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The map label for this gene is 226947657

Identifier: 226947657

GI number: 226947657

Start: 542371

End: 544137

Strand: Direct

Name: 226947657

Synonym: CLM_0501

Alternate gene names: NA

Gene position: 542371-544137 (Clockwise)

Preceding gene: 226947656

Following gene: 226947662

Centisome position: 13.05

GC content: 31.86

Gene sequence:

>1767_bases
ATGAAAAAAAATAGGGGAGTTTTATTAACTTTTTCATTTGTTTTAATGATCTTATTATTTAATAACATGTCAGTATTAGC
GGCAGATTTAGATCCAAAAGTTGTAGCAGAAAATGCTAGTAGACTGGGGATATGGACTATTTTACCGCCAGTAATAGCTA
TTGTATTAGCTTTTATTACAAAAAATGTAGTTATTTCTTTAGCACTAGGTGTTTTTAGTGGAAGCTTTTTATTACAGCTA
AATGGAAACAACATATTCGGTGCTAGTTTCAAAGCTTTTTTAGATTTTATAAATAGAATACTAAATTCACTTGCAGATCC
TTGGAATGCAGGAATAATACTTCAATGTATGGTTATAGGTGGTCTTATAGCAGTAATTTCTAAAATGGGTGGGGCTAAAG
CTGTTGCAGAGTCTTTAGCTAAAAAAGCTAAAACTCCAAAGAGCGCCCAAATTATAACTTGGTTTTTAGGTTTATTAGTT
TTCTTTGACGATTATGCTAATGCCCTTATAGTAGGACCTATAATGAGACCTGTTGCAGATAAAATGAAAATATCAAGGGA
AAAATTAGCCTTTATAATAGATGGTACAGCGGCACCAATAGCTGGTATAGCAGTTATATCTACATGGATAGGATATGAAA
TAAGTTTAATAAAAGATGCTTATGCAAGTATTGGTCAAAGTGTAAATGCTTATGGATTATTTTTATCAACTATACCTTAT
AGGTTTTATAATATATTAATATTAGCATTTATAGTTTTAATAGCTTTAATGGGAAGAGATTTTGGACCAATGCTTAAGGC
TGAAAGAAGAGCAAGAACTACAGGTAAGCTTTTATCTGATACAGCAAAGCCGATGGTTTCTGAAGAAAGTACAGAACTTG
AACCAAGGGAAGGGATAAAATTAAATATTTGGAATGCAATAATTCCAATAACAATATTAATAGTTGGAGCTTTTGCAGGT
TTTTATTATAATGGTTATCAAGTTATAATGGGTGGAGAGGATAAGGCTTTAATACAAATGTTACAAACTTCACCTGCATC
CTTTGAGGCTTTAAGAGAAACCTTTAGTGCATCAGATGCTAGCATAGTTTTATTTCAATCCGCTTTACTTGCAAGTATAG
TAGCAATAATAATGGGAGCTTCACAAAAGATTTTTAAAGTAGGAGAAGCTATAGATGTTTGGATTACAGGGATGAAATCT
TTAATTATAACAGCAGTTATACTGCTTCTTGCTTGGTCCTTAAGTGCAGTTATAAAAGAACTTGGAACAGCTACTTTCTT
AGTTTCAATTTTATCTAATTCTATACCAAAATTTTTATTACCAAGCATAATATTTATATTGGGATCTGTTATATCTTTTG
CTACAGGATCAGCTTACGGAACAATGGGTATATTAATGCCTTTAACAATTCCATTAGCTTATGCTATATCACCAGATCCA
ACTTATGTAGTAATAAGCGTAAGTGCGGTTTTGACAGGAGCAATATTTGGAGATCATTGTTCTCCAATATCAGACACAAC
TATAATGTCTTCTATGGGATCTGCTTGTGATCATTTGGATCATACCTCAACACAAATGGTATATGCTTTAACTGTAGCAG
CATGTACAATATTATTTGGGTATATTCCAGCAGGCTTAGGATTACCAATATATATAGTTTTACCATTATCAATAGGGCTA
GTTGCATTATTAATTAGATTTGTAGGTAAGTCAAATGATATACCAGAAGAAGAAAGTTTAGAAGAAGTTTTAGAAATGGA
TGCATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTAAGGCTTTTTTGTTTTTGATGATGGTTTTCCTCCCCATATTCACTTAAATTTTAAAGCTTATAGGGCTTGAAATTTAT
AAATAGAGGAGGAGATTTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATAAGGAAAGTGCTTAGCACTTTCCTTATTGTTCTTCTTTAGGTTCTTCATTTCTATCTCTTCCATAGAATGAAATTGC
ATATAAACCTGCTATACCTA

