Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 226950476

Identifier: 226950476

GI number: 226950476

Start: 3475578

End: 3477029

Strand: Direct

Name: 226950476

Synonym: CLM_3452

Alternate gene names: NA

Gene position: 3475578-3477029 (Clockwise)

Preceding gene: 226950475

Following gene: 226950482

Centisome position: 83.64

GC content: 23.48

Gene sequence:

>1452_bases
ATGAGAAAAAAATTTATATTTAGATTTACTACTTTTATAATAATACTATTGCTTATTATATCTATAATAACTCCTGCATT
TATAATAAAAACTGGCCATCGAGAAAAATTGATTGAAGGTTTGTATGGACATGAAGAGAACTCATATGACGTTGTATTAT
TAGGCTCAAGTCATATGAATGGTTCTATAAATCCTAATATCTTATGGAACGAACATGGCATAACTAGCTTTAATTATGGA
ACTGGAGGCCAACCAATAGATGTAACTTACTATTTATTAAAAGAAATATTAAAAAAACAAGATAATCCAATTGTTGTAAT
TGATTTATATTATCTAGGATTAACAGATGAGTTTGGTAAAGATGAGTATATTAGATATGTTCTTGATAATATGAAGTTTT
CTATTAATAAAATAAAAGCTATTATTAATACTACACCTAAGAGTCAATGGGTATATTATTTTTTCCCAATTTTAAAATAT
CATTCTAGATGGAAAGAATTACAAAAAGAGGATTTTAAATTTGATACTAAAAGTAGTTATTATGCAAAAGGATTTAGTGC
TGGACGTAATAAATACAATAAGGAAAATCTATCAAACACTAGTACAAATGAAAAATCAAATTTGCCATCTAAATCAAAAG
ATTATCTATACAAAATTATTAATTTATCCAAAAAAGAAAACTTTAAGCTAGTATTTACTAATGCACCACATGATTATACA
AGTACACATGCTTTAGATAACTGGCATAAAGAACCTGCAAAAATGTTTAATGAAGTAGCAGAAATTGCAAAGAAAAATAA
TATTCCTTTTATAAATTATTGTGATATGATTGATGAAATAAATTTTGATTTTAAATCGGATATGAATAATGAAGGTCATG
TGAATATTTGGGGAGCAGATAAACTATCAACACATTTAGGAAATTTTTTAAAAGAAAATTACGAACTAAAAGATCACCGT
TATGATGATAAATACAAGCAATGGAATTTAGATTATATTTATTATTCTCAAGTACAGAAATATAATAATCTAATTTCAGA
AAAAGATGTAAATAAATATATTGCATTACTTAAAGATGAAAATTATATTGTAAATATAAGCTGTAATAATTATACTTCAG
CAAATATAAACACTTCTATAGATAAAGATTTACGGGAACATTTAGGTATAAAAATAAACTCAACTAATAGTAATAATTAT
ATTGCTATTATAAATAATAATAAGGTAGTATTTGAAGAACAAAGTAGTTCTATACTTTCTAAAGAACTCTGCTTAGAAAA
TAATATTTTATTAAAAACTACAACCTCAAGTGATAAAAATATGCCAAGTGTAATATTTAACGGAAAAGAATATTCAAATA
AATATAATAAATTTAATATTGCTGTTTATGACAAAGTATTAAATAAAGTTATAGACAGTGTATACTTATCTAATAATTTA
ATTATTAGATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTTATCTGCTATTTTCTTTGTGCTAATATTAGGTATATATGGAGCAGGGTATGATGCAAATCAATTTATTTATTTTC
AGTTTTAAGGAGAATTAGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTATATTTAAGATCCTTCAGAAATAATCTCTGTAACTAAGAAATTTAAAATATTGTAAAAGTTTATAATCTATAAATTC
AAAAGAGATTAGATATATAA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 483; Mature: 483

Protein sequence:

>483_residues
MRKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPAFIIKTGHREKLIEGLYGHEENSYDVVLLGSSHMNGSINPNILWNEHGITSFNYG
TGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGKDEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKSQWVYYFFPILKY
HSRWKELQKEDFKFDTKSSYYAKGFSAGRNKYNKENLSNTSTNEKSNLPSKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
STHALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGADKLSTHLGNFLKENYELKDHR
YDDKYKQWNLDYIYYSQVQKYNNLISEKDVNKYIALLKDENYIVNISCNNYTSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNY
IAIINNNKVVFEEQSSSILSKELCLENNILLKTTTSSDKNMPSVIFNGKEYSNKYNKFNIAVYDKVLNKVIDSVYLSNNL
IIR

Sequences:

>Translated_483_residues
MRKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPAFIIKTGHREKLIEGLYGHEENSYDVVLLGSSHMNGSINPNILWNEHGITSFNYG
TGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGKDEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKSQWVYYFFPILKY
HSRWKELQKEDFKFDTKSSYYAKGFSAGRNKYNKENLSNTSTNEKSNLPSKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
STHALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGADKLSTHLGNFLKENYELKDHR
YDDKYKQWNLDYIYYSQVQKYNNLISEKDVNKYIALLKDENYIVNISCNNYTSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNY
IAIINNNKVVFEEQSSSILSKELCLENNILLKTTTSSDKNMPSVIFNGKEYSNKYNKFNIAVYDKVLNKVIDSVYLSNNL
IIR
>Mature_483_residues
MRKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPAFIIKTGHREKLIEGLYGHEENSYDVVLLGSSHMNGSINPNILWNEHGITSFNYG
TGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGKDEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKSQWVYYFFPILKY
HSRWKELQKEDFKFDTKSSYYAKGFSAGRNKYNKENLSNTSTNEKSNLPSKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
STHALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGADKLSTHLGNFLKENYELKDHR
YDDKYKQWNLDYIYYSQVQKYNNLISEKDVNKYIALLKDENYIVNISCNNYTSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNY
IAIINNNKVVFEEQSSSILSKELCLENNILLKTTTSSDKNMPSVIFNGKEYSNKYNKFNIAVYDKVLNKVIDSVYLSNNL
IIR

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56498; Mature: 56498

Theoretical pI: Translated: 8.84; Mature: 8.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
1.4 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPAFIIKTGHREKLIEGLYGHEENSYDVVLLGSSHMN
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCC
GSINPNILWNEHGITSFNYGTGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGK
CCCCCCEEECCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCC
DEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKSQWVYYFFPILKYHSRWKELQKEDFKFDTKSSY
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
YAKGFSAGRNKYNKENLSNTSTNEKSNLPSKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
HHCCHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCC
STHALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGAD
CHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCEEEEEECH
KLSTHLGNFLKENYELKDHRYDDKYKQWNLDYIYYSQVQKYNNLISEKDVNKYIALLKDE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEEECC
NYIVNISCNNYTSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNYIAIINNNKVVFEEQSSSILS
CEEEEEEECCEECCCCCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCEEEEECCCEEEEECCCHHHHH
KELCLENNILLKTTTSSDKNMPSVIFNGKEYSNKYNKFNIAVYDKVLNKVIDSVYLSNNL
HHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IIR
EEC
>Mature Secondary Structure
MRKKFIFRFTTFIIILLLIISIITPAFIIKTGHREKLIEGLYGHEENSYDVVLLGSSHMN
CCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCC
GSINPNILWNEHGITSFNYGTGGQPIDVTYYLLKEILKKQDNPIVVIDLYYLGLTDEFGK
CCCCCCEEECCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCC
DEYIRYVLDNMKFSINKIKAIINTTPKSQWVYYFFPILKYHSRWKELQKEDFKFDTKSSY
HHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCH
YAKGFSAGRNKYNKENLSNTSTNEKSNLPSKSKDYLYKIINLSKKENFKLVFTNAPHDYT
HHCCHHHHCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCC
STHALDNWHKEPAKMFNEVAEIAKKNNIPFINYCDMIDEINFDFKSDMNNEGHVNIWGAD
CHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHCCCCHHCCCCCCCEEEEEECH
KLSTHLGNFLKENYELKDHRYDDKYKQWNLDYIYYSQVQKYNNLISEKDVNKYIALLKDE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCHHEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHEEEEECC
NYIVNISCNNYTSANINTSIDKDLREHLGIKINSTNSNNYIAIINNNKVVFEEQSSSILS
CEEEEEEECCEECCCCCCHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCEEEEECCCEEEEECCCHHHHH
KELCLENNILLKTTTSSDKNMPSVIFNGKEYSNKYNKFNIAVYDKVLNKVIDSVYLSNNL
HHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCEEEECCHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
IIR
EEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA