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The map label for this gene is ybjZ [C]

Identifier: 226948073

GI number: 226948073

Start: 993262

End: 995958

Strand: Direct

Name: ybjZ [C]

Synonym: CLM_0934

Alternate gene names: 226948073

Gene position: 993262-995958 (Clockwise)

Preceding gene: 226948072

Following gene: 226948074

Centisome position: 23.9

GC content: 25.73

Gene sequence:

>2697_bases
TTGAAAAGCTATAGTGAAATTACAGTAAGATATTTAAAACAGAATAAGAAAAGAACAGTATTAACCATAGTAGGAATAAT
ATTAGCTATATCTTTATTTTCTGGTATAGGAAATTTATTTTTCAGCATGAGAGATAATTTTATACAAAGAGAAAGAGAGC
AGAAAGGTAACTATGAAGTAAAATATTCAGGAGTAAGTGAAAATAAACTAAATAAATTAAAAAATAATTTTCAAATTAAG
GATTATGGTGTAAGTAAAGAAAATAATAGCTTTATTTTAAAGGATGATAAAAATGGTGAGAAAACAGGCAGTGATATTGG
TAAAAATTCATCAGACAATAACCCTAAAATTATAGATTTAGATTTTTATGATAATAGTATGTTAAATAATGTAATGACCA
TTGATATGAAGGAAGGCAGAAAACCAAAGGCAGCGGATGAAATAATATTAGAGAAAAAAGCAAAAAGAAACTTAGGAAAA
AAAGTAGGAGATTATATAGAAGGAATTAATATGGATTCCGAAATACTTAAAAAAGCAATAAAGGACAATCCTCAAATACT
TTTTAATGCTAATGAAAAGATTAATTTACAAAAATCAGATTCAAAAGAAGTTAAAAAGTATAAAATAGTAGGATATTTTG
ATGTTGAAACAAGTATATCAAGCAATTTTTATGGAGCTATAGGATATTTAGATAAGAACACCATAAAAAATGATGATAAG
TATTCTTTTTATGCAAATCTTAAAGAAAAGAAAAATAAAGTAGCTATAGGTAAGAAAGTTGGTAAAACAGTAGGATTAAG
TGAAAATAAAAAAGTGGATAATAAAGATGAAATAAGTTTTAATGACTCTGTATTAAGACTTATGGCAGAGGGAAATAATA
CCATATTAAATGAGGGGACAAAAGGTATATTTATATTTATTGTAACTTTAATAATAGTATGTACTGTTGCTGTTATTTAT
AATGCTTTTAACATATCTGTAGCGGAGAGAATAAATCAATTTGGTATATTAAGAAGTATAGGAGCTACCCCAGCAAAAAT
AAGAAAACTAGTATTTAAAGAAGCTTTTATAATGAGCATTATAGCTATTCCTATAGGAATCATTTCAGGATATTTAGGAA
TTTATACTACAATAAAGCTTATGTCAAATTCAAAACAGTTCATATTTAAAGGTTTTAAAATAGGTTTTTATAAAGAGGTT
ATAATTATATGTATTGTACTTACAGCTATAACTATAATATTATCTGTATTAGGTCCAGCTATAAAGGCCTCTAGGGTAGC
ACCAATAGACGCTATAAGAAATTCTTCAAACCTTAAAAAAGAAAAAATAAAAAGAAGAAAAGGAAGATTTATAAAGTTAA
TATTTGGTGTAGAAGGGGCAGTGGCCTACAAAAATATAAGAAGAAATAGTAAGAGATTTATAATAACAGTTTTTTCTCTT
ATGATATCTTTAATAATGTTTATAATTTTCACTTCTATGGGTAAGATATCAGGAGAAATTACTAAACAATTTATGGATTC
AATGCCTTTTGATGCTAGTATTCAATCAGATAAACCAATAAATGAAAAGTTTATATCTGAAATTAGAAATAAAGATGGTA
TAAAAGAAGTATATGCTCCAAAGATTAGAAATGCTTTAGTATATTTAGAAAAAAATATTTTAAATGAAAAATATTATGAA
AAGATAAATAAAGAAATGCCTAAAAGCGAAAAAATTAAAGGAAAAGATTATGTCTGTTTAGATAATATAGCATACTCAGC
CTATGATAAAGCTTCCTTTGAAGAGGCAAAAAATAATTTAGTAGATGGAAAAATAGATATAAAAGCTTTAGATAATAATG
GAGTATTGCTTATAAATAGAAATGAGATAACTAAGAAAAACGGAGGAAAAGTAATATCAGATATTACAAAATATAAGGTT
GGGGATAAAATAAGAATTCCAAGGACTAAAGATAAATTTTATCCTGAAAGAGGAGAAGAAAAGAAAATTGATTTAAAAGA
AGAATATAAACAAGGTATAGAAAAAGGAGATTTCATTGAATTAACTATAGTAGGTATATTAAGCAAGGATAGTTTTAATG
GAAATTTAGGTAAAGATAGTATAGGCTTAGTTTTTAGTGATAAATGTTTTGAAAATAATTTTGGCGCATTACCTGTAAAA
TCTGTTGCTATAACTTATAAAGATAAAAAGGCTAGAGAAAAATATGAAAGTTATTTTGAAGAAAAGGCAGAAGAAGTAGA
AGGAAGTTATATAGATGTTTATAATATGAACAATCGAATGGAAAGCGCTAATAAACAAGTTGCAGTATTTATGTACGGTT
TTATAACTATAATAACCATAATTGGAATGGTAAATATAATAAATACTGTAACTATAGGATTACTTCTTAGAAAATCAGAA
TTTGCAACTTTAACAGCCATAGGAATGACAAAAGCTCAATTAAATAAAATGGTAATGCTAGAAGGGTTACTTCATGGGGT
ATTTACCAGTGTATTTGGATCAATTATATCCTATGTATTATATAATTTCCTTTTAAAACAGAGCTCAGATTTTATGAGTT
TTGATATTAAGTTTCCTATAGATGTATTTGCAATAGGCATTTTAGGAGTAATAGGCATAACACTTTTAGCTTCAATAATA
CCACTTAGAAAACTTAAAAAAATGAGCATAGTAGAAAACATAAGAGCTAAGGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACACTAGTGCTTATAACCCATGACTTAAATATAGCAAAAATGGCAGATAGAGTTATAACCATAGCAGATGGAGAAGTTAA
AGGGGACGAGGTGACTAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTTTAAAAATTGTGTTTTAAAATAGATTTAATTTCAACGATGCAAAGATAAAAAATATATTTATTACATATATTTTT
TATCTTTGCTATATCAAAAT

Product: putative ABC transporter permease

Products: NA

Alternate protein names: ABC Transporter Permease Protein; Permease; ABC Transporter-Associated Permease; ATP Transporter Permease

Number of amino acids: Translated: 898; Mature: 898

Protein sequence:

>898_residues
MKSYSEITVRYLKQNKKRTVLTIVGIILAISLFSGIGNLFFSMRDNFIQREREQKGNYEVKYSGVSENKLNKLKNNFQIK
DYGVSKENNSFILKDDKNGEKTGSDIGKNSSDNNPKIIDLDFYDNSMLNNVMTIDMKEGRKPKAADEIILEKKAKRNLGK
KVGDYIEGINMDSEILKKAIKDNPQILFNANEKINLQKSDSKEVKKYKIVGYFDVETSISSNFYGAIGYLDKNTIKNDDK
YSFYANLKEKKNKVAIGKKVGKTVGLSENKKVDNKDEISFNDSVLRLMAEGNNTILNEGTKGIFIFIVTLIIVCTVAVIY
NAFNISVAERINQFGILRSIGATPAKIRKLVFKEAFIMSIIAIPIGIISGYLGIYTTIKLMSNSKQFIFKGFKIGFYKEV
IIICIVLTAITIILSVLGPAIKASRVAPIDAIRNSSNLKKEKIKRRKGRFIKLIFGVEGAVAYKNIRRNSKRFIITVFSL
MISLIMFIIFTSMGKISGEITKQFMDSMPFDASIQSDKPINEKFISEIRNKDGIKEVYAPKIRNALVYLEKNILNEKYYE
KINKEMPKSEKIKGKDYVCLDNIAYSAYDKASFEEAKNNLVDGKIDIKALDNNGVLLINRNEITKKNGGKVISDITKYKV
GDKIRIPRTKDKFYPERGEEKKIDLKEEYKQGIEKGDFIELTIVGILSKDSFNGNLGKDSIGLVFSDKCFENNFGALPVK
SVAITYKDKKAREKYESYFEEKAEEVEGSYIDVYNMNNRMESANKQVAVFMYGFITIITIIGMVNIINTVTIGLLLRKSE
FATLTAIGMTKAQLNKMVMLEGLLHGVFTSVFGSIISYVLYNFLLKQSSDFMSFDIKFPIDVFAIGILGVIGITLLASII
PLRKLKKMSIVENIRAKE

Sequences:

