Definition | Listeria monocytogenes Clip81459, complete genome. |
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Accession | NC_012488 |
Length | 2,912,690 |
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The map label for this gene is gltA
Identifier: 226225304
GI number: 226225304
Start: 2800179
End: 2802032
Strand: Direct
Name: gltA
Synonym: Lm4b_02727
Alternate gene names: NA
Gene position: 2800179-2802032 (Clockwise)
Preceding gene: 226225303
Following gene: 226225305
Centisome position: 96.14
GC content: 33.12
Gene sequence:
>1854_bases GTGTTAAATAAAAAAAGAGTTATAGTTGGGGTTTTGCTACTATTACTAAGTTTAATTTCTATTAGCTATTATTCAGAAAC CTTTAAACTAACTTTAAGCTGGTTGTTATTTGCAGTAGTTTTAACGGTTCTTTATTTTAGACAAGAGAAAAACTTTCAAT TTCAATGGTCAACATTGATAACCTCACTAATAATTAGTTTATTTTGGATGGCTTCATCATTCAATGGTGGACCATATGGC GGGAATTTTGTTTTTAATAGTATTATTTTAGCAGGAACTTTTCTTGTAATCACTATCTTTGTTTTACTTTTATTACTTGA AATGCGAACGGAATATAAAGCAAGACCGAATCGCAAAGTAAAATGGCCATTTTTCGCACTATTTACGAGTATTCCATTCG TGGTCTGGATGATTTCATTTCTAGCCTATTATCCAGCAAAAATGACATTTGACTCCTATTACCAATGGGGAATGGCTCAC GGTATTCGCCAATATAGTCAGTGGCATCCGCTTTTACACACTTTGTGGATAGAAACAACAAGTGCGATTTACGACTCACC TTCGAGTTACATTTTTTCTCAAATAATTGTTGTTTCATTAATCGTTGGCTTTGCTATTTATACTCTTGTAAAAATGGGCG CGCATATTTGGATTGGTGTTTGTATTTCAATCGGCTATGCCATTTACCCTGCAGCAATGTTTTATTCTGCAACAGCATGG AAAGATTTTCCATTTGCAGCCTTTATATTACTTTTCACCGTTTTAATTTTAAAAATAGTACAATCTAATGGAATGTGGCT GAAAAATTGGTGGCACCTTATCGCTTTTGTTTTAGTAGCTTTTGTTTGTATAAATTTACGAAACAATGGAATGATGATTA TCATCGTATCGCTTCTGTGCTTGCTTATTTTCATGAAAAACTTTCGTCTTATTATTACCGGTATTCTTGTTGGAACCTTG GGACTGAATTTTTTATTTGGTCTGGTTATGACAAACGGGCTTAATGCGCAACCTAATCCATTAAACCAAGCGCTAGCAAT TCCTTCCCAACAAATTGGGGCTACTTTTTACAATGATGGAAACTTTACTCCTGAATTAAAAGAGTATTTCACTTCCATAT TACCTGAAGAAAATTGGAAAAAAGATTACAACCCTTATACTGTAGACCCAATTAAGCATGATACCAAATACAATTCATCC GTCATTGAAGATGATTTTGGACTATACATTAAAAATTGGTTCAAACTCTTAACGGCTAATTTCGGTACTTATGTAGGGGC TTATTTAGATCAAACAGCAGTCATTTGGCAATTCTATTCTCCAGAAAATTATAAAGTATTCTTTGATACTTCAGCGAATA TTCAAGATACAAGATATGATGTGAGAGCATTCGCCAAATTCTTCCCAGAAGGTTTATCGGAAGAAGAGATTAATAAATTA GGATATGAAGTCTATCAAAATGAATACAAAAATGCAACTGGAAAAGATGCTGTTAGCTACAATGAGTATAAGAGACGGAT TGATGACTCTACTAATCCACTTATTTCAATATCTAAAGCTCCAAGTCTGAAGAAAATAACAGATAGCATTTATGCAAAAA CAACAAATGAGTGGCAAAATTATTTATTAAAAGGAGCCATTCCATTAGTATTGCTCATAATAGCAATTGCTGCCGTCTGC CTCCAACGTCCTAAAAAGAAACTTCTTATTTTTGCACCTGTAGTAATGGCACTTATTACTATAGCAATCGCAATGCCAGC AACAGACTTTAGATATTCTTATAGTTTTATTTTCACCGTGCCTATTGTCTTTTTTGCAACTAAATTAAAAAATTACAAAG AAAATCAATTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTTTCAAGTAAGGGCTCGCTTTAAATTTCAATTGCGCTAGCATCTTTTTTTTGCTATATTAAAGGATAGTAACGTCTCAT ATAGGGAGTGGAGAAAAAGA
Downstream 100 bases:
>100_bases GGAGAGAATAATGGGAATTCTAAATGAGAAAGTAGCTGTACTCTTGCCTTGTTATAACGAGGAGCTTACAATTGGTAAGG TAATTGATGATTTTAAGAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 617; Mature: 617
Protein sequence:
>617_residues MLNKKRVIVGVLLLLLSLISISYYSETFKLTLSWLLFAVVLTVLYFRQEKNFQFQWSTLITSLIISLFWMASSFNGGPYG GNFVFNSIILAGTFLVITIFVLLLLLEMRTEYKARPNRKVKWPFFALFTSIPFVVWMISFLAYYPAKMTFDSYYQWGMAH GIRQYSQWHPLLHTLWIETTSAIYDSPSSYIFSQIIVVSLIVGFAIYTLVKMGAHIWIGVCISIGYAIYPAAMFYSATAW KDFPFAAFILLFTVLILKIVQSNGMWLKNWWHLIAFVLVAFVCINLRNNGMMIIIVSLLCLLIFMKNFRLIITGILVGTL GLNFLFGLVMTNGLNAQPNPLNQALAIPSQQIGATFYNDGNFTPELKEYFTSILPEENWKKDYNPYTVDPIKHDTKYNSS VIEDDFGLYIKNWFKLLTANFGTYVGAYLDQTAVIWQFYSPENYKVFFDTSANIQDTRYDVRAFAKFFPEGLSEEEINKL GYEVYQNEYKNATGKDAVSYNEYKRRIDDSTNPLISISKAPSLKKITDSIYAKTTNEWQNYLLKGAIPLVLLIIAIAAVC LQRPKKKLLIFAPVVMALITIAIAMPATDFRYSYSFIFTVPIVFFATKLKNYKENQF
Sequences:
>Translated_617_residues MLNKKRVIVGVLLLLLSLISISYYSETFKLTLSWLLFAVVLTVLYFRQEKNFQFQWSTLITSLIISLFWMASSFNGGPYG GNFVFNSIILAGTFLVITIFVLLLLLEMRTEYKARPNRKVKWPFFALFTSIPFVVWMISFLAYYPAKMTFDSYYQWGMAH GIRQYSQWHPLLHTLWIETTSAIYDSPSSYIFSQIIVVSLIVGFAIYTLVKMGAHIWIGVCISIGYAIYPAAMFYSATAW KDFPFAAFILLFTVLILKIVQSNGMWLKNWWHLIAFVLVAFVCINLRNNGMMIIIVSLLCLLIFMKNFRLIITGILVGTL GLNFLFGLVMTNGLNAQPNPLNQALAIPSQQIGATFYNDGNFTPELKEYFTSILPEENWKKDYNPYTVDPIKHDTKYNSS VIEDDFGLYIKNWFKLLTANFGTYVGAYLDQTAVIWQFYSPENYKVFFDTSANIQDTRYDVRAFAKFFPEGLSEEEINKL GYEVYQNEYKNATGKDAVSYNEYKRRIDDSTNPLISISKAPSLKKITDSIYAKTTNEWQNYLLKGAIPLVLLIIAIAAVC LQRPKKKLLIFAPVVMALITIAIAMPATDFRYSYSFIFTVPIVFFATKLKNYKENQF >Mature_617_residues MLNKKRVIVGVLLLLLSLISISYYSETFKLTLSWLLFAVVLTVLYFRQEKNFQFQWSTLITSLIISLFWMASSFNGGPYG GNFVFNSIILAGTFLVITIFVLLLLLEMRTEYKARPNRKVKWPFFALFTSIPFVVWMISFLAYYPAKMTFDSYYQWGMAH GIRQYSQWHPLLHTLWIETTSAIYDSPSSYIFSQIIVVSLIVGFAIYTLVKMGAHIWIGVCISIGYAIYPAAMFYSATAW KDFPFAAFILLFTVLILKIVQSNGMWLKNWWHLIAFVLVAFVCINLRNNGMMIIIVSLLCLLIFMKNFRLIITGILVGTL GLNFLFGLVMTNGLNAQPNPLNQALAIPSQQIGATFYNDGNFTPELKEYFTSILPEENWKKDYNPYTVDPIKHDTKYNSS VIEDDFGLYIKNWFKLLTANFGTYVGAYLDQTAVIWQFYSPENYKVFFDTSANIQDTRYDVRAFAKFFPEGLSEEEINKL GYEVYQNEYKNATGKDAVSYNEYKRRIDDSTNPLISISKAPSLKKITDSIYAKTTNEWQNYLLKGAIPLVLLIIAIAAVC LQRPKKKLLIFAPVVMALITIAIAMPATDFRYSYSFIFTVPIVFFATKLKNYKENQF
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 70929; Mature: 70929
Theoretical pI: Translated: 9.46; Mature: 9.46
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MLNKKRVIVGVLLLLLSLISISYYSETFKLTLSWLLFAVVLTVLYFRQEKNFQFQWSTLI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH TSLIISLFWMASSFNGGPYGGNFVFNSIILAGTFLVITIFVLLLLLEMRTEYKARPNRKV HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KWPFFALFTSIPFVVWMISFLAYYPAKMTFDSYYQWGMAHGIRQYSQWHPLLHTLWIETT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAIYDSPSSYIFSQIIVVSLIVGFAIYTLVKMGAHIWIGVCISIGYAIYPAAMFYSATAW HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KDFPFAAFILLFTVLILKIVQSNGMWLKNWWHLIAFVLVAFVCINLRNNGMMIIIVSLLC CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH LLIFMKNFRLIITGILVGTLGLNFLFGLVMTNGLNAQPNPLNQALAIPSQQIGATFYNDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHCCEEECCC NFTPELKEYFTSILPEENWKKDYNPYTVDPIKHDTKYNSSVIEDDFGLYIKNWFKLLTAN CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH FGTYVGAYLDQTAVIWQFYSPENYKVFFDTSANIQDTRYDVRAFAKFFPEGLSEEEINKL HHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH GYEVYQNEYKNATGKDAVSYNEYKRRIDDSTNPLISISKAPSLKKITDSIYAKTTNEWQN HHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH YLLKGAIPLVLLIIAIAAVCLQRPKKKLLIFAPVVMALITIAIAMPATDFRYSYSFIFTV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH PIVFFATKLKNYKENQF HHHHHHHHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MLNKKRVIVGVLLLLLSLISISYYSETFKLTLSWLLFAVVLTVLYFRQEKNFQFQWSTLI CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHH TSLIISLFWMASSFNGGPYGGNFVFNSIILAGTFLVITIFVLLLLLEMRTEYKARPNRKV HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCC KWPFFALFTSIPFVVWMISFLAYYPAKMTFDSYYQWGMAHGIRQYSQWHPLLHTLWIETT CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SAIYDSPSSYIFSQIIVVSLIVGFAIYTLVKMGAHIWIGVCISIGYAIYPAAMFYSATAW HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC KDFPFAAFILLFTVLILKIVQSNGMWLKNWWHLIAFVLVAFVCINLRNNGMMIIIVSLLC CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHH LLIFMKNFRLIITGILVGTLGLNFLFGLVMTNGLNAQPNPLNQALAIPSQQIGATFYNDG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCCCHHHCCEEECCC NFTPELKEYFTSILPEENWKKDYNPYTVDPIKHDTKYNSSVIEDDFGLYIKNWFKLLTAN CCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH FGTYVGAYLDQTAVIWQFYSPENYKVFFDTSANIQDTRYDVRAFAKFFPEGLSEEEINKL HHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHH GYEVYQNEYKNATGKDAVSYNEYKRRIDDSTNPLISISKAPSLKKITDSIYAKTTNEWQN HHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHH YLLKGAIPLVLLIIAIAAVCLQRPKKKLLIFAPVVMALITIAIAMPATDFRYSYSFIFTV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH PIVFFATKLKNYKENQF HHHHHHHHHHCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA