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The map label for this gene is ydaO [H]

Identifier: 226947776

GI number: 226947776

Start: 678444

End: 680297

Strand: Reverse

Name: ydaO [H]

Synonym: CLM_0625

Alternate gene names: 226947776

Gene position: 680297-678444 (Counterclockwise)

Preceding gene: 226947778

Following gene: 226947775

Centisome position: 16.37

GC content: 33.23

Gene sequence:

>1854_bases
ATGATAAAAAAATTCCTAGATATACTTATTGGCCAGCCTTTGCCAAACGAAAAAAGTTCACATGAAAGATATAATGTCCC
TTTTGGATTGGCCATTATGGCAAGCGATGCTGTTTCATCTGTTTCCTATGCTGCTGAAGAAATACTTGGTGTATTGATTG
CTGTAATAGGTTTAGCATCTTATAAATGGCTTGGTTGGGTTTCATTAATGATTATAATATTATTGCTTATCTTAACCGTT
TCCTACATACAAATAATACATGCATATCCCCATGGTGGCGGTGCATATGTAGTTGCTAAGGAAAATATTAATTTAAAATC
AGGATTAATAGCAGCTTCTGCATTGTTAGTTGATTATATATTAACCGTTGCGGTAAGCTCCAGCGCTGGAGTTGCTGCAA
TAATATCTGCCTTTCCTAGCTTAGGCAGTCATAAAATTTTATTAGCAGTCAGTATTATAATAATACTGACAATTTTAAAT
TTAAGAGGAGTTAGTGAGTCAGCTAAAATATTTAGTTTGCCTGCTTATCTTTTTATATTAAGTATGATTTTTATGATAAT
TTATGGACTTATAAAATACTCTATGTATGGTGCACCTGAACCTATGGTACATAGTCAAATAAAAGCCACTGGGGAACTAA
GTGTTTTCCTTATTTTAAAGGCATTTTCCTCAGGTTGTTCTGCATTGACTGGTCTTGAAGCGGTAAGCAACTCTGTACCA
AACTTTAAGGAACCATCTCAGAAAAATGCTAAAACTGTTATGATACTTTTATCTTGCTTAATACTATTTATATTTGGCGG
GACTTCAATACTTGCTAGATTTTATCGAACTATTCCTGTTGGATATCCTACTGTAATAGCACAGCTAGCCTACGGTATTT
TTGGTCAGAGTTTTATGTTTTATGTAATTCAATTTACAACTGCAATGATACTGATTATGGCATGTAATACAGCTTTTACT
GGCTTTCCAATGCTTATGTACACTGTAGGTAAAGATGGATTTGTACCAAGACAATTTACCGTAAGAGGCAAAAGATTAGG
TTTTTCAAATGGAATAGTTGCTCTATCTTTCGTGGCTTGTTTATTAGTTATTACATTTAATGCAGAAACTCATAGTCTTT
TACCTTTATATGCAGTTGGTGTATTTCTTTCATTTACATTGGCTCAAGCAGGTATGGTAAAACATTGGAGTAAAAATAAA
GAAAAGGGCTGGAGAAGCCGATCTATTATTAATGCTTTCGGTGCTTTTCTAGCTGCTGCAACAACTTTAATCATAGCCTA
TGAAAAATTCCGACACGGAGCATGGATGGTTATTATTATAATACCTATTCTGGTTGCTTCCATGTTGTCTATAAAAAAAC
ATTATAATAGTGTTGCAATTCAACTTAGGGTTGAAACTGAAGATCTAAAGGATTATAACTTAAATAAACCCTTTACACAA
ATTATTGTAGTTCCAATAGCAAGCTTAAATAAAGCAGCCTTATCGACATTGCAATATGCTAGAAGTTTATCATCTTATGT
TATAGCACTTAATGTCTCTACAGATAATAAAGAAATCGATAAACTTAAAAATAGATGGGCAAAACTTGATACAGATATAC
TACTCGTGTCAAAATATTCCACTTATAGAACAGTGGTTACCCCTTTATTAGGTTATATTAATCAGATAGCCAATGCTACA
AGTGAAACTGAAAAAATCACTGTTATGATACCTCAGTTTATAACTCATGAAGGCTTAGGAGAAGTTCTACATAACCACAC
TGGTTTTATAATCAGAGAAAGCCTACTAAGAAATAAGAATGTTATAGTGTCCACCTATCCGTACCACTTAGAAGATACTG
ACGTAGAAATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
GGTATAAATGGGAAAAATAAATTACATTGGTCTTCTTATAATATATTATATATTTAAAAAGAAGATTTTATTTTTTTTAT
ATGCAATGGAGGTGTTTTAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CAAAAATATACTTTTCAACGTATTTGAAGCATATTTTTTATTAATACTTTATTAATACAAACTTAAGATAAATTATATTA
TTTGTTTTTTCTATTATGAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 617; Mature: 617

Protein sequence:

>617_residues
MIKKFLDILIGQPLPNEKSSHERYNVPFGLAIMASDAVSSVSYAAEEILGVLIAVIGLASYKWLGWVSLMIIILLLILTV
SYIQIIHAYPHGGGAYVVAKENINLKSGLIAASALLVDYILTVAVSSSAGVAAIISAFPSLGSHKILLAVSIIIILTILN
LRGVSESAKIFSLPAYLFILSMIFMIIYGLIKYSMYGAPEPMVHSQIKATGELSVFLILKAFSSGCSALTGLEAVSNSVP
NFKEPSQKNAKTVMILLSCLILFIFGGTSILARFYRTIPVGYPTVIAQLAYGIFGQSFMFYVIQFTTAMILIMACNTAFT
GFPMLMYTVGKDGFVPRQFTVRGKRLGFSNGIVALSFVACLLVITFNAETHSLLPLYAVGVFLSFTLAQAGMVKHWSKNK
EKGWRSRSIINAFGAFLAAATTLIIAYEKFRHGAWMVIIIIPILVASMLSIKKHYNSVAIQLRVETEDLKDYNLNKPFTQ
IIVVPIASLNKAALSTLQYARSLSSYVIALNVSTDNKEIDKLKNRWAKLDTDILLVSKYSTYRTVVTPLLGYINQIANAT
SETEKITVMIPQFITHEGLGEVLHNHTGFIIRESLLRNKNVIVSTYPYHLEDTDVEI

Sequences:

>Translated_617_residues
MIKKFLDILIGQPLPNEKSSHERYNVPFGLAIMASDAVSSVSYAAEEILGVLIAVIGLASYKWLGWVSLMIIILLLILTV
SYIQIIHAYPHGGGAYVVAKENINLKSGLIAASALLVDYILTVAVSSSAGVAAIISAFPSLGSHKILLAVSIIIILTILN
LRGVSESAKIFSLPAYLFILSMIFMIIYGLIKYSMYGAPEPMVHSQIKATGELSVFLILKAFSSGCSALTGLEAVSNSVP
NFKEPSQKNAKTVMILLSCLILFIFGGTSILARFYRTIPVGYPTVIAQLAYGIFGQSFMFYVIQFTTAMILIMACNTAFT
GFPMLMYTVGKDGFVPRQFTVRGKRLGFSNGIVALSFVACLLVITFNAETHSLLPLYAVGVFLSFTLAQAGMVKHWSKNK
EKGWRSRSIINAFGAFLAAATTLIIAYEKFRHGAWMVIIIIPILVASMLSIKKHYNSVAIQLRVETEDLKDYNLNKPFTQ
IIVVPIASLNKAALSTLQYARSLSSYVIALNVSTDNKEIDKLKNRWAKLDTDILLVSKYSTYRTVVTPLLGYINQIANAT
SETEKITVMIPQFITHEGLGEVLHNHTGFIIRESLLRNKNVIVSTYPYHLEDTDVEI
>Mature_617_residues
MIKKFLDILIGQPLPNEKSSHERYNVPFGLAIMASDAVSSVSYAAEEILGVLIAVIGLASYKWLGWVSLMIIILLLILTV
SYIQIIHAYPHGGGAYVVAKENINLKSGLIAASALLVDYILTVAVSSSAGVAAIISAFPSLGSHKILLAVSIIIILTILN
LRGVSESAKIFSLPAYLFILSMIFMIIYGLIKYSMYGAPEPMVHSQIKATGELSVFLILKAFSSGCSALTGLEAVSNSVP
NFKEPSQKNAKTVMILLSCLILFIFGGTSILARFYRTIPVGYPTVIAQLAYGIFGQSFMFYVIQFTTAMILIMACNTAFT
GFPMLMYTVGKDGFVPRQFTVRGKRLGFSNGIVALSFVACLLVITFNAETHSLLPLYAVGVFLSFTLAQAGMVKHWSKNK
EKGWRSRSIINAFGAFLAAATTLIIAYEKFRHGAWMVIIIIPILVASMLSIKKHYNSVAIQLRVETEDLKDYNLNKPFTQ
IIVVPIASLNKAALSTLQYARSLSSYVIALNVSTDNKEIDKLKNRWAKLDTDILLVSKYSTYRTVVTPLLGYINQIANAT
SETEKITVMIPQFITHEGLGEVLHNHTGFIIRESLLRNKNVIVSTYPYHLEDTDVEI

Specific function: Probable Amino-Acid Or Metabolite Transport Protein. [C]

COG id: COG0531

COG function: function code E; Amino acid transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the amino acid-polyamine-organocation (APC) superfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002293 [H]

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 67768; Mature: 67768

Theoretical pI: Translated: 9.65; Mature: 9.65

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.8 %Met     (Translated Protein)
3.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIKKFLDILIGQPLPNEKSSHERYNVPFGLAIMASDAVSSVSYAAEEILGVLIAVIGLAS
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKWLGWVSLMIIILLLILTVSYIQIIHAYPHGGGAYVVAKENINLKSGLIAASALLVDYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LTVAVSSSAGVAAIISAFPSLGSHKILLAVSIIIILTILNLRGVSESAKIFSLPAYLFIL
HHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEHHHHHHHH
SMIFMIIYGLIKYSMYGAPEPMVHSQIKATGELSVFLILKAFSSGCSALTGLEAVSNSVP
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCC
NFKEPSQKNAKTVMILLSCLILFIFGGTSILARFYRTIPVGYPTVIAQLAYGIFGQSFMF
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVIQFTTAMILIMACNTAFTGFPMLMYTVGKDGFVPRQFTVRGKRLGFSNGIVALSFVAC
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LLVITFNAETHSLLPLYAVGVFLSFTLAQAGMVKHWSKNKEKGWRSRSIINAFGAFLAAA
HHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
TTLIIAYEKFRHGAWMVIIIIPILVASMLSIKKHYNSVAIQLRVETEDLKDYNLNKPFTQ
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHH
IIVVPIASLNKAALSTLQYARSLSSYVIALNVSTDNKEIDKLKNRWAKLDTDILLVSKYS
EEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCH
TYRTVVTPLLGYINQIANATSETEKITVMIPQFITHEGLGEVLHNHTGFIIRESLLRNKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCC
VIVSTYPYHLEDTDVEI
EEEEECCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MIKKFLDILIGQPLPNEKSSHERYNVPFGLAIMASDAVSSVSYAAEEILGVLIAVIGLAS
CHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YKWLGWVSLMIIILLLILTVSYIQIIHAYPHGGGAYVVAKENINLKSGLIAASALLVDYI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
LTVAVSSSAGVAAIISAFPSLGSHKILLAVSIIIILTILNLRGVSESAKIFSLPAYLFIL
HHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEHHHHHHHH
SMIFMIIYGLIKYSMYGAPEPMVHSQIKATGELSVFLILKAFSSGCSALTGLEAVSNSVP
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCC
NFKEPSQKNAKTVMILLSCLILFIFGGTSILARFYRTIPVGYPTVIAQLAYGIFGQSFMF
CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YVIQFTTAMILIMACNTAFTGFPMLMYTVGKDGFVPRQFTVRGKRLGFSNGIVALSFVAC
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHH
LLVITFNAETHSLLPLYAVGVFLSFTLAQAGMVKHWSKNKEKGWRSRSIINAFGAFLAAA
HHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
TTLIIAYEKFRHGAWMVIIIIPILVASMLSIKKHYNSVAIQLRVETEDLKDYNLNKPFTQ
HHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCHHH
IIVVPIASLNKAALSTLQYARSLSSYVIALNVSTDNKEIDKLKNRWAKLDTDILLVSKYS
EEEEEHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCH
TYRTVVTPLLGYINQIANATSETEKITVMIPQFITHEGLGEVLHNHTGFIIRESLLRNKN
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCC
VIVSTYPYHLEDTDVEI
EEEEECCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]