Product: Na+/H+ antiporter family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 588; Mature: 588

Protein sequence:

>588_residues
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL
NGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLV
FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPITILIVGAFAG
FYYNGYQVIMGGEDKALIQMLQTSPASFEALRETFSASDASIVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS
LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL
VALLIRFVGKSNDIPEEESLEEVLEMDA

Sequences:

>Translated_588_residues
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL
NGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLV
FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPITILIVGAFAG
FYYNGYQVIMGGEDKALIQMLQTSPASFEALRETFSASDASIVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS
LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL
VALLIRFVGKSNDIPEEESLEEVLEMDA
>Mature_588_residues
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFITKNVVISLALGVFSGSFLLQL
NGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIGGLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLV
FFDDYANALIVGPIMRPVADKMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIKLNIWNAIIPITILIVGAFAG
FYYNGYQVIMGGEDKALIQMLQTSPASFEALRETFSASDASIVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKS
LIITAVILLLAWSLSAVIKELGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFGYIPAGLGLPIYIVLPLSIGL
VALLIRFVGKSNDIPEEESLEEVLEMDA

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63025; Mature: 63025

Theoretical pI: Translated: 5.87; Mature: 5.87

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
3.4 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
3.4 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFIT
CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNVVISLALGVFSGSFLLQLNGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIG
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
GLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLVFFDDYANALIVGPIMRPVAD
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHH
KMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
HHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCE
LNIWNAIIPITILIVGAFAGFYYNGYQVIMGGEDKALIQMLQTSPASFEALRETFSASDA
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCC
SIVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKSLIITAVILLLAWSLSAVIKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFG
CEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIPAGLGLPIYIVLPLSIGLVALLIRFVGKSNDIPEEESLEEVLEMDA
HHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKKNRGVLLTFSFVLMILLFNNMSVLAADLDPKVVAENASRLGIWTILPPVIAIVLAFIT
CCCCCCEEEHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
KNVVISLALGVFSGSFLLQLNGNNIFGASFKAFLDFINRILNSLADPWNAGIILQCMVIG
HHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
GLIAVISKMGGAKAVAESLAKKAKTPKSAQIITWFLGLLVFFDDYANALIVGPIMRPVAD
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHH
KMKISREKLAFIIDGTAAPIAGIAVISTWIGYEISLIKDAYASIGQSVNAYGLFLSTIPY
HHHHHHHHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH
RFYNILILAFIVLIALMGRDFGPMLKAERRARTTGKLLSDTAKPMVSEESTELEPREGIK
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCE
LNIWNAIIPITILIVGAFAGFYYNGYQVIMGGEDKALIQMLQTSPASFEALRETFSASDA
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCC
SIVLFQSALLASIVAIIMGASQKIFKVGEAIDVWITGMKSLIITAVILLLAWSLSAVIKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGTATFLVSILSNSIPKFLLPSIIFILGSVISFATGSAYGTMGILMPLTIPLAYAISPDP
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCC
TYVVISVSAVLTGAIFGDHCSPISDTTIMSSMGSACDHLDHTSTQMVYALTVAACTILFG
CEEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YIPAGLGLPIYIVLPLSIGLVALLIRFVGKSNDIPEEESLEEVLEMDA
HHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]