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The map label for this gene is spoVB [H]

Identifier: 226948700

GI number: 226948700

Start: 1662628

End: 1664133

Strand: Reverse

Name: spoVB [H]

Synonym: CLM_1598

Alternate gene names: 226948700

Gene position: 1664133-1662628 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226948702

Following gene: 226948689

Centisome position: 40.05

GC content: 26.69

Gene sequence:

>1506_bases
ATGCTTAAAAAAAGAAGTACTTTTTTTAAAGAGTCCCTTACATTAATAGTTTCTAATTTAACTACTGGAGTTTGTGCTTT
TACCTTCTCTATACTTATTTCTAACAAACTTGGCGCTGAAGGTATGGGACTTTATGGGCTAATTATGCCTATTTATGATT
TATTCACTTGCCTTATAAACGGTGGTATGACTGCAGCTATATCTAGAAATTGTGCTATCTATTTCGGTAAAAATGATTTT
GGCAATTTACATAAAACTGTAGAATCTACCCTAACCTTTGATGCTATATGGGCTATAATTGTTGCGTGCTTTGTTTTTAT
TAATTCTTCTTACATAAGTTCTAACATAATAAAAGACGCTAGATCTCTTAGGGCTTTGAGGGTTATATGCCCTGCTATGA
TTTTTATTGCTTTGTCTGCTATATTAAAAGGATATTTTTACTCTATATCAACTTCTAAAGTACCTGCTATCATAGATATA
GTAGAAAAAGGCCTTAGAATTGTTGTATTTTCCCTCATAATTTATTCCTTTAATATTTCTTCAGTATCTGGGACTGTAAC
TACAGCTTATACTACTCTTGCTGTAGGAGAACTTGTAAGTTTGATATTTCTATATTTTTTTTATATAAAAAATAAATTGA
AATTTAAATTTAGCTATAATAAATCTGAGGATAGTCTACAACTTCTCTTTAATGTACTTATAGTATCCTTGCCCTTATGT
TTAAACGGTTTTTTAACTACTGGTTTATATACATTATCAACCCTTATAATACCAAGAAGATTAATAAGTGCTGGAATTAA
TTACAGAGAAGCTTTATCATTGATGGGAAAATTTTCAAACATGGCCTTGTCTATCCCTTTATTCCCTTCAATAATATTAA
CCTCTATTTGTACTATATTAATACCTGACTTATCTGAGAGTATGAGTAAAGGTAACTACTTTTCTATGGAAAATAGAATA
GAAAAAATTATAAAAATAGCTCTAATATTAAGTTTAAGCACCTTATCTATTTGTGCTGCTATACCTAATGAATTAGGACT
TATGTTTTTTAATAGAACGGACCTAGGAAATTATATAAGGTTTTTATCCTTCTCTACACCTTTCGCATATGTCTCCATTA
TAAGTTATGCTATATTAAACGGTATAGGGAAACAGAAAATACTTTTAAGAAATTCAATAATTGTAGCTATAGAAGATTTG
ATATTTCTATATATACTAACAGGCTTATCTTTTATAAATATATACGGCTATGGTATAACCCTAATAATAACTTCTATAAC
ATCTATAGTATTAAACTTTGAAGAAATAAAAAAACATTGTTTTATAAAAATAGACCTCCATGAAAAATTCATATATGCTT
TATGTACAATTTTAGTATATCTTATATTAAATCTATTAAATAATATAATATTAATACAAAATATTTATATAAAAAATATT
TTAATAATATTTTCTGGATTCTCCTTAATGTTTATACTTATAAATATTACAAATAAAAAACATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATAACTTTCTTCTTATTTGGCATTCAGTAGAATATATTTCAAGTTTTCCTCATATTTATTTAGTGTTAGTATTTTGGA
GGAGTTGAAATATATTTTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATTAGCAAGAAAACACCTTGCCAATCTAATGTTTTTTTATCTTATTCTTTTTCTAACAAACTTAGGTATAAATTTTATTA
ATCTAGAAGGCATTCTATCT

Product: stage V sporulation protein B

Products: NA

Alternate protein names: Stage III sporulation protein F [H]

Number of amino acids: Translated: 501; Mature: 501

Protein sequence:

>501_residues
MLKKRSTFFKESLTLIVSNLTTGVCAFTFSILISNKLGAEGMGLYGLIMPIYDLFTCLINGGMTAAISRNCAIYFGKNDF
GNLHKTVESTLTFDAIWAIIVACFVFINSSYISSNIIKDARSLRALRVICPAMIFIALSAILKGYFYSISTSKVPAIIDI
VEKGLRIVVFSLIIYSFNISSVSGTVTTAYTTLAVGELVSLIFLYFFYIKNKLKFKFSYNKSEDSLQLLFNVLIVSLPLC
LNGFLTTGLYTLSTLIIPRRLISAGINYREALSLMGKFSNMALSIPLFPSIILTSICTILIPDLSESMSKGNYFSMENRI
EKIIKIALILSLSTLSICAAIPNELGLMFFNRTDLGNYIRFLSFSTPFAYVSIISYAILNGIGKQKILLRNSIIVAIEDL
IFLYILTGLSFINIYGYGITLIITSITSIVLNFEEIKKHCFIKIDLHEKFIYALCTILVYLILNLLNNIILIQNIYIKNI
LIIFSGFSLMFILINITNKKH

Sequences:

>Translated_501_residues
MLKKRSTFFKESLTLIVSNLTTGVCAFTFSILISNKLGAEGMGLYGLIMPIYDLFTCLINGGMTAAISRNCAIYFGKNDF
GNLHKTVESTLTFDAIWAIIVACFVFINSSYISSNIIKDARSLRALRVICPAMIFIALSAILKGYFYSISTSKVPAIIDI
VEKGLRIVVFSLIIYSFNISSVSGTVTTAYTTLAVGELVSLIFLYFFYIKNKLKFKFSYNKSEDSLQLLFNVLIVSLPLC
LNGFLTTGLYTLSTLIIPRRLISAGINYREALSLMGKFSNMALSIPLFPSIILTSICTILIPDLSESMSKGNYFSMENRI
EKIIKIALILSLSTLSICAAIPNELGLMFFNRTDLGNYIRFLSFSTPFAYVSIISYAILNGIGKQKILLRNSIIVAIEDL
IFLYILTGLSFINIYGYGITLIITSITSIVLNFEEIKKHCFIKIDLHEKFIYALCTILVYLILNLLNNIILIQNIYIKNI
LIIFSGFSLMFILINITNKKH
>Mature_501_residues
MLKKRSTFFKESLTLIVSNLTTGVCAFTFSILISNKLGAEGMGLYGLIMPIYDLFTCLINGGMTAAISRNCAIYFGKNDF
GNLHKTVESTLTFDAIWAIIVACFVFINSSYISSNIIKDARSLRALRVICPAMIFIALSAILKGYFYSISTSKVPAIIDI
VEKGLRIVVFSLIIYSFNISSVSGTVTTAYTTLAVGELVSLIFLYFFYIKNKLKFKFSYNKSEDSLQLLFNVLIVSLPLC
LNGFLTTGLYTLSTLIIPRRLISAGINYREALSLMGKFSNMALSIPLFPSIILTSICTILIPDLSESMSKGNYFSMENRI
EKIIKIALILSLSTLSICAAIPNELGLMFFNRTDLGNYIRFLSFSTPFAYVSIISYAILNGIGKQKILLRNSIIVAIEDL
IFLYILTGLSFINIYGYGITLIITSITSIVLNFEEIKKHCFIKIDLHEKFIYALCTILVYLILNLLNNIILIQNIYIKNI
LIIFSGFSLMFILINITNKKH

Specific function: Involved, directly or indirectly, in spore cortex biosynthesis. Affects only indirectly the expression of late sporulation genes [H]

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Probable) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR002797
- InterPro:   IPR014249 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56029; Mature: 56029

Theoretical pI: Translated: 9.50; Mature: 9.50

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.0 %Cys     (Translated Protein)
2.2 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
2.0 %Cys     (Mature Protein)
2.2 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKKRSTFFKESLTLIVSNLTTGVCAFTFSILISNKLGAEGMGLYGLIMPIYDLFTCLIN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
GGMTAAISRNCAIYFGKNDFGNLHKTVESTLTFDAIWAIIVACFVFINSSYISSNIIKDA
CCCEEEECCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
RSLRALRVICPAMIFIALSAILKGYFYSISTSKVPAIIDIVEKGLRIVVFSLIIYSFNIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SVSGTVTTAYTTLAVGELVSLIFLYFFYIKNKLKFKFSYNKSEDSLQLLFNVLIVSLPLC
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNGFLTTGLYTLSTLIIPRRLISAGINYREALSLMGKFSNMALSIPLFPSIILTSICTIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH
IPDLSESMSKGNYFSMENRIEKIIKIALILSLSTLSICAAIPNELGLMFFNRTDLGNYIR
HHCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCEEEEECCCHHHHHH
FLSFSTPFAYVSIISYAILNGIGKQKILLRNSIIVAIEDLIFLYILTGLSFINIYGYGIT
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIITSITSIVLNFEEIKKHCFIKIDLHEKFIYALCTILVYLILNLLNNIILIQNIYIKNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LIIFSGFSLMFILINITNKKH
HHHHCCHHHHHEEEEECCCCC
>Mature Secondary Structure
MLKKRSTFFKESLTLIVSNLTTGVCAFTFSILISNKLGAEGMGLYGLIMPIYDLFTCLIN
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHC
GGMTAAISRNCAIYFGKNDFGNLHKTVESTLTFDAIWAIIVACFVFINSSYISSNIIKDA
CCCEEEECCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHH
RSLRALRVICPAMIFIALSAILKGYFYSISTSKVPAIIDIVEKGLRIVVFSLIIYSFNIS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
SVSGTVTTAYTTLAVGELVSLIFLYFFYIKNKLKFKFSYNKSEDSLQLLFNVLIVSLPLC
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LNGFLTTGLYTLSTLIIPRRLISAGINYREALSLMGKFSNMALSIPLFPSIILTSICTIL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCEEECCHHHHHHHHHHHHHH
IPDLSESMSKGNYFSMENRIEKIIKIALILSLSTLSICAAIPNELGLMFFNRTDLGNYIR
HHCHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHCEEEEECCCHHHHHH
FLSFSTPFAYVSIISYAILNGIGKQKILLRNSIIVAIEDLIFLYILTGLSFINIYGYGIT
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LIITSITSIVLNFEEIKKHCFIKIDLHEKFIYALCTILVYLILNLLNNIILIQNIYIKNI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
LIIFSGFSLMFILINITNKKH
HHHHCCHHHHHEEEEECCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 1744050; 9384377 [H]