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The map label for this gene is ypnP [H]

Identifier: 226947527

GI number: 226947527

Start: 352022

End: 353392

Strand: Direct

Name: ypnP [H]

Synonym: CLM_0363

Alternate gene names: 226947527

Gene position: 352022-353392 (Clockwise)

Preceding gene: 226947526

Following gene: 226947528

Centisome position: 8.47

GC content: 29.69

Gene sequence:

>1371_bases
ATGGAAACTGATATGACAAAAGGAAAACCAATGGGAATCATTGTAAGATTCTTTATTCCTATGTTTATTGGAAATTTATT
TCAACAAATATACAATATAGTAGATTCCATTGTTGTAGGCCGATTTGTAGGAAATGAAGCCTTTGCAGCTGTAGGTTCCT
GTTTTCTCATTATGAGTTTTATGACATCTATTTTAATTGGACTAGCTATGGGAGCATCTGCATTCTTTTCACAACTTTAT
GGTGCAAAACAATATGATGAAATGAAAAAAGCTATATCTACTTCATTTTTTTTCATATTATCTATAAGCATTCTGTTAAG
TCTTATAACAAATGTATTTCTTTATGAAATAATTGAATTATTTCAGATGCCCAAAGATACTGTAACATATTCTGCTGAAT
ATTTAAGGTATATCTTAACAGGGCTTATATTTACCGGACTTTATAATATATGTGCTTATTTGCTACGTTCCATCGGAGAT
TCAAAATCTCCACTATATTTTTTGATTGTTTCTTGTATTTTAAATACTATTTTAGATTTAATTTTTGTTTTAGTGTTTAA
CATGGGAGTTTCAGGTGTAGGATTAGCTACATTTATAGCACAAGGATTATCCGCATTATGGTGTGCATTATATACTGTAA
AACATATGAAATTCCTTGATTTTAAAAGAAAGGATATTGTATTTAGTAGAAAACTTTTTAAAACTATTTTAAGTTACTCT
GTTTTGACAGCAGTGCAGCAATCTCTATCAAGTTTTGGAATGTTAATGATTCAAGGATTAATTAATACATTTGGAACTAC
TGTTATGGCTGCCTTTGCAGCTTGCTCAAAGATTGATGAGTTTGCTAATCGTCCTTTACAGGATTTAAGTAATGCATTTT
CAACTTATGTGGCACAAAATAAGGGAGCAGGAAATATAAAAAGAATTCGTCAAGGGTTTCATGCTATTTTAAAAGTTATT
GCTTTAATTTCTTTTGTAATATCAATAGTTGTCTTTATTTTTGCTCCTAATTTAATTTCAATTTTTGTAAAAAAGGAATC
CATAGATATTATTCAGGTTGGGGTAGGTTATCTTCGGATTGTATGTATTTTTTACATATTACTTGGTTGTATCGTTATGT
TTTATGGATTTTTCCGTGGTATGGGAGAAGTTAATATATCAATTATTTTAACTGTTGTATCTCAAGGAATAAGAGTAGCC
TTGGCCTATGGACTAGCCAGAACATCTATGGGATTTACAGGAATATGCTGGTCCATTGTAATTGGATGGTTCTTATCCAA
TGCTTTAGGTGGATTTATGTATAAAAAAGTAATGATAAATGCAGGGCAATTATATAATACATTGGAAGGTTTATTTAAGA
AAACTAAATAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTGTGAGATATATACCAATCCTATAACGGGAGAAATGGCTATTGCTTATAAAATGCCTAAATATTAAAAAGTGCATATTT
GAAAAAAAGGAGGTTTTATC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACTTTCAAATTATTATATTGAAAAAATAGATTTAAGATACAAAAACTATCTATTAAAATACAAAAATTAAAAGTAAGAAT
ATACTTTGTAGATAACATTA

Product: mate efflux family protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 456; Mature: 456

Protein sequence:

>456_residues
METDMTKGKPMGIIVRFFIPMFIGNLFQQIYNIVDSIVVGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILSISILLSLITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSIGD
SKSPLYFLIVSCILNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCALYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFKTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIKRIRQGFHAILKVI
ALISFVISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWFLSNALGGFMYKKVMINAGQLYNTLEGLFKKTK

Sequences:

>Translated_456_residues
METDMTKGKPMGIIVRFFIPMFIGNLFQQIYNIVDSIVVGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILSISILLSLITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSIGD
SKSPLYFLIVSCILNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCALYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFKTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIKRIRQGFHAILKVI
ALISFVISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWFLSNALGGFMYKKVMINAGQLYNTLEGLFKKTK
>Mature_456_residues
METDMTKGKPMGIIVRFFIPMFIGNLFQQIYNIVDSIVVGRFVGNEAFAAVGSCFLIMSFMTSILIGLAMGASAFFSQLY
GAKQYDEMKKAISTSFFFILSISILLSLITNVFLYEIIELFQMPKDTVTYSAEYLRYILTGLIFTGLYNICAYLLRSIGD
SKSPLYFLIVSCILNTILDLIFVLVFNMGVSGVGLATFIAQGLSALWCALYTVKHMKFLDFKRKDIVFSRKLFKTILSYS
VLTAVQQSLSSFGMLMIQGLINTFGTTVMAAFAACSKIDEFANRPLQDLSNAFSTYVAQNKGAGNIKRIRQGFHAILKVI
ALISFVISIVVFIFAPNLISIFVKKESIDIIQVGVGYLRIVCIFYILLGCIVMFYGFFRGMGEVNISIILTVVSQGIRVA
LAYGLARTSMGFTGICWSIVIGWFLSNALGGFMYKKVMINAGQLYNTLEGLFKKTK

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the multi antimicrobial extrusion (MATE) (TC 2.A.66.1) family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002528
- InterPro:   IPR015522 [H]

Pfam domain/function: PF01554 MatE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50699; Mature: 50699

Theoretical pI: Translated: 9.73; Mature: 9.73

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.8 %Cys     (Translated Protein)
4.2 %Met     (Translated Protein)
5.9 %Cys+Met (Translated Protein)
1.8 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]