>Translated_898_residues
MKSYSEITVRYLKQNKKRTVLTIVGIILAISLFSGIGNLFFSMRDNFIQREREQKGNYEVKYSGVSENKLNKLKNNFQIK
DYGVSKENNSFILKDDKNGEKTGSDIGKNSSDNNPKIIDLDFYDNSMLNNVMTIDMKEGRKPKAADEIILEKKAKRNLGK
KVGDYIEGINMDSEILKKAIKDNPQILFNANEKINLQKSDSKEVKKYKIVGYFDVETSISSNFYGAIGYLDKNTIKNDDK
YSFYANLKEKKNKVAIGKKVGKTVGLSENKKVDNKDEISFNDSVLRLMAEGNNTILNEGTKGIFIFIVTLIIVCTVAVIY
NAFNISVAERINQFGILRSIGATPAKIRKLVFKEAFIMSIIAIPIGIISGYLGIYTTIKLMSNSKQFIFKGFKIGFYKEV
IIICIVLTAITIILSVLGPAIKASRVAPIDAIRNSSNLKKEKIKRRKGRFIKLIFGVEGAVAYKNIRRNSKRFIITVFSL
MISLIMFIIFTSMGKISGEITKQFMDSMPFDASIQSDKPINEKFISEIRNKDGIKEVYAPKIRNALVYLEKNILNEKYYE
KINKEMPKSEKIKGKDYVCLDNIAYSAYDKASFEEAKNNLVDGKIDIKALDNNGVLLINRNEITKKNGGKVISDITKYKV
GDKIRIPRTKDKFYPERGEEKKIDLKEEYKQGIEKGDFIELTIVGILSKDSFNGNLGKDSIGLVFSDKCFENNFGALPVK
SVAITYKDKKAREKYESYFEEKAEEVEGSYIDVYNMNNRMESANKQVAVFMYGFITIITIIGMVNIINTVTIGLLLRKSE
FATLTAIGMTKAQLNKMVMLEGLLHGVFTSVFGSIISYVLYNFLLKQSSDFMSFDIKFPIDVFAIGILGVIGITLLASII
PLRKLKKMSIVENIRAKE
>Mature_898_residues
MKSYSEITVRYLKQNKKRTVLTIVGIILAISLFSGIGNLFFSMRDNFIQREREQKGNYEVKYSGVSENKLNKLKNNFQIK
DYGVSKENNSFILKDDKNGEKTGSDIGKNSSDNNPKIIDLDFYDNSMLNNVMTIDMKEGRKPKAADEIILEKKAKRNLGK
KVGDYIEGINMDSEILKKAIKDNPQILFNANEKINLQKSDSKEVKKYKIVGYFDVETSISSNFYGAIGYLDKNTIKNDDK
YSFYANLKEKKNKVAIGKKVGKTVGLSENKKVDNKDEISFNDSVLRLMAEGNNTILNEGTKGIFIFIVTLIIVCTVAVIY
NAFNISVAERINQFGILRSIGATPAKIRKLVFKEAFIMSIIAIPIGIISGYLGIYTTIKLMSNSKQFIFKGFKIGFYKEV
IIICIVLTAITIILSVLGPAIKASRVAPIDAIRNSSNLKKEKIKRRKGRFIKLIFGVEGAVAYKNIRRNSKRFIITVFSL
MISLIMFIIFTSMGKISGEITKQFMDSMPFDASIQSDKPINEKFISEIRNKDGIKEVYAPKIRNALVYLEKNILNEKYYE
KINKEMPKSEKIKGKDYVCLDNIAYSAYDKASFEEAKNNLVDGKIDIKALDNNGVLLINRNEITKKNGGKVISDITKYKV
GDKIRIPRTKDKFYPERGEEKKIDLKEEYKQGIEKGDFIELTIVGILSKDSFNGNLGKDSIGLVFSDKCFENNFGALPVK
SVAITYKDKKAREKYESYFEEKAEEVEGSYIDVYNMNNRMESANKQVAVFMYGFITIITIIGMVNIINTVTIGLLLRKSE
FATLTAIGMTKAQLNKMVMLEGLLHGVFTSVFGSIISYVLYNFLLKQSSDFMSFDIKFPIDVFAIGILGVIGITLLASII
PLRKLKKMSIVENIRAKE

Specific function: Unknown

COG id: COG0577

COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component

Gene ontology:

Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 101484; Mature: 101484

Theoretical pI: Translated: 10.10; Mature: 10.10

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
2.7 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
2.7 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKSYSEITVRYLKQNKKRTVLTIVGIILAISLFSGIGNLFFSMRDNFIQREREQKGNYEV
CCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
KYSGVSENKLNKLKNNFQIKDYGVSKENNSFILKDDKNGEKTGSDIGKNSSDNNPKIIDL
EECCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
DFYDNSMLNNVMTIDMKEGRKPKAADEIILEKKAKRNLGKKVGDYIEGINMDSEILKKAI
ECCCCHHHCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
KDNPQILFNANEKINLQKSDSKEVKKYKIVGYFDVETSISSNFYGAIGYLDKNTIKNDDK
CCCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC
YSFYANLKEKKNKVAIGKKVGKTVGLSENKKVDNKDEISFNDSVLRLMAEGNNTILNEGT
EEEEEEHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCC
KGIFIFIVTLIIVCTVAVIYNAFNISVAERINQFGILRSIGATPAKIRKLVFKEAFIMSI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAIPIGIISGYLGIYTTIKLMSNSKQFIFKGFKIGFYKEVIIICIVLTAITIILSVLGPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
IKASRVAPIDAIRNSSNLKKEKIKRRKGRFIKLIFGVEGAVAYKNIRRNSKRFIITVFSL
HHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
MISLIMFIIFTSMGKISGEITKQFMDSMPFDASIQSDKPINEKFISEIRNKDGIKEVYAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
KIRNALVYLEKNILNEKYYEKINKEMPKSEKIKGKDYVCLDNIAYSAYDKASFEEAKNNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHCHHHHHHHHCCC
VDGKIDIKALDNNGVLLINRNEITKKNGGKVISDITKYKVGDKIRIPRTKDKFYPERGEE
CCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCC
KKIDLKEEYKQGIEKGDFIELTIVGILSKDSFNGNLGKDSIGLVFSDKCFENNFGALPVK
CCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHCCCCCCCCEE
SVAITYKDKKAREKYESYFEEKAEEVEGSYIDVYNMNNRMESANKQVAVFMYGFITIITI
EEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHH
IGMVNIINTVTIGLLLRKSEFATLTAIGMTKAQLNKMVMLEGLLHGVFTSVFGSIISYVL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNFLLKQSSDFMSFDIKFPIDVFAIGILGVIGITLLASIIPLRKLKKMSIVENIRAKE
HHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKSYSEITVRYLKQNKKRTVLTIVGIILAISLFSGIGNLFFSMRDNFIQREREQKGNYEV
CCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
KYSGVSENKLNKLKNNFQIKDYGVSKENNSFILKDDKNGEKTGSDIGKNSSDNNPKIIDL
EECCCCHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEE
DFYDNSMLNNVMTIDMKEGRKPKAADEIILEKKAKRNLGKKVGDYIEGINMDSEILKKAI
ECCCCHHHCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
KDNPQILFNANEKINLQKSDSKEVKKYKIVGYFDVETSISSNFYGAIGYLDKNTIKNDDK
CCCCEEEEECCCEEEEECCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCC
YSFYANLKEKKNKVAIGKKVGKTVGLSENKKVDNKDEISFNDSVLRLMAEGNNTILNEGT
EEEEEEHHHHCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCEEECCCC
KGIFIFIVTLIIVCTVAVIYNAFNISVAERINQFGILRSIGATPAKIRKLVFKEAFIMSI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
IAIPIGIISGYLGIYTTIKLMSNSKQFIFKGFKIGFYKEVIIICIVLTAITIILSVLGPA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHH
IKASRVAPIDAIRNSSNLKKEKIKRRKGRFIKLIFGVEGAVAYKNIRRNSKRFIITVFSL
HHHCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHH
MISLIMFIIFTSMGKISGEITKQFMDSMPFDASIQSDKPINEKFISEIRNKDGIKEVYAP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
KIRNALVYLEKNILNEKYYEKINKEMPKSEKIKGKDYVCLDNIAYSAYDKASFEEAKNNL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHCHHHHHHHHCCC
VDGKIDIKALDNNGVLLINRNEITKKNGGKVISDITKYKVGDKIRIPRTKDKFYPERGEE
CCCEEEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCC
KKIDLKEEYKQGIEKGDFIELTIVGILSKDSFNGNLGKDSIGLVFSDKCFENNFGALPVK
CCCCHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEECCHHCCCCCCCCEE
SVAITYKDKKAREKYESYFEEKAEEVEGSYIDVYNMNNRMESANKQVAVFMYGFITIITI
EEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHH
IGMVNIINTVTIGLLLRKSEFATLTAIGMTKAQLNKMVMLEGLLHGVFTSVFGSIISYVL
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YNFLLKQSSDFMSFDIKFPIDVFAIGILGVIGITLLASIIPLRKLKKMSIVENIRAKE
HHHHHHCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA