNDKLAVGAMETLFQQQTGKELVSVAKKYGAGYILT
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEE
RVNWHGDIEGKVIDKQGEWGIFQINYD
EEEECCCCCCEEECCCCCEